MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 101179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017267	CGC	2	6	159068	159073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417215
3003	NC_017267	GC	3	6	159115	159120	0 %	0 %	50 %	50 %	384417215
3004	NC_017267	CGGC	2	8	159160	159167	0 %	0 %	50 %	50 %	384417215
3005	NC_017267	TG	3	6	159312	159317	0 %	50 %	50 %	0 %	384417216
3006	NC_017267	A	6	6	159410	159415	100 %	0 %	0 %	0 %	384417216
3007	NC_017267	GCG	2	6	159544	159549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417217
3008	NC_017267	TCG	2	6	159589	159594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417217
3009	NC_017267	GAACTC	2	12	159660	159671	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384417217
3010	NC_017267	CCA	2	6	159698	159703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417217
3011	NC_017267	CG	3	6	159708	159713	0 %	0 %	50 %	50 %	384417217
3012	NC_017267	CA	3	6	159757	159762	50 %	0 %	0 %	50 %	384417217
3013	NC_017267	GCCA	2	8	159789	159796	25 %	0 %	25 %	50 %	384417217
3014	NC_017267	GCG	2	6	159802	159807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417217
3015	NC_017267	GAT	2	6	159840	159845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417217
3016	NC_017267	ACC	2	6	159895	159900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417217
3017	NC_017267	CGA	2	6	160049	160054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417217
3018	NC_017267	GCA	2	6	160137	160142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417217
3019	NC_017267	GCA	3	9	160148	160156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417217
3020	NC_017267	TGGC	2	8	160216	160223	0 %	25 %	50 %	25 %	384417217
3021	NC_017267	CCA	2	6	160244	160249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417217
3022	NC_017267	GCCG	2	8	160257	160264	0 %	0 %	50 %	50 %	384417217
3023	NC_017267	CG	3	6	160275	160280	0 %	0 %	50 %	50 %	384417217
3024	NC_017267	TGG	2	6	160313	160318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417217
3025	NC_017267	GCA	2	6	160325	160330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417217
3026	NC_017267	CTT	2	6	160332	160337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417217
3027	NC_017267	GCC	2	6	160371	160376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417217
3028	NC_017267	CGGC	2	8	160399	160406	0 %	0 %	50 %	50 %	384417217
3029	NC_017267	CAG	2	6	160410	160415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417217
3030	NC_017267	AAC	2	6	160432	160437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417217
3031	NC_017267	CG	3	6	160490	160495	0 %	0 %	50 %	50 %	384417217
3032	NC_017267	GCT	3	9	160514	160522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417217
3033	NC_017267	GC	3	6	160537	160542	0 %	0 %	50 %	50 %	384417217
3034	NC_017267	TCG	2	6	160564	160569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417217
3035	NC_017267	TTG	2	6	160597	160602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417217
3036	NC_017267	AAG	2	6	160675	160680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417217
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3041	NC_017267	GAC	2	6	160994	160999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417218
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3043	NC_017267	CGA	3	9	161035	161043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417218
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3045	NC_017267	GC	3	6	161055	161060	0 %	0 %	50 %	50 %	384417218
3046	NC_017267	GCT	2	6	161071	161076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417218
3047	NC_017267	TGG	2	6	161094	161099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417218
3048	NC_017267	CG	3	6	161100	161105	0 %	0 %	50 %	50 %	384417218
3049	NC_017267	GC	4	8	161154	161161	0 %	0 %	50 %	50 %	384417218
3050	NC_017267	GCG	2	6	161178	161183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417218
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3052	NC_017267	TGC	2	6	161277	161282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417218
3053	NC_017267	CTC	2	6	161311	161316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384417218
3054	NC_017267	CGG	2	6	161317	161322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417218
3055	NC_017267	TGC	2	6	161325	161330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417218
3056	NC_017267	GGC	2	6	161367	161372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417218
3057	NC_017267	GCA	2	6	161388	161393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417218
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3059	NC_017267	GGC	2	6	161759	161764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417218
3060	NC_017267	CAGCG	2	10	161765	161774	20 %	0 %	40 %	40 %	384417218
3061	NC_017267	CGGG	2	8	161826	161833	0 %	0 %	75 %	25 %	384417218
3062	NC_017267	GATC	2	8	161836	161843	25 %	25 %	25 %	25 %	384417218
3063	NC_017267	CG	3	6	161869	161874	0 %	0 %	50 %	50 %	384417218
3064	NC_017267	GCCG	2	8	161901	161908	0 %	0 %	50 %	50 %	384417218
3065	NC_017267	GCACC	2	10	161950	161959	20 %	0 %	20 %	60 %	384417218
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3089	NC_017267	TGG	2	6	162970	162975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417218
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3091	NC_017267	ATG	2	6	163669	163674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417219
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3093	NC_017267	CCGG	2	8	163777	163784	0 %	0 %	50 %	50 %	384417219
3094	NC_017267	GCA	3	9	163818	163826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417219
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3099	NC_017267	CG	3	6	163931	163936	0 %	0 %	50 %	50 %	384417219
3100	NC_017267	GGC	2	6	163953	163958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417219
3101	NC_017267	CG	3	6	163982	163987	0 %	0 %	50 %	50 %	384417219
3102	NC_017267	GCA	2	6	164091	164096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417219
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3104	NC_017267	TTC	2	6	164211	164216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417219
3105	NC_017267	CATTT	2	10	165381	165390	20 %	60 %	0 %	20 %	384417220
3106	NC_017267	CAG	2	6	165462	165467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417220
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3108	NC_017267	GC	5	10	165580	165589	0 %	0 %	50 %	50 %	384417220
3109	NC_017267	CGCC	2	8	165613	165620	0 %	0 %	25 %	75 %	384417220
3110	NC_017267	TCC	2	6	165673	165678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384417220
3111	NC_017267	CAGC	2	8	165774	165781	25 %	0 %	25 %	50 %	384417220
3112	NC_017267	GCA	2	6	165896	165901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417220
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3117	NC_017267	CG	4	8	166148	166155	0 %	0 %	50 %	50 %	384417220
3118	NC_017267	GCC	2	6	166156	166161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417220
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3120	NC_017267	CGC	2	6	166181	166186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417220
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3122	NC_017267	GCA	2	6	166289	166294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417220
3123	NC_017267	GCC	2	6	166362	166367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417220
3124	NC_017267	GGC	2	6	166390	166395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417220
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3126	NC_017267	GCG	2	6	166429	166434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417220
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3234	NC_017267	TCGA	2	8	171118	171125	25 %	25 %	25 %	25 %	384417227
3235	NC_017267	GC	3	6	171134	171139	0 %	0 %	50 %	50 %	384417227
3236	NC_017267	G	7	7	171168	171174	0 %	0 %	100 %	0 %	384417227
3237	NC_017267	GC	4	8	171230	171237	0 %	0 %	50 %	50 %	384417227
3238	NC_017267	ACCGC	2	10	171323	171332	20 %	0 %	20 %	60 %	384417227
3239	NC_017267	CG	3	6	171345	171350	0 %	0 %	50 %	50 %	384417227
3240	NC_017267	GGC	2	6	171367	171372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417227
3241	NC_017267	GGT	2	6	171396	171401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417227
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3243	NC_017267	CGCCTG	2	12	171571	171582	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384417227
3244	NC_017267	GAC	2	6	171583	171588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417227
3245	NC_017267	CGA	2	6	171600	171605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417227
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3249	NC_017267	CTG	2	6	172062	172067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417228
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3252	NC_017267	CGT	2	6	172143	172148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417229
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3331	NC_017267	GC	4	8	177647	177654	0 %	0 %	50 %	50 %	384417233
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3355	NC_017267	ACGGTG	2	12	178932	178943	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384417234
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3487	NC_017267	GCC	2	6	184728	184733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417247
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3491	NC_017267	CG	3	6	185012	185017	0 %	0 %	50 %	50 %	384417248
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