MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 38757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017562	CGA	2	6	31547	31552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083140
502	NC_017562	AAC	2	6	31567	31572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083140
503	NC_017562	CTG	2	6	31581	31586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083140
504	NC_017562	CAAC	2	8	31652	31659	50 %	0 %	0 %	50 %	386083140
505	NC_017562	GTC	2	6	31698	31703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083140
506	NC_017562	ATTG	2	8	31742	31749	25 %	50 %	25 %	0 %	386083140
507	NC_017562	ACCA	2	8	31811	31818	50 %	0 %	0 %	50 %	386083140
508	NC_017562	CAT	2	6	31826	31831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083140
509	NC_017562	CGC	2	6	31958	31963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083140
510	NC_017562	TCG	2	6	31975	31980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083140
511	NC_017562	GTCAAA	2	12	32076	32087	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386083140
512	NC_017562	GCC	2	6	32131	32136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083140
513	NC_017562	GAA	2	6	32142	32147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083140
514	NC_017562	ACC	2	6	32150	32155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083140
515	NC_017562	CAG	2	6	32164	32169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083140
516	NC_017562	A	7	7	32213	32219	100 %	0 %	0 %	0 %	386083140
517	NC_017562	CAA	2	6	33247	33252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083141
518	NC_017562	AGC	2	6	33267	33272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083141
519	NC_017562	ACA	2	6	33330	33335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083141
520	NC_017562	GCA	2	6	33379	33384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083141
521	NC_017562	CCG	2	6	33494	33499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083141
522	NC_017562	CAT	2	6	33504	33509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083141
523	NC_017562	ATC	2	6	33515	33520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083141
524	NC_017562	ACT	2	6	33525	33530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083141
525	NC_017562	TGA	2	6	33774	33779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083141
526	NC_017562	GAA	2	6	33796	33801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083141
527	NC_017562	AC	3	6	33824	33829	50 %	0 %	0 %	50 %	386083141
528	NC_017562	AGA	2	6	33924	33929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083141
529	NC_017562	TGGC	2	8	34042	34049	0 %	25 %	50 %	25 %	386083141
530	NC_017562	CGA	2	6	34077	34082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083141
531	NC_017562	TGA	2	6	34148	34153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083141
532	NC_017562	AAT	2	6	34171	34176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083141
533	NC_017562	GCC	2	6	34183	34188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083141
534	NC_017562	AAC	2	6	34241	34246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083141
535	NC_017562	ACT	2	6	34260	34265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083141
536	NC_017562	CCA	2	6	34276	34281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083141
537	NC_017562	ACA	2	6	34299	34304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083141
538	NC_017562	AGC	2	6	34389	34394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083141
539	NC_017562	CTCCCA	2	12	34441	34452	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386083141
540	NC_017562	AGC	2	6	34491	34496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083141
541	NC_017562	CTG	2	6	34525	34530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083141
542	NC_017562	ATG	3	9	34570	34578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083141
543	NC_017562	CAG	2	6	34587	34592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083141
544	NC_017562	CTG	2	6	34594	34599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083141
545	NC_017562	TG	3	6	34598	34603	0 %	50 %	50 %	0 %	386083141
546	NC_017562	ACC	2	6	34623	34628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083141
547	NC_017562	TTGA	2	8	34696	34703	25 %	50 %	25 %	0 %	386083141
548	NC_017562	GGC	2	6	34709	34714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083141
549	NC_017562	TGG	2	6	34768	34773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083141
550	NC_017562	ACA	2	6	34775	34780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083141
551	NC_017562	TCA	2	6	34823	34828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083141
552	NC_017562	TGC	2	6	34853	34858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083141
553	NC_017562	ACA	2	6	34908	34913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083141
554	NC_017562	CAC	2	6	34981	34986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083141
555	NC_017562	CCA	2	6	35030	35035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083141
556	NC_017562	CAT	2	6	35075	35080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083141
557	NC_017562	CAC	2	6	35087	35092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083141
558	NC_017562	CAG	2	6	35133	35138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083141
559	NC_017562	GCC	2	6	35161	35166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083141
560	NC_017562	GCT	2	6	35338	35343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083142
561	NC_017562	CTG	2	6	35425	35430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083142
562	NC_017562	TGAC	2	8	35531	35538	25 %	25 %	25 %	25 %	386083142
563	NC_017562	GGC	2	6	35596	35601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083142
564	NC_017562	CAG	2	6	35621	35626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083142
565	NC_017562	CA	3	6	35628	35633	50 %	0 %	0 %	50 %	386083142
566	NC_017562	ATT	2	6	35690	35695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386083142
567	NC_017562	AAT	2	6	35894	35899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083142
568	NC_017562	CAA	2	6	36107	36112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083143
569	NC_017562	GAA	2	6	36120	36125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083143
570	NC_017562	TCA	2	6	36133	36138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083143
571	NC_017562	AAGC	2	8	36184	36191	50 %	0 %	25 %	25 %	386083143
572	NC_017562	TC	3	6	36215	36220	0 %	50 %	0 %	50 %	386083143
573	NC_017562	AC	3	6	36262	36267	50 %	0 %	0 %	50 %	386083143
574	NC_017562	GCG	2	6	36271	36276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083143
575	NC_017562	GTC	2	6	36333	36338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083143
576	NC_017562	TGC	2	6	36358	36363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083143
577	NC_017562	ATG	2	6	36385	36390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083143
578	NC_017562	TCT	2	6	36421	36426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083143
579	NC_017562	ATCA	2	8	36450	36457	50 %	25 %	0 %	25 %	386083143
580	NC_017562	CTGG	2	8	36470	36477	0 %	25 %	50 %	25 %	386083143
581	NC_017562	CTT	2	6	36491	36496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083143
582	NC_017562	ACC	2	6	36558	36563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083143
583	NC_017562	ACA	2	6	37353	37358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083144
584	NC_017562	GCG	2	6	37372	37377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083144
585	NC_017562	CCA	2	6	37386	37391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083144
586	NC_017562	ATCA	2	8	37420	37427	50 %	25 %	0 %	25 %	386083144
587	NC_017562	GCA	2	6	37470	37475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083144
588	NC_017562	A	6	6	37481	37486	100 %	0 %	0 %	0 %	386083144
589	NC_017562	CGC	2	6	37495	37500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083144
590	NC_017562	CAAG	2	8	37533	37540	50 %	0 %	25 %	25 %	386083144
591	NC_017562	CCG	2	6	37566	37571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083144
592	NC_017562	ATC	2	6	37657	37662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083144
593	NC_017562	CGC	2	6	37699	37704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083144
594	NC_017562	TCA	2	6	37706	37711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083144
595	NC_017562	CAACGC	2	12	37729	37740	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386083144
596	NC_017562	ATT	2	6	37759	37764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386083144
597	NC_017562	AATGG	2	10	37820	37829	40 %	20 %	40 %	0 %	386083144
598	NC_017562	CT	3	6	37840	37845	0 %	50 %	0 %	50 %	386083144
599	NC_017562	GAA	2	6	37866	37871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083144
600	NC_017562	CGC	2	6	37987	37992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083144
601	NC_017562	TGC	2	6	38000	38005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083144
602	NC_017562	CAC	2	6	38040	38045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083144
603	NC_017562	AGCG	2	8	38081	38088	25 %	0 %	50 %	25 %	386083144
604	NC_017562	AGC	3	9	38396	38404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083145
605	NC_017562	TCGCAC	2	12	38431	38442	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386083145
606	NC_017562	TCC	2	6	38533	38538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083145
607	NC_017562	GCA	2	6	38550	38555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083145
608	NC_017562	ACCT	2	8	38565	38572	25 %	25 %	0 %	50 %	386083145
609	NC_017562	TGC	2	6	38651	38656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083145
610	NC_017562	TCC	2	6	38665	38670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083145
611	NC_017562	ACC	2	6	38700	38705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083145
612	NC_017562	GTG	2	6	38796	38801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083145
613	NC_017562	TCG	2	6	38836	38841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083145
614	NC_017562	GCT	2	6	38912	38917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083145
615	NC_017562	GCTGGC	2	12	38935	38946	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386083145
616	NC_017562	TCA	2	6	38952	38957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083145
617	NC_017562	CA	3	6	39177	39182	50 %	0 %	0 %	50 %	386083146
618	NC_017562	CAA	2	6	39207	39212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083146
619	NC_017562	TAC	2	6	39220	39225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083146
620	NC_017562	TGTC	2	8	39226	39233	0 %	50 %	25 %	25 %	386083146
621	NC_017562	ATCC	2	8	39245	39252	25 %	25 %	0 %	50 %	386083146
622	NC_017562	TAC	2	6	39335	39340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083146
623	NC_017562	AAC	2	6	39524	39529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083146
624	NC_017562	CCG	2	6	39567	39572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083146
625	NC_017562	TGGC	2	8	39642	39649	0 %	25 %	50 %	25 %	386083146
626	NC_017562	AC	3	6	39737	39742	50 %	0 %	0 %	50 %	386083146
627	NC_017562	GCAAC	2	10	39774	39783	40 %	0 %	20 %	40 %	386083146
628	NC_017562	AC	3	6	39881	39886	50 %	0 %	0 %	50 %	386083146
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742	NC_017562	T	6	6	46590	46595	0 %	100 %	0 %	0 %	386083153
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754	NC_017562	CA	3	6	47184	47189	50 %	0 %	0 %	50 %	386083154
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