MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 108921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017271	CACC	2	8	238028	238035	25 %	0 %	0 %	75 %	384425896
5003	NC_017271	GGC	2	6	238070	238075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425896
5004	NC_017271	CGG	2	6	238083	238088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425896
5005	NC_017271	TGC	2	6	238103	238108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425896
5006	NC_017271	CAC	2	6	238128	238133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425896
5007	NC_017271	CGG	2	6	238176	238181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425896
5008	NC_017271	CAC	2	6	238200	238205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425896
5009	NC_017271	CGTG	2	8	238212	238219	0 %	25 %	50 %	25 %	384425896
5010	NC_017271	GC	3	6	238223	238228	0 %	0 %	50 %	50 %	384425896
5011	NC_017271	ACT	2	6	238250	238255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425896
5012	NC_017271	GGC	2	6	238270	238275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425896
5013	NC_017271	CTG	2	6	238279	238284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425896
5014	NC_017271	GCC	2	6	238303	238308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425896
5015	NC_017271	CCG	2	6	238322	238327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425896
5016	NC_017271	GCCG	2	8	238345	238352	0 %	0 %	50 %	50 %	384425896
5017	NC_017271	CGG	3	9	238361	238369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425896
5018	NC_017271	CCA	2	6	238370	238375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425896
5019	NC_017271	CAGC	2	8	238407	238414	25 %	0 %	25 %	50 %	384425896
5020	NC_017271	CCGG	2	8	238447	238454	0 %	0 %	50 %	50 %	384425896
5021	NC_017271	CG	3	6	238511	238516	0 %	0 %	50 %	50 %	384425896
5022	NC_017271	AGCC	2	8	238518	238525	25 %	0 %	25 %	50 %	384425896
5023	NC_017271	GCC	2	6	238528	238533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425896
5024	NC_017271	TGG	3	9	238598	238606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425896
5025	NC_017271	CCG	2	6	238658	238663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425896
5026	NC_017271	GC	3	6	238679	238684	0 %	0 %	50 %	50 %	384425896
5027	NC_017271	GCG	2	6	238687	238692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425896
5028	NC_017271	GGC	2	6	238708	238713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425896
5029	NC_017271	GC	4	8	238749	238756	0 %	0 %	50 %	50 %	384425896
5030	NC_017271	CTG	2	6	238832	238837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425896
5031	NC_017271	TGC	2	6	239246	239251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425897
5032	NC_017271	GTG	2	6	239252	239257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425897
5033	NC_017271	CTG	2	6	239258	239263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425897
5034	NC_017271	CTG	2	6	239283	239288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425897
5035	NC_017271	GGC	2	6	239350	239355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425897
5036	NC_017271	GCG	2	6	239380	239385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425897
5037	NC_017271	TGA	2	6	239388	239393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425897
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5039	NC_017271	GGAT	2	8	239431	239438	25 %	25 %	50 %	0 %	384425897
5040	NC_017271	TGT	2	6	239445	239450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425897
5041	NC_017271	CCGG	2	8	239474	239481	0 %	0 %	50 %	50 %	384425897
5042	NC_017271	GAC	2	6	239594	239599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425897
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5044	NC_017271	TGC	2	6	239616	239621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425897
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5049	NC_017271	CGAG	2	8	239725	239732	25 %	0 %	50 %	25 %	384425897
5050	NC_017271	GGCA	2	8	239752	239759	25 %	0 %	50 %	25 %	384425897
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5052	NC_017271	T	6	6	239904	239909	0 %	100 %	0 %	0 %	384425897
5053	NC_017271	CACG	2	8	239968	239975	25 %	0 %	25 %	50 %	384425897
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5058	NC_017271	CTG	2	6	240271	240276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425898
5059	NC_017271	GGC	2	6	240363	240368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425898
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5061	NC_017271	TGA	2	6	240401	240406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425898
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5105	NC_017271	GAC	2	6	242587	242592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425900
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5113	NC_017271	A	6	6	242996	243001	100 %	0 %	0 %	0 %	384425900
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5121	NC_017271	TTA	2	6	243353	243358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384425901
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5238	NC_017271	TCGCG	2	10	247356	247365	0 %	20 %	40 %	40 %	384425904
5239	NC_017271	GC	4	8	247447	247454	0 %	0 %	50 %	50 %	384425905
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5482	NC_017271	GCA	2	6	256451	256456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425913
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5488	NC_017271	AGCAAC	3	18	256957	256974	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384425914
5489	NC_017271	AGCCAC	3	18	256975	256992	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384425914
5490	NC_017271	AGC	2	6	256993	256998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425914
5491	NC_017271	CAA	2	6	257016	257021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425914
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5493	NC_017271	ACGCC	2	10	257292	257301	20 %	0 %	20 %	60 %	384425915
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5500	NC_017271	AAGCC	2	10	257616	257625	40 %	0 %	20 %	40 %	384425915

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