MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 38757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_017562	ATC	2	6	116425	116430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083216
2003	NC_017562	GCTC	2	8	116504	116511	0 %	25 %	25 %	50 %	386083216
2004	NC_017562	GCA	2	6	116524	116529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083216
2005	NC_017562	CA	3	6	116547	116552	50 %	0 %	0 %	50 %	386083216
2006	NC_017562	GAA	2	6	116560	116565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083216
2007	NC_017562	TCA	2	6	116618	116623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083216
2008	NC_017562	CA	4	8	116670	116677	50 %	0 %	0 %	50 %	386083216
2009	NC_017562	ACCG	2	8	116809	116816	25 %	0 %	25 %	50 %	386083216
2010	NC_017562	ACC	2	6	116893	116898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083216
2011	NC_017562	ATT	2	6	116931	116936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386083216
2012	NC_017562	ACA	2	6	117036	117041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083216
2013	NC_017562	CCAAA	2	10	117057	117066	60 %	0 %	0 %	40 %	386083216
2014	NC_017562	AAT	2	6	117109	117114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083216
2015	NC_017562	AGC	2	6	117117	117122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083216
2016	NC_017562	GTG	2	6	117465	117470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083217
2017	NC_017562	A	6	6	117482	117487	100 %	0 %	0 %	0 %	386083217
2018	NC_017562	GCCAC	2	10	117658	117667	20 %	0 %	20 %	60 %	386083217
2019	NC_017562	CGC	2	6	117832	117837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083217
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2021	NC_017562	GCGAC	2	10	117901	117910	20 %	0 %	40 %	40 %	386083217
2022	NC_017562	TGGC	2	8	117972	117979	0 %	25 %	50 %	25 %	386083217
2023	NC_017562	CGC	2	6	117983	117988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083217
2024	NC_017562	ACC	2	6	118011	118016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083217
2025	NC_017562	GCGGCC	2	12	118020	118031	0 %	0 %	50 %	50 %	386083217
2026	NC_017562	CAGCG	2	10	118301	118310	20 %	0 %	40 %	40 %	386083218
2027	NC_017562	AC	3	6	118312	118317	50 %	0 %	0 %	50 %	386083218
2028	NC_017562	TGC	2	6	118365	118370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083218
2029	NC_017562	CAG	2	6	118591	118596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083218
2030	NC_017562	CGGA	2	8	118687	118694	25 %	0 %	50 %	25 %	386083218
2031	NC_017562	ACC	2	6	118695	118700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083218
2032	NC_017562	CAT	2	6	118805	118810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083218
2033	NC_017562	ACGCA	2	10	118818	118827	40 %	0 %	20 %	40 %	386083218
2034	NC_017562	ACCA	2	8	118871	118878	50 %	0 %	0 %	50 %	386083218
2035	NC_017562	CAC	2	6	118879	118884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083218
2036	NC_017562	GCAAC	2	10	118918	118927	40 %	0 %	20 %	40 %	386083218
2037	NC_017562	CCA	2	6	118978	118983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083218
2038	NC_017562	GCC	2	6	119013	119018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083218
2039	NC_017562	TGC	2	6	119031	119036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083218
2040	NC_017562	CA	3	6	119155	119160	50 %	0 %	0 %	50 %	386083218
2041	NC_017562	CACT	2	8	119163	119170	25 %	25 %	0 %	50 %	386083218
2042	NC_017562	CTT	2	6	119192	119197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083218
2043	NC_017562	CAGC	2	8	119269	119276	25 %	0 %	25 %	50 %	386083218
2044	NC_017562	CCCTT	2	10	119283	119292	0 %	40 %	0 %	60 %	386083218
2045	NC_017562	CAA	2	6	119309	119314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083218
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2048	NC_017562	CTC	2	6	119450	119455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083218
2049	NC_017562	ACG	2	6	119459	119464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083218
2050	NC_017562	A	6	6	119466	119471	100 %	0 %	0 %	0 %	386083218
2051	NC_017562	TGC	2	6	119542	119547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083218
2052	NC_017562	ACCG	2	8	119579	119586	25 %	0 %	25 %	50 %	386083218
2053	NC_017562	AAG	2	6	119624	119629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083218
2054	NC_017562	GAT	2	6	119705	119710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083218
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2056	NC_017562	TAGAAG	2	12	119776	119787	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386083218
2057	NC_017562	CTC	2	6	119819	119824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083218
2058	NC_017562	ACC	2	6	119846	119851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083218
2059	NC_017562	TGA	2	6	119913	119918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083218
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2062	NC_017562	GCA	2	6	120000	120005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083218
2063	NC_017562	ACC	2	6	120011	120016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083218
2064	NC_017562	CGCA	2	8	120065	120072	25 %	0 %	25 %	50 %	386083218
2065	NC_017562	ATCA	2	8	120143	120150	50 %	25 %	0 %	25 %	386083218
2066	NC_017562	TGC	2	6	120514	120519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083219
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2115	NC_017562	A	9	9	122616	122624	100 %	0 %	0 %	0 %	386083221
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2121	NC_017562	CAA	2	6	122838	122843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083221
2122	NC_017562	TCT	2	6	122844	122849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083221
2123	NC_017562	CGA	2	6	122850	122855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083221
2124	NC_017562	CT	3	6	122886	122891	0 %	50 %	0 %	50 %	386083221
2125	NC_017562	AAC	2	6	123345	123350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083222
2126	NC_017562	GTC	2	6	123686	123691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083222
2127	NC_017562	CGT	2	6	123730	123735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083222
2128	NC_017562	CGG	2	6	123739	123744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083222
2129	NC_017562	GCA	2	6	123749	123754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083222
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2131	NC_017562	TCA	3	9	123795	123803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083222
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2133	NC_017562	TCG	2	6	123903	123908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083222
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2135	NC_017562	TCG	2	6	123969	123974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083222
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2141	NC_017562	TAC	2	6	124442	124447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083222
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2147	NC_017562	GCA	2	6	124628	124633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083222
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2150	NC_017562	TACT	2	8	124732	124739	25 %	50 %	0 %	25 %	386083222
2151	NC_017562	GCC	2	6	124755	124760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083222
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2154	NC_017562	CATCG	2	10	124823	124832	20 %	20 %	20 %	40 %	386083222
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2211	NC_017562	CT	3	6	129184	129189	0 %	50 %	0 %	50 %	386083225
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2213	NC_017562	AAAC	2	8	129216	129223	75 %	0 %	0 %	25 %	386083225
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2224	NC_017562	CAG	2	6	129514	129519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083225
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2226	NC_017562	GGCAGT	2	12	129554	129565	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386083225
2227	NC_017562	ACT	2	6	129587	129592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083225
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2229	NC_017562	CTT	2	6	129978	129983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083226
2230	NC_017562	TCA	2	6	130048	130053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083226
2231	NC_017562	CAG	2	6	130214	130219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083226
2232	NC_017562	CACT	2	8	130249	130256	25 %	25 %	0 %	50 %	386083226
2233	NC_017562	CTC	2	6	130266	130271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083226
2234	NC_017562	CAT	2	6	130284	130289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083226
2235	NC_017562	AC	3	6	130301	130306	50 %	0 %	0 %	50 %	386083226
2236	NC_017562	CAT	2	6	130307	130312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083226
2237	NC_017562	GCC	2	6	130371	130376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083226
2238	NC_017562	CTG	3	9	130425	130433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083226
2239	NC_017562	CTGA	2	8	130485	130492	25 %	25 %	25 %	25 %	386083226
2240	NC_017562	ATC	2	6	130540	130545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083226
2241	NC_017562	ACC	2	6	130546	130551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083226
2242	NC_017562	ACC	2	6	130623	130628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083226
2243	NC_017562	TCA	2	6	130705	130710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083226
2244	NC_017562	AAACT	2	10	130723	130732	60 %	20 %	0 %	20 %	386083226
2245	NC_017562	CTG	2	6	130755	130760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083226
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2247	NC_017562	CCA	2	6	130873	130878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083226
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2249	NC_017562	ATC	2	6	130971	130976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083226
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2256	NC_017562	CAC	2	6	131336	131341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083226
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2357	NC_017562	GCT	2	6	136422	136427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083229
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2362	NC_017562	ACA	3	9	136642	136650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083229
2363	NC_017562	AATT	2	8	136795	136802	50 %	50 %	0 %	0 %	386083230
2364	NC_017562	TCA	3	9	136822	136830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083230
2365	NC_017562	CTG	2	6	136913	136918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083230
2366	NC_017562	A	6	6	137025	137030	100 %	0 %	0 %	0 %	386083230
2367	NC_017562	GCA	2	6	137046	137051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083230
2368	NC_017562	ACT	2	6	137113	137118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083230
2369	NC_017562	GCT	2	6	137157	137162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083230
2370	NC_017562	TGA	2	6	137216	137221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083230
2371	NC_017562	AGC	2	6	137282	137287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083230
2372	NC_017562	GCG	2	6	137302	137307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083230
2373	NC_017562	CTC	2	6	137322	137327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083230
2374	NC_017562	ACT	2	6	137455	137460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083230
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2379	NC_017562	CAC	2	6	137691	137696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083231
2380	NC_017562	CAT	2	6	137733	137738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083231
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2382	NC_017562	CG	3	6	137801	137806	0 %	0 %	50 %	50 %	386083231
2383	NC_017562	CAT	2	6	137808	137813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083231
2384	NC_017562	GT	3	6	137819	137824	0 %	50 %	50 %	0 %	386083231
2385	NC_017562	CAA	2	6	137847	137852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083231
2386	NC_017562	GC	3	6	137868	137873	0 %	0 %	50 %	50 %	386083231
2387	NC_017562	ACCA	2	8	137893	137900	50 %	0 %	0 %	50 %	386083231
2388	NC_017562	AAC	2	6	137907	137912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083231
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2392	NC_017562	ATC	2	6	138160	138165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083231
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2395	NC_017562	CTG	2	6	138262	138267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083231
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2399	NC_017562	ACT	2	6	138510	138515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083231
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2401	NC_017562	CGG	2	6	138672	138677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083231
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2406	NC_017562	TGC	2	6	138944	138949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083231
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2409	NC_017562	GCT	2	6	139058	139063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083231
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2435	NC_017562	TGAT	2	8	141184	141191	25 %	50 %	25 %	0 %	386083233
2436	NC_017562	TGC	2	6	141280	141285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083233
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2439	NC_017562	GAAC	2	8	144557	144564	50 %	0 %	25 %	25 %	386083234
2440	NC_017562	TCA	2	6	144649	144654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083234
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2444	NC_017562	CGC	2	6	144870	144875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083234
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2450	NC_017562	GC	3	6	145140	145145	0 %	0 %	50 %	50 %	386083235
2451	NC_017562	CGTTT	2	10	145193	145202	0 %	60 %	20 %	20 %	386083235
2452	NC_017562	GGCG	2	8	145327	145334	0 %	0 %	75 %	25 %	386083235
2453	NC_017562	CTGAT	2	10	145336	145345	20 %	40 %	20 %	20 %	386083235
2454	NC_017562	CGC	2	6	145362	145367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083235
2455	NC_017562	CTGG	3	12	145434	145445	0 %	25 %	50 %	25 %	386083235
2456	NC_017562	GAA	2	6	145464	145469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083235
2457	NC_017562	ACT	2	6	145495	145500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083235
2458	NC_017562	ATC	2	6	145626	145631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083235
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2461	NC_017562	CCGTG	2	10	145850	145859	0 %	20 %	40 %	40 %	386083236
2462	NC_017562	GC	3	6	145930	145935	0 %	0 %	50 %	50 %	386083236
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2466	NC_017562	GGT	2	6	146192	146197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083236
2467	NC_017562	CGCCC	2	10	146249	146258	0 %	0 %	20 %	80 %	386083236
2468	NC_017562	TCA	3	9	146274	146282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083236
2469	NC_017562	GAT	2	6	146288	146293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083236
2470	NC_017562	CAC	2	6	146338	146343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083236
2471	NC_017562	GCA	2	6	146352	146357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083236
2472	NC_017562	CGT	2	6	146360	146365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083236
2473	NC_017562	GC	3	6	146452	146457	0 %	0 %	50 %	50 %	386083236
2474	NC_017562	CTG	2	6	146494	146499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083236
2475	NC_017562	ACGCA	2	10	146505	146514	40 %	0 %	20 %	40 %	386083236
2476	NC_017562	GCA	2	6	146551	146556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083236
2477	NC_017562	CG	3	6	146592	146597	0 %	0 %	50 %	50 %	386083236
2478	NC_017562	CAT	2	6	146602	146607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083236
2479	NC_017562	CTGG	2	8	146628	146635	0 %	25 %	50 %	25 %	386083236
2480	NC_017562	ATG	2	6	146658	146663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083236
2481	NC_017562	GGA	2	6	146700	146705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083236
2482	NC_017562	CAA	2	6	146753	146758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083236
2483	NC_017562	TCG	2	6	146847	146852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083236
2484	NC_017562	GTG	2	6	146913	146918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083236
2485	NC_017562	CGC	2	6	146985	146990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083236
2486	NC_017562	CGAT	2	8	147059	147066	25 %	25 %	25 %	25 %	386083236
2487	NC_017562	CAG	2	6	147122	147127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083236
2488	NC_017562	ACC	2	6	147156	147161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083236
2489	NC_017562	CAC	2	6	147169	147174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083236
2490	NC_017562	GCC	2	6	147258	147263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083236
2491	NC_017562	GCAGC	2	10	147334	147343	20 %	0 %	40 %	40 %	386083236
2492	NC_017562	TCA	2	6	147783	147788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083237
2493	NC_017562	CG	3	6	147997	148002	0 %	0 %	50 %	50 %	386083238
2494	NC_017562	TTG	2	6	148078	148083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083238
2495	NC_017562	GAT	2	6	148112	148117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083238
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2498	NC_017562	GCT	2	6	148369	148374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083238
2499	NC_017562	CGGA	2	8	148403	148410	25 %	0 %	50 %	25 %	386083238
2500	NC_017562	ACC	2	6	148438	148443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083238

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