MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 3462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017267	GCCTG	2	10	821	830	0 %	20 %	40 %	40 %	384417080
2	NC_017267	ACCAC	2	10	1265	1274	40 %	0 %	0 %	60 %	384417080
3	NC_017267	TGGAA	2	10	4041	4050	40 %	20 %	40 %	0 %	384417083
4	NC_017267	CAAGC	2	10	4661	4670	40 %	0 %	20 %	40 %	384417083
5	NC_017267	GGCGC	2	10	5635	5644	0 %	0 %	60 %	40 %	384417084
6	NC_017267	CCGCG	2	10	5932	5941	0 %	0 %	40 %	60 %	384417084
7	NC_017267	CGCGC	2	10	12754	12763	0 %	0 %	40 %	60 %	384417090
8	NC_017267	CGCAG	2	10	12852	12861	20 %	0 %	40 %	40 %	384417090
9	NC_017267	AGCGC	2	10	15870	15879	20 %	0 %	40 %	40 %	384417094
10	NC_017267	CGCGC	2	10	20924	20933	0 %	0 %	40 %	60 %	384417099
11	NC_017267	GCCCG	2	10	21091	21100	0 %	0 %	40 %	60 %	384417099
12	NC_017267	ACGCC	2	10	21124	21133	20 %	0 %	20 %	60 %	384417099
13	NC_017267	GCCTG	2	10	21413	21422	0 %	20 %	40 %	40 %	384417099
14	NC_017267	CAGCG	2	10	23566	23575	20 %	0 %	40 %	40 %	384417100
15	NC_017267	CGTGG	2	10	24393	24402	0 %	20 %	60 %	20 %	384417100
16	NC_017267	TGCGA	2	10	24940	24949	20 %	20 %	40 %	20 %	384417100
17	NC_017267	AGCCC	2	10	26527	26536	20 %	0 %	20 %	60 %	384417102
18	NC_017267	GCCAA	2	10	26721	26730	40 %	0 %	20 %	40 %	384417102
19	NC_017267	TGGAT	2	10	29751	29760	20 %	40 %	40 %	0 %	384417105
20	NC_017267	GCCAG	2	10	30933	30942	20 %	0 %	40 %	40 %	384417105
21	NC_017267	TGCAC	2	10	34114	34123	20 %	20 %	20 %	40 %	384417106
22	NC_017267	GATTT	2	10	37161	37170	20 %	60 %	20 %	0 %	384417108
23	NC_017267	GGCAG	2	10	37216	37225	20 %	0 %	60 %	20 %	384417108
24	NC_017267	GCAAG	2	10	38539	38548	40 %	0 %	40 %	20 %	384417110
25	NC_017267	GATCG	2	10	40499	40508	20 %	20 %	40 %	20 %	384417111
26	NC_017267	AGCTG	2	10	40735	40744	20 %	20 %	40 %	20 %	384417111
27	NC_017267	CGATC	2	10	41379	41388	20 %	20 %	20 %	40 %	384417112
28	NC_017267	AGCCT	2	10	42217	42226	20 %	20 %	20 %	40 %	384417112
29	NC_017267	CCAGC	2	10	42972	42981	20 %	0 %	20 %	60 %	384417112
30	NC_017267	AACTC	2	10	45699	45708	40 %	20 %	0 %	40 %	384417113
31	NC_017267	CAGCC	2	10	46822	46831	20 %	0 %	20 %	60 %	384417114
32	NC_017267	GCATT	2	10	47240	47249	20 %	40 %	20 %	20 %	384417115
33	NC_017267	TGCGG	2	10	48752	48761	0 %	20 %	60 %	20 %	384417117
34	NC_017267	GCGCA	2	10	48850	48859	20 %	0 %	40 %	40 %	384417117
35	NC_017267	GGCTG	2	10	50747	50756	0 %	20 %	60 %	20 %	384417119
36	NC_017267	GGATG	2	10	52553	52562	20 %	20 %	60 %	0 %	384417120
37	NC_017267	GCGCA	2	10	54004	54013	20 %	0 %	40 %	40 %	384417122
38	NC_017267	GACCA	2	10	55390	55399	40 %	0 %	20 %	40 %	384417124
39	NC_017267	GCTTG	2	10	57787	57796	0 %	40 %	40 %	20 %	384417126
40	NC_017267	AGCGC	2	10	59655	59664	20 %	0 %	40 %	40 %	384417127
41	NC_017267	AGCGA	2	10	60924	60933	40 %	0 %	40 %	20 %	384417128
42	NC_017267	GGCCG	2	10	62999	63008	0 %	0 %	60 %	40 %	384417131
43	NC_017267	GCCGC	2	10	63228	63237	0 %	0 %	40 %	60 %	384417131
44	NC_017267	GTTGC	2	10	66155	66164	0 %	40 %	40 %	20 %	384417133
45	NC_017267	CCTGC	2	10	68011	68020	0 %	20 %	20 %	60 %	384417136
46	NC_017267	GGTGT	2	10	71232	71241	0 %	40 %	60 %	0 %	384417137
47	NC_017267	TGCAC	2	10	72596	72605	20 %	20 %	20 %	40 %	384417138
48	NC_017267	TGCAC	2	10	75233	75242	20 %	20 %	20 %	40 %	384417140
49	NC_017267	CACGC	2	10	76955	76964	20 %	0 %	20 %	60 %	384417141
50	NC_017267	ACGGC	2	10	78137	78146	20 %	0 %	40 %	40 %	384417142
51	NC_017267	GCACG	2	10	80014	80023	20 %	0 %	40 %	40 %	384417144
52	NC_017267	CGCTG	2	10	81280	81289	0 %	20 %	40 %	40 %	384417145
53	NC_017267	GTCGT	2	10	81615	81624	0 %	40 %	40 %	20 %	384417145
54	NC_017267	ATCGC	2	10	82068	82077	20 %	20 %	20 %	40 %	384417145
55	NC_017267	TGGTC	2	10	82905	82914	0 %	40 %	40 %	20 %	384417146
56	NC_017267	CGCAG	2	10	83933	83942	20 %	0 %	40 %	40 %	384417148
57	NC_017267	GCGCG	2	10	84167	84176	0 %	0 %	60 %	40 %	384417148
58	NC_017267	CGAAC	2	10	85023	85032	40 %	0 %	20 %	40 %	384417149
59	NC_017267	ATCAC	2	10	87327	87336	40 %	20 %	0 %	40 %	384417151
60	NC_017267	TTGCG	2	10	89427	89436	0 %	40 %	40 %	20 %	384417153
61	NC_017267	GACGA	2	10	96561	96570	40 %	0 %	40 %	20 %	384417162
62	NC_017267	CAGCG	2	10	98832	98841	20 %	0 %	40 %	40 %	384417165
63	NC_017267	CGGCG	2	10	99746	99755	0 %	0 %	60 %	40 %	384417166
64	NC_017267	GCCGC	2	10	99969	99978	0 %	0 %	40 %	60 %	384417167
65	NC_017267	CGCCA	2	10	100355	100364	20 %	0 %	20 %	60 %	384417168
66	NC_017267	TGGGG	2	10	101905	101914	0 %	20 %	80 %	0 %	384417168
67	NC_017267	CGGGG	2	10	102947	102956	0 %	0 %	80 %	20 %	384417169
68	NC_017267	ACAGA	2	10	103091	103100	60 %	0 %	20 %	20 %	384417169
69	NC_017267	GTGCG	2	10	104041	104050	0 %	20 %	60 %	20 %	384417169
70	NC_017267	GGTCG	2	10	104177	104186	0 %	20 %	60 %	20 %	384417169
71	NC_017267	CGGCG	2	10	106193	106202	0 %	0 %	60 %	40 %	384417169
72	NC_017267	GCCAC	2	10	107400	107409	20 %	0 %	20 %	60 %	384417171
73	NC_017267	CGCGG	2	10	108176	108185	0 %	0 %	60 %	40 %	384417171
74	NC_017267	ATCGC	2	10	110738	110747	20 %	20 %	20 %	40 %	384417172
75	NC_017267	AGCGC	2	10	110877	110886	20 %	0 %	40 %	40 %	384417172
76	NC_017267	TTGCG	2	10	111900	111909	0 %	40 %	40 %	20 %	384417175
77	NC_017267	ACGGC	2	10	112805	112814	20 %	0 %	40 %	40 %	384417177
78	NC_017267	GCCGC	3	15	113831	113845	0 %	0 %	40 %	60 %	384417178
79	NC_017267	TTCGA	2	10	114861	114870	20 %	40 %	20 %	20 %	384417180
80	NC_017267	CGACC	2	10	115630	115639	20 %	0 %	20 %	60 %	384417181
81	NC_017267	CGTGG	2	10	116539	116548	0 %	20 %	60 %	20 %	384417183
82	NC_017267	GCCCG	2	10	116588	116597	0 %	0 %	40 %	60 %	384417183
83	NC_017267	CACGC	2	10	120175	120184	20 %	0 %	20 %	60 %	384417187
84	NC_017267	GTGCG	2	10	121242	121251	0 %	20 %	60 %	20 %	384417188
85	NC_017267	AATGC	2	10	121975	121984	40 %	20 %	20 %	20 %	384417189
86	NC_017267	CGGTG	2	10	123269	123278	0 %	20 %	60 %	20 %	384417190
87	NC_017267	GTGCA	2	10	124324	124333	20 %	20 %	40 %	20 %	384417191
88	NC_017267	GCCCA	2	10	127692	127701	20 %	0 %	20 %	60 %	384417192
89	NC_017267	CTGGT	2	10	132304	132313	0 %	40 %	40 %	20 %	384417195
90	NC_017267	CAGCG	2	10	133386	133395	20 %	0 %	40 %	40 %	384417195
91	NC_017267	AGGCC	2	10	134095	134104	20 %	0 %	40 %	40 %	384417196
92	NC_017267	CACCG	2	10	136454	136463	20 %	0 %	20 %	60 %	384417196
93	NC_017267	CGCTG	2	10	137653	137662	0 %	20 %	40 %	40 %	384417196
94	NC_017267	ACACC	2	10	138010	138019	40 %	0 %	0 %	60 %	384417196
95	NC_017267	GACGC	2	10	139365	139374	20 %	0 %	40 %	40 %	384417198
96	NC_017267	CCAGG	2	10	144393	144402	20 %	0 %	40 %	40 %	384417204
97	NC_017267	GCTGC	2	10	144984	144993	0 %	20 %	40 %	40 %	384417204
98	NC_017267	AGGCC	2	10	146693	146702	20 %	0 %	40 %	40 %	384417204
99	NC_017267	GCGTT	2	10	147947	147956	0 %	40 %	40 %	20 %	384417205
100	NC_017267	GCAAG	2	10	148516	148525	40 %	0 %	40 %	20 %	384417207
101	NC_017267	GACCA	2	10	149321	149330	40 %	0 %	20 %	40 %	384417207
102	NC_017267	GCTGG	2	10	155786	155795	0 %	20 %	60 %	20 %	384417211
103	NC_017267	GGCGT	2	10	155886	155895	0 %	20 %	60 %	20 %	384417211
104	NC_017267	CAGCG	2	10	161765	161774	20 %	0 %	40 %	40 %	384417218
105	NC_017267	GCACC	2	10	161950	161959	20 %	0 %	20 %	60 %	384417218
106	NC_017267	CAGGC	2	10	163843	163852	20 %	0 %	40 %	40 %	384417219
107	NC_017267	CATTT	2	10	165381	165390	20 %	60 %	0 %	20 %	384417220
108	NC_017267	CCAGA	2	10	167117	167126	40 %	0 %	20 %	40 %	384417221
109	NC_017267	CAGCG	2	10	167697	167706	20 %	0 %	40 %	40 %	384417222
110	NC_017267	ATGGA	2	10	168796	168805	40 %	20 %	40 %	0 %	384417223
111	NC_017267	GCTGC	2	10	169678	169687	0 %	20 %	40 %	40 %	384417225
112	NC_017267	TGCGC	2	10	169983	169992	0 %	20 %	40 %	40 %	384417225
113	NC_017267	TGGCC	2	10	170736	170745	0 %	20 %	40 %	40 %	384417227
114	NC_017267	ACCGC	2	10	171323	171332	20 %	0 %	20 %	60 %	384417227
115	NC_017267	TGCAA	2	10	175763	175772	40 %	20 %	20 %	20 %	384417231
116	NC_017267	CCGCA	2	10	176227	176236	20 %	0 %	20 %	60 %	384417232
117	NC_017267	GCCCG	2	10	180174	180183	0 %	0 %	40 %	60 %	384417235
118	NC_017267	GGTCG	2	10	180378	180387	0 %	20 %	60 %	20 %	384417236
119	NC_017267	GTGCT	2	10	180765	180774	0 %	40 %	40 %	20 %	384417237
120	NC_017267	AGGCA	2	10	181892	181901	40 %	0 %	40 %	20 %	384417241
121	NC_017267	CCGCG	2	10	182711	182720	0 %	0 %	40 %	60 %	384417244
122	NC_017267	CTGCA	2	10	184334	184343	20 %	20 %	20 %	40 %	384417247
123	NC_017267	CGGCA	2	10	187838	187847	20 %	0 %	40 %	40 %	384417253
124	NC_017267	TGCAC	2	10	190999	191008	20 %	20 %	20 %	40 %	384417255
125	NC_017267	GGCTG	2	10	191973	191982	0 %	20 %	60 %	20 %	384417256
126	NC_017267	CGGGC	2	10	192127	192136	0 %	0 %	60 %	40 %	384417256
127	NC_017267	GCCTG	2	10	193605	193614	0 %	20 %	40 %	40 %	384417258
128	NC_017267	GGCGC	2	10	194958	194967	0 %	0 %	60 %	40 %	384417261
129	NC_017267	TGCGC	2	10	197185	197194	0 %	20 %	40 %	40 %	384417263
130	NC_017267	GCGCA	2	10	198300	198309	20 %	0 %	40 %	40 %	384417266
131	NC_017267	TGGCG	2	10	201913	201922	0 %	20 %	60 %	20 %	384417271
132	NC_017267	GGCGC	2	10	201935	201944	0 %	0 %	60 %	40 %	384417271
133	NC_017267	GCGCG	2	10	202112	202121	0 %	0 %	60 %	40 %	384417272
134	NC_017267	CCTGG	2	10	204862	204871	0 %	20 %	40 %	40 %	384417273
135	NC_017267	GGCGA	2	10	204968	204977	20 %	0 %	60 %	20 %	384417273
136	NC_017267	CGCAG	2	10	206174	206183	20 %	0 %	40 %	40 %	384417273
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253	NC_017267	GGCCG	2	10	393295	393304	0 %	0 %	60 %	40 %	384417434
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259	NC_017267	CGGCG	2	10	399490	399499	0 %	0 %	60 %	40 %	384417443
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