MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas albilineans GPE PC73 plasmid plasmIII

Total Repeats: 367

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017555	GAA	2	6	5	10	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076360
2	NC_017555	ACA	2	6	61	66	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076360
3	NC_017555	CGA	2	6	116	121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076360
4	NC_017555	GGC	2	6	146	151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076360
5	NC_017555	GAC	2	6	282	287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076360
6	NC_017555	GCT	2	6	302	307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076360
7	NC_017555	GTC	2	6	396	401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076360
8	NC_017555	CGG	2	6	701	706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076360
9	NC_017555	GAT	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076360
10	NC_017555	GAT	2	6	829	834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076361
11	NC_017555	TGG	2	6	858	863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076361
12	NC_017555	ATC	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076361
13	NC_017555	GAA	2	6	1017	1022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
14	NC_017555	GAT	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076361
15	NC_017555	CAT	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076361
16	NC_017555	GCG	2	6	1056	1061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076361
17	NC_017555	GAA	2	6	1086	1091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
18	NC_017555	GAC	2	6	1177	1182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076361
19	NC_017555	GAA	2	6	1236	1241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
20	NC_017555	TTC	2	6	1392	1397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076361
21	NC_017555	GAA	2	6	1426	1431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
22	NC_017555	AAC	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076361
23	NC_017555	AGC	2	6	1505	1510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076361
24	NC_017555	CAA	2	6	1539	1544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076361
25	NC_017555	GGT	2	6	1579	1584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076361
26	NC_017555	GGT	2	6	1686	1691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076361
27	NC_017555	AAG	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
28	NC_017555	GTC	2	6	1717	1722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076361
29	NC_017555	CGA	2	6	1742	1747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076361
30	NC_017555	TCC	2	6	2327	2332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076362
31	NC_017555	CTT	2	6	2347	2352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076362
32	NC_017555	AGC	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076362
33	NC_017555	AGC	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076362
34	NC_017555	TTG	2	6	2556	2561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076362
35	NC_017555	TCG	2	6	2700	2705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076362
36	NC_017555	CAG	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076362
37	NC_017555	GTC	2	6	2861	2866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076362
38	NC_017555	GCT	2	6	3250	3255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076363
39	NC_017555	ATC	2	6	3292	3297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076363
40	NC_017555	GGC	2	6	3942	3947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076364
41	NC_017555	GGC	2	6	4114	4119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076364
42	NC_017555	GAA	2	6	4136	4141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076364
43	NC_017555	ATG	2	6	4163	4168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076364
44	NC_017555	GAA	2	6	4384	4389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076364
45	NC_017555	GTC	2	6	4480	4485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076364
46	NC_017555	TCG	2	6	4516	4521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076364
47	NC_017555	TCG	2	6	4534	4539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076364
48	NC_017555	GCT	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076364
49	NC_017555	GCG	2	6	4678	4683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076364
50	NC_017555	CAG	2	6	4703	4708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076364
51	NC_017555	GCA	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076365
52	NC_017555	GCG	2	6	4937	4942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
53	NC_017555	GCG	2	6	4994	4999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
54	NC_017555	GCT	2	6	5046	5051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
55	NC_017555	TGG	2	6	5054	5059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076365
56	NC_017555	GCT	2	6	5069	5074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
57	NC_017555	CGT	2	6	5112	5117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
58	NC_017555	CGG	3	9	5124	5132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
59	NC_017555	GCG	2	6	5183	5188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
60	NC_017555	GCG	2	6	5258	5263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
61	NC_017555	GCT	2	6	5385	5390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
62	NC_017555	GCC	2	6	5468	5473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076365
63	NC_017555	CGG	2	6	5499	5504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
64	NC_017555	CTT	2	6	5508	5513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076365
65	NC_017555	GCT	2	6	5566	5571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
66	NC_017555	GCC	3	9	5611	5619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076365
67	NC_017555	GAT	2	6	5686	5691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076365
68	NC_017555	CGA	2	6	5977	5982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076366
69	NC_017555	ACG	2	6	6233	6238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076366
70	NC_017555	GAT	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076366
71	NC_017555	TGC	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076366
72	NC_017555	CGA	2	6	6501	6506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076366
73	NC_017555	TGA	2	6	6591	6596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076367
74	NC_017555	CGA	2	6	6652	6657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076367
75	NC_017555	GAT	2	6	6773	6778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076367
76	NC_017555	GCG	2	6	6848	6853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076367
77	NC_017555	TGC	2	6	6915	6920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076367
78	NC_017555	AGC	2	6	6967	6972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076367
79	NC_017555	AGC	3	9	7343	7351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076368
80	NC_017555	CGC	2	6	7461	7466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076368
81	NC_017555	CAA	2	6	7474	7479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076368
82	NC_017555	CGG	2	6	7494	7499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076368
83	NC_017555	ACA	2	6	7514	7519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076368
84	NC_017555	CGG	2	6	7548	7553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076368
85	NC_017555	GCA	2	6	7587	7592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076368
86	NC_017555	AGT	2	6	7649	7654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076368
87	NC_017555	TCA	2	6	7679	7684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076368
88	NC_017555	CAA	2	6	7689	7694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076368
89	NC_017555	GCA	2	6	7750	7755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076369
90	NC_017555	TTC	2	6	7785	7790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076369
91	NC_017555	TCT	2	6	7910	7915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076369
92	NC_017555	TGC	2	6	7936	7941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076369
93	NC_017555	TCA	2	6	8088	8093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076370
94	NC_017555	CCG	2	6	8164	8169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076370
95	NC_017555	CCA	2	6	8230	8235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386076370
96	NC_017555	GAA	2	6	8252	8257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076370
97	NC_017555	AGC	2	6	8456	8461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076371
98	NC_017555	CTG	2	6	8474	8479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076371
99	NC_017555	CGC	3	9	8489	8497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076371
100	NC_017555	AGC	2	6	8507	8512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076371
101	NC_017555	TTG	2	6	8542	8547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076371
102	NC_017555	CAA	2	6	8548	8553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076371
103	NC_017555	GAG	2	6	8602	8607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076371
104	NC_017555	ACA	2	6	8772	8777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076371
105	NC_017555	AGC	2	6	9011	9016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076372
106	NC_017555	TCG	2	6	9047	9052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076372
107	NC_017555	AGT	2	6	9072	9077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076372
108	NC_017555	GGA	2	6	9288	9293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076373
109	NC_017555	ATC	2	6	9334	9339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076373
110	NC_017555	GTA	2	6	9490	9495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076373
111	NC_017555	GAG	2	6	9547	9552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076373
112	NC_017555	GCT	2	6	9584	9589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076373
113	NC_017555	TTC	2	6	9670	9675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076373
114	NC_017555	GCG	2	6	9719	9724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076373
115	NC_017555	GCG	2	6	9748	9753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076373
116	NC_017555	CGG	2	6	9792	9797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076374
117	NC_017555	CGA	2	6	9902	9907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076374
118	NC_017555	TCC	2	6	9940	9945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076374
119	NC_017555	TGC	2	6	10172	10177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076374
120	NC_017555	CGC	2	6	10265	10270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076374
121	NC_017555	GTA	2	6	10290	10295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076374
122	NC_017555	CTT	2	6	10305	10310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076374
123	NC_017555	AGC	2	6	10345	10350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076374
124	NC_017555	CGG	3	9	10385	10393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076374
125	NC_017555	TGG	2	6	10399	10404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076374
126	NC_017555	GCT	2	6	10483	10488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076374
127	NC_017555	TGC	2	6	10508	10513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076374
128	NC_017555	TTC	2	6	10539	10544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076374
129	NC_017555	GCC	2	6	10563	10568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076374
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.