MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1

Total Repeats: 73552

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020800	TCG	2	6	175	180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469930
2	NC_020800	TCG	2	6	232	237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469930
3	NC_020800	GCA	2	6	397	402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469930
4	NC_020800	GGC	2	6	416	421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469930
5	NC_020800	TGC	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469930
6	NC_020800	GCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469930
7	NC_020800	GCC	2	6	549	554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469930
8	NC_020800	TTC	2	6	582	587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470469930
9	NC_020800	GAT	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470469930
10	NC_020800	CAG	2	6	645	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469930
11	NC_020800	GCT	2	6	659	664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469930
12	NC_020800	CGA	2	6	668	673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469930
13	NC_020800	TTC	2	6	681	686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470469930
14	NC_020800	TTC	2	6	714	719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470469930
15	NC_020800	GCC	2	6	745	750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469930
16	NC_020800	ATC	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469930
17	NC_020800	CCG	2	6	852	857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469930
18	NC_020800	GCG	2	6	904	909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469930
19	NC_020800	CGA	2	6	920	925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469930
20	NC_020800	AAG	2	6	945	950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470469930
21	NC_020800	TGG	2	6	994	999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469930
22	NC_020800	CTG	2	6	1062	1067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469930
23	NC_020800	AGA	2	6	1105	1110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470469930
24	NC_020800	TAC	2	6	1122	1127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469930
25	NC_020800	CTG	2	6	1146	1151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469930
26	NC_020800	GCG	2	6	1157	1162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469930
27	NC_020800	TGC	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469930
28	NC_020800	TGG	2	6	1819	1824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469931
29	NC_020800	CGT	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469931
30	NC_020800	CAG	2	6	2085	2090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469931
31	NC_020800	TGT	2	6	2116	2121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470469931
32	NC_020800	TGC	2	6	2140	2145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469931
33	NC_020800	ATC	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469931
34	NC_020800	AGG	3	9	2542	2550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470469931
35	NC_020800	CGA	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469931
36	NC_020800	GTG	2	6	2652	2657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469931
37	NC_020800	CAG	2	6	2702	2707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469931
38	NC_020800	CTG	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469932
39	NC_020800	CAA	2	6	3982	3987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470469932
40	NC_020800	AAG	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470469932
41	NC_020800	GCG	3	9	4028	4036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469932
42	NC_020800	GTG	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469932
43	NC_020800	GGT	2	6	4192	4197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469932
44	NC_020800	CGC	2	6	4204	4209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469932
45	NC_020800	AAC	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470469932
46	NC_020800	CCT	2	6	4515	4520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470469932
47	NC_020800	CAT	2	6	4747	4752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469932
48	NC_020800	TGC	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469932
49	NC_020800	TCA	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469932
50	NC_020800	GCA	2	6	4851	4856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469932
51	NC_020800	CGA	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
52	NC_020800	TGC	2	6	5084	5089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469933
53	NC_020800	GGT	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469933
54	NC_020800	CGA	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
55	NC_020800	CGA	2	6	5217	5222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
56	NC_020800	GCG	2	6	5276	5281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
57	NC_020800	GAA	2	6	5302	5307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470469933
58	NC_020800	CGG	2	6	5315	5320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
59	NC_020800	CGG	2	6	5349	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
60	NC_020800	CGA	2	6	5361	5366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
61	NC_020800	CGG	2	6	5385	5390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
62	NC_020800	GGT	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469933
63	NC_020800	CAG	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
64	NC_020800	AGC	2	6	5513	5518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
65	NC_020800	CGA	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
66	NC_020800	GCG	2	6	5672	5677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
67	NC_020800	CGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
68	NC_020800	GGC	2	6	5707	5712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
69	NC_020800	CGC	2	6	5750	5755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469933
70	NC_020800	CAT	2	6	5796	5801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469933
71	NC_020800	CAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470469933
72	NC_020800	CGG	2	6	5880	5885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
73	NC_020800	GCG	2	6	5908	5913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
74	NC_020800	CGA	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
75	NC_020800	CGG	2	6	6089	6094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
76	NC_020800	TCG	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469933
77	NC_020800	GCG	2	6	6199	6204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
78	NC_020800	CGC	2	6	6226	6231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469933
79	NC_020800	TCG	2	6	6314	6319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469933
80	NC_020800	TGC	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469933
81	NC_020800	CGA	2	6	6489	6494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
82	NC_020800	ACC	2	6	6518	6523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470469933
83	NC_020800	CAT	2	6	6525	6530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469933
84	NC_020800	TGA	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470469933
85	NC_020800	CTG	3	9	6574	6582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469933
86	NC_020800	CTT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470469933
87	NC_020800	GCC	2	6	6642	6647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469933
88	NC_020800	GAC	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
89	NC_020800	GCG	2	6	6697	6702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
90	NC_020800	GCG	2	6	6739	6744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
91	NC_020800	CGA	2	6	6759	6764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
92	NC_020800	TTG	2	6	6796	6801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470469933
93	NC_020800	GCC	2	6	6885	6890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469933
94	NC_020800	TGG	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469933
95	NC_020800	CCG	2	6	7044	7049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469933
96	NC_020800	TGC	2	6	7076	7081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469933
97	NC_020800	GCG	2	6	7100	7105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
98	NC_020800	CAA	2	6	7179	7184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470469933
99	NC_020800	AAG	2	6	7240	7245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470469933
100	NC_020800	GCC	2	6	7247	7252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469933
101	NC_020800	AGC	2	6	7292	7297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
102	NC_020800	GCC	2	6	7363	7368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469933
103	NC_020800	CGC	2	6	7411	7416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469933
104	NC_020800	CAC	2	6	7560	7565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470469934
105	NC_020800	GCC	2	6	7582	7587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469934
106	NC_020800	GCT	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469934
107	NC_020800	GGC	2	6	7634	7639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469934
108	NC_020800	CTG	2	6	7640	7645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469934
109	NC_020800	GGC	2	6	7708	7713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469934
110	NC_020800	GCC	2	6	7754	7759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469934
111	NC_020800	GCT	2	6	7786	7791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469934
112	NC_020800	GCT	2	6	7822	7827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469934
113	NC_020800	TAC	2	6	7832	7837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469934
114	NC_020800	CGC	2	6	7844	7849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469934
115	NC_020800	CGC	3	9	7924	7932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469934
116	NC_020800	CTG	2	6	7940	7945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469934
117	NC_020800	GGC	2	6	7963	7968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469934
118	NC_020800	CCA	2	6	7995	8000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470469934
119	NC_020800	TGA	2	6	8010	8015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470469934
120	NC_020800	AAG	2	6	8016	8021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470469934
121	NC_020800	ATC	2	6	8063	8068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469934
122	NC_020800	CTG	2	6	8087	8092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469934
123	NC_020800	GCC	2	6	8126	8131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469934
124	NC_020800	GCA	2	6	8244	8249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469934
125	NC_020800	GCG	2	6	8255	8260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469934
126	NC_020800	CAA	2	6	8320	8325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470469934
127	NC_020800	GTT	2	6	8573	8578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470469935
128	NC_020800	CCA	2	6	8604	8609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470469935
129	NC_020800	GCC	2	6	8625	8630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469935
130	NC_020800	GGT	2	6	8635	8640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469935
131	NC_020800	GCG	2	6	8643	8648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469935
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255	NC_020800	TCG	2	6	15066	15071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469943
256	NC_020800	CCG	2	6	15144	15149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469943
257	NC_020800	CGC	2	6	15176	15181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469943
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260	NC_020800	GCT	2	6	15349	15354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469943
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371	NC_020800	GCG	2	6	24430	24435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469951
372	NC_020800	GGC	2	6	24462	24467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469951
373	NC_020800	GGC	3	9	24519	24527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469951
374	NC_020800	GCA	2	6	24578	24583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469951
375	NC_020800	CTC	2	6	24603	24608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470469951
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