MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 108921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017271	GTG	2	6	195857	195862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425861
4002	NC_017271	GCC	2	6	195872	195877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425861
4003	NC_017271	GAC	2	6	195902	195907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425861
4004	NC_017271	CG	3	6	195940	195945	0 %	0 %	50 %	50 %	384425861
4005	NC_017271	CGA	2	6	195952	195957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425861
4006	NC_017271	CGA	2	6	195999	196004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425862
4007	NC_017271	CGGC	2	8	196076	196083	0 %	0 %	50 %	50 %	384425862
4008	NC_017271	CCG	2	6	196098	196103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425862
4009	NC_017271	ATG	2	6	196105	196110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425862
4010	NC_017271	AGCCGG	2	12	196154	196165	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384425862
4011	NC_017271	GCT	2	6	196185	196190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425862
4012	NC_017271	GC	3	6	196195	196200	0 %	0 %	50 %	50 %	384425862
4013	NC_017271	ATG	2	6	196207	196212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425862
4014	NC_017271	AGC	2	6	196217	196222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425862
4015	NC_017271	TAC	2	6	196225	196230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425862
4016	NC_017271	CTT	2	6	196248	196253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425862
4017	NC_017271	GC	3	6	196277	196282	0 %	0 %	50 %	50 %	384425862
4018	NC_017271	GTGC	2	8	196306	196313	0 %	25 %	50 %	25 %	384425862
4019	NC_017271	CGG	2	6	196316	196321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425862
4020	NC_017271	CCG	2	6	196337	196342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425862
4021	NC_017271	ACG	2	6	196373	196378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425862
4022	NC_017271	GTG	2	6	196384	196389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425862
4023	NC_017271	CGA	2	6	196413	196418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425862
4024	NC_017271	CGG	2	6	196468	196473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425862
4025	NC_017271	GCG	2	6	196526	196531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425862
4026	NC_017271	ACT	2	6	196595	196600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425862
4027	NC_017271	CTT	2	6	196629	196634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425862
4028	NC_017271	AGC	2	6	196643	196648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425862
4029	NC_017271	GCA	2	6	196668	196673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425862
4030	NC_017271	TGCA	2	8	196700	196707	25 %	25 %	25 %	25 %	384425862
4031	NC_017271	CGG	2	6	196712	196717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425862
4032	NC_017271	ACG	2	6	196742	196747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425862
4033	NC_017271	CGC	2	6	196764	196769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425862
4034	NC_017271	CGGCC	2	10	196830	196839	0 %	0 %	40 %	60 %	384425862
4035	NC_017271	CGC	2	6	196896	196901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425862
4036	NC_017271	GCG	2	6	196969	196974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425862
4037	NC_017271	ACC	2	6	197041	197046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425862
4038	NC_017271	CG	5	10	197109	197118	0 %	0 %	50 %	50 %	384425862
4039	NC_017271	TGC	2	6	197123	197128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425862
4040	NC_017271	CTG	2	6	197176	197181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425862
4041	NC_017271	GGT	2	6	197301	197306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425862
4042	NC_017271	GCAC	2	8	197309	197316	25 %	0 %	25 %	50 %	384425862
4043	NC_017271	GCT	2	6	197367	197372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425862
4044	NC_017271	GC	3	6	197377	197382	0 %	0 %	50 %	50 %	384425862
4045	NC_017271	ACGC	2	8	197384	197391	25 %	0 %	25 %	50 %	384425862
4046	NC_017271	TGG	2	6	197438	197443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425862
4047	NC_017271	GCG	2	6	197450	197455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425862
4048	NC_017271	GGCT	2	8	197467	197474	0 %	25 %	50 %	25 %	384425862
4049	NC_017271	GC	3	6	197537	197542	0 %	0 %	50 %	50 %	384425862
4050	NC_017271	GGA	2	6	197568	197573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384425862
4051	NC_017271	GCC	2	6	197584	197589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425862
4052	NC_017271	GC	3	6	197620	197625	0 %	0 %	50 %	50 %	384425862
4053	NC_017271	GAT	2	6	197635	197640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425862
4054	NC_017271	CGA	2	6	197661	197666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425862
4055	NC_017271	GAA	2	6	197668	197673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425862
4056	NC_017271	ATCT	2	8	197680	197687	25 %	50 %	0 %	25 %	384425862
4057	NC_017271	GCT	2	6	197706	197711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425862
4058	NC_017271	CCG	2	6	197720	197725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425862
4059	NC_017271	AAC	2	6	197732	197737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425862
4060	NC_017271	CTG	2	6	197746	197751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425862
4061	NC_017271	CGA	2	6	197823	197828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425862
4062	NC_017271	GCC	2	6	197834	197839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425862
4063	NC_017271	GC	3	6	197955	197960	0 %	0 %	50 %	50 %	384425862
4064	NC_017271	TAC	2	6	198028	198033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425862
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4066	NC_017271	CCAG	2	8	198074	198081	25 %	0 %	25 %	50 %	384425862
4067	NC_017271	TGG	2	6	198143	198148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425862
4068	NC_017271	CGCAGG	2	12	198197	198208	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384425862
4069	NC_017271	GC	3	6	198227	198232	0 %	0 %	50 %	50 %	384425862
4070	NC_017271	TCG	2	6	198326	198331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425862
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4072	NC_017271	CG	3	6	199102	199107	0 %	0 %	50 %	50 %	384425863
4073	NC_017271	TTG	2	6	199157	199162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425863
4074	NC_017271	GCA	2	6	199190	199195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425863
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4083	NC_017271	GC	3	6	199525	199530	0 %	0 %	50 %	50 %	384425863
4084	NC_017271	CG	3	6	199559	199564	0 %	0 %	50 %	50 %	384425863
4085	NC_017271	CAG	2	6	199582	199587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425863
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4089	NC_017271	CTG	2	6	199714	199719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425863
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4091	NC_017271	GGCC	2	8	199769	199776	0 %	0 %	50 %	50 %	384425863
4092	NC_017271	GCG	2	6	199791	199796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425863
4093	NC_017271	TGC	2	6	199814	199819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425863
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4099	NC_017271	CCGC	2	8	200363	200370	0 %	0 %	25 %	75 %	384425864
4100	NC_017271	CGGC	2	8	200394	200401	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
4101	NC_017271	CTGGCG	2	12	200412	200423	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384425864
4102	NC_017271	TCG	2	6	200433	200438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425864
4103	NC_017271	CGG	2	6	200464	200469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425864
4104	NC_017271	GCT	2	6	200510	200515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425864
4105	NC_017271	TGC	2	6	200518	200523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425864
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4107	NC_017271	CAT	2	6	200537	200542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425864
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4116	NC_017271	GC	3	6	200958	200963	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
4117	NC_017271	GTG	2	6	201027	201032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425864
4118	NC_017271	TGCC	2	8	201033	201040	0 %	25 %	25 %	50 %	384425864
4119	NC_017271	GGT	2	6	201059	201064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425864
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4121	NC_017271	CG	4	8	201093	201100	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
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4249	NC_017271	GCA	2	6	206244	206249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425867
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4252	NC_017271	CG	3	6	206451	206456	0 %	0 %	50 %	50 %	384425867
4253	NC_017271	GCC	2	6	206486	206491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425867
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4361	NC_017271	A	6	6	210353	210358	100 %	0 %	0 %	0 %	384425870
4362	NC_017271	CTG	3	9	210478	210486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425870
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4487	NC_017271	GGC	2	6	216488	216493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425876
4488	NC_017271	GCCA	2	8	216510	216517	25 %	0 %	25 %	50 %	384425876
4489	NC_017271	CCG	2	6	216570	216575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425876
4490	NC_017271	GC	3	6	216576	216581	0 %	0 %	50 %	50 %	384425876
4491	NC_017271	CAC	2	6	216635	216640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425876
4492	NC_017271	CG	3	6	216661	216666	0 %	0 %	50 %	50 %	384425876
4493	NC_017271	GGC	3	9	216701	216709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425876
4494	NC_017271	CAC	4	12	216713	216724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425876
4495	NC_017271	GCG	2	6	216750	216755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425876
4496	NC_017271	CGC	2	6	216880	216885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425877
4497	NC_017271	CGT	2	6	216897	216902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425877
4498	NC_017271	CGGC	2	8	216924	216931	0 %	0 %	50 %	50 %	384425877
4499	NC_017271	GC	3	6	216946	216951	0 %	0 %	50 %	50 %	384425877
4500	NC_017271	TGCC	2	8	216984	216991	0 %	25 %	25 %	50 %	384425877

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