MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 101179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017267	CAG	3	9	60111	60119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417128
1002	NC_017267	ACA	2	6	60121	60126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417128
1003	NC_017267	CGA	2	6	60149	60154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417128
1004	NC_017267	GC	4	8	60165	60172	0 %	0 %	50 %	50 %	384417128
1005	NC_017267	CGAT	2	8	60217	60224	25 %	25 %	25 %	25 %	384417128
1006	NC_017267	GCG	2	6	60250	60255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417128
1007	NC_017267	GCA	2	6	60262	60267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417128
1008	NC_017267	CAT	2	6	60281	60286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417128
1009	NC_017267	GCA	2	6	60355	60360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417128
1010	NC_017267	GGCTAC	2	12	60375	60386	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384417128
1011	NC_017267	AGA	2	6	60430	60435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417128
1012	NC_017267	AGC	2	6	60442	60447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417128
1013	NC_017267	CGG	2	6	60455	60460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417128
1014	NC_017267	GCA	2	6	60490	60495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417128
1015	NC_017267	CGG	2	6	60500	60505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417128
1016	NC_017267	CTG	2	6	60507	60512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417128
1017	NC_017267	CGG	2	6	60517	60522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417128
1018	NC_017267	CGA	2	6	60533	60538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417128
1019	NC_017267	CG	3	6	60568	60573	0 %	0 %	50 %	50 %	384417128
1020	NC_017267	GC	3	6	60631	60636	0 %	0 %	50 %	50 %	384417128
1021	NC_017267	TGG	2	6	60649	60654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417128
1022	NC_017267	ACA	2	6	60703	60708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417128
1023	NC_017267	CAT	2	6	60719	60724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417128
1024	NC_017267	CAC	2	6	60797	60802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417128
1025	NC_017267	CG	3	6	60803	60808	0 %	0 %	50 %	50 %	384417128
1026	NC_017267	TTA	2	6	60809	60814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384417128
1027	NC_017267	AGCGA	2	10	60924	60933	40 %	0 %	40 %	20 %	384417128
1028	NC_017267	GCG	2	6	60952	60957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417128
1029	NC_017267	ACG	2	6	60958	60963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417128
1030	NC_017267	GAA	2	6	60969	60974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417128
1031	NC_017267	CCG	2	6	61051	61056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417128
1032	NC_017267	CGCA	2	8	61070	61077	25 %	0 %	25 %	50 %	384417128
1033	NC_017267	GAAGGC	2	12	61100	61111	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384417128
1034	NC_017267	CGG	2	6	61138	61143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417128
1035	NC_017267	GC	3	6	61146	61151	0 %	0 %	50 %	50 %	384417128
1036	NC_017267	CGG	2	6	61153	61158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417128
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1038	NC_017267	TGC	2	6	61471	61476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417129
1039	NC_017267	CGC	2	6	61540	61545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417129
1040	NC_017267	CG	3	6	61605	61610	0 %	0 %	50 %	50 %	384417129
1041	NC_017267	TGC	2	6	61613	61618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417129
1042	NC_017267	AGC	2	6	61619	61624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417129
1043	NC_017267	GCCG	2	8	61679	61686	0 %	0 %	50 %	50 %	384417129
1044	NC_017267	CGC	2	6	61699	61704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417129
1045	NC_017267	CAG	2	6	61705	61710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417129
1046	NC_017267	GC	3	6	61763	61768	0 %	0 %	50 %	50 %	384417129
1047	NC_017267	GC	3	6	61771	61776	0 %	0 %	50 %	50 %	384417129
1048	NC_017267	CG	3	6	61890	61895	0 %	0 %	50 %	50 %	384417129
1049	NC_017267	CTGC	2	8	61896	61903	0 %	25 %	25 %	50 %	384417129
1050	NC_017267	CGC	2	6	61917	61922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417129
1051	NC_017267	CG	3	6	61948	61953	0 %	0 %	50 %	50 %	384417129
1052	NC_017267	GCA	2	6	62016	62021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417129
1053	NC_017267	CTG	2	6	62062	62067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417129
1054	NC_017267	GAC	3	9	62091	62099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417129
1055	NC_017267	CGGCCA	2	12	62160	62171	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384417129
1056	NC_017267	CGC	2	6	62188	62193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417129
1057	NC_017267	GC	3	6	62205	62210	0 %	0 %	50 %	50 %	384417129
1058	NC_017267	GCA	2	6	62256	62261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417129
1059	NC_017267	CAC	2	6	62296	62301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417129
1060	NC_017267	GCATCG	2	12	62303	62314	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384417129
1061	NC_017267	CG	3	6	62330	62335	0 %	0 %	50 %	50 %	384417129
1062	NC_017267	GTACCT	2	12	62361	62372	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384417129
1063	NC_017267	TGC	2	6	62387	62392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417129
1064	NC_017267	GC	3	6	62391	62396	0 %	0 %	50 %	50 %	384417129
1065	NC_017267	ACC	2	6	62482	62487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417130
1066	NC_017267	GGT	2	6	62496	62501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417130
1067	NC_017267	T	6	6	62526	62531	0 %	100 %	0 %	0 %	384417130
1068	NC_017267	TTC	2	6	62595	62600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417130
1069	NC_017267	TTC	2	6	62610	62615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417130
1070	NC_017267	CCA	3	9	62624	62632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417130
1071	NC_017267	CG	3	6	62704	62709	0 %	0 %	50 %	50 %	384417130
1072	NC_017267	GC	3	6	62782	62787	0 %	0 %	50 %	50 %	384417130
1073	NC_017267	GCC	2	6	62908	62913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417131
1074	NC_017267	CGC	2	6	62921	62926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417131
1075	NC_017267	GC	3	6	62925	62930	0 %	0 %	50 %	50 %	384417131
1076	NC_017267	CCA	2	6	62986	62991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417131
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1078	NC_017267	ACC	2	6	63021	63026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417131
1079	NC_017267	GCA	2	6	63028	63033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417131
1080	NC_017267	CAA	2	6	63050	63055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417131
1081	NC_017267	GCA	2	6	63097	63102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417131
1082	NC_017267	GAT	2	6	63176	63181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417131
1083	NC_017267	CGC	2	6	63212	63217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417131
1084	NC_017267	GCCGC	2	10	63228	63237	0 %	0 %	40 %	60 %	384417131
1085	NC_017267	CAG	2	6	63248	63253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417131
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1087	NC_017267	GCA	2	6	63370	63375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417131
1088	NC_017267	CCA	2	6	63398	63403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417131
1089	NC_017267	GC	3	6	63433	63438	0 %	0 %	50 %	50 %	384417131
1090	NC_017267	GC	3	6	63461	63466	0 %	0 %	50 %	50 %	384417131
1091	NC_017267	CGGC	2	8	63473	63480	0 %	0 %	50 %	50 %	384417131
1092	NC_017267	GCCA	2	8	63498	63505	25 %	0 %	25 %	50 %	384417131
1093	NC_017267	CAG	2	6	63518	63523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417131
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1096	NC_017267	CAT	2	6	63963	63968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417132
1097	NC_017267	CAA	2	6	63972	63977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417132
1098	NC_017267	CCGG	2	8	63979	63986	0 %	0 %	50 %	50 %	384417132
1099	NC_017267	CGG	2	6	64104	64109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417132
1100	NC_017267	CGG	2	6	64113	64118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417132
1101	NC_017267	ACA	2	6	64181	64186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417132
1102	NC_017267	GCTG	2	8	64404	64411	0 %	25 %	50 %	25 %	384417132
1103	NC_017267	CGC	2	6	64414	64419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417132
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1105	NC_017267	TCG	2	6	64643	64648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417132
1106	NC_017267	ACC	2	6	64834	64839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417132
1107	NC_017267	GCG	2	6	64889	64894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417132
1108	NC_017267	CGTC	2	8	64990	64997	0 %	25 %	25 %	50 %	384417132
1109	NC_017267	CTGG	2	8	65083	65090	0 %	25 %	50 %	25 %	384417132
1110	NC_017267	G	7	7	65527	65533	0 %	0 %	100 %	0 %	384417133
1111	NC_017267	GCG	2	6	65573	65578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417133
1112	NC_017267	GCC	2	6	65603	65608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417133
1113	NC_017267	GCA	2	6	65610	65615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417133
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1115	NC_017267	TGG	2	6	65720	65725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417133
1116	NC_017267	GC	3	6	65770	65775	0 %	0 %	50 %	50 %	384417133
1117	NC_017267	CCTG	2	8	65777	65784	0 %	25 %	25 %	50 %	384417133
1118	NC_017267	CCG	2	6	65816	65821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417133
1119	NC_017267	GGC	2	6	65827	65832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417133
1120	NC_017267	CG	3	6	65861	65866	0 %	0 %	50 %	50 %	384417133
1121	NC_017267	CTG	2	6	65896	65901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417133
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1124	NC_017267	CTG	2	6	65989	65994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417133
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1126	NC_017267	CGA	2	6	66062	66067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417133
1127	NC_017267	CGG	2	6	66102	66107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417133
1128	NC_017267	CGG	2	6	66132	66137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417133
1129	NC_017267	GCT	3	9	66146	66154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417133
1130	NC_017267	GTTGC	2	10	66155	66164	0 %	40 %	40 %	20 %	384417133
1131	NC_017267	GCTC	2	8	66227	66234	0 %	25 %	25 %	50 %	384417133
1132	NC_017267	TGCA	2	8	66287	66294	25 %	25 %	25 %	25 %	384417134
1133	NC_017267	GAA	2	6	66295	66300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417134
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1139	NC_017267	GAA	2	6	66491	66496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417134
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1143	NC_017267	GCG	2	6	66769	66774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417134
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1159	NC_017267	TGT	2	6	67902	67907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417136
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1234	NC_017267	CCA	2	6	73943	73948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417139
1235	NC_017267	TGC	2	6	73960	73965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417139
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1239	NC_017267	GCCT	2	8	74141	74148	0 %	25 %	25 %	50 %	384417139
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1241	NC_017267	ACCG	2	8	74300	74307	25 %	0 %	25 %	50 %	384417139
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1247	NC_017267	CAG	2	6	74408	74413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417139
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1249	NC_017267	CG	3	6	74493	74498	0 %	0 %	50 %	50 %	384417139
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1378	NC_017267	GCA	2	6	80910	80915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417144
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1380	NC_017267	GTT	2	6	80974	80979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417144
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1382	NC_017267	CGT	2	6	81127	81132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417145
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1480	NC_017267	GC	3	6	84429	84434	0 %	0 %	50 %	50 %	384417148
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1488	NC_017267	GCC	2	6	84697	84702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417148
1489	NC_017267	CAGC	2	8	84726	84733	25 %	0 %	25 %	50 %	384417148
1490	NC_017267	ACGGGT	2	12	84740	84751	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384417148
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1496	NC_017267	AGT	2	6	85073	85078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417149
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1500	NC_017267	GGA	2	6	85286	85291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384417149

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