MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC47

Total Repeats: 865

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020798	GCC	3	9	28665	28673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464959
502	NC_020798	CAC	2	6	28683	28688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464959
503	NC_020798	GCCGG	2	10	28831	28840	0 %	0 %	60 %	40 %	470464959
504	NC_020798	GCA	2	6	28852	28857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464959
505	NC_020798	CAG	2	6	28875	28880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464959
506	NC_020798	CTT	2	6	28920	28925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470464959
507	NC_020798	CTTGGC	3	18	29114	29131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464960
508	NC_020798	TGG	2	6	29146	29151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464960
509	NC_020798	TGG	2	6	29155	29160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464960
510	NC_020798	GCC	2	6	29169	29174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464960
511	NC_020798	GTC	3	9	29195	29203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464960
512	NC_020798	ATG	2	6	29205	29210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470464960
513	NC_020798	CAC	2	6	29244	29249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464960
514	NC_020798	GCG	2	6	29267	29272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464960
515	NC_020798	GTC	3	9	29333	29341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464960
516	NC_020798	TCGGTG	2	12	29361	29372	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	470464960
517	NC_020798	CTT	2	6	29417	29422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470464960
518	NC_020798	GCG	2	6	29437	29442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464960
519	NC_020798	GCC	2	6	29480	29485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464960
520	NC_020798	CGT	2	6	29488	29493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464960
521	NC_020798	GCC	2	6	29537	29542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464960
522	NC_020798	CAC	2	6	29575	29580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464960
523	NC_020798	CGCT	2	8	29600	29607	0 %	25 %	25 %	50 %	470464960
524	NC_020798	GTC	3	9	29624	29632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464960
525	NC_020798	ACG	2	6	29702	29707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464960
526	NC_020798	CGC	2	6	29752	29757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464960
527	NC_020798	GC	3	6	29768	29773	0 %	0 %	50 %	50 %	470464960
528	NC_020798	CCA	2	6	29806	29811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464960
529	NC_020798	GCCTT	2	10	29826	29835	0 %	40 %	20 %	40 %	470464960
530	NC_020798	GCA	2	6	29905	29910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464960
531	NC_020798	CCA	3	9	29917	29925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464960
532	NC_020798	GCA	2	6	29944	29949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464960
533	NC_020798	CTT	2	6	29957	29962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470464960
534	NC_020798	GCCG	3	12	30018	30029	0 %	0 %	50 %	50 %	470464960
535	NC_020798	CGGCG	2	10	30075	30084	0 %	0 %	60 %	40 %	470464960
536	NC_020798	TCT	2	6	30091	30096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470464960
537	NC_020798	CG	3	6	30119	30124	0 %	0 %	50 %	50 %	470464960
538	NC_020798	CCA	2	6	30132	30137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464960
539	NC_020798	TCG	2	6	30177	30182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464960
540	NC_020798	TTC	2	6	30188	30193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470464960
541	NC_020798	CAG	2	6	30212	30217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464960
542	NC_020798	ATC	2	6	30237	30242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470464960
543	NC_020798	CG	3	6	30252	30257	0 %	0 %	50 %	50 %	470464960
544	NC_020798	CG	3	6	30315	30320	0 %	0 %	50 %	50 %	470464960
545	NC_020798	CCTCGA	2	12	30397	30408	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470464960
546	NC_020798	GC	3	6	30445	30450	0 %	0 %	50 %	50 %	470464960
547	NC_020798	GCA	2	6	30528	30533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464960
548	NC_020798	GCC	2	6	30600	30605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464960
549	NC_020798	TCG	3	9	30607	30615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464960
550	NC_020798	GC	3	6	30648	30653	0 %	0 %	50 %	50 %	470464960
551	NC_020798	CGG	2	6	30680	30685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464960
552	NC_020798	CGC	3	9	30829	30837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464960
553	NC_020798	CAC	2	6	30851	30856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464960
554	NC_020798	TGG	2	6	30871	30876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464960
555	NC_020798	CGC	2	6	30884	30889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464960
556	NC_020798	GCG	2	6	30893	30898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464960
557	NC_020798	CCA	3	9	30907	30915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464960
558	NC_020798	CTGC	2	8	30939	30946	0 %	25 %	25 %	50 %	470464960
559	NC_020798	AG	3	6	30947	30952	50 %	0 %	50 %	0 %	470464960
560	NC_020798	GC	3	6	31014	31019	0 %	0 %	50 %	50 %	470464960
561	NC_020798	CTT	2	6	31024	31029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470464960
562	NC_020798	GCG	2	6	31062	31067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464960
563	NC_020798	CCT	2	6	31147	31152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470464960
564	NC_020798	GAC	2	6	31205	31210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464960
565	NC_020798	CAG	2	6	31252	31257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464960
566	NC_020798	GCG	2	6	31288	31293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464960
567	NC_020798	ACC	2	6	31380	31385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464960
568	NC_020798	TCG	2	6	31392	31397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464960
569	NC_020798	CCA	3	9	31438	31446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464960
570	NC_020798	AGA	2	6	31484	31489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470464961
571	NC_020798	GTC	2	6	31497	31502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464961
572	NC_020798	GCC	2	6	31510	31515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464961
573	NC_020798	CAT	2	6	31559	31564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470464961
574	NC_020798	GGC	2	6	31582	31587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464961
575	NC_020798	CGG	2	6	31608	31613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464961
576	NC_020798	CGGC	2	8	31643	31650	0 %	0 %	50 %	50 %	470464961
577	NC_020798	CCG	2	6	31652	31657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464961
578	NC_020798	GCC	2	6	31675	31680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464961
579	NC_020798	CTG	2	6	31691	31696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464961
580	NC_020798	GC	4	8	31755	31762	0 %	0 %	50 %	50 %	470464961
581	NC_020798	CAC	2	6	31794	31799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464961
582	NC_020798	CG	3	6	31862	31867	0 %	0 %	50 %	50 %	470464961
583	NC_020798	AGT	2	6	31880	31885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470464961
584	NC_020798	CGC	2	6	31896	31901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464961
585	NC_020798	ACGC	2	8	31937	31944	25 %	0 %	25 %	50 %	470464961
586	NC_020798	CGCA	2	8	31974	31981	25 %	0 %	25 %	50 %	470464961
587	NC_020798	GCC	2	6	32076	32081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464961
588	NC_020798	TGC	2	6	32092	32097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464961
589	NC_020798	CGACT	2	10	32181	32190	20 %	20 %	20 %	40 %	470464961
590	NC_020798	GCG	2	6	32213	32218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464961
591	NC_020798	CGGT	2	8	32222	32229	0 %	25 %	50 %	25 %	470464961
592	NC_020798	CTG	2	6	32235	32240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464961
593	NC_020798	TGGC	2	8	32361	32368	0 %	25 %	50 %	25 %	470464962
594	NC_020798	CAA	2	6	32376	32381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470464962
595	NC_020798	TCGG	2	8	32388	32395	0 %	25 %	50 %	25 %	470464962
596	NC_020798	CAA	2	6	32455	32460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470464962
597	NC_020798	TCC	2	6	32511	32516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470464962
598	NC_020798	AAG	2	6	32551	32556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470464962
599	NC_020798	GTA	2	6	32569	32574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470464962
600	NC_020798	ATATT	2	10	32690	32699	40 %	60 %	0 %	0 %	470464962
601	NC_020798	GGC	2	6	32701	32706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464962
602	NC_020798	GGGT	2	8	32749	32756	0 %	25 %	75 %	0 %	470464962
603	NC_020798	GGT	2	6	32762	32767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464962
604	NC_020798	GGC	2	6	32770	32775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464962
605	NC_020798	TCTCGG	2	12	32795	32806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464962
606	NC_020798	AGCAA	2	10	34379	34388	60 %	0 %	20 %	20 %	470464963
607	NC_020798	TGC	2	6	34425	34430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464963
608	NC_020798	GC	3	6	34454	34459	0 %	0 %	50 %	50 %	470464963
609	NC_020798	GTG	3	9	34489	34497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464963
610	NC_020798	TGG	2	6	34519	34524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464963
611	NC_020798	ACG	2	6	34527	34532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464963
612	NC_020798	TGA	2	6	34533	34538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470464963
613	NC_020798	CT	3	6	34578	34583	0 %	50 %	0 %	50 %	470464963
614	NC_020798	AGCA	2	8	34601	34608	50 %	0 %	25 %	25 %	470464963
615	NC_020798	CGA	2	6	34612	34617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464963
616	NC_020798	GCC	2	6	34647	34652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464963
617	NC_020798	CGC	2	6	34697	34702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464963
618	NC_020798	GAC	2	6	34744	34749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464964
619	NC_020798	CAG	2	6	34755	34760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464964
620	NC_020798	TCA	2	6	34775	34780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470464964
621	NC_020798	GAA	2	6	34815	34820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470464964
622	NC_020798	CTG	2	6	34912	34917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464964
623	NC_020798	CGC	2	6	34941	34946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464964
624	NC_020798	CAC	2	6	34962	34967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464964
625	NC_020798	AGC	2	6	34973	34978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464964
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627	NC_020798	CG	3	6	35132	35137	0 %	0 %	50 %	50 %	470464964
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.