MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 3735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017271	ACCAC	2	10	1423	1432	40 %	0 %	0 %	60 %	384425692
2	NC_017271	CCGCG	2	10	7407	7416	0 %	0 %	40 %	60 %	384425695
3	NC_017271	ACGCC	2	10	20432	20441	20 %	0 %	20 %	60 %	384425710
4	NC_017271	CCGCG	2	10	21781	21790	0 %	0 %	40 %	60 %	384425712
5	NC_017271	CGGTG	2	10	22160	22169	0 %	20 %	60 %	20 %	384425712
6	NC_017271	CGGCC	2	10	22319	22328	0 %	0 %	40 %	60 %	384425712
7	NC_017271	CCTGC	2	10	22835	22844	0 %	20 %	20 %	60 %	384425714
8	NC_017271	GTTGC	2	10	23794	23803	0 %	40 %	40 %	20 %	384425715
9	NC_017271	TCGGC	2	10	24764	24773	0 %	20 %	40 %	40 %	384425717
10	NC_017271	TGCGC	2	10	27226	27235	0 %	20 %	40 %	40 %	384425718
11	NC_017271	CGGGT	2	10	27699	27708	0 %	20 %	60 %	20 %	384425718
12	NC_017271	CGGGC	2	10	28765	28774	0 %	0 %	60 %	40 %	384425721
13	NC_017271	CCAGC	2	10	31681	31690	20 %	0 %	20 %	60 %	384425724
14	NC_017271	CTTGC	2	10	33247	33256	0 %	40 %	20 %	40 %	384425725
15	NC_017271	CGCAG	2	10	34023	34032	20 %	0 %	40 %	40 %	384425725
16	NC_017271	CGGCG	2	10	34695	34704	0 %	0 %	60 %	40 %	384425727
17	NC_017271	CCAGC	2	10	34813	34822	20 %	0 %	20 %	60 %	384425727
18	NC_017271	GTGAC	2	10	36285	36294	20 %	20 %	40 %	20 %	384425728
19	NC_017271	TGCGC	2	10	36706	36715	0 %	20 %	40 %	40 %	384425728
20	NC_017271	CTGGT	2	10	38845	38854	0 %	40 %	40 %	20 %	384425731
21	NC_017271	AGGCC	2	10	40563	40572	20 %	0 %	40 %	40 %	384425733
22	NC_017271	CGCAG	2	10	42813	42822	20 %	0 %	40 %	40 %	384425733
23	NC_017271	CGCTG	2	10	44121	44130	0 %	20 %	40 %	40 %	384425733
24	NC_017271	CGGCG	2	10	44244	44253	0 %	0 %	60 %	40 %	384425733
25	NC_017271	CAGCG	2	10	44629	44638	20 %	0 %	40 %	40 %	384425733
26	NC_017271	CGGCG	2	10	45196	45205	0 %	0 %	60 %	40 %	384425734
27	NC_017271	CAGGC	2	10	45323	45332	20 %	0 %	40 %	40 %	384425734
28	NC_017271	GGTGA	2	10	48432	48441	20 %	20 %	60 %	0 %	384425738
29	NC_017271	AGTGG	2	10	49594	49603	20 %	20 %	60 %	0 %	384425739
30	NC_017271	GCTCG	2	10	50017	50026	0 %	20 %	40 %	40 %	384425739
31	NC_017271	AGGCG	2	10	53466	53475	20 %	0 %	60 %	20 %	384425744
32	NC_017271	ACCGC	2	10	54532	54541	20 %	0 %	20 %	60 %	384425745
33	NC_017271	GCGCA	2	10	55003	55012	20 %	0 %	40 %	40 %	384425746
34	NC_017271	CGTGG	2	10	55792	55801	0 %	20 %	60 %	20 %	384425747
35	NC_017271	GCGCC	2	10	56735	56744	0 %	0 %	40 %	60 %	384425748
36	NC_017271	GTGGC	2	10	56751	56760	0 %	20 %	60 %	20 %	384425748
37	NC_017271	GCACG	2	10	58649	58658	20 %	0 %	40 %	40 %	384425750
38	NC_017271	GCCGC	2	10	60744	60753	0 %	0 %	40 %	60 %	384425752
39	NC_017271	CCGCG	2	10	60860	60869	0 %	0 %	40 %	60 %	384425752
40	NC_017271	CGCCA	2	10	63664	63673	20 %	0 %	20 %	60 %	384425754
41	NC_017271	GCGGG	2	10	69583	69592	0 %	0 %	80 %	20 %	384425759
42	NC_017271	CGGCG	2	10	69799	69808	0 %	0 %	60 %	40 %	384425759
43	NC_017271	CCAGG	2	10	72523	72532	20 %	0 %	40 %	40 %	384425762
44	NC_017271	TCTTG	2	10	73251	73260	0 %	60 %	20 %	20 %	384425763
45	NC_017271	CGGGT	2	10	74700	74709	0 %	20 %	60 %	20 %	384425764
46	NC_017271	CGCGG	2	10	77100	77109	0 %	0 %	60 %	40 %	384425767
47	NC_017271	GCTTG	2	10	80472	80481	0 %	40 %	40 %	20 %	384425768
48	NC_017271	GGCGC	2	10	83212	83221	0 %	0 %	60 %	40 %	384425771
49	NC_017271	CGGCG	2	10	83682	83691	0 %	0 %	60 %	40 %	384425771
50	NC_017271	TGGTC	2	10	84351	84360	0 %	40 %	40 %	20 %	384425771
51	NC_017271	AGCGC	2	10	89381	89390	20 %	0 %	40 %	40 %	384425776
52	NC_017271	GCGGG	2	10	90415	90424	0 %	0 %	80 %	20 %	384425778
53	NC_017271	GCCAC	2	10	90534	90543	20 %	0 %	20 %	60 %	384425778
54	NC_017271	CGGCG	2	10	91632	91641	0 %	0 %	60 %	40 %	384425779
55	NC_017271	GTCCA	2	10	91982	91991	20 %	20 %	20 %	40 %	384425780
56	NC_017271	ACCAC	2	10	92211	92220	40 %	0 %	0 %	60 %	384425780
57	NC_017271	CGGTG	2	10	93696	93705	0 %	20 %	60 %	20 %	384425782
58	NC_017271	ATGGC	2	10	93767	93776	20 %	20 %	40 %	20 %	384425782
59	NC_017271	GGTGG	2	10	94018	94027	0 %	20 %	80 %	0 %	384425782
60	NC_017271	TGCGC	2	10	94696	94705	0 %	20 %	40 %	40 %	384425783
61	NC_017271	CTGCG	2	10	95537	95546	0 %	20 %	40 %	40 %	384425784
62	NC_017271	CCGCA	2	10	96230	96239	20 %	0 %	20 %	60 %	384425785
63	NC_017271	CCGAC	2	10	96337	96346	20 %	0 %	20 %	60 %	384425785
64	NC_017271	GCAAT	2	10	97754	97763	40 %	20 %	20 %	20 %	384425787
65	NC_017271	TGCCC	2	10	99180	99189	0 %	20 %	20 %	60 %	384425788
66	NC_017271	TCCAG	2	10	99450	99459	20 %	20 %	20 %	40 %	384425788
67	NC_017271	CGCAG	2	10	99771	99780	20 %	0 %	40 %	40 %	384425789
68	NC_017271	CGATG	2	10	101246	101255	20 %	20 %	40 %	20 %	384425790
69	NC_017271	CTGTC	2	10	101463	101472	0 %	40 %	20 %	40 %	384425791
70	NC_017271	CAGGG	2	10	103224	103233	20 %	0 %	60 %	20 %	384425791
71	NC_017271	GCGCG	2	10	103925	103934	0 %	0 %	60 %	40 %	384425792
72	NC_017271	GCGGG	2	10	104534	104543	0 %	0 %	80 %	20 %	384425792
73	NC_017271	CGCGG	2	10	105667	105676	0 %	0 %	60 %	40 %	384425793
74	NC_017271	AGCGC	2	10	106201	106210	20 %	0 %	40 %	40 %	384425793
75	NC_017271	CGCAG	2	10	106719	106728	20 %	0 %	40 %	40 %	384425793
76	NC_017271	GCGCC	2	10	106754	106763	0 %	0 %	40 %	60 %	384425793
77	NC_017271	GCGCA	2	10	107700	107709	20 %	0 %	40 %	40 %	384425794
78	NC_017271	ACGGC	2	10	107904	107913	20 %	0 %	40 %	40 %	384425795
79	NC_017271	AGCCC	2	10	112275	112284	20 %	0 %	20 %	60 %	384425798
80	NC_017271	GGTGC	2	10	119569	119578	0 %	20 %	60 %	20 %	384425803
81	NC_017271	CAGCG	2	10	119899	119908	20 %	0 %	40 %	40 %	384425803
82	NC_017271	CACCG	2	10	120085	120094	20 %	0 %	20 %	60 %	384425803
83	NC_017271	TTCCG	2	10	120253	120262	0 %	40 %	20 %	40 %	384425803
84	NC_017271	GAGCT	2	10	120637	120646	20 %	20 %	40 %	20 %	384425803
85	NC_017271	CACCG	2	10	120756	120765	20 %	0 %	20 %	60 %	384425803
86	NC_017271	CCCGG	2	10	121060	121069	0 %	0 %	40 %	60 %	384425803
87	NC_017271	CACAA	2	10	124440	124449	60 %	0 %	0 %	40 %	384425809
88	NC_017271	CGGCG	2	10	125601	125610	0 %	0 %	60 %	40 %	384425811
89	NC_017271	TCCGC	2	10	126078	126087	0 %	20 %	20 %	60 %	384425812
90	NC_017271	CGCTG	2	10	129655	129664	0 %	20 %	40 %	40 %	384425813
91	NC_017271	CGCGT	2	10	131286	131295	0 %	20 %	40 %	40 %	384425815
92	NC_017271	CAGCG	2	10	132706	132715	20 %	0 %	40 %	40 %	384425816
93	NC_017271	GCGCC	2	10	134259	134268	0 %	0 %	40 %	60 %	384425818
94	NC_017271	GCTGG	2	10	135588	135597	0 %	20 %	60 %	20 %	384425820
95	NC_017271	GGTCG	2	10	136071	136080	0 %	20 %	60 %	20 %	384425820
96	NC_017271	GCCGC	2	10	136692	136701	0 %	0 %	40 %	60 %	384425821
97	NC_017271	TGAAC	2	10	137468	137477	40 %	20 %	20 %	20 %	384425822
98	NC_017271	CGCGC	2	10	137697	137706	0 %	0 %	40 %	60 %	384425823
99	NC_017271	TGTCC	2	10	138580	138589	0 %	40 %	20 %	40 %	384425825
100	NC_017271	CCAGC	2	10	140042	140051	20 %	0 %	20 %	60 %	384425825
101	NC_017271	GCGCC	2	10	140180	140189	0 %	0 %	40 %	60 %	384425825
102	NC_017271	GGCCT	2	10	142621	142630	0 %	20 %	40 %	40 %	384425826
103	NC_017271	CGGCG	2	10	144573	144582	0 %	0 %	60 %	40 %	384425828
104	NC_017271	GGCTG	2	10	145351	145360	0 %	20 %	60 %	20 %	384425828
105	NC_017271	GCGCC	2	10	148402	148411	0 %	0 %	40 %	60 %	384425830
106	NC_017271	GCACC	2	10	151052	151061	20 %	0 %	20 %	60 %	384425831
107	NC_017271	CGCTG	2	10	153998	154007	0 %	20 %	40 %	40 %	384425832
108	NC_017271	TCGCT	2	10	154695	154704	0 %	40 %	20 %	40 %	384425833
109	NC_017271	CCAGC	2	10	154747	154756	20 %	0 %	20 %	60 %	384425833
110	NC_017271	TGGCA	2	10	155018	155027	20 %	20 %	40 %	20 %	384425833
111	NC_017271	TCATC	2	10	161617	161626	20 %	40 %	0 %	40 %	384425836
112	NC_017271	CCGGC	2	10	165038	165047	0 %	0 %	40 %	60 %	384425839
113	NC_017271	TGATC	2	10	169906	169915	20 %	40 %	20 %	20 %	384425840
114	NC_017271	AGGTC	2	10	170158	170167	20 %	20 %	40 %	20 %	384425840
115	NC_017271	CCCAG	2	10	171397	171406	20 %	0 %	20 %	60 %	384425841
116	NC_017271	TGCGG	2	10	172887	172896	0 %	20 %	60 %	20 %	384425843
117	NC_017271	CCGCG	2	10	173513	173522	0 %	0 %	40 %	60 %	384425843
118	NC_017271	ACGCA	2	10	176583	176592	40 %	0 %	20 %	40 %	384425848
119	NC_017271	GCGCT	2	10	177769	177778	0 %	20 %	40 %	40 %	384425849
120	NC_017271	GCTGG	2	10	180873	180882	0 %	20 %	60 %	20 %	384425851
121	NC_017271	CGGTG	2	10	187982	187991	0 %	20 %	60 %	20 %	384425854
122	NC_017271	TGCGC	2	10	190625	190634	0 %	20 %	40 %	40 %	384425856
123	NC_017271	GATCG	2	10	192299	192308	20 %	20 %	40 %	20 %	384425858
124	NC_017271	CGCAT	2	10	194230	194239	20 %	20 %	20 %	40 %	384425860
125	NC_017271	GCTGG	2	10	195151	195160	0 %	20 %	60 %	20 %	384425861
126	NC_017271	CGGCC	2	10	196830	196839	0 %	0 %	40 %	60 %	384425862
127	NC_017271	GGCGC	2	10	201562	201571	0 %	0 %	60 %	40 %	384425864
128	NC_017271	TGGCC	2	10	201897	201906	0 %	20 %	40 %	40 %	384425864
129	NC_017271	TGCGC	2	10	203006	203015	0 %	20 %	40 %	40 %	384425864
130	NC_017271	CATCG	2	10	205015	205024	20 %	20 %	20 %	40 %	384425866
131	NC_017271	GCAGC	2	10	207030	207039	20 %	0 %	40 %	40 %	384425867
132	NC_017271	GCGCC	2	10	207520	207529	0 %	0 %	40 %	60 %	384425868
133	NC_017271	CGCGG	2	10	207747	207756	0 %	0 %	60 %	40 %	384425868
134	NC_017271	AGCCG	2	10	207882	207891	20 %	0 %	40 %	40 %	384425868
135	NC_017271	AGGTC	2	10	208266	208275	20 %	20 %	40 %	20 %	384425868
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