MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879

Total Repeats: 114593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_020815	CGG	2	6	207206	207211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265726
4503	NC_020815	TGC	2	6	207215	207220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265726
4504	NC_020815	TGGT	2	8	207226	207233	0 %	50 %	50 %	0 %	471265726
4505	NC_020815	AAC	2	6	207250	207255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265726
4506	NC_020815	CGC	2	6	207308	207313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265726
4507	NC_020815	TGG	2	6	207329	207334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265726
4508	NC_020815	CCG	2	6	207340	207345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265726
4509	NC_020815	GCC	2	6	207348	207353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265726
4510	NC_020815	GGC	2	6	207384	207389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265726
4511	NC_020815	TGG	2	6	207442	207447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265726
4512	NC_020815	GCC	2	6	207450	207455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265726
4513	NC_020815	CGT	2	6	207461	207466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265726
4514	NC_020815	GGC	2	6	207618	207623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265726
4515	NC_020815	GCG	2	6	207635	207640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265726
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4517	NC_020815	CGG	2	6	207684	207689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265726
4518	NC_020815	CAG	2	6	207699	207704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265726
4519	NC_020815	GCG	2	6	207709	207714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265726
4520	NC_020815	CGG	2	6	207716	207721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265726
4521	NC_020815	CCAC	2	8	207746	207753	25 %	0 %	0 %	75 %	471265726
4522	NC_020815	GATC	2	8	207755	207762	25 %	25 %	25 %	25 %	471265726
4523	NC_020815	TGT	2	6	207791	207796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265726
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4526	NC_020815	GGC	2	6	207903	207908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265726
4527	NC_020815	CGG	2	6	207914	207919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265726
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4529	NC_020815	GGC	2	6	208101	208106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265726
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4532	NC_020815	CAG	2	6	208218	208223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265726
4533	NC_020815	TGG	2	6	208232	208237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265726
4534	NC_020815	TGGGCG	2	12	208315	208326	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	471265726
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4536	NC_020815	GACGC	2	10	208424	208433	20 %	0 %	40 %	40 %	471265726
4537	NC_020815	TGC	2	6	208548	208553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265727
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4540	NC_020815	GC	3	6	208698	208703	0 %	0 %	50 %	50 %	471265727
4541	NC_020815	ACC	3	9	208799	208807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265727
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4543	NC_020815	CGC	2	6	208818	208823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265727
4544	NC_020815	TGC	2	6	208859	208864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265727
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4547	NC_020815	GC	4	8	208920	208927	0 %	0 %	50 %	50 %	471265727
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4550	NC_020815	GCCCA	2	10	209027	209036	20 %	0 %	20 %	60 %	471265727
4551	NC_020815	CAG	2	6	209038	209043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265727
4552	NC_020815	CGG	2	6	209070	209075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265727
4553	NC_020815	CCGG	2	8	209117	209124	0 %	0 %	50 %	50 %	471265727
4554	NC_020815	GC	3	6	209178	209183	0 %	0 %	50 %	50 %	471265727
4555	NC_020815	GCA	3	9	209187	209195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265727
4556	NC_020815	CGGC	2	8	209261	209268	0 %	0 %	50 %	50 %	471265727
4557	NC_020815	GCC	2	6	209273	209278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265727
4558	NC_020815	GC	3	6	209284	209289	0 %	0 %	50 %	50 %	471265727
4559	NC_020815	GCGCA	2	10	209305	209314	20 %	0 %	40 %	40 %	471265727
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4561	NC_020815	CGGT	2	8	209346	209353	0 %	25 %	50 %	25 %	471265727
4562	NC_020815	GC	3	6	209496	209501	0 %	0 %	50 %	50 %	471265727
4563	NC_020815	GTA	2	6	209503	209508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265727
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4565	NC_020815	GGTGA	2	10	209545	209554	20 %	20 %	60 %	0 %	471265727
4566	NC_020815	CCGG	2	8	209555	209562	0 %	0 %	50 %	50 %	471265727
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4570	NC_020815	CGAGCC	2	12	209718	209729	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	471265727
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4592	NC_020815	GCCGA	2	10	210812	210821	20 %	0 %	40 %	40 %	471265728
4593	NC_020815	TCT	2	6	210822	210827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265728
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4595	NC_020815	GCCA	2	8	210926	210933	25 %	0 %	25 %	50 %	471265728
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4598	NC_020815	GTC	3	9	211252	211260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265728
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4601	NC_020815	GC	4	8	211408	211415	0 %	0 %	50 %	50 %	471265728
4602	NC_020815	GTC	2	6	211423	211428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265728
4603	NC_020815	CG	3	6	211446	211451	0 %	0 %	50 %	50 %	471265728
4604	NC_020815	CGC	2	6	211491	211496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265728
4605	NC_020815	AC	3	6	211527	211532	50 %	0 %	0 %	50 %	471265728
4606	NC_020815	TCG	2	6	211559	211564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265728
4607	NC_020815	CAG	2	6	211588	211593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265728
4608	NC_020815	GGC	2	6	211612	211617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265728
4609	NC_020815	GGC	2	6	211639	211644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265728
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4612	NC_020815	CG	3	6	211857	211862	0 %	0 %	50 %	50 %	471265728
4613	NC_020815	TGCG	2	8	211874	211881	0 %	25 %	50 %	25 %	471265728
4614	NC_020815	CTGG	2	8	211888	211895	0 %	25 %	50 %	25 %	471265728
4615	NC_020815	GCGG	2	8	211935	211942	0 %	0 %	75 %	25 %	471265728
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4622	NC_020815	CGG	2	6	212256	212261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265728
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4987	NC_020815	CGG	2	6	227227	227232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265739
4988	NC_020815	GGTGGA	2	12	227233	227244	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	471265739
4989	NC_020815	GCA	2	6	227248	227253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265739
4990	NC_020815	CG	3	6	227380	227385	0 %	0 %	50 %	50 %	471265739
4991	NC_020815	CG	4	8	227501	227508	0 %	0 %	50 %	50 %	471265739
4992	NC_020815	CCG	2	6	227512	227517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265739
4993	NC_020815	TGT	2	6	227561	227566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265740
4994	NC_020815	GGT	3	9	227583	227591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265740
4995	NC_020815	CTG	2	6	227611	227616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265740
4996	NC_020815	TGGG	3	12	227629	227640	0 %	25 %	75 %	0 %	471265740
4997	NC_020815	AGC	2	6	227674	227679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265740
4998	NC_020815	GGC	2	6	227682	227687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265740
4999	NC_020815	TGC	2	6	227708	227713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265740
5000	NC_020815	TGG	2	6	227714	227719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265740

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