MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC33

Total Repeats: 546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020801	GGCG	2	8	259	266	0 %	0 %	75 %	25 %	470474283
2	NC_020801	GGATCA	2	12	274	285	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470474283
3	NC_020801	GCA	2	6	311	316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474283
4	NC_020801	TTC	2	6	330	335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470474283
5	NC_020801	CCAAG	2	10	515	524	40 %	0 %	20 %	40 %	470474283
6	NC_020801	CGG	2	6	530	535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474283
7	NC_020801	GTT	2	6	722	727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470474283
8	NC_020801	TTG	2	6	735	740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470474283
9	NC_020801	CGC	2	6	797	802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474284
10	NC_020801	GC	3	6	801	806	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
11	NC_020801	TCT	2	6	886	891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470474284
12	NC_020801	GC	3	6	986	991	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
13	NC_020801	CGC	2	6	1034	1039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474284
14	NC_020801	CG	3	6	1058	1063	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
15	NC_020801	GGC	2	6	1073	1078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
16	NC_020801	GCA	2	6	1097	1102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
17	NC_020801	CGG	2	6	1114	1119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
18	NC_020801	TCG	3	9	1123	1131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474284
19	NC_020801	TGG	2	6	1196	1201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474284
20	NC_020801	ATG	2	6	1228	1233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470474284
21	NC_020801	GAGC	2	8	1260	1267	25 %	0 %	50 %	25 %	470474284
22	NC_020801	GCA	2	6	1277	1282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
23	NC_020801	CAT	2	6	1283	1288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474284
24	NC_020801	TGC	2	6	1504	1509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474284
25	NC_020801	CGC	2	6	1613	1618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474284
26	NC_020801	CAC	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474284
27	NC_020801	CCA	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474284
28	NC_020801	GTC	2	6	1782	1787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474284
29	NC_020801	TGG	2	6	1907	1912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474284
30	NC_020801	CG	5	10	1923	1932	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
31	NC_020801	TCAG	2	8	1939	1946	25 %	25 %	25 %	25 %	470474284
32	NC_020801	CAG	2	6	1989	1994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
33	NC_020801	CG	3	6	2012	2017	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
34	NC_020801	GC	3	6	2022	2027	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
35	NC_020801	GGC	2	6	2059	2064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
36	NC_020801	TCC	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470474284
37	NC_020801	CGT	2	6	2132	2137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474284
38	NC_020801	GC	3	6	2148	2153	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
39	NC_020801	CGG	2	6	2161	2166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
40	NC_020801	CG	3	6	2183	2188	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
41	NC_020801	AGCG	2	8	2230	2237	25 %	0 %	50 %	25 %	470474284
42	NC_020801	CAG	2	6	2277	2282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
43	NC_020801	TGA	2	6	2318	2323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470474284
44	NC_020801	CGG	2	6	2332	2337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
45	NC_020801	GC	3	6	2363	2368	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
46	NC_020801	CAT	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474284
47	NC_020801	CGA	2	6	2435	2440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
48	NC_020801	GCA	2	6	2537	2542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
49	NC_020801	GGGC	2	8	2607	2614	0 %	0 %	75 %	25 %	470474284
50	NC_020801	GGC	2	6	2667	2672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
51	NC_020801	AGC	2	6	2716	2721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
52	NC_020801	GGC	2	6	2748	2753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
53	NC_020801	TCT	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470474284
54	NC_020801	GCA	3	9	2825	2833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
55	NC_020801	GC	3	6	2861	2866	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
56	NC_020801	CGG	2	6	2933	2938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
57	NC_020801	CGG	2	6	2985	2990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
58	NC_020801	CACG	2	8	3023	3030	25 %	0 %	25 %	50 %	470474284
59	NC_020801	GCA	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
60	NC_020801	GCT	2	6	3158	3163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474284
61	NC_020801	AGT	2	6	3184	3189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470474284
62	NC_020801	AGC	2	6	3259	3264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
63	NC_020801	CCAG	2	8	3278	3285	25 %	0 %	25 %	50 %	470474284
64	NC_020801	TGC	2	6	3424	3429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474284
65	NC_020801	CGA	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
66	NC_020801	GCA	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
67	NC_020801	CGG	2	6	3524	3529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
68	NC_020801	CTG	2	6	3595	3600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474284
69	NC_020801	TGG	2	6	3611	3616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474284
70	NC_020801	TCG	2	6	3634	3639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474284
71	NC_020801	GC	3	6	3654	3659	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
72	NC_020801	TG	3	6	3709	3714	0 %	50 %	50 %	0 %	470474284
73	NC_020801	GCA	2	6	3807	3812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474285
74	NC_020801	GCG	2	6	3820	3825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474285
75	NC_020801	CAG	2	6	3871	3876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474285
76	NC_020801	GGC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474285
77	NC_020801	GCA	2	6	3933	3938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474285
78	NC_020801	GC	3	6	3944	3949	0 %	0 %	50 %	50 %	470474285
79	NC_020801	TGT	2	6	3954	3959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470474285
80	NC_020801	ATC	2	6	3962	3967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474285
81	NC_020801	TCA	2	6	4031	4036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474285
82	NC_020801	TGC	2	6	4069	4074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474285
83	NC_020801	GAT	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470474285
84	NC_020801	CGA	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474285
85	NC_020801	GAC	2	6	4150	4155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474285
86	NC_020801	TCA	2	6	4189	4194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474286
87	NC_020801	GC	3	6	4273	4278	0 %	0 %	50 %	50 %	470474286
88	NC_020801	CCG	2	6	4318	4323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474286
89	NC_020801	GCG	2	6	4330	4335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474286
90	NC_020801	CGGA	2	8	4345	4352	25 %	0 %	50 %	25 %	470474286
91	NC_020801	GC	3	6	4629	4634	0 %	0 %	50 %	50 %	470474287
92	NC_020801	CG	3	6	4642	4647	0 %	0 %	50 %	50 %	470474287
93	NC_020801	GGC	2	6	4682	4687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474287
94	NC_020801	GCG	2	6	4720	4725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474287
95	NC_020801	CG	3	6	4733	4738	0 %	0 %	50 %	50 %	470474287
96	NC_020801	CTG	2	6	4755	4760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474287
97	NC_020801	GGC	2	6	4773	4778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474287
98	NC_020801	CTCA	2	8	4817	4824	25 %	25 %	0 %	50 %	470474287
99	NC_020801	TGG	2	6	4840	4845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474287
100	NC_020801	GCT	2	6	4871	4876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474287
101	NC_020801	ACC	2	6	4899	4904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474287
102	NC_020801	CG	3	6	5000	5005	0 %	0 %	50 %	50 %	470474287
103	NC_020801	CGC	2	6	5044	5049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474287
104	NC_020801	GGC	2	6	5069	5074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474287
105	NC_020801	GTCG	2	8	5102	5109	0 %	25 %	50 %	25 %	470474287
106	NC_020801	ACAA	2	8	5191	5198	75 %	0 %	0 %	25 %	470474287
107	NC_020801	CCA	2	6	5263	5268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474287
108	NC_020801	CTG	2	6	5271	5276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474287
109	NC_020801	AAG	2	6	5316	5321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470474287
110	NC_020801	TCGA	2	8	5325	5332	25 %	25 %	25 %	25 %	470474287
111	NC_020801	T	6	6	5343	5348	0 %	100 %	0 %	0 %	470474287
112	NC_020801	CGG	2	6	5373	5378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474287
113	NC_020801	TGCGG	2	10	5466	5475	0 %	20 %	60 %	20 %	470474287
114	NC_020801	AG	3	6	5495	5500	50 %	0 %	50 %	0 %	470474287
115	NC_020801	CTC	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470474288
116	NC_020801	ATC	2	6	5713	5718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474288
117	NC_020801	GCC	2	6	5812	5817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474288
118	NC_020801	CGATC	2	10	5933	5942	20 %	20 %	20 %	40 %	470474288
119	NC_020801	GCT	2	6	5956	5961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474288
120	NC_020801	TGGGC	2	10	5989	5998	0 %	20 %	60 %	20 %	470474288
121	NC_020801	ATGC	2	8	6030	6037	25 %	25 %	25 %	25 %	470474288
122	NC_020801	GGA	2	6	6105	6110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470474288
123	NC_020801	G	6	6	6134	6139	0 %	0 %	100 %	0 %	470474288
124	NC_020801	AAC	2	6	6194	6199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470474288
125	NC_020801	TCA	2	6	6233	6238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474288
126	NC_020801	TGGG	2	8	6250	6257	0 %	25 %	75 %	0 %	470474288
127	NC_020801	A	6	6	6269	6274	100 %	0 %	0 %	0 %	470474288
128	NC_020801	CCG	2	6	6407	6412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474288
129	NC_020801	AGGC	2	8	6413	6420	25 %	0 %	50 %	25 %	470474288
130	NC_020801	CGA	2	6	6426	6431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474288
131	NC_020801	GGT	2	6	6432	6437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474288
132	NC_020801	CAA	2	6	6483	6488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470474288
133	NC_020801	GCC	3	9	6508	6516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474288
134	NC_020801	CCA	2	6	6531	6536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
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256	NC_020801	CGGT	2	8	13190	13197	0 %	25 %	50 %	25 %	470474293
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259	NC_020801	ATC	2	6	14121	14126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474294
260	NC_020801	CAGGCC	2	12	14139	14150	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470474294
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262	NC_020801	CGCA	2	8	14249	14256	25 %	0 %	25 %	50 %	470474294
263	NC_020801	GGA	3	9	14267	14275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470474294
264	NC_020801	CCG	2	6	14279	14284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474294
265	NC_020801	AAG	2	6	14289	14294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470474294
266	NC_020801	CTG	2	6	14325	14330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474294
267	NC_020801	A	7	7	14345	14351	100 %	0 %	0 %	0 %	470474294
268	NC_020801	AGGCCA	2	12	14466	14477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474295
269	NC_020801	CTGG	2	8	14503	14510	0 %	25 %	50 %	25 %	470474295
270	NC_020801	TACCTG	2	12	14555	14566	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470474295
271	NC_020801	GAA	2	6	14650	14655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470474295
272	NC_020801	CGA	2	6	14779	14784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474295
273	NC_020801	ATC	2	6	14861	14866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474295
274	NC_020801	CCG	2	6	14883	14888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474295
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277	NC_020801	G	6	6	15205	15210	0 %	0 %	100 %	0 %	470474296
278	NC_020801	TGG	2	6	15224	15229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474296
279	NC_020801	CTG	2	6	15321	15326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474296
280	NC_020801	CGG	2	6	15335	15340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474296
281	NC_020801	TGA	2	6	15341	15346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470474296
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284	NC_020801	GCC	2	6	15464	15469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474296
285	NC_020801	GTG	3	9	15478	15486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474296
286	NC_020801	CGAA	2	8	15504	15511	50 %	0 %	25 %	25 %	470474296
287	NC_020801	GC	3	6	15533	15538	0 %	0 %	50 %	50 %	470474296
288	NC_020801	GCC	2	6	15584	15589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474296
289	NC_020801	GCGCA	2	10	15702	15711	20 %	0 %	40 %	40 %	470474296
290	NC_020801	CCG	2	6	15737	15742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474296
291	NC_020801	TGC	2	6	16053	16058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474297
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299	NC_020801	TTTG	2	8	16333	16340	0 %	75 %	25 %	0 %	470474298
300	NC_020801	GCC	3	9	16405	16413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474298
301	NC_020801	CCG	2	6	16433	16438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474298
302	NC_020801	TGG	2	6	16515	16520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474298
303	NC_020801	AAG	2	6	16543	16548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470474298
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359	NC_020801	GCA	2	6	21292	21297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474306
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363	NC_020801	GCCA	2	8	21520	21527	25 %	0 %	25 %	50 %	470474307
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381	NC_020801	TGAC	2	8	22151	22158	25 %	25 %	25 %	25 %	470474308
382	NC_020801	CTG	2	6	22159	22164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474308
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386	NC_020801	CCA	2	6	22298	22303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474308
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388	NC_020801	GCC	2	6	22378	22383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474308
389	NC_020801	CTT	2	6	22401	22406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470474308
390	NC_020801	AGG	2	6	22409	22414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470474308
391	NC_020801	GCATGA	2	12	22420	22431	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470474308
392	NC_020801	GCC	2	6	22460	22465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474309
393	NC_020801	TGG	2	6	22522	22527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474309
394	NC_020801	CTG	2	6	22531	22536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474309
395	NC_020801	CGC	2	6	22561	22566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474309
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398	NC_020801	GCG	2	6	22649	22654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474309
399	NC_020801	GGC	2	6	22683	22688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474309
400	NC_020801	ATG	2	6	22890	22895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470474310
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411	NC_020801	GCTG	2	8	23651	23658	0 %	25 %	50 %	25 %	470474311
412	NC_020801	TCGACC	2	12	23663	23674	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470474311
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419	NC_020801	CGA	2	6	24015	24020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474311
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423	NC_020801	CGC	3	9	24324	24332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474311
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430	NC_020801	TCT	2	6	24631	24636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470474311
431	NC_020801	CTC	2	6	25071	25076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470474312
432	NC_020801	ATC	2	6	25095	25100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474312
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