MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 108921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017271	GCC	2	6	145395	145400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425828
3002	NC_017271	CAG	2	6	145401	145406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425828
3003	NC_017271	GCG	2	6	145408	145413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425828
3004	NC_017271	GCG	3	9	145420	145428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425828
3005	NC_017271	CGG	2	6	145698	145703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425829
3006	NC_017271	GTC	2	6	145723	145728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425829
3007	NC_017271	GAT	2	6	145798	145803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425829
3008	NC_017271	TTC	2	6	145813	145818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425829
3009	NC_017271	TGG	2	6	145874	145879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425829
3010	NC_017271	GTG	2	6	145892	145897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425829
3011	NC_017271	CAGCTG	2	12	145915	145926	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384425829
3012	NC_017271	CTG	2	6	145945	145950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425829
3013	NC_017271	CGC	2	6	145995	146000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425829
3014	NC_017271	CAC	2	6	146005	146010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425829
3015	NC_017271	CG	3	6	146073	146078	0 %	0 %	50 %	50 %	384425829
3016	NC_017271	CG	5	10	146146	146155	0 %	0 %	50 %	50 %	384425829
3017	NC_017271	GCGG	2	8	146158	146165	0 %	0 %	75 %	25 %	384425829
3018	NC_017271	CGGC	2	8	146268	146275	0 %	0 %	50 %	50 %	384425829
3019	NC_017271	ACC	2	6	146309	146314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425829
3020	NC_017271	GGT	2	6	146338	146343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425829
3021	NC_017271	CGC	2	6	146375	146380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425829
3022	NC_017271	CCG	2	6	146424	146429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425829
3023	NC_017271	TGC	2	6	146543	146548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425829
3024	NC_017271	CAG	2	6	146551	146556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425829
3025	NC_017271	GCA	2	6	146580	146585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425829
3026	NC_017271	GCA	2	6	147002	147007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3027	NC_017271	CCG	2	6	147024	147029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425830
3028	NC_017271	GCG	2	6	147096	147101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425830
3029	NC_017271	GGA	2	6	147130	147135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384425830
3030	NC_017271	GTG	2	6	147191	147196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425830
3031	NC_017271	CAC	2	6	147289	147294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425830
3032	NC_017271	GCG	2	6	147315	147320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425830
3033	NC_017271	GCTC	2	8	147420	147427	0 %	25 %	25 %	50 %	384425830
3034	NC_017271	GC	3	6	147452	147457	0 %	0 %	50 %	50 %	384425830
3035	NC_017271	CGC	2	6	147484	147489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425830
3036	NC_017271	CG	3	6	147534	147539	0 %	0 %	50 %	50 %	384425830
3037	NC_017271	ACA	2	6	147570	147575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425830
3038	NC_017271	GAA	2	6	147623	147628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425830
3039	NC_017271	CGG	2	6	147667	147672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425830
3040	NC_017271	CAG	2	6	147746	147751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3041	NC_017271	CAG	2	6	147761	147766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3042	NC_017271	CAC	2	6	147811	147816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425830
3043	NC_017271	CGA	2	6	147859	147864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3044	NC_017271	CGG	2	6	147895	147900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425830
3045	NC_017271	GC	3	6	147905	147910	0 %	0 %	50 %	50 %	384425830
3046	NC_017271	CGT	2	6	147937	147942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3047	NC_017271	CAA	2	6	147961	147966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425830
3048	NC_017271	ACG	2	6	148020	148025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3049	NC_017271	CGA	2	6	148078	148083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3050	NC_017271	CG	3	6	148096	148101	0 %	0 %	50 %	50 %	384425830
3051	NC_017271	ACC	2	6	148142	148147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425830
3052	NC_017271	ATC	2	6	148148	148153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425830
3053	NC_017271	ACG	2	6	148164	148169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3054	NC_017271	CAA	2	6	148198	148203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425830
3055	NC_017271	CG	3	6	148205	148210	0 %	0 %	50 %	50 %	384425830
3056	NC_017271	CCGA	2	8	148235	148242	25 %	0 %	25 %	50 %	384425830
3057	NC_017271	GCGCC	2	10	148402	148411	0 %	0 %	40 %	60 %	384425830
3058	NC_017271	GCCG	2	8	148456	148463	0 %	0 %	50 %	50 %	384425830
3059	NC_017271	CG	3	6	148590	148595	0 %	0 %	50 %	50 %	384425830
3060	NC_017271	CAA	2	6	148597	148602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425830
3061	NC_017271	GAA	2	6	148616	148621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425830
3062	NC_017271	GCGT	2	8	148695	148702	0 %	25 %	50 %	25 %	384425830
3063	NC_017271	CAA	2	6	148744	148749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425830
3064	NC_017271	ACC	2	6	148763	148768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425830
3065	NC_017271	ACA	3	9	148782	148790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425830
3066	NC_017271	CTG	3	9	148832	148840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3067	NC_017271	GCC	2	6	148850	148855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425830
3068	NC_017271	CCGTGG	2	12	148902	148913	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384425830
3069	NC_017271	GGT	2	6	148916	148921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425830
3070	NC_017271	GC	3	6	148922	148927	0 %	0 %	50 %	50 %	384425830
3071	NC_017271	CGG	2	6	148936	148941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425830
3072	NC_017271	CCA	2	6	148968	148973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425830
3073	NC_017271	CG	4	8	149065	149072	0 %	0 %	50 %	50 %	384425830
3074	NC_017271	CAG	2	6	149089	149094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3075	NC_017271	GAC	2	6	149141	149146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3076	NC_017271	GCG	2	6	149178	149183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425830
3077	NC_017271	TGC	2	6	149226	149231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3078	NC_017271	CAG	2	6	149302	149307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3079	NC_017271	TGA	2	6	149319	149324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425830
3080	NC_017271	TCG	2	6	149351	149356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3081	NC_017271	CCA	2	6	149409	149414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425830
3082	NC_017271	CGA	2	6	149419	149424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3083	NC_017271	CAC	2	6	149491	149496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425830
3084	NC_017271	AGCA	2	8	149528	149535	50 %	0 %	25 %	25 %	384425830
3085	NC_017271	CGA	2	6	149581	149586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3086	NC_017271	GTC	2	6	149593	149598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3087	NC_017271	GCC	2	6	149640	149645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425830
3088	NC_017271	CTG	2	6	149651	149656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425830
3089	NC_017271	CAT	2	6	149852	149857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425831
3090	NC_017271	GTC	2	6	149872	149877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425831
3091	NC_017271	GGCG	2	8	149888	149895	0 %	0 %	75 %	25 %	384425831
3092	NC_017271	CCG	2	6	149905	149910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425831
3093	NC_017271	CG	3	6	149909	149914	0 %	0 %	50 %	50 %	384425831
3094	NC_017271	TGGACC	2	12	150001	150012	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384425831
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3096	NC_017271	GT	3	6	150163	150168	0 %	50 %	50 %	0 %	384425831
3097	NC_017271	CCG	2	6	150268	150273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425831
3098	NC_017271	GCAGCG	2	12	150274	150285	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384425831
3099	NC_017271	CGA	2	6	150380	150385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425831
3100	NC_017271	TTCGAC	2	12	150429	150440	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384425831
3101	NC_017271	GCC	2	6	150453	150458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425831
3102	NC_017271	CG	3	6	150487	150492	0 %	0 %	50 %	50 %	384425831
3103	NC_017271	AGCG	2	8	150573	150580	25 %	0 %	50 %	25 %	384425831
3104	NC_017271	CCA	2	6	150655	150660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425831
3105	NC_017271	CGAA	2	8	150727	150734	50 %	0 %	25 %	25 %	384425831
3106	NC_017271	CG	3	6	150736	150741	0 %	0 %	50 %	50 %	384425831
3107	NC_017271	CAA	2	6	150773	150778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425831
3108	NC_017271	CCA	2	6	150805	150810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425831
3109	NC_017271	CG	3	6	150827	150832	0 %	0 %	50 %	50 %	384425831
3110	NC_017271	AC	3	6	150841	150846	50 %	0 %	0 %	50 %	384425831
3111	NC_017271	CGA	2	6	150971	150976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425831
3112	NC_017271	GCT	2	6	150980	150985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425831
3113	NC_017271	TCGG	2	8	151035	151042	0 %	25 %	50 %	25 %	384425831
3114	NC_017271	GCACC	2	10	151052	151061	20 %	0 %	20 %	60 %	384425831
3115	NC_017271	CGG	2	6	151070	151075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425831
3116	NC_017271	CAG	2	6	151169	151174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425831
3117	NC_017271	GAA	2	6	151179	151184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425831
3118	NC_017271	GCA	2	6	151217	151222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425831
3119	NC_017271	ACA	2	6	151312	151317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425831
3120	NC_017271	CCG	2	6	151343	151348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425831
3121	NC_017271	GGT	2	6	151350	151355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425831
3122	NC_017271	CGC	2	6	151388	151393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425831
3123	NC_017271	CAA	2	6	151400	151405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425831
3124	NC_017271	CG	4	8	151454	151461	0 %	0 %	50 %	50 %	384425831
3125	NC_017271	CACCTT	2	12	151553	151564	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384425831
3126	NC_017271	GCCG	2	8	151649	151656	0 %	0 %	50 %	50 %	384425831
3127	NC_017271	GCGTGG	2	12	151657	151668	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384425831
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3130	NC_017271	TGCAAC	2	12	151779	151790	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384425831
3131	NC_017271	CAA	3	9	151847	151855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425831
3132	NC_017271	ACCT	2	8	151884	151891	25 %	25 %	0 %	50 %	384425831
3133	NC_017271	CG	3	6	151923	151928	0 %	0 %	50 %	50 %	384425831
3134	NC_017271	CGC	2	6	151970	151975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425831
3135	NC_017271	CCG	3	9	152002	152010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425831
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3137	NC_017271	TTC	2	6	152037	152042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425831
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3142	NC_017271	TGA	2	6	152153	152158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425831
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3145	NC_017271	TTC	2	6	152247	152252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425831
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3224	NC_017271	TCG	2	6	154881	154886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425833
3225	NC_017271	GC	3	6	154910	154915	0 %	0 %	50 %	50 %	384425833
3226	NC_017271	TGGCA	2	10	155018	155027	20 %	20 %	40 %	20 %	384425833
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3230	NC_017271	TGT	2	6	155258	155263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425834
3231	NC_017271	CGA	2	6	155385	155390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425834
3232	NC_017271	GC	5	10	155457	155466	0 %	0 %	50 %	50 %	384425834
3233	NC_017271	GC	3	6	155599	155604	0 %	0 %	50 %	50 %	384425834
3234	NC_017271	GCC	2	6	155716	155721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425834
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3237	NC_017271	GGCC	2	8	155796	155803	0 %	0 %	50 %	50 %	384425834
3238	NC_017271	CGC	2	6	155813	155818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425834
3239	NC_017271	CGA	2	6	155862	155867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425834
3240	NC_017271	GGC	2	6	155899	155904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425834
3241	NC_017271	GCC	2	6	155905	155910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425834
3242	NC_017271	CG	3	6	155916	155921	0 %	0 %	50 %	50 %	384425834
3243	NC_017271	CACC	2	8	155948	155955	25 %	0 %	0 %	75 %	384425834
3244	NC_017271	GCA	2	6	155964	155969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425834
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3247	NC_017271	CTG	2	6	156019	156024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425834
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3249	NC_017271	ACC	2	6	156118	156123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425834
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3271	NC_017271	CG	3	6	157031	157036	0 %	0 %	50 %	50 %	384425834
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3345	NC_017271	AG	3	6	162106	162111	50 %	0 %	50 %	0 %	384425836
3346	NC_017271	ACT	2	6	162138	162143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425836
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3352	NC_017271	ATT	2	6	162313	162318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384425836
3353	NC_017271	ATC	2	6	162427	162432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425836
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3359	NC_017271	GCC	2	6	163930	163935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425837
3360	NC_017271	GGTC	2	8	163949	163956	0 %	25 %	50 %	25 %	384425837
3361	NC_017271	TCG	2	6	164036	164041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425837
3362	NC_017271	CTGG	2	8	164091	164098	0 %	25 %	50 %	25 %	384425837
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3364	NC_017271	CG	3	6	164248	164253	0 %	0 %	50 %	50 %	384425837
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3484	NC_017271	GCGGCC	2	12	171333	171344	0 %	0 %	50 %	50 %	384425841
3485	NC_017271	CGC	3	9	171358	171366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425841
3486	NC_017271	CGAG	2	8	171367	171374	25 %	0 %	50 %	25 %	384425841
3487	NC_017271	CCCAG	2	10	171397	171406	20 %	0 %	20 %	60 %	384425841
3488	NC_017271	CCA	2	6	171415	171420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425841
3489	NC_017271	GCA	2	6	171421	171426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425841
3490	NC_017271	GCT	2	6	171440	171445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425841
3491	NC_017271	TGGCCG	2	12	171483	171494	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384425841
3492	NC_017271	GC	3	6	171538	171543	0 %	0 %	50 %	50 %	384425841
3493	NC_017271	CCAG	2	8	171571	171578	25 %	0 %	25 %	50 %	384425841
3494	NC_017271	CG	3	6	171676	171681	0 %	0 %	50 %	50 %	384425842
3495	NC_017271	GTG	2	6	171713	171718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425842
3496	NC_017271	CTT	2	6	171792	171797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425842
3497	NC_017271	CGC	2	6	171855	171860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425842
3498	NC_017271	GCCCAG	2	12	171955	171966	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384425842
3499	NC_017271	GC	3	6	171984	171989	0 %	0 %	50 %	50 %	384425842
3500	NC_017271	CTG	2	6	172000	172005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425842

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