MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 38757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017562	CGC	2	6	309769	309774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083389
5002	NC_017562	GAA	3	9	309788	309796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083389
5003	NC_017562	CAAG	2	8	309808	309815	50 %	0 %	25 %	25 %	386083389
5004	NC_017562	AGCT	2	8	309829	309836	25 %	25 %	25 %	25 %	386083389
5005	NC_017562	CAT	2	6	309877	309882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083389
5006	NC_017562	GAA	2	6	309920	309925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083389
5007	NC_017562	TGG	2	6	309951	309956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083389
5008	NC_017562	GC	3	6	310027	310032	0 %	0 %	50 %	50 %	386083389
5009	NC_017562	ACA	2	6	310048	310053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083389
5010	NC_017562	A	6	6	310055	310060	100 %	0 %	0 %	0 %	386083389
5011	NC_017562	GTG	2	6	310128	310133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083389
5012	NC_017562	TAC	2	6	310158	310163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083389
5013	NC_017562	GCAG	2	8	310211	310218	25 %	0 %	50 %	25 %	386083389
5014	NC_017562	CCAT	2	8	310219	310226	25 %	25 %	0 %	50 %	386083389
5015	NC_017562	TGG	2	6	310236	310241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083389
5016	NC_017562	CGC	2	6	310297	310302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083389
5017	NC_017562	CGA	2	6	310357	310362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083389
5018	NC_017562	GCA	2	6	310437	310442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083389
5019	NC_017562	A	6	6	310505	310510	100 %	0 %	0 %	0 %	386083389
5020	NC_017562	CCCTG	2	10	310731	310740	0 %	20 %	20 %	60 %	386083390
5021	NC_017562	TCACC	2	10	310749	310758	20 %	20 %	0 %	60 %	386083390
5022	NC_017562	AC	3	6	310770	310775	50 %	0 %	0 %	50 %	386083390
5023	NC_017562	ACCAC	2	10	310805	310814	40 %	0 %	0 %	60 %	386083390
5024	NC_017562	AAC	2	6	311089	311094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083390
5025	NC_017562	GCG	2	6	311118	311123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083390
5026	NC_017562	CAA	2	6	311253	311258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083390
5027	NC_017562	CCG	2	6	311340	311345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083390
5028	NC_017562	CGAC	2	8	311373	311380	25 %	0 %	25 %	50 %	386083390
5029	NC_017562	A	6	6	311387	311392	100 %	0 %	0 %	0 %	386083390
5030	NC_017562	CCG	2	6	311412	311417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083390
5031	NC_017562	ACG	2	6	311424	311429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083390
5032	NC_017562	CAG	2	6	311439	311444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083390
5033	NC_017562	AC	3	6	311496	311501	50 %	0 %	0 %	50 %	386083390
5034	NC_017562	CGC	2	6	311512	311517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083390
5035	NC_017562	CAT	2	6	311605	311610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083390
5036	NC_017562	GCC	2	6	311681	311686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083390
5037	NC_017562	GCA	2	6	311687	311692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083390
5038	NC_017562	CGC	2	6	311710	311715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083390
5039	NC_017562	ATCACG	2	12	311722	311733	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386083390
5040	NC_017562	ATA	2	6	311743	311748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083390
5041	NC_017562	CA	3	6	311818	311823	50 %	0 %	0 %	50 %	386083390
5042	NC_017562	CAC	2	6	311881	311886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083390
5043	NC_017562	GTGCG	2	10	312012	312021	0 %	20 %	60 %	20 %	386083390
5044	NC_017562	CCA	2	6	312030	312035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083390
5045	NC_017562	GACC	2	8	312038	312045	25 %	0 %	25 %	50 %	386083390
5046	NC_017562	CAG	2	6	312048	312053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083390
5047	NC_017562	CTG	3	9	312103	312111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083390
5048	NC_017562	CTG	2	6	312115	312120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083390
5049	NC_017562	ACA	2	6	312213	312218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083390
5050	NC_017562	TCA	2	6	312242	312247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083390
5051	NC_017562	ACA	2	6	312290	312295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083390
5052	NC_017562	ACC	2	6	312418	312423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083390
5053	NC_017562	GC	3	6	312526	312531	0 %	0 %	50 %	50 %	386083390
5054	NC_017562	CTG	2	6	312643	312648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083390
5055	NC_017562	GCT	2	6	312649	312654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083390
5056	NC_017562	CAC	2	6	312691	312696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083390
5057	NC_017562	ACC	2	6	312769	312774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083390
5058	NC_017562	TAA	2	6	312861	312866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083390
5059	NC_017562	GCCA	2	8	312986	312993	25 %	0 %	25 %	50 %	386083390
5060	NC_017562	AAGT	2	8	313001	313008	50 %	25 %	25 %	0 %	386083390
5061	NC_017562	CGA	2	6	313040	313045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083390
5062	NC_017562	CCAT	2	8	313046	313053	25 %	25 %	0 %	50 %	386083390
5063	NC_017562	CAC	2	6	313110	313115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083390
5064	NC_017562	CTG	2	6	313153	313158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083390
5065	NC_017562	ACT	2	6	313168	313173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083390
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5067	NC_017562	CCA	2	6	313319	313324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083390
5068	NC_017562	TATCCG	2	12	313374	313385	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386083390
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5070	NC_017562	CAC	2	6	313482	313487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083390
5071	NC_017562	TGGC	2	8	313518	313525	0 %	25 %	50 %	25 %	386083390
5072	NC_017562	AAGA	2	8	313541	313548	75 %	0 %	25 %	0 %	386083390
5073	NC_017562	CGG	2	6	313586	313591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083390
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5080	NC_017562	CGT	2	6	314686	314691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083391
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5089	NC_017562	TGC	2	6	314924	314929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083391
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5091	NC_017562	TGT	2	6	315009	315014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083391
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5103	NC_017562	CAG	2	6	315292	315297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083391
5104	NC_017562	AAC	2	6	315332	315337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083391
5105	NC_017562	CAA	2	6	315346	315351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083391
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5107	NC_017562	AAATCG	2	12	315410	315421	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386083391
5108	NC_017562	GAA	2	6	315460	315465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083391
5109	NC_017562	ACCCA	2	10	315500	315509	40 %	0 %	0 %	60 %	386083391
5110	NC_017562	AAG	2	6	315513	315518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083391
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5112	NC_017562	CTG	2	6	315630	315635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083392
5113	NC_017562	CAC	2	6	315654	315659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083392
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5121	NC_017562	CTG	2	6	316218	316223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083392
5122	NC_017562	GCT	3	9	316238	316246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083392
5123	NC_017562	CGT	2	6	316335	316340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083392
5124	NC_017562	GT	3	6	316397	316402	0 %	50 %	50 %	0 %	386083392
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5232	NC_017562	GACT	2	8	322711	322718	25 %	25 %	25 %	25 %	386083398
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5239	NC_017562	CCCAAA	2	12	322909	322920	50 %	0 %	0 %	50 %	386083398
5240	NC_017562	AC	3	6	322929	322934	50 %	0 %	0 %	50 %	386083398
5241	NC_017562	ACA	2	6	322939	322944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083398
5242	NC_017562	CCACG	2	10	322999	323008	20 %	0 %	20 %	60 %	386083398
5243	NC_017562	CCAA	2	8	323056	323063	50 %	0 %	0 %	50 %	386083398
5244	NC_017562	ACA	2	6	323064	323069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083398
5245	NC_017562	CAC	3	9	323156	323164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083398
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5248	NC_017562	C	6	6	323531	323536	0 %	0 %	0 %	100 %	386083399
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5353	NC_017562	ACGC	2	8	328795	328802	25 %	0 %	25 %	50 %	386083406
5354	NC_017562	TCC	2	6	328825	328830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083406
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5359	NC_017562	ACA	2	6	329007	329012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083406
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5362	NC_017562	CTG	2	6	329177	329182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083407
5363	NC_017562	CTG	2	6	329189	329194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083407
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5365	NC_017562	GCC	2	6	329261	329266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083407
5366	NC_017562	ACCC	2	8	329374	329381	25 %	0 %	0 %	75 %	386083407
5367	NC_017562	CCG	2	6	329394	329399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083407
5368	NC_017562	CCT	2	6	329422	329427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083407
5369	NC_017562	CCTG	2	8	329587	329594	0 %	25 %	25 %	50 %	386083407
5370	NC_017562	TGC	2	6	329625	329630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083407
5371	NC_017562	C	7	7	329654	329660	0 %	0 %	0 %	100 %	386083407
5372	NC_017562	CTG	2	6	329717	329722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083407
5373	NC_017562	AGCC	2	8	329736	329743	25 %	0 %	25 %	50 %	386083407
5374	NC_017562	CTG	2	6	329786	329791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083407
5375	NC_017562	TGG	2	6	329816	329821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083407
5376	NC_017562	TGG	2	6	329849	329854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083407
5377	NC_017562	ATTC	2	8	329912	329919	25 %	50 %	0 %	25 %	386083407
5378	NC_017562	TGC	2	6	330049	330054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083407
5379	NC_017562	CTG	2	6	330080	330085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083407
5380	NC_017562	GGC	2	6	330104	330109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083407
5381	NC_017562	CTG	3	9	330113	330121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083407
5382	NC_017562	CAA	2	6	330167	330172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083407
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5384	NC_017562	CTG	2	6	330269	330274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083407
5385	NC_017562	GCACTG	2	12	330281	330292	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386083407
5386	NC_017562	CTG	2	6	330338	330343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083407
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5388	NC_017562	CTGG	2	8	330464	330471	0 %	25 %	50 %	25 %	386083407
5389	NC_017562	CCACA	2	10	330477	330486	40 %	0 %	0 %	60 %	386083407
5390	NC_017562	GCA	2	6	330521	330526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083407
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5393	NC_017562	GAC	2	6	330829	330834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083407
5394	NC_017562	CGC	2	6	330842	330847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083407
5395	NC_017562	GGC	2	6	330857	330862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083407
5396	NC_017562	CAC	2	6	330868	330873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083407
5397	NC_017562	CATC	2	8	330883	330890	25 %	25 %	0 %	50 %	386083407
5398	NC_017562	CTGG	2	8	330988	330995	0 %	25 %	50 %	25 %	386083407
5399	NC_017562	GCA	2	6	330998	331003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083407
5400	NC_017562	GGGC	2	8	331015	331022	0 %	0 %	75 %	25 %	386083407
5401	NC_017562	GCT	3	9	331028	331036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083407
5402	NC_017562	CCA	2	6	331051	331056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083407
5403	NC_017562	CGC	2	6	331086	331091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083407
5404	NC_017562	CTGATC	2	12	331131	331142	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386083408
5405	NC_017562	ACT	2	6	331199	331204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083408
5406	NC_017562	CTG	2	6	331236	331241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083408
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5414	NC_017562	CAG	2	6	331575	331580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083408
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5422	NC_017562	TAC	2	6	332007	332012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083409
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5431	NC_017562	ACCAA	2	10	332490	332499	60 %	0 %	0 %	40 %	386083410
5432	NC_017562	CCT	2	6	332523	332528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083410
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5436	NC_017562	CGT	2	6	332646	332651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083410
5437	NC_017562	CCGC	2	8	332663	332670	0 %	0 %	25 %	75 %	386083410
5438	NC_017562	AGCAC	2	10	332694	332703	40 %	0 %	20 %	40 %	386083410
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5442	NC_017562	AGC	3	9	332939	332947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083411
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5444	NC_017562	CA	3	6	332970	332975	50 %	0 %	0 %	50 %	386083411
5445	NC_017562	CAC	2	6	332977	332982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083411
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5449	NC_017562	CCA	2	6	333363	333368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083412
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5453	NC_017562	G	6	6	333735	333740	0 %	0 %	100 %	0 %	386083412
5454	NC_017562	CTG	2	6	333760	333765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083412
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5457	NC_017562	ACG	2	6	333896	333901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083412
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5459	NC_017562	ACCAA	2	10	334013	334022	60 %	0 %	0 %	40 %	386083412
5460	NC_017562	AC	3	6	334025	334030	50 %	0 %	0 %	50 %	386083412
5461	NC_017562	ACT	2	6	334058	334063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083412
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5465	NC_017562	CAA	3	9	334255	334263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083412
5466	NC_017562	AC	3	6	334291	334296	50 %	0 %	0 %	50 %	386083412
5467	NC_017562	ATG	2	6	334331	334336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083412
5468	NC_017562	C	6	6	334400	334405	0 %	0 %	0 %	100 %	386083412
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5470	NC_017562	GACCG	2	10	334854	334863	20 %	0 %	40 %	40 %	386083413
5471	NC_017562	CTGC	2	8	334883	334890	0 %	25 %	25 %	50 %	386083413
5472	NC_017562	CTG	2	6	334909	334914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083413
5473	NC_017562	A	6	6	334936	334941	100 %	0 %	0 %	0 %	386083413
5474	NC_017562	ACG	2	6	334951	334956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083413
5475	NC_017562	ATT	2	6	334983	334988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386083413
5476	NC_017562	AGC	2	6	335014	335019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083413
5477	NC_017562	GCA	2	6	335063	335068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083413
5478	NC_017562	GAC	2	6	335144	335149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083413
5479	NC_017562	GCAT	2	8	335150	335157	25 %	25 %	25 %	25 %	386083413
5480	NC_017562	AAG	2	6	335341	335346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083413
5481	NC_017562	AGC	2	6	335425	335430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083413
5482	NC_017562	GGATGC	2	12	335573	335584	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386083413
5483	NC_017562	CCA	2	6	335745	335750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083413
5484	NC_017562	CCCA	2	8	335814	335821	25 %	0 %	0 %	75 %	386083413
5485	NC_017562	GGT	2	6	335835	335840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083413
5486	NC_017562	CGG	2	6	336056	336061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083413
5487	NC_017562	ATC	2	6	336066	336071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083413
5488	NC_017562	GC	3	6	336159	336164	0 %	0 %	50 %	50 %	386083413
5489	NC_017562	AC	3	6	336177	336182	50 %	0 %	0 %	50 %	386083413
5490	NC_017562	GTAG	2	8	336187	336194	25 %	25 %	50 %	0 %	386083413
5491	NC_017562	TGA	2	6	336252	336257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083413
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