MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 108921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_017271	CG	3	6	280707	280712	0 %	0 %	50 %	50 %	384425932
6003	NC_017271	CGG	2	6	280760	280765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425932
6004	NC_017271	CG	3	6	281150	281155	0 %	0 %	50 %	50 %	384425933
6005	NC_017271	GC	3	6	281164	281169	0 %	0 %	50 %	50 %	384425933
6006	NC_017271	GCC	2	6	281173	281178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425933
6007	NC_017271	AGC	3	9	281229	281237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425933
6008	NC_017271	GC	3	6	281261	281266	0 %	0 %	50 %	50 %	384425933
6009	NC_017271	CGGC	2	8	281302	281309	0 %	0 %	50 %	50 %	384425933
6010	NC_017271	AGC	2	6	281367	281372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425933
6011	NC_017271	ACC	2	6	281379	281384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425933
6012	NC_017271	CGC	2	6	281418	281423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425933
6013	NC_017271	GCA	2	6	281425	281430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425933
6014	NC_017271	CAC	2	6	281465	281470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425933
6015	NC_017271	AGG	2	6	281515	281520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384425933
6016	NC_017271	CGG	2	6	281537	281542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425933
6017	NC_017271	CAG	2	6	281579	281584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425933
6018	NC_017271	GCA	2	6	281590	281595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425933
6019	NC_017271	GC	3	6	281605	281610	0 %	0 %	50 %	50 %	384425933
6020	NC_017271	CAG	3	9	281621	281629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425933
6021	NC_017271	CG	3	6	281662	281667	0 %	0 %	50 %	50 %	384425933
6022	NC_017271	TGCCGG	2	12	281669	281680	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384425933
6023	NC_017271	GCC	2	6	281720	281725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425934
6024	NC_017271	CGG	2	6	281781	281786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425934
6025	NC_017271	GCAG	2	8	281787	281794	25 %	0 %	50 %	25 %	384425934
6026	NC_017271	TGC	2	6	281811	281816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425934
6027	NC_017271	GAA	2	6	281833	281838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425934
6028	NC_017271	ATGC	2	8	281922	281929	25 %	25 %	25 %	25 %	384425934
6029	NC_017271	GGCC	2	8	281937	281944	0 %	0 %	50 %	50 %	384425934
6030	NC_017271	GC	3	6	281952	281957	0 %	0 %	50 %	50 %	384425934
6031	NC_017271	TCA	2	6	282024	282029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425934
6032	NC_017271	CGAT	2	8	282044	282051	25 %	25 %	25 %	25 %	384425934
6033	NC_017271	GGT	2	6	282070	282075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425934
6034	NC_017271	GC	3	6	282096	282101	0 %	0 %	50 %	50 %	384425934
6035	NC_017271	AAC	2	6	282116	282121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425934
6036	NC_017271	GCG	2	6	282221	282226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425934
6037	NC_017271	CTG	2	6	282250	282255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425934
6038	NC_017271	CAGCGC	2	12	282259	282270	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384425934
6039	NC_017271	GCG	2	6	282299	282304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425934
6040	NC_017271	GCG	2	6	282320	282325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425934
6041	NC_017271	GCGG	2	8	282344	282351	0 %	0 %	75 %	25 %	384425934
6042	NC_017271	CAAA	2	8	282375	282382	75 %	0 %	0 %	25 %	384425934
6043	NC_017271	GAA	2	6	283105	283110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425935
6044	NC_017271	GTC	2	6	283117	283122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425935
6045	NC_017271	GAG	2	6	283181	283186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384425935
6046	NC_017271	GCG	2	6	283280	283285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425935
6047	NC_017271	CCG	2	6	283337	283342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425935
6048	NC_017271	CTG	2	6	283522	283527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425935
6049	NC_017271	CAG	2	6	283531	283536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425935
6050	NC_017271	GC	3	6	283573	283578	0 %	0 %	50 %	50 %	384425935
6051	NC_017271	TGC	2	6	283649	283654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425935
6052	NC_017271	GTA	2	6	283660	283665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425935
6053	NC_017271	GCG	2	6	283716	283721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425935
6054	NC_017271	TGGCC	2	10	283773	283782	0 %	20 %	40 %	40 %	384425935
6055	NC_017271	CGGC	2	8	283788	283795	0 %	0 %	50 %	50 %	384425935
6056	NC_017271	ACC	2	6	283796	283801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425935
6057	NC_017271	CTG	2	6	283846	283851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425935
6058	NC_017271	GCTGA	2	10	283903	283912	20 %	20 %	40 %	20 %	384425935
6059	NC_017271	GAA	2	6	283972	283977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425935
6060	NC_017271	TTC	2	6	284089	284094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425935
6061	NC_017271	CAG	2	6	284098	284103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425935
6062	NC_017271	CAGC	2	8	284125	284132	25 %	0 %	25 %	50 %	384425935
6063	NC_017271	TTG	2	6	284234	284239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425935
6064	NC_017271	CACGG	2	10	284242	284251	20 %	0 %	40 %	40 %	384425935
6065	NC_017271	GGCCG	2	10	284293	284302	0 %	0 %	60 %	40 %	384425935
6066	NC_017271	GCACG	2	10	284328	284337	20 %	0 %	40 %	40 %	384425935
6067	NC_017271	TCTT	2	8	284354	284361	0 %	75 %	0 %	25 %	384425935
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6070	NC_017271	TCG	2	6	284567	284572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425935
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6073	NC_017271	CGA	2	6	284631	284636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425935
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6076	NC_017271	CGGCG	2	10	284685	284694	0 %	0 %	60 %	40 %	384425935
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6086	NC_017271	GCCG	2	8	285018	285025	0 %	0 %	50 %	50 %	384425935
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6090	NC_017271	CGG	3	9	285084	285092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425935
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6094	NC_017271	GCGGT	2	10	285246	285255	0 %	20 %	60 %	20 %	384425935
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6101	NC_017271	GC	3	6	285839	285844	0 %	0 %	50 %	50 %	384425936
6102	NC_017271	TGCCCA	2	12	285860	285871	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384425936
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6105	NC_017271	TGGCG	2	10	285926	285935	0 %	20 %	60 %	20 %	384425937
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6111	NC_017271	CG	4	8	286103	286110	0 %	0 %	50 %	50 %	384425937
6112	NC_017271	CGG	2	6	286112	286117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425937
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6367	NC_017271	AGG	2	6	295571	295576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384425948
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6369	NC_017271	GCT	2	6	295623	295628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425948
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6371	NC_017271	GGC	2	6	295647	295652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425948
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6483	NC_017271	GC	4	8	301584	301591	0 %	0 %	50 %	50 %	384425953
6484	NC_017271	CGA	2	6	301592	301597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425953
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6487	NC_017271	CGG	2	6	301646	301651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425953
6488	NC_017271	TCA	2	6	301679	301684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425953
6489	NC_017271	CG	3	6	301686	301691	0 %	0 %	50 %	50 %	384425953
6490	NC_017271	GCG	2	6	301732	301737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425953
6491	NC_017271	CGG	2	6	301796	301801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425953
6492	NC_017271	CGT	2	6	301817	301822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425953
6493	NC_017271	CGATCA	2	12	301823	301834	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384425953
6494	NC_017271	CGT	2	6	301856	301861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425953
6495	NC_017271	GTC	2	6	301917	301922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425953
6496	NC_017271	GCC	2	6	302003	302008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425954
6497	NC_017271	GCA	2	6	302032	302037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425954
6498	NC_017271	GGC	2	6	302054	302059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425954
6499	NC_017271	GC	3	6	302066	302071	0 %	0 %	50 %	50 %	384425954
6500	NC_017271	CGT	2	6	302101	302106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425954

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