MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 108921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017271	TGG	2	6	69818	69823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425759
1502	NC_017271	CGC	2	6	70073	70078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425760
1503	NC_017271	TCA	2	6	70558	70563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425761
1504	NC_017271	CAC	2	6	70567	70572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425761
1505	NC_017271	GTG	2	6	70575	70580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425761
1506	NC_017271	GCA	2	6	70608	70613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425761
1507	NC_017271	GCCG	2	8	70663	70670	0 %	0 %	50 %	50 %	384425761
1508	NC_017271	CCA	2	6	70713	70718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425761
1509	NC_017271	CCAC	2	8	72419	72426	25 %	0 %	0 %	75 %	384425762
1510	NC_017271	GCA	3	9	72429	72437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425762
1511	NC_017271	CCCA	2	8	72448	72455	25 %	0 %	0 %	75 %	384425762
1512	NC_017271	GCCC	2	8	72478	72485	0 %	0 %	25 %	75 %	384425762
1513	NC_017271	CGG	2	6	72514	72519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425762
1514	NC_017271	CCAGG	2	10	72523	72532	20 %	0 %	40 %	40 %	384425762
1515	NC_017271	GAT	2	6	72539	72544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425762
1516	NC_017271	GTGC	2	8	72641	72648	0 %	25 %	50 %	25 %	384425762
1517	NC_017271	GTG	2	6	72672	72677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425762
1518	NC_017271	CGG	2	6	72710	72715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425762
1519	NC_017271	TGC	3	9	72761	72769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425762
1520	NC_017271	GC	3	6	72811	72816	0 %	0 %	50 %	50 %	384425762
1521	NC_017271	GC	3	6	72821	72826	0 %	0 %	50 %	50 %	384425762
1522	NC_017271	GGT	2	6	72827	72832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425762
1523	NC_017271	GCT	2	6	73046	73051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425763
1524	NC_017271	GCT	2	6	73064	73069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425763
1525	NC_017271	TG	3	6	73178	73183	0 %	50 %	50 %	0 %	384425763
1526	NC_017271	CAC	2	6	73218	73223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425763
1527	NC_017271	GCG	2	6	73237	73242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425763
1528	NC_017271	TCTTG	2	10	73251	73260	0 %	60 %	20 %	20 %	384425763
1529	NC_017271	AGC	2	6	73267	73272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425763
1530	NC_017271	CGCT	2	8	73333	73340	0 %	25 %	25 %	50 %	384425763
1531	NC_017271	GCT	2	6	73376	73381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425763
1532	NC_017271	CTG	2	6	73398	73403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425763
1533	NC_017271	CG	3	6	73495	73500	0 %	0 %	50 %	50 %	384425763
1534	NC_017271	TTC	2	6	73507	73512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425763
1535	NC_017271	GAT	2	6	73667	73672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425763
1536	NC_017271	CTG	2	6	73756	73761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425763
1537	NC_017271	GTC	2	6	73819	73824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425763
1538	NC_017271	CCG	2	6	73896	73901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425763
1539	NC_017271	GC	3	6	73969	73974	0 %	0 %	50 %	50 %	384425763
1540	NC_017271	AG	3	6	73989	73994	50 %	0 %	50 %	0 %	384425763
1541	NC_017271	CG	3	6	74006	74011	0 %	0 %	50 %	50 %	384425763
1542	NC_017271	AGT	2	6	74180	74185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425763
1543	NC_017271	GA	3	6	74350	74355	50 %	0 %	50 %	0 %	384425763
1544	NC_017271	AGCA	2	8	74430	74437	50 %	0 %	25 %	25 %	384425763
1545	NC_017271	AC	3	6	74499	74504	50 %	0 %	0 %	50 %	384425764
1546	NC_017271	TCG	2	6	74517	74522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425764
1547	NC_017271	GCC	3	9	74621	74629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425764
1548	NC_017271	CGGGT	2	10	74700	74709	0 %	20 %	60 %	20 %	384425764
1549	NC_017271	GTT	2	6	75328	75333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425765
1550	NC_017271	TGC	2	6	75395	75400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425765
1551	NC_017271	CTT	2	6	75565	75570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425765
1552	NC_017271	GGC	2	6	75656	75661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425765
1553	NC_017271	CACG	2	8	76024	76031	25 %	0 %	25 %	50 %	384425766
1554	NC_017271	CAC	2	6	76056	76061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425766
1555	NC_017271	TCC	2	6	76067	76072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384425766
1556	NC_017271	TCC	2	6	76079	76084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384425766
1557	NC_017271	TGC	2	6	76099	76104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425766
1558	NC_017271	CTG	2	6	76119	76124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425766
1559	NC_017271	TCG	2	6	76156	76161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425766
1560	NC_017271	CGCGTA	2	12	76205	76216	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384425766
1561	NC_017271	GGT	2	6	76220	76225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425766
1562	NC_017271	TCG	2	6	76258	76263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425766
1563	NC_017271	GC	3	6	76666	76671	0 %	0 %	50 %	50 %	384425767
1564	NC_017271	CTG	2	6	76706	76711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425767
1565	NC_017271	CAGC	2	8	76750	76757	25 %	0 %	25 %	50 %	384425767
1566	NC_017271	TG	3	6	76822	76827	0 %	50 %	50 %	0 %	384425767
1567	NC_017271	CAC	2	6	76880	76885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425767
1568	NC_017271	CGCT	2	8	76989	76996	0 %	25 %	25 %	50 %	384425767
1569	NC_017271	CGT	2	6	77002	77007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425767
1570	NC_017271	CGCGG	2	10	77100	77109	0 %	0 %	60 %	40 %	384425767
1571	NC_017271	GC	3	6	77119	77124	0 %	0 %	50 %	50 %	384425767
1572	NC_017271	CAC	2	6	77129	77134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425767
1573	NC_017271	GGC	2	6	77205	77210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425767
1574	NC_017271	TGC	2	6	77215	77220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425767
1575	NC_017271	GCC	2	6	77301	77306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425767
1576	NC_017271	GTA	2	6	77396	77401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425767
1577	NC_017271	TGC	2	6	77514	77519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425767
1578	NC_017271	CAG	2	6	80435	80440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425768
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1580	NC_017271	GCC	2	6	80821	80826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425769
1581	NC_017271	CAC	2	6	80840	80845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425769
1582	NC_017271	CAC	2	6	80882	80887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425769
1583	NC_017271	TCTT	2	8	80960	80967	0 %	75 %	0 %	25 %	384425769
1584	NC_017271	CAG	2	6	81053	81058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425769
1585	NC_017271	GCC	2	6	81113	81118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425769
1586	NC_017271	GCC	2	6	81123	81128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425769
1587	NC_017271	CGTAGT	2	12	81274	81285	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384425769
1588	NC_017271	CGA	2	6	81307	81312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425769
1589	NC_017271	GCT	2	6	81434	81439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425769
1590	NC_017271	TCG	2	6	81444	81449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425769
1591	NC_017271	GCAG	2	8	81531	81538	25 %	0 %	50 %	25 %	384425769
1592	NC_017271	CTA	2	6	81580	81585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425769
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1594	NC_017271	CGAT	2	8	81668	81675	25 %	25 %	25 %	25 %	384425769
1595	NC_017271	GCG	2	6	81750	81755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425769
1596	NC_017271	GCT	2	6	81956	81961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425769
1597	NC_017271	ATGC	2	8	81997	82004	25 %	25 %	25 %	25 %	384425769
1598	NC_017271	TGC	2	6	82017	82022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425769
1599	NC_017271	GTG	2	6	82044	82049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425769
1600	NC_017271	GCT	2	6	82063	82068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425769
1601	NC_017271	TGC	2	6	82072	82077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425769
1602	NC_017271	TCT	2	6	82111	82116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425769
1603	NC_017271	CCAG	2	8	82148	82155	25 %	0 %	25 %	50 %	384425769
1604	NC_017271	GGC	2	6	82175	82180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425769
1605	NC_017271	AGC	2	6	82185	82190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425769
1606	NC_017271	GGCC	2	8	82675	82682	0 %	0 %	50 %	50 %	384425770
1607	NC_017271	CGG	2	6	82711	82716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425770
1608	NC_017271	CTTC	2	8	82762	82769	0 %	50 %	0 %	50 %	384425770
1609	NC_017271	GGC	2	6	82790	82795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425770
1610	NC_017271	CGGC	2	8	82985	82992	0 %	0 %	50 %	50 %	384425771
1611	NC_017271	CGC	2	6	83025	83030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425771
1612	NC_017271	AC	3	6	83091	83096	50 %	0 %	0 %	50 %	384425771
1613	NC_017271	CTGG	2	8	83197	83204	0 %	25 %	50 %	25 %	384425771
1614	NC_017271	GGCGC	2	10	83212	83221	0 %	0 %	60 %	40 %	384425771
1615	NC_017271	CGGT	2	8	83318	83325	0 %	25 %	50 %	25 %	384425771
1616	NC_017271	GC	3	6	83416	83421	0 %	0 %	50 %	50 %	384425771
1617	NC_017271	CTG	2	6	83476	83481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425771
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1620	NC_017271	CTC	2	6	83656	83661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384425771
1621	NC_017271	CGGCG	2	10	83682	83691	0 %	0 %	60 %	40 %	384425771
1622	NC_017271	GGCC	2	8	83754	83761	0 %	0 %	50 %	50 %	384425771
1623	NC_017271	ACC	2	6	83765	83770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425771
1624	NC_017271	TGC	2	6	83778	83783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425771
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1626	NC_017271	TGG	2	6	83820	83825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425771
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1999	NC_017271	ATC	2	6	100924	100929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425790
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