MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 107169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016010	ACC	2	6	140212	140217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723060
3002	NC_016010	ATC	2	6	140218	140223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723060
3003	NC_016010	ACG	2	6	140234	140239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723060
3004	NC_016010	CAA	2	6	140268	140273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723060
3005	NC_016010	CG	3	6	140275	140280	0 %	0 %	50 %	50 %	346723060
3006	NC_016010	GCAG	2	8	140544	140551	25 %	0 %	50 %	25 %	346723060
3007	NC_016010	CAA	2	6	140667	140672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723060
3008	NC_016010	GAA	2	6	140686	140691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346723060
3009	NC_016010	GCGT	2	8	140765	140772	0 %	25 %	50 %	25 %	346723060
3010	NC_016010	CAA	2	6	140814	140819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723060
3011	NC_016010	ACA	3	9	140852	140860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723060
3012	NC_016010	TGG	2	6	140879	140884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723060
3013	NC_016010	CTG	3	9	140902	140910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723060
3014	NC_016010	CCGTGG	2	12	140972	140983	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	346723060
3015	NC_016010	GCAC	2	8	140992	140999	25 %	0 %	25 %	50 %	346723060
3016	NC_016010	CGG	2	6	141006	141011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723060
3017	NC_016010	CCA	2	6	141038	141043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723060
3018	NC_016010	CAG	2	6	141159	141164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723060
3019	NC_016010	CCT	2	6	141176	141181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	346723060
3020	NC_016010	ACG	2	6	141209	141214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723060
3021	NC_016010	TGA	2	6	141389	141394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723060
3022	NC_016010	TCG	2	6	141421	141426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723060
3023	NC_016010	GCCG	2	8	141463	141470	0 %	0 %	50 %	50 %	346723060
3024	NC_016010	CCA	2	6	141479	141484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723060
3025	NC_016010	CGA	2	6	141489	141494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723060
3026	NC_016010	CAC	2	6	141561	141566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723060
3027	NC_016010	AGCA	2	8	141598	141605	50 %	0 %	25 %	25 %	346723060
3028	NC_016010	CGA	2	6	141651	141656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723060
3029	NC_016010	CGC	2	6	141668	141673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723060
3030	NC_016010	GTG	2	6	142125	142130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723061
3031	NC_016010	TGT	2	6	142142	142147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346723061
3032	NC_016010	TGCG	2	8	142163	142170	0 %	25 %	50 %	25 %	346723061
3033	NC_016010	GCC	3	9	142171	142179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723061
3034	NC_016010	TTG	2	6	142192	142197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346723061
3035	NC_016010	CGA	2	6	142320	142325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723061
3036	NC_016010	TCT	2	6	142385	142390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723061
3037	NC_016010	CG	3	6	142533	142538	0 %	0 %	50 %	50 %	346723061
3038	NC_016010	GCC	2	6	142573	142578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723061
3039	NC_016010	GCG	2	6	142667	142672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723061
3040	NC_016010	ACG	2	6	142703	142708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723061
3041	NC_016010	GCCG	2	8	142732	142739	0 %	0 %	50 %	50 %	346723061
3042	NC_016010	CGC	2	6	142748	142753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723061
3043	NC_016010	CGA	2	6	142797	142802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723061
3044	NC_016010	CGG	2	6	142833	142838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723061
3045	NC_016010	CG	3	6	142851	142856	0 %	0 %	50 %	50 %	346723061
3046	NC_016010	CAC	2	6	142869	142874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723061
3047	NC_016010	CGC	2	6	142905	142910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723061
3048	NC_016010	CCGC	2	8	142948	142955	0 %	0 %	25 %	75 %	346723061
3049	NC_016010	CG	4	8	143001	143008	0 %	0 %	50 %	50 %	346723061
3050	NC_016010	ACC	2	6	143053	143058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723061
3051	NC_016010	ACT	2	6	143102	143107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723061
3052	NC_016010	GCC	2	6	143203	143208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723061
3053	NC_016010	GGCCA	2	10	143212	143221	20 %	0 %	40 %	40 %	346723061
3054	NC_016010	CAA	2	6	143266	143271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723061
3055	NC_016010	GTG	2	6	143275	143280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723061
3056	NC_016010	CGG	2	6	143310	143315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723061
3057	NC_016010	GC	3	6	143405	143410	0 %	0 %	50 %	50 %	346723061
3058	NC_016010	GC	3	6	143469	143474	0 %	0 %	50 %	50 %	346723061
3059	NC_016010	CCA	2	6	143494	143499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723061
3060	NC_016010	CCA	2	6	143528	143533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723061
3061	NC_016010	CAA	2	6	143570	143575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723061
3062	NC_016010	CGC	2	6	143627	143632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723061
3063	NC_016010	ACG	2	6	143681	143686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723061
3064	NC_016010	CCAC	2	8	143732	143739	25 %	0 %	0 %	75 %	346723061
3065	NC_016010	GCA	2	6	143744	143749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723061
3066	NC_016010	CG	4	8	143787	143794	0 %	0 %	50 %	50 %	346723061
3067	NC_016010	CGC	4	12	143898	143909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723061
3068	NC_016010	CAGCTG	2	12	143944	143955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	346723061
3069	NC_016010	CG	3	6	143966	143971	0 %	0 %	50 %	50 %	346723061
3070	NC_016010	CAC	2	6	144048	144053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723061
3071	NC_016010	GCT	2	6	144066	144071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723061
3072	NC_016010	CTG	2	6	144103	144108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723061
3073	NC_016010	GCC	2	6	144134	144139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723061
3074	NC_016010	CGC	2	6	144256	144261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723061
3075	NC_016010	TGG	2	6	144271	144276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723061
3076	NC_016010	AGC	2	6	144281	144286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723061
3077	NC_016010	CGG	2	6	144309	144314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723061
3078	NC_016010	CGA	2	6	144324	144329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723061
3079	NC_016010	GCA	2	6	144342	144347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723061
3080	NC_016010	CCA	2	6	144455	144460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723061
3081	NC_016010	CGA	2	6	144468	144473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723061
3082	NC_016010	CAT	2	6	144585	144590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723061
3083	NC_016010	CTG	2	6	144613	144618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723061
3084	NC_016010	CGG	2	6	144636	144641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723061
3085	NC_016010	TGGCAA	2	12	144667	144678	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	346723061
3086	NC_016010	GGC	2	6	144721	144726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723061
3087	NC_016010	GCC	2	6	144746	144751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723061
3088	NC_016010	CGG	2	6	144858	144863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723061
3089	NC_016010	GCG	3	9	144881	144889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723061
3090	NC_016010	GCC	2	6	144913	144918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723061
3091	NC_016010	CGC	2	6	145062	145067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723061
3092	NC_016010	GAC	2	6	145075	145080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723061
3093	NC_016010	CGC	2	6	145143	145148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723061
3094	NC_016010	AG	3	6	145168	145173	50 %	0 %	50 %	0 %	346723061
3095	NC_016010	TGG	2	6	145210	145215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723061
3096	NC_016010	GGC	2	6	145264	145269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723061
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3098	NC_016010	GCCATC	2	12	145351	145362	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	346723061
3099	NC_016010	ACA	2	6	145400	145405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723061
3100	NC_016010	GC	3	6	145422	145427	0 %	0 %	50 %	50 %	346723061
3101	NC_016010	ACG	2	6	145493	145498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723061
3102	NC_016010	A	6	6	145541	145546	100 %	0 %	0 %	0 %	346723061
3103	NC_016010	CATCGA	2	12	145554	145565	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	346723061
3104	NC_016010	CAC	2	6	145581	145586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723061
3105	NC_016010	CCA	2	6	145613	145618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723061
3106	NC_016010	GCCG	2	8	145722	145729	0 %	0 %	50 %	50 %	346723061
3107	NC_016010	GGA	2	6	145743	145748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	346723061
3108	NC_016010	CG	3	6	145799	145804	0 %	0 %	50 %	50 %	346723061
3109	NC_016010	CAC	2	6	145818	145823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723061
3110	NC_016010	CGC	2	6	145848	145853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723061
3111	NC_016010	TCA	2	6	145880	145885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723061
3112	NC_016010	CGC	2	6	145896	145901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723061
3113	NC_016010	CAA	2	6	145917	145922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723061
3114	NC_016010	CCAACC	2	12	145936	145947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723061
3115	NC_016010	A	6	6	145962	145967	100 %	0 %	0 %	0 %	346723061
3116	NC_016010	CGT	2	6	146184	146189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723062
3117	NC_016010	ACTG	2	8	146193	146200	25 %	25 %	25 %	25 %	346723062
3118	NC_016010	GAA	2	6	146411	146416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346723063
3119	NC_016010	GC	3	6	146485	146490	0 %	0 %	50 %	50 %	346723063
3120	NC_016010	ACC	2	6	146517	146522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723063
3121	NC_016010	AAAG	2	8	146582	146589	75 %	0 %	25 %	0 %	346723063
3122	NC_016010	GAA	2	6	146600	146605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346723063
3123	NC_016010	GAA	2	6	146608	146613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346723063
3124	NC_016010	CTA	2	6	146659	146664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723063
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3126	NC_016010	GAAA	2	8	146713	146720	75 %	0 %	25 %	0 %	346723063
3127	NC_016010	AATTC	2	10	146740	146749	40 %	40 %	0 %	20 %	346723063
3128	NC_016010	GA	3	6	146789	146794	50 %	0 %	50 %	0 %	346723063
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3133	NC_016010	GTC	2	6	147142	147147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723063
3134	NC_016010	TCG	2	6	147198	147203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723064
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3138	NC_016010	GAT	2	6	148638	148643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723066
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3142	NC_016010	CT	3	6	149333	149338	0 %	50 %	0 %	50 %	346723067
3143	NC_016010	CGCTG	2	10	149348	149357	0 %	20 %	40 %	40 %	346723067
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3150	NC_016010	CTG	2	6	149593	149598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723067
3151	NC_016010	TGC	2	6	149662	149667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723067
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3230	NC_016010	GGC	2	6	156025	156030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723075
3231	NC_016010	T	6	6	156105	156110	0 %	100 %	0 %	0 %	346723075
3232	NC_016010	CGAGC	2	10	156121	156130	20 %	0 %	40 %	40 %	346723075
3233	NC_016010	TCG	2	6	156216	156221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723075
3234	NC_016010	GAT	2	6	156611	156616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723076
3235	NC_016010	CCA	2	6	156701	156706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723076
3236	NC_016010	CCAT	2	8	156737	156744	25 %	25 %	0 %	50 %	346723076
3237	NC_016010	CGCA	2	8	156759	156766	25 %	0 %	25 %	50 %	346723076
3238	NC_016010	GAT	2	6	156819	156824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723076
3239	NC_016010	TGC	2	6	156843	156848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723076
3240	NC_016010	CTT	2	6	156902	156907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723076
3241	NC_016010	GCC	2	6	156922	156927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723076
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3243	NC_016010	GC	3	6	157075	157080	0 %	0 %	50 %	50 %	346723076
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3366	NC_016010	CCG	2	6	163531	163536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723079
3367	NC_016010	CTG	2	6	163555	163560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723079
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3369	NC_016010	CGA	2	6	163683	163688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723079
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3374	NC_016010	CTG	2	6	163843	163848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723079
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3479	NC_016010	ATC	2	6	168304	168309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723082
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3481	NC_016010	CG	3	6	168372	168377	0 %	0 %	50 %	50 %	346723082
3482	NC_016010	GTC	2	6	168405	168410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723082
3483	NC_016010	GTGGC	2	10	168420	168429	0 %	20 %	60 %	20 %	346723082
3484	NC_016010	GGGCT	2	10	168533	168542	0 %	20 %	60 %	20 %	346723082
3485	NC_016010	CAT	2	6	168563	168568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723082
3486	NC_016010	CGA	2	6	168586	168591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723082
3487	NC_016010	GTG	2	6	168596	168601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723082
3488	NC_016010	CGAC	2	8	168630	168637	25 %	0 %	25 %	50 %	346723082
3489	NC_016010	CGC	2	6	168639	168644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723082
3490	NC_016010	GCA	2	6	168658	168663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723082
3491	NC_016010	GCG	2	6	168709	168714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723082
3492	NC_016010	TCGA	2	8	168716	168723	25 %	25 %	25 %	25 %	346723082
3493	NC_016010	TC	3	6	168778	168783	0 %	50 %	0 %	50 %	346723082
3494	NC_016010	AGC	2	6	168819	168824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723082
3495	NC_016010	AGG	2	6	168876	168881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	346723082
3496	NC_016010	GC	3	6	168931	168936	0 %	0 %	50 %	50 %	346723082
3497	NC_016010	GAA	2	6	168941	168946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346723082
3498	NC_016010	GCT	2	6	168985	168990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723082
3499	NC_016010	GGT	3	9	169048	169056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723082
3500	NC_016010	TTG	2	6	169067	169072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346723082

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