MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 107169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016010	CGGC	2	8	70864	70871	0 %	0 %	50 %	50 %	346722996
1502	NC_016010	CGG	3	9	70904	70912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722996
1503	NC_016010	GCC	2	6	71048	71053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722997
1504	NC_016010	GC	3	6	71058	71063	0 %	0 %	50 %	50 %	346722997
1505	NC_016010	GCC	2	6	71084	71089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722997
1506	NC_016010	GTC	2	6	71126	71131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722997
1507	NC_016010	CCG	2	6	71299	71304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722997
1508	NC_016010	TGG	2	6	71308	71313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722997
1509	NC_016010	TGG	2	6	71356	71361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722997
1510	NC_016010	GCC	2	6	71378	71383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722997
1511	NC_016010	CGT	2	6	71394	71399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722997
1512	NC_016010	TCG	2	6	71466	71471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722997
1513	NC_016010	ATG	2	6	71496	71501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722997
1514	NC_016010	GTT	2	6	71507	71512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722997
1515	NC_016010	CGC	2	6	71527	71532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722997
1516	NC_016010	CG	3	6	71606	71611	0 %	0 %	50 %	50 %	346722997
1517	NC_016010	TGC	2	6	71629	71634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722997
1518	NC_016010	ACG	2	6	71679	71684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722997
1519	NC_016010	CGG	2	6	71695	71700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722997
1520	NC_016010	TGC	2	6	71763	71768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722997
1521	NC_016010	CATG	2	8	71774	71781	25 %	25 %	25 %	25 %	346722997
1522	NC_016010	GTT	2	6	71925	71930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722998
1523	NC_016010	GCG	2	6	71946	71951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722998
1524	NC_016010	CCA	2	6	71999	72004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722998
1525	NC_016010	GC	3	6	72025	72030	0 %	0 %	50 %	50 %	346722998
1526	NC_016010	CAC	2	6	72054	72059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722998
1527	NC_016010	GTG	2	6	72064	72069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722998
1528	NC_016010	CGA	2	6	72120	72125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722998
1529	NC_016010	CGTGG	2	10	72151	72160	0 %	20 %	60 %	20 %	346722998
1530	NC_016010	GCT	2	6	72171	72176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722998
1531	NC_016010	CTG	2	6	72214	72219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722998
1532	NC_016010	TGA	2	6	72266	72271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722998
1533	NC_016010	TGG	2	6	72296	72301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722998
1534	NC_016010	AAG	2	6	72302	72307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722998
1535	NC_016010	CGC	2	6	72361	72366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722998
1536	NC_016010	CGC	2	6	72398	72403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722998
1537	NC_016010	ACC	3	9	72449	72457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722998
1538	NC_016010	CAC	2	6	72480	72485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722998
1539	NC_016010	GCA	2	6	72645	72650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722998
1540	NC_016010	TGG	2	6	72659	72664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722998
1541	NC_016010	CGC	2	6	72683	72688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722998
1542	NC_016010	GCT	2	6	72705	72710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722998
1543	NC_016010	CGCC	2	8	72720	72727	0 %	0 %	25 %	75 %	346722998
1544	NC_016010	CACACC	2	12	72886	72897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722999
1545	NC_016010	GC	4	8	72930	72937	0 %	0 %	50 %	50 %	346722999
1546	NC_016010	CAT	2	6	72958	72963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722999
1547	NC_016010	GGC	2	6	73136	73141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722999
1548	NC_016010	CGTC	2	8	73145	73152	0 %	25 %	25 %	50 %	346722999
1549	NC_016010	CGA	2	6	73188	73193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722999
1550	NC_016010	CTG	2	6	73306	73311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722999
1551	NC_016010	AT	3	6	73322	73327	50 %	50 %	0 %	0 %	346722999
1552	NC_016010	CCA	2	6	73332	73337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722999
1553	NC_016010	GCG	2	6	73344	73349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722999
1554	NC_016010	CG	3	6	73415	73420	0 %	0 %	50 %	50 %	346722999
1555	NC_016010	ATG	2	6	73421	73426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722999
1556	NC_016010	CTG	2	6	73435	73440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722999
1557	NC_016010	CAC	2	6	73459	73464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722999
1558	NC_016010	CCA	2	6	73467	73472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722999
1559	NC_016010	CTG	2	6	73504	73509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722999
1560	NC_016010	GCA	2	6	73524	73529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722999
1561	NC_016010	GGT	2	6	73543	73548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722999
1562	NC_016010	GCC	2	6	73589	73594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722999
1563	NC_016010	CA	3	6	73654	73659	50 %	0 %	0 %	50 %	346722999
1564	NC_016010	TCT	2	6	73674	73679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346722999
1565	NC_016010	GCC	2	6	73752	73757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722999
1566	NC_016010	GC	4	8	73780	73787	0 %	0 %	50 %	50 %	346722999
1567	NC_016010	GTG	2	6	73826	73831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722999
1568	NC_016010	G	6	6	73847	73852	0 %	0 %	100 %	0 %	346722999
1569	NC_016010	CTG	2	6	73860	73865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722999
1570	NC_016010	GCA	2	6	73881	73886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722999
1571	NC_016010	CACC	2	8	73920	73927	25 %	0 %	0 %	75 %	346722999
1572	NC_016010	CGTTC	2	10	73945	73954	0 %	40 %	20 %	40 %	346722999
1573	NC_016010	GCAG	2	8	74765	74772	25 %	0 %	50 %	25 %	346723000
1574	NC_016010	CCGA	2	8	74808	74815	25 %	0 %	25 %	50 %	346723000
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1579	NC_016010	GCG	2	6	74932	74937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723000
1580	NC_016010	GCC	3	9	74955	74963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723000
1581	NC_016010	CTA	2	6	74981	74986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723000
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1583	NC_016010	AAC	2	6	75475	75480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723001
1584	NC_016010	GC	4	8	75493	75500	0 %	0 %	50 %	50 %	346723001
1585	NC_016010	CAG	2	6	75543	75548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723001
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1587	NC_016010	CG	3	6	75631	75636	0 %	0 %	50 %	50 %	346723001
1588	NC_016010	GCC	2	6	75654	75659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723001
1589	NC_016010	CTT	2	6	75693	75698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723001
1590	NC_016010	TCG	2	6	75721	75726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723001
1591	NC_016010	GCCCA	2	10	75730	75739	20 %	0 %	20 %	60 %	346723001
1592	NC_016010	CAG	2	6	75768	75773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723001
1593	NC_016010	ACC	2	6	75785	75790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723001
1594	NC_016010	ACCAGC	2	12	75805	75816	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	346723001
1595	NC_016010	CG	3	6	75835	75840	0 %	0 %	50 %	50 %	346723001
1596	NC_016010	CG	3	6	75870	75875	0 %	0 %	50 %	50 %	346723001
1597	NC_016010	CTG	2	6	75876	75881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723001
1598	NC_016010	GCC	3	9	75957	75965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723001
1599	NC_016010	GCC	2	6	75967	75972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723001
1600	NC_016010	CCAGC	2	10	75974	75983	20 %	0 %	20 %	60 %	346723001
1601	NC_016010	GCGT	2	8	76003	76010	0 %	25 %	50 %	25 %	346723001
1602	NC_016010	AGCG	2	8	76012	76019	25 %	0 %	50 %	25 %	346723001
1603	NC_016010	CAA	3	9	76034	76042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723001
1604	NC_016010	GCAT	2	8	76048	76055	25 %	25 %	25 %	25 %	346723001
1605	NC_016010	GTTGAT	2	12	76955	76966	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	346723002
1606	NC_016010	GTTG	2	8	77015	77022	0 %	50 %	50 %	0 %	346723003
1607	NC_016010	CGC	2	6	77093	77098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723003
1608	NC_016010	GGC	2	6	77295	77300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723003
1609	NC_016010	TCG	2	6	77347	77352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723003
1610	NC_016010	TCGA	2	8	77407	77414	25 %	25 %	25 %	25 %	346723003
1611	NC_016010	CTG	2	6	77479	77484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723003
1612	NC_016010	CGA	2	6	77485	77490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723003
1613	NC_016010	TTGA	2	8	77493	77500	25 %	50 %	25 %	0 %	346723003
1614	NC_016010	TCA	2	6	77504	77509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723003
1615	NC_016010	CA	3	6	77542	77547	50 %	0 %	0 %	50 %	346723003
1616	NC_016010	CGG	2	6	77557	77562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723003
1617	NC_016010	ACA	2	6	77618	77623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723003
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1623	NC_016010	GCC	2	6	77894	77899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723004
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1625	NC_016010	AC	3	6	77951	77956	50 %	0 %	0 %	50 %	346723004
1626	NC_016010	GGC	2	6	77968	77973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723004
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1630	NC_016010	ATC	2	6	78252	78257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723005
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1650	NC_016010	ATC	2	6	79310	79315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723006
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1872	NC_016010	CGCA	2	8	90230	90237	25 %	0 %	25 %	50 %	346723019
1873	NC_016010	CGG	2	6	90243	90248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723019
1874	NC_016010	GAC	2	6	90263	90268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723019
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1877	NC_016010	GGC	2	6	90331	90336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723019
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1992	NC_016010	CAC	2	6	95376	95381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723022
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1994	NC_016010	TAC	2	6	95437	95442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723022
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1998	NC_016010	GC	4	8	95548	95555	0 %	0 %	50 %	50 %	346723022
1999	NC_016010	CTG	2	6	95557	95562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723022
2000	NC_016010	CAC	3	9	95604	95612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723022

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