MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 38757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017562	CGTGG	2	10	247764	247773	0 %	20 %	60 %	20 %	386083335
4002	NC_017562	TTA	2	6	247783	247788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386083335
4003	NC_017562	CAA	2	6	247816	247821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083335
4004	NC_017562	GCG	2	6	247861	247866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083335
4005	NC_017562	CAT	2	6	247910	247915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083335
4006	NC_017562	T	6	6	248190	248195	0 %	100 %	0 %	0 %	386083336
4007	NC_017562	AATT	2	8	248204	248211	50 %	50 %	0 %	0 %	386083336
4008	NC_017562	A	8	8	248223	248230	100 %	0 %	0 %	0 %	386083336
4009	NC_017562	AGA	2	6	248247	248252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083336
4010	NC_017562	TC	3	6	248382	248387	0 %	50 %	0 %	50 %	386083336
4011	NC_017562	GCAT	2	8	248821	248828	25 %	25 %	25 %	25 %	386083337
4012	NC_017562	GCA	2	6	248878	248883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083337
4013	NC_017562	CCA	2	6	249264	249269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083338
4014	NC_017562	TAGA	2	8	249279	249286	50 %	25 %	25 %	0 %	386083338
4015	NC_017562	CGG	2	6	249313	249318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083338
4016	NC_017562	CGCC	2	8	249330	249337	0 %	0 %	25 %	75 %	386083338
4017	NC_017562	TGA	2	6	249339	249344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083338
4018	NC_017562	GCG	2	6	249358	249363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083338
4019	NC_017562	GCT	2	6	249376	249381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083338
4020	NC_017562	CGC	2	6	249397	249402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083338
4021	NC_017562	TCA	2	6	249447	249452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083338
4022	NC_017562	CCA	2	6	249466	249471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083338
4023	NC_017562	GCC	2	6	249498	249503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083338
4024	NC_017562	ATC	2	6	249578	249583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083338
4025	NC_017562	CAAT	2	8	249588	249595	50 %	25 %	0 %	25 %	386083338
4026	NC_017562	ACG	2	6	249611	249616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083338
4027	NC_017562	GCA	2	6	249660	249665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083338
4028	NC_017562	CAG	2	6	249778	249783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083338
4029	NC_017562	GATG	2	8	249797	249804	25 %	25 %	50 %	0 %	386083338
4030	NC_017562	GCG	2	6	249805	249810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083338
4031	NC_017562	AGC	2	6	249821	249826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083338
4032	NC_017562	TTG	2	6	249922	249927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083338
4033	NC_017562	GTC	2	6	249968	249973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083338
4034	NC_017562	TGCC	2	8	250018	250025	0 %	25 %	25 %	50 %	386083338
4035	NC_017562	AAACA	2	10	250073	250082	80 %	0 %	0 %	20 %	386083338
4036	NC_017562	CAA	2	6	250097	250102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083338
4037	NC_017562	TGCC	2	8	250241	250248	0 %	25 %	25 %	50 %	386083339
4038	NC_017562	CCG	2	6	250286	250291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083339
4039	NC_017562	TGG	2	6	250300	250305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083339
4040	NC_017562	CTT	2	6	250356	250361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083339
4041	NC_017562	CGT	2	6	250401	250406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083339
4042	NC_017562	CGA	2	6	250449	250454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083339
4043	NC_017562	GCA	2	6	250474	250479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083339
4044	NC_017562	GC	4	8	250507	250514	0 %	0 %	50 %	50 %	386083339
4045	NC_017562	TTC	2	6	250519	250524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083339
4046	NC_017562	CG	3	6	250537	250542	0 %	0 %	50 %	50 %	386083339
4047	NC_017562	ACCC	2	8	250609	250616	25 %	0 %	0 %	75 %	386083339
4048	NC_017562	GC	4	8	250796	250803	0 %	0 %	50 %	50 %	386083339
4049	NC_017562	TGC	2	6	250880	250885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083339
4050	NC_017562	CGC	2	6	250991	250996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083339
4051	NC_017562	CAC	2	6	251286	251291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083340
4052	NC_017562	CAC	2	6	251424	251429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083340
4053	NC_017562	CTCC	2	8	251435	251442	0 %	25 %	0 %	75 %	386083340
4054	NC_017562	TCAT	2	8	251443	251450	25 %	50 %	0 %	25 %	386083340
4055	NC_017562	ATC	2	6	251472	251477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083340
4056	NC_017562	GCCGC	2	10	251483	251492	0 %	0 %	40 %	60 %	386083340
4057	NC_017562	CAG	2	6	251528	251533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083340
4058	NC_017562	CAC	2	6	251535	251540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083340
4059	NC_017562	CGC	2	6	251559	251564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083340
4060	NC_017562	GCAT	2	8	251565	251572	25 %	25 %	25 %	25 %	386083340
4061	NC_017562	ACC	2	6	251604	251609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083340
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4063	NC_017562	CA	3	6	251684	251689	50 %	0 %	0 %	50 %	386083340
4064	NC_017562	AACGC	2	10	251690	251699	40 %	0 %	20 %	40 %	386083340
4065	NC_017562	CGCA	2	8	251780	251787	25 %	0 %	25 %	50 %	386083340
4066	NC_017562	AACA	2	8	251853	251860	75 %	0 %	0 %	25 %	386083340
4067	NC_017562	TCA	2	6	251893	251898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083340
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4069	NC_017562	CAG	2	6	251907	251912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083340
4070	NC_017562	ATG	2	6	251913	251918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083340
4071	NC_017562	AAT	2	6	251960	251965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083340
4072	NC_017562	CAC	2	6	251969	251974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083340
4073	NC_017562	ATT	2	6	251979	251984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386083340
4074	NC_017562	CTGG	2	8	252047	252054	0 %	25 %	50 %	25 %	386083340
4075	NC_017562	TCG	2	6	252107	252112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083340
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4078	NC_017562	CTG	2	6	252300	252305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083340
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4089	NC_017562	GCCG	2	8	253333	253340	0 %	0 %	50 %	50 %	386083341
4090	NC_017562	CTG	2	6	253435	253440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083341
4091	NC_017562	TTAT	2	8	253462	253469	25 %	75 %	0 %	0 %	386083341
4092	NC_017562	AGT	2	6	253593	253598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083341
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4095	NC_017562	CGT	2	6	253815	253820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083341
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4097	NC_017562	TCA	2	6	253907	253912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083341
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4099	NC_017562	TAT	2	6	254153	254158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386083341
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4101	NC_017562	CAT	2	6	254247	254252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083341
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4103	NC_017562	CT	3	6	254293	254298	0 %	50 %	0 %	50 %	386083341
4104	NC_017562	GCC	2	6	254361	254366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083341
4105	NC_017562	CGT	2	6	254616	254621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083341
4106	NC_017562	CGG	2	6	254799	254804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083341
4107	NC_017562	CCAACG	2	12	254805	254816	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386083341
4108	NC_017562	CCA	2	6	254873	254878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083341
4109	NC_017562	TCA	2	6	254951	254956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083341
4110	NC_017562	ATCGT	2	10	254990	254999	20 %	40 %	20 %	20 %	386083341
4111	NC_017562	CTC	2	6	255046	255051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083341
4112	NC_017562	CAA	2	6	255057	255062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083341
4113	NC_017562	CAA	2	6	255091	255096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083341
4114	NC_017562	CTTT	2	8	255134	255141	0 %	75 %	0 %	25 %	386083342
4115	NC_017562	GCC	2	6	255165	255170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083342
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4117	NC_017562	CAC	2	6	255206	255211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083342
4118	NC_017562	ATT	2	6	255294	255299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386083342
4119	NC_017562	TTG	2	6	255349	255354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083342
4120	NC_017562	TCG	3	9	255373	255381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083342
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4122	NC_017562	GCCACC	2	12	255489	255500	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386083342
4123	NC_017562	GC	3	6	255563	255568	0 %	0 %	50 %	50 %	386083342
4124	NC_017562	ATCGC	2	10	255634	255643	20 %	20 %	20 %	40 %	386083342
4125	NC_017562	CACTGA	2	12	255655	255666	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386083342
4126	NC_017562	CGC	2	6	255723	255728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083342
4127	NC_017562	CGCA	2	8	255776	255783	25 %	0 %	25 %	50 %	386083342
4128	NC_017562	CCG	2	6	255799	255804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083342
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4131	NC_017562	CCG	2	6	255877	255882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083342
4132	NC_017562	TCCGC	2	10	255922	255931	0 %	20 %	20 %	60 %	386083342
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4152	NC_017562	CTCAC	2	10	256738	256747	20 %	20 %	0 %	60 %	386083343
4153	NC_017562	CACCC	2	10	256758	256767	20 %	0 %	0 %	80 %	386083343
4154	NC_017562	CCCA	2	8	256786	256793	25 %	0 %	0 %	75 %	386083343
4155	NC_017562	A	6	6	256817	256822	100 %	0 %	0 %	0 %	386083343
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4161	NC_017562	A	6	6	257168	257173	100 %	0 %	0 %	0 %	386083344
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4244	NC_017562	TA	3	6	261166	261171	50 %	50 %	0 %	0 %	386083352
4245	NC_017562	ATT	2	6	261282	261287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386083352
4246	NC_017562	ATG	2	6	261329	261334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083352
4247	NC_017562	GGC	2	6	261449	261454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083353
4248	NC_017562	GAA	2	6	261478	261483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083353
4249	NC_017562	CGC	2	6	261509	261514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083353
4250	NC_017562	TAA	2	6	261562	261567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083353
4251	NC_017562	CAT	2	6	261581	261586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083353
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4253	NC_017562	TAA	2	6	261599	261604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083353
4254	NC_017562	CTTGC	2	10	261658	261667	0 %	40 %	20 %	40 %	386083354
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4262	NC_017562	A	6	6	261799	261804	100 %	0 %	0 %	0 %	386083354
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4264	NC_017562	ATTTC	2	10	261861	261870	20 %	60 %	0 %	20 %	386083354
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4277	NC_017562	ATA	2	6	262593	262598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083356
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4304	NC_017562	TGG	2	6	263975	263980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083357
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4318	NC_017562	CAGCGG	2	12	264810	264821	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386083357
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4325	NC_017562	GCA	2	6	264968	264973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083357
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4332	NC_017562	GTA	2	6	265264	265269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083357
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4334	NC_017562	GATGG	2	10	265398	265407	20 %	20 %	60 %	0 %	386083357
4335	NC_017562	GCA	2	6	265446	265451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083357
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4342	NC_017562	GAC	2	6	265729	265734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083357
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4346	NC_017562	GCA	2	6	265808	265813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083357
4347	NC_017562	GGC	2	6	265825	265830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083357
4348	NC_017562	TGA	2	6	265896	265901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083357
4349	NC_017562	TGT	2	6	265904	265909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083357
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4351	NC_017562	CACGA	2	10	265957	265966	40 %	0 %	20 %	40 %	386083357
4352	NC_017562	TGA	2	6	265983	265988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083357
4353	NC_017562	TAC	2	6	266033	266038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083357
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4357	NC_017562	TGGC	2	8	266239	266246	0 %	25 %	50 %	25 %	386083357
4358	NC_017562	CTG	2	6	266261	266266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083357
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4360	NC_017562	GCG	2	6	266298	266303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083357
4361	NC_017562	CTG	3	9	266312	266320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083357
4362	NC_017562	CGG	2	6	266347	266352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083357
4363	NC_017562	GCA	2	6	266358	266363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083357
4364	NC_017562	GGC	2	6	266375	266380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083357
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4487	NC_017562	GCC	2	6	270972	270977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083359
4488	NC_017562	GAT	2	6	271200	271205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083359
4489	NC_017562	ATG	2	6	271226	271231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083359
4490	NC_017562	GCG	2	6	271242	271247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083359
4491	NC_017562	GGT	2	6	271675	271680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083360
4492	NC_017562	CTGCC	2	10	271709	271718	0 %	20 %	20 %	60 %	386083360
4493	NC_017562	CGG	2	6	271760	271765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083360
4494	NC_017562	GCG	2	6	271924	271929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083361
4495	NC_017562	GCT	2	6	271937	271942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083361
4496	NC_017562	AGA	2	6	271955	271960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083361
4497	NC_017562	TGG	2	6	271983	271988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083361
4498	NC_017562	TG	3	6	272078	272083	0 %	50 %	50 %	0 %	386083361
4499	NC_017562	CTGT	2	8	272091	272098	0 %	50 %	25 %	25 %	386083361
4500	NC_017562	GGT	2	6	275229	275234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083362

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