MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 107169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016010	GCA	2	6	48002	48007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722979
1003	NC_016010	GAC	2	6	48061	48066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722979
1004	NC_016010	CAT	2	6	48132	48137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722979
1005	NC_016010	GAC	2	6	48256	48261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722979
1006	NC_016010	GCG	2	6	48329	48334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722979
1007	NC_016010	ACA	2	6	48346	48351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722979
1008	NC_016010	ATGTCG	2	12	48386	48397	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	346722979
1009	NC_016010	CGGT	2	8	48421	48428	0 %	25 %	50 %	25 %	346722979
1010	NC_016010	AGCC	2	8	48433	48440	25 %	0 %	25 %	50 %	346722979
1011	NC_016010	CGGCG	2	10	48441	48450	0 %	0 %	60 %	40 %	346722979
1012	NC_016010	CGCTA	2	10	48464	48473	20 %	20 %	20 %	40 %	346722979
1013	NC_016010	GCA	2	6	48479	48484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722979
1014	NC_016010	CGG	2	6	48558	48563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722979
1015	NC_016010	CCG	2	6	48581	48586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722979
1016	NC_016010	CGC	2	6	48598	48603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722979
1017	NC_016010	TGC	2	6	48620	48625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722979
1018	NC_016010	GAA	2	6	48690	48695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722979
1019	NC_016010	TCA	2	6	48710	48715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722979
1020	NC_016010	CCG	2	6	48740	48745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722979
1021	NC_016010	GCGCA	2	10	48757	48766	20 %	0 %	40 %	40 %	346722979
1022	NC_016010	GGA	2	6	48846	48851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	346722979
1023	NC_016010	TTG	2	6	48907	48912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722979
1024	NC_016010	GCT	2	6	48957	48962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722979
1025	NC_016010	CGC	2	6	48999	49004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722979
1026	NC_016010	GC	3	6	49091	49096	0 %	0 %	50 %	50 %	346722979
1027	NC_016010	GCCG	2	8	49155	49162	0 %	0 %	50 %	50 %	346722979
1028	NC_016010	CGC	2	6	49165	49170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722979
1029	NC_016010	TGC	3	9	49178	49186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722979
1030	NC_016010	CAA	2	6	49269	49274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722979
1031	NC_016010	CG	3	6	49312	49317	0 %	0 %	50 %	50 %	346722979
1032	NC_016010	GGC	2	6	49345	49350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722979
1033	NC_016010	ATC	2	6	49426	49431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722979
1034	NC_016010	GCT	2	6	49548	49553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722979
1035	NC_016010	CG	3	6	49559	49564	0 %	0 %	50 %	50 %	346722979
1036	NC_016010	CAG	2	6	49760	49765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722980
1037	NC_016010	CAT	2	6	49826	49831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722980
1038	NC_016010	GCCA	2	8	49848	49855	25 %	0 %	25 %	50 %	346722980
1039	NC_016010	CGC	2	6	49868	49873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722980
1040	NC_016010	GGC	2	6	49889	49894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722980
1041	NC_016010	GCGCT	2	10	49930	49939	0 %	20 %	40 %	40 %	346722980
1042	NC_016010	GCA	2	6	50032	50037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722980
1043	NC_016010	CGA	2	6	50041	50046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722980
1044	NC_016010	CG	3	6	50065	50070	0 %	0 %	50 %	50 %	346722980
1045	NC_016010	ATC	2	6	50076	50081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722980
1046	NC_016010	CTG	2	6	50135	50140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722980
1047	NC_016010	GCCG	2	8	50169	50176	0 %	0 %	50 %	50 %	346722980
1048	NC_016010	TCG	2	6	50346	50351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722980
1049	NC_016010	GCG	2	6	50397	50402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722980
1050	NC_016010	CCA	2	6	50431	50436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722980
1051	NC_016010	GC	3	6	50497	50502	0 %	0 %	50 %	50 %	346722980
1052	NC_016010	TGG	2	6	50768	50773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722981
1053	NC_016010	CG	3	6	50803	50808	0 %	0 %	50 %	50 %	346722981
1054	NC_016010	GGA	2	6	50853	50858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	346722981
1055	NC_016010	CAG	2	6	50920	50925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722981
1056	NC_016010	CG	4	8	50979	50986	0 %	0 %	50 %	50 %	346722981
1057	NC_016010	CGC	2	6	50999	51004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722981
1058	NC_016010	GTT	2	6	51033	51038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722981
1059	NC_016010	GGT	2	6	51105	51110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722981
1060	NC_016010	GCC	2	6	51185	51190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722981
1061	NC_016010	TGG	4	12	51221	51232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722981
1062	NC_016010	GTG	2	6	51286	51291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722981
1063	NC_016010	TGG	2	6	51327	51332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722981
1064	NC_016010	GGC	2	6	51409	51414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722981
1065	NC_016010	GCA	2	6	51444	51449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722981
1066	NC_016010	TGC	2	6	51467	51472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722981
1067	NC_016010	CGT	2	6	51590	51595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722981
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1070	NC_016010	CG	3	6	51918	51923	0 %	0 %	50 %	50 %	346722982
1071	NC_016010	ATG	2	6	51950	51955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722982
1072	NC_016010	GT	3	6	52002	52007	0 %	50 %	50 %	0 %	346722982
1073	NC_016010	CCG	2	6	52023	52028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722982
1074	NC_016010	TCG	2	6	52065	52070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722982
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1083	NC_016010	GGT	2	6	52360	52365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722983
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1088	NC_016010	GC	4	8	52601	52608	0 %	0 %	50 %	50 %	346722983
1089	NC_016010	GCT	2	6	52685	52690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722983
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1091	NC_016010	CGT	2	6	52859	52864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722983
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1096	NC_016010	CG	4	8	52939	52946	0 %	0 %	50 %	50 %	346722983
1097	NC_016010	GCC	2	6	52967	52972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722983
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1101	NC_016010	GCGCC	2	10	53048	53057	0 %	0 %	40 %	60 %	346722983
1102	NC_016010	CG	3	6	53058	53063	0 %	0 %	50 %	50 %	346722983
1103	NC_016010	GTGGC	2	10	53064	53073	0 %	20 %	60 %	20 %	346722983
1104	NC_016010	TCA	2	6	53091	53096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722983
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1108	NC_016010	TGG	2	6	53205	53210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722983
1109	NC_016010	TGCCGG	2	12	53214	53225	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	346722983
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1111	NC_016010	CAG	2	6	53293	53298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722983
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1114	NC_016010	GC	3	6	53332	53337	0 %	0 %	50 %	50 %	346722983
1115	NC_016010	CTGCGC	2	12	53355	53366	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	346722983
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1117	NC_016010	CACG	2	8	53383	53390	25 %	0 %	25 %	50 %	346722983
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1120	NC_016010	GCC	2	6	53510	53515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722983
1121	NC_016010	GCA	2	6	53557	53562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722983
1122	NC_016010	ACGC	2	8	53598	53605	25 %	0 %	25 %	50 %	346722983
1123	NC_016010	AAC	2	6	53607	53612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722983
1124	NC_016010	AGC	2	6	53679	53684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722983
1125	NC_016010	GCG	2	6	53837	53842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722983
1126	NC_016010	AGCGCA	2	12	53860	53871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722983
1127	NC_016010	AAGCAG	2	12	53913	53924	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	346722983
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1129	NC_016010	CG	3	6	55034	55039	0 %	0 %	50 %	50 %	346722984
1130	NC_016010	GCCAT	2	10	55061	55070	20 %	20 %	20 %	40 %	346722984
1131	NC_016010	GCACG	2	10	55131	55140	20 %	0 %	40 %	40 %	346722984
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1141	NC_016010	GCA	2	6	55545	55550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722984
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1234	NC_016010	GCC	2	6	59655	59660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722987
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1246	NC_016010	CATC	2	8	59966	59973	25 %	25 %	0 %	50 %	346722987
1247	NC_016010	GGC	2	6	59981	59986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722987
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1250	NC_016010	CGG	2	6	60161	60166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722987
1251	NC_016010	CGA	2	6	60176	60181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722987
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1254	NC_016010	TGG	2	6	60200	60205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722987
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1371	NC_016010	CG	3	6	65251	65256	0 %	0 %	50 %	50 %	346722991
1372	NC_016010	ATC	2	6	65270	65275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722991
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1485	NC_016010	TGGT	2	8	70393	70400	0 %	50 %	50 %	0 %	346722996
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1498	NC_016010	CCG	2	6	70757	70762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722996
1499	NC_016010	GCT	3	9	70814	70822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722996
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