MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 38757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017562	G	7	7	82980	82986	0 %	0 %	100 %	0 %	386083190
1502	NC_017562	TCA	2	6	83046	83051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083190
1503	NC_017562	CAAT	2	8	83062	83069	50 %	25 %	0 %	25 %	386083190
1504	NC_017562	GCC	2	6	83097	83102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083190
1505	NC_017562	GCGGTT	2	12	83122	83133	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386083190
1506	NC_017562	TGG	2	6	83149	83154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083190
1507	NC_017562	GC	3	6	83228	83233	0 %	0 %	50 %	50 %	386083190
1508	NC_017562	GGA	2	6	83234	83239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083190
1509	NC_017562	GCC	2	6	83383	83388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083191
1510	NC_017562	CGC	2	6	83457	83462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083191
1511	NC_017562	CCG	2	6	83480	83485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083191
1512	NC_017562	CGG	2	6	83562	83567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083191
1513	NC_017562	GCT	2	6	83724	83729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083191
1514	NC_017562	TCA	2	6	83763	83768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083191
1515	NC_017562	AGG	2	6	83789	83794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083191
1516	NC_017562	GAG	2	6	83827	83832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083191
1517	NC_017562	CAG	2	6	83835	83840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083191
1518	NC_017562	GGC	3	9	83857	83865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083191
1519	NC_017562	CGA	2	6	83913	83918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083191
1520	NC_017562	TGT	2	6	83936	83941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083191
1521	NC_017562	CGC	2	6	84019	84024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083191
1522	NC_017562	GCC	2	6	84037	84042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083191
1523	NC_017562	CAG	2	6	84082	84087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083191
1524	NC_017562	CCG	2	6	84090	84095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083191
1525	NC_017562	GAC	2	6	84133	84138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083191
1526	NC_017562	CA	3	6	84255	84260	50 %	0 %	0 %	50 %	386083191
1527	NC_017562	GCGG	2	8	84436	84443	0 %	0 %	75 %	25 %	386083191
1528	NC_017562	CCG	2	6	84467	84472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083191
1529	NC_017562	TG	3	6	84515	84520	0 %	50 %	50 %	0 %	386083191
1530	NC_017562	CAAT	2	8	84581	84588	50 %	25 %	0 %	25 %	386083191
1531	NC_017562	TTC	2	6	84654	84659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083192
1532	NC_017562	GCA	3	9	84848	84856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083192
1533	NC_017562	AGC	2	6	84954	84959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083192
1534	NC_017562	GGA	2	6	84972	84977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083192
1535	NC_017562	CGA	2	6	85043	85048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083192
1536	NC_017562	GCA	2	6	85054	85059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083192
1537	NC_017562	ATGTG	2	10	85060	85069	20 %	40 %	40 %	0 %	386083192
1538	NC_017562	TGG	2	6	85103	85108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083192
1539	NC_017562	TTC	2	6	85152	85157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083192
1540	NC_017562	GCG	2	6	85233	85238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083192
1541	NC_017562	GTC	2	6	85320	85325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083192
1542	NC_017562	CAA	2	6	85335	85340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083192
1543	NC_017562	AGG	2	6	85417	85422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083192
1544	NC_017562	CGG	2	6	85423	85428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083192
1545	NC_017562	T	6	6	85451	85456	0 %	100 %	0 %	0 %	386083192
1546	NC_017562	AGG	2	6	85532	85537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083193
1547	NC_017562	GGCCTG	2	12	85541	85552	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386083193
1548	NC_017562	GCC	2	6	85568	85573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083193
1549	NC_017562	CG	3	6	85593	85598	0 %	0 %	50 %	50 %	386083193
1550	NC_017562	TGG	2	6	85609	85614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083193
1551	NC_017562	GGCC	2	8	85653	85660	0 %	0 %	50 %	50 %	386083193
1552	NC_017562	AGC	2	6	85665	85670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083193
1553	NC_017562	ACG	2	6	85677	85682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083193
1554	NC_017562	AGGC	2	8	85764	85771	25 %	0 %	50 %	25 %	386083193
1555	NC_017562	GGT	2	6	85802	85807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083193
1556	NC_017562	GTT	2	6	85834	85839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083193
1557	NC_017562	CCACG	2	10	86490	86499	20 %	0 %	20 %	60 %	386083194
1558	NC_017562	CG	4	8	86498	86505	0 %	0 %	50 %	50 %	386083194
1559	NC_017562	GAC	2	6	86524	86529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083194
1560	NC_017562	T	6	6	86576	86581	0 %	100 %	0 %	0 %	386083194
1561	NC_017562	CCG	2	6	86609	86614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083194
1562	NC_017562	CATC	2	8	86661	86668	25 %	25 %	0 %	50 %	386083194
1563	NC_017562	ACC	2	6	86672	86677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083194
1564	NC_017562	GCT	2	6	86689	86694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083194
1565	NC_017562	C	6	6	86818	86823	0 %	0 %	0 %	100 %	386083194
1566	NC_017562	TGAT	2	8	86849	86856	25 %	50 %	25 %	0 %	386083194
1567	NC_017562	GTA	2	6	86884	86889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083194
1568	NC_017562	GCA	2	6	86994	86999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083194
1569	NC_017562	TGG	2	6	87066	87071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083194
1570	NC_017562	CAA	2	6	87081	87086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083194
1571	NC_017562	GCCCT	2	10	87127	87136	0 %	20 %	20 %	60 %	386083194
1572	NC_017562	TC	3	6	87146	87151	0 %	50 %	0 %	50 %	386083194
1573	NC_017562	GTT	2	6	87262	87267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083194
1574	NC_017562	GC	3	6	87416	87421	0 %	0 %	50 %	50 %	386083194
1575	NC_017562	CGC	2	6	87423	87428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083194
1576	NC_017562	CGGAA	2	10	87455	87464	40 %	0 %	40 %	20 %	386083194
1577	NC_017562	GC	3	6	87496	87501	0 %	0 %	50 %	50 %	386083194
1578	NC_017562	TCAAA	2	10	87513	87522	60 %	20 %	0 %	20 %	386083194
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1581	NC_017562	GGC	2	6	87767	87772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083194
1582	NC_017562	TCG	2	6	88157	88162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083195
1583	NC_017562	CG	4	8	88161	88168	0 %	0 %	50 %	50 %	386083195
1584	NC_017562	AGG	2	6	88178	88183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083195
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1587	NC_017562	ACC	2	6	88232	88237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083195
1588	NC_017562	CCG	2	6	88323	88328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083195
1589	NC_017562	TCG	2	6	88352	88357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083195
1590	NC_017562	CGA	2	6	88361	88366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083195
1591	NC_017562	GTC	2	6	88399	88404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083195
1592	NC_017562	GGC	2	6	88423	88428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083195
1593	NC_017562	GCG	2	6	88436	88441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083195
1594	NC_017562	CGC	2	6	88446	88451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083195
1595	NC_017562	CATTG	2	10	88498	88507	20 %	40 %	20 %	20 %	386083195
1596	NC_017562	CTGGG	2	10	88523	88532	0 %	20 %	60 %	20 %	386083195
1597	NC_017562	GC	4	8	88619	88626	0 %	0 %	50 %	50 %	386083195
1598	NC_017562	GGC	2	6	88683	88688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083195
1599	NC_017562	GTA	2	6	88723	88728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083195
1600	NC_017562	GCA	2	6	88740	88745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083195
1601	NC_017562	GCCA	2	8	88849	88856	25 %	0 %	25 %	50 %	386083195
1602	NC_017562	GTAT	2	8	88865	88872	25 %	50 %	25 %	0 %	386083195
1603	NC_017562	AAC	2	6	88884	88889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083195
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1606	NC_017562	GCC	3	9	88970	88978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083195
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1608	NC_017562	CCA	2	6	89007	89012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083195
1609	NC_017562	CGT	2	6	89039	89044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083195
1610	NC_017562	CAGG	2	8	89053	89060	25 %	0 %	50 %	25 %	386083195
1611	NC_017562	GCA	2	6	89093	89098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083195
1612	NC_017562	GCA	2	6	89148	89153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083195
1613	NC_017562	GTG	2	6	89154	89159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083195
1614	NC_017562	AAG	2	6	89222	89227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083195
1615	NC_017562	AGT	2	6	89234	89239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083195
1616	NC_017562	GCGGTG	2	12	89240	89251	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386083195
1617	NC_017562	GCC	2	6	89314	89319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083195
1618	NC_017562	GGT	2	6	89356	89361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083195
1619	NC_017562	TGGAA	2	10	89382	89391	40 %	20 %	40 %	0 %	386083195
1620	NC_017562	GC	4	8	89456	89463	0 %	0 %	50 %	50 %	386083196
1621	NC_017562	GTG	2	6	89476	89481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083196
1622	NC_017562	AGC	2	6	89519	89524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083196
1623	NC_017562	GCG	2	6	89538	89543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083196
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1751	NC_017562	CAT	2	6	97624	97629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083202
1752	NC_017562	GATA	2	8	97641	97648	50 %	25 %	25 %	0 %	386083202
1753	NC_017562	GGA	2	6	100575	100580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083203
1754	NC_017562	TGCGGA	2	12	100752	100763	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386083203
1755	NC_017562	GAC	2	6	100984	100989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083203
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1765	NC_017562	GC	4	8	101474	101481	0 %	0 %	50 %	50 %	386083204
1766	NC_017562	ATTG	2	8	101496	101503	25 %	50 %	25 %	0 %	386083204
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1855	NC_017562	ACG	2	6	106812	106817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083208
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1872	NC_017562	CGG	2	6	108133	108138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083208
1873	NC_017562	CCT	2	6	108242	108247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083208
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1987	NC_017562	AATC	2	8	114940	114947	50 %	25 %	0 %	25 %	386083214
1988	NC_017562	GAA	2	6	114960	114965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083214
1989	NC_017562	TCC	2	6	114986	114991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083214
1990	NC_017562	ACA	2	6	115024	115029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083214
1991	NC_017562	CAG	2	6	115037	115042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083214
1992	NC_017562	CAGAA	2	10	115069	115078	60 %	0 %	20 %	20 %	386083214
1993	NC_017562	TGAA	2	8	115173	115180	50 %	25 %	25 %	0 %	386083214
1994	NC_017562	CTG	3	9	115634	115642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083215
1995	NC_017562	GCAC	2	8	115823	115830	25 %	0 %	25 %	50 %	386083215
1996	NC_017562	GGA	2	6	115880	115885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083215
1997	NC_017562	CCG	2	6	115888	115893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083215
1998	NC_017562	GCG	2	6	116109	116114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083215
1999	NC_017562	GAGT	2	8	116136	116143	25 %	25 %	50 %	0 %	386083215
2000	NC_017562	CGAAGG	2	12	116173	116184	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386083215

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