MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas albilineans GPE PC73 plasmid plasmII

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017556	GCCG	2	8	225	232	0 %	0 %	50 %	50 %	386081562
2	NC_017556	ACCT	2	8	1368	1375	25 %	25 %	0 %	50 %	386081562
3	NC_017556	GTCG	2	8	1463	1470	0 %	25 %	50 %	25 %	386081562
4	NC_017556	GTCC	2	8	1594	1601	0 %	25 %	25 %	50 %	386081562
5	NC_017556	CCAT	2	8	2153	2160	25 %	25 %	0 %	50 %	386081563
6	NC_017556	AGCG	2	8	2770	2777	25 %	0 %	50 %	25 %	386081564
7	NC_017556	TTGG	2	8	2785	2792	0 %	50 %	50 %	0 %	386081564
8	NC_017556	AGCG	2	8	3025	3032	25 %	0 %	50 %	25 %	386081564
9	NC_017556	GATC	2	8	3348	3355	25 %	25 %	25 %	25 %	386081565
10	NC_017556	GCTG	2	8	3612	3619	0 %	25 %	50 %	25 %	386081565
11	NC_017556	AAGG	2	8	5074	5081	50 %	0 %	50 %	0 %	386081566
12	NC_017556	TCGC	3	12	8133	8144	0 %	25 %	25 %	50 %	386081571
13	NC_017556	CGTA	2	8	9709	9716	25 %	25 %	25 %	25 %	386081573
14	NC_017556	TGTT	2	8	9842	9849	0 %	75 %	25 %	0 %	386081573
15	NC_017556	TTTC	2	8	10219	10226	0 %	75 %	0 %	25 %	386081574
16	NC_017556	GGTC	2	8	10421	10428	0 %	25 %	50 %	25 %	386081574
17	NC_017556	GGCA	2	8	10775	10782	25 %	0 %	50 %	25 %	386081575
18	NC_017556	CAGC	2	8	11446	11453	25 %	0 %	25 %	50 %	386081576
19	NC_017556	CATC	2	8	11587	11594	25 %	25 %	0 %	50 %	386081576
20	NC_017556	ATCG	2	8	12631	12638	25 %	25 %	25 %	25 %	386081578
21	NC_017556	ACCA	2	8	13066	13073	50 %	0 %	0 %	50 %	386081578
22	NC_017556	CTGG	2	8	13230	13237	0 %	25 %	50 %	25 %	386081578
23	NC_017556	CGGC	2	8	13362	13369	0 %	0 %	50 %	50 %	386081578
24	NC_017556	CGGT	2	8	13562	13569	0 %	25 %	50 %	25 %	386081578
25	NC_017556	GCAC	2	8	13670	13677	25 %	0 %	25 %	50 %	386081578
26	NC_017556	CTCG	2	8	14989	14996	0 %	25 %	25 %	50 %	386081579
27	NC_017556	AGGC	2	8	15733	15740	25 %	0 %	50 %	25 %	386081579
28	NC_017556	TCGG	2	8	18403	18410	0 %	25 %	50 %	25 %	386081583
29	NC_017556	ACCT	2	8	18753	18760	25 %	25 %	0 %	50 %	386081583
30	NC_017556	TCGA	2	8	19102	19109	25 %	25 %	25 %	25 %	386081583
31	NC_017556	GCCG	2	8	19865	19872	0 %	0 %	50 %	50 %	386081584
32	NC_017556	ACCC	2	8	20236	20243	25 %	0 %	0 %	75 %	386081584
33	NC_017556	ACCA	2	8	20421	20428	50 %	0 %	0 %	50 %	386081585
34	NC_017556	CTTT	2	8	20482	20489	0 %	75 %	0 %	25 %	386081585
35	NC_017556	CGCA	2	8	20700	20707	25 %	0 %	25 %	50 %	386081585
36	NC_017556	CTTC	2	8	20894	20901	0 %	50 %	0 %	50 %	386081585
37	NC_017556	CGTG	2	8	20963	20970	0 %	25 %	50 %	25 %	386081585
38	NC_017556	AGCA	2	8	21120	21127	50 %	0 %	25 %	25 %	386081585
39	NC_017556	GCTC	2	8	21312	21319	0 %	25 %	25 %	50 %	386081586
40	NC_017556	CGAC	2	8	21735	21742	25 %	0 %	25 %	50 %	386081586
41	NC_017556	GTCA	2	8	22180	22187	25 %	25 %	25 %	25 %	386081587
42	NC_017556	TGCT	2	8	22898	22905	0 %	50 %	25 %	25 %	386081587
43	NC_017556	AACG	2	8	23042	23049	50 %	0 %	25 %	25 %	386081587
44	NC_017556	TGCC	2	8	24502	24509	0 %	25 %	25 %	50 %	386081590
45	NC_017556	TCTT	2	8	24831	24838	0 %	75 %	0 %	25 %	386081590
46	NC_017556	CGGT	2	8	24840	24847	0 %	25 %	50 %	25 %	386081590
47	NC_017556	AGCC	2	8	25092	25099	25 %	0 %	25 %	50 %	386081590
48	NC_017556	CAGC	2	8	25312	25319	25 %	0 %	25 %	50 %	386081590
49	NC_017556	GCTC	2	8	25393	25400	0 %	25 %	25 %	50 %	386081590
50	NC_017556	CCGG	2	8	25750	25757	0 %	0 %	50 %	50 %	386081590
51	NC_017556	AGGT	2	8	26247	26254	25 %	25 %	50 %	0 %	386081590
52	NC_017556	TGCG	2	8	26877	26884	0 %	25 %	50 %	25 %	386081590
53	NC_017556	GACG	2	8	27454	27461	25 %	0 %	50 %	25 %	386081592
54	NC_017556	GCTG	2	8	27521	27528	0 %	25 %	50 %	25 %	386081592
55	NC_017556	ATGG	2	8	27557	27564	25 %	25 %	50 %	0 %	386081592
56	NC_017556	TGGC	2	8	28111	28118	0 %	25 %	50 %	25 %	386081594
57	NC_017556	TTGC	2	8	28122	28129	0 %	50 %	25 %	25 %	386081594
58	NC_017556	GCAA	2	8	28194	28201	50 %	0 %	25 %	25 %	386081594
59	NC_017556	GTGG	2	8	28582	28589	0 %	25 %	75 %	0 %	386081594
60	NC_017556	TGGG	2	8	28960	28967	0 %	25 %	75 %	0 %	386081595
61	NC_017556	CGCT	2	8	29811	29818	0 %	25 %	25 %	50 %	386081596
62	NC_017556	TGGC	2	8	30632	30639	0 %	25 %	50 %	25 %	386081597
63	NC_017556	AGGC	2	8	30931	30938	25 %	0 %	50 %	25 %	386081598
64	NC_017556	TACC	2	8	31251	31258	25 %	25 %	0 %	50 %	386081599

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.