MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 107169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_016010	GCA	2	6	116716	116721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723040
2503	NC_016010	CTT	2	6	116723	116728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723040
2504	NC_016010	GCC	2	6	116762	116767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723040
2505	NC_016010	CAG	2	6	116825	116830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723040
2506	NC_016010	CG	3	6	116881	116886	0 %	0 %	50 %	50 %	346723040
2507	NC_016010	GCT	3	9	116905	116913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723040
2508	NC_016010	GC	3	6	116928	116933	0 %	0 %	50 %	50 %	346723040
2509	NC_016010	TCG	2	6	116955	116960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723040
2510	NC_016010	TTG	2	6	116988	116993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346723040
2511	NC_016010	GGC	2	6	116995	117000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723040
2512	NC_016010	AAG	2	6	117066	117071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346723040
2513	NC_016010	TTG	2	6	117248	117253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346723041
2514	NC_016010	GCC	3	9	117254	117262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723041
2515	NC_016010	GCC	2	6	117302	117307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723041
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2517	NC_016010	CCT	2	6	117324	117329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	346723041
2518	NC_016010	CCG	2	6	117351	117356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723041
2519	NC_016010	GC	3	6	117371	117376	0 %	0 %	50 %	50 %	346723041
2520	NC_016010	GAC	2	6	117389	117394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723041
2521	NC_016010	GTG	2	6	117419	117424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723041
2522	NC_016010	GAC	2	6	117434	117439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723041
2523	NC_016010	CCG	2	6	117442	117447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723041
2524	NC_016010	GC	3	6	117450	117455	0 %	0 %	50 %	50 %	346723041
2525	NC_016010	GCT	2	6	117466	117471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723041
2526	NC_016010	TGG	2	6	117489	117494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723041
2527	NC_016010	CG	3	6	117495	117500	0 %	0 %	50 %	50 %	346723041
2528	NC_016010	GC	4	8	117549	117556	0 %	0 %	50 %	50 %	346723041
2529	NC_016010	GCG	2	6	117573	117578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723041
2530	NC_016010	TGG	2	6	117588	117593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723041
2531	NC_016010	GGCCAG	2	12	117620	117631	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	346723041
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2533	NC_016010	TGC	2	6	117672	117677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723041
2534	NC_016010	CGG	2	6	117712	117717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723041
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2538	NC_016010	GCA	2	6	117783	117788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723041
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2543	NC_016010	GCAG	2	8	118093	118100	25 %	0 %	50 %	25 %	346723041
2544	NC_016010	GGC	2	6	118154	118159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723041
2545	NC_016010	CAGCG	2	10	118160	118169	20 %	0 %	40 %	40 %	346723041
2546	NC_016010	CGGG	2	8	118221	118228	0 %	0 %	75 %	25 %	346723041
2547	NC_016010	GATC	2	8	118231	118238	25 %	25 %	25 %	25 %	346723041
2548	NC_016010	GC	3	6	118265	118270	0 %	0 %	50 %	50 %	346723041
2549	NC_016010	GCCG	2	8	118296	118303	0 %	0 %	50 %	50 %	346723041
2550	NC_016010	CGCCAG	2	12	118334	118345	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	346723041
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2552	NC_016010	TCG	2	6	118368	118373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723041
2553	NC_016010	AC	3	6	118377	118382	50 %	0 %	0 %	50 %	346723041
2554	NC_016010	TGG	2	6	118454	118459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723041
2555	NC_016010	GAGC	2	8	118465	118472	25 %	0 %	50 %	25 %	346723041
2556	NC_016010	GCT	2	6	118483	118488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723041
2557	NC_016010	GAC	2	6	118523	118528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723041
2558	NC_016010	CGA	2	6	118552	118557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723041
2559	NC_016010	GC	3	6	118567	118572	0 %	0 %	50 %	50 %	346723041
2560	NC_016010	CGA	2	6	118615	118620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723041
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2562	NC_016010	GGC	2	6	118697	118702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723041
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2570	NC_016010	CAG	2	6	118931	118936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723041
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2572	NC_016010	CAG	2	6	118996	119001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723041
2573	NC_016010	TGG	2	6	119025	119030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723041
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2577	NC_016010	CGCA	2	8	119242	119249	25 %	0 %	25 %	50 %	346723041
2578	NC_016010	CTA	2	6	119311	119316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723041
2579	NC_016010	GCCCG	2	10	119320	119329	0 %	0 %	40 %	60 %	346723041
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2583	NC_016010	TGATCG	2	12	119477	119488	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	346723042
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2588	NC_016010	TGG	2	6	119992	119997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723043
2589	NC_016010	GGC	2	6	120005	120010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723043
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2591	NC_016010	CGC	2	6	120029	120034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723043
2592	NC_016010	CCGG	2	8	120075	120082	0 %	0 %	50 %	50 %	346723043
2593	NC_016010	GCA	3	9	120116	120124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723043
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2598	NC_016010	CGGCA	2	10	120440	120449	20 %	0 %	40 %	40 %	346723043
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2602	NC_016010	ACA	2	6	120990	120995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723044
2603	NC_016010	CG	3	6	121030	121035	0 %	0 %	50 %	50 %	346723044
2604	NC_016010	GCG	2	6	121058	121063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723044
2605	NC_016010	TGC	2	6	121069	121074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723044
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2608	NC_016010	CG	3	6	121277	121282	0 %	0 %	50 %	50 %	346723044
2609	NC_016010	AGG	2	6	121284	121289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	346723044
2610	NC_016010	GTG	2	6	121349	121354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723044
2611	NC_016010	ATC	2	6	121361	121366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723044
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2615	NC_016010	GCAGA	2	10	121448	121457	40 %	0 %	40 %	20 %	346723044
2616	NC_016010	GCCT	2	8	121459	121466	0 %	25 %	25 %	50 %	346723044
2617	NC_016010	CTG	2	6	121499	121504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723044
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2619	NC_016010	GCCA	2	8	121634	121641	25 %	0 %	25 %	50 %	346723044
2620	NC_016010	TCT	2	6	121689	121694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723044
2621	NC_016010	GAC	2	6	121715	121720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723044
2622	NC_016010	TCAA	2	8	121764	121771	50 %	25 %	0 %	25 %	346723044
2623	NC_016010	GT	3	6	121778	121783	0 %	50 %	50 %	0 %	346723044
2624	NC_016010	CG	4	8	121794	121801	0 %	0 %	50 %	50 %	346723044
2625	NC_016010	GC	3	6	121847	121852	0 %	0 %	50 %	50 %	346723044
2626	NC_016010	GGC	2	6	121855	121860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723044
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2730	NC_016010	CAC	2	6	128510	128515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723051
2731	NC_016010	TGCCCA	2	12	128539	128550	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	346723051
2732	NC_016010	CAG	2	6	128570	128575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723051
2733	NC_016010	ACG	2	6	128587	128592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723051
2734	NC_016010	CAGC	2	8	128600	128607	25 %	0 %	25 %	50 %	346723051
2735	NC_016010	GC	3	6	128669	128674	0 %	0 %	50 %	50 %	346723051
2736	NC_016010	CCG	2	6	128809	128814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723051
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2739	NC_016010	CGGCG	2	10	128872	128881	0 %	0 %	60 %	40 %	346723051
2740	NC_016010	CGG	2	6	128883	128888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723051
2741	NC_016010	AGC	3	9	128892	128900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723051
2742	NC_016010	CCAGA	2	10	128912	128921	40 %	0 %	20 %	40 %	346723051
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2744	NC_016010	CGC	2	6	129104	129109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723052
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2988	NC_016010	GCC	2	6	139543	139548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723060
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