MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 107169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016010	CGA	2	6	256026	256031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723162
5502	NC_016010	GCC	2	6	256083	256088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723162
5503	NC_016010	TGG	2	6	256094	256099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723162
5504	NC_016010	CG	3	6	256108	256113	0 %	0 %	50 %	50 %	346723162
5505	NC_016010	CTG	2	6	256114	256119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723162
5506	NC_016010	TGCC	2	8	256162	256169	0 %	25 %	25 %	50 %	346723162
5507	NC_016010	CG	3	6	256205	256210	0 %	0 %	50 %	50 %	346723162
5508	NC_016010	TG	3	6	256237	256242	0 %	50 %	50 %	0 %	346723162
5509	NC_016010	GGT	2	6	256248	256253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723162
5510	NC_016010	ATT	2	6	256273	256278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	346723162
5511	NC_016010	GCGTGC	2	12	256313	256324	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	346723162
5512	NC_016010	CGC	2	6	256426	256431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723162
5513	NC_016010	AGCG	2	8	256441	256448	25 %	0 %	50 %	25 %	346723162
5514	NC_016010	CGT	2	6	256449	256454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723162
5515	NC_016010	GCG	2	6	256596	256601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723162
5516	NC_016010	TGG	2	6	256610	256615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723162
5517	NC_016010	CAG	2	6	256633	256638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723162
5518	NC_016010	GC	4	8	256710	256717	0 %	0 %	50 %	50 %	346723162
5519	NC_016010	GCCC	2	8	256726	256733	0 %	0 %	25 %	75 %	346723162
5520	NC_016010	CG	3	6	256749	256754	0 %	0 %	50 %	50 %	346723162
5521	NC_016010	GCAGC	2	10	256831	256840	20 %	0 %	40 %	40 %	346723162
5522	NC_016010	ACA	2	6	256860	256865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723162
5523	NC_016010	GGT	2	6	257110	257115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723163
5524	NC_016010	GC	4	8	257151	257158	0 %	0 %	50 %	50 %	346723163
5525	NC_016010	GGT	2	6	257169	257174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723163
5526	NC_016010	GCG	2	6	257186	257191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723163
5527	NC_016010	TGC	2	6	257201	257206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723163
5528	NC_016010	GCC	2	6	257299	257304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723163
5529	NC_016010	TGG	2	6	257351	257356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723163
5530	NC_016010	CCA	2	6	257441	257446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723163
5531	NC_016010	CGA	2	6	257469	257474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723163
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5533	NC_016010	GCC	2	6	257545	257550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723163
5534	NC_016010	TTG	2	6	257617	257622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346723163
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5536	NC_016010	GGC	2	6	257651	257656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723163
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5540	NC_016010	GCTG	2	8	257829	257836	0 %	25 %	50 %	25 %	346723163
5541	NC_016010	CGCT	2	8	257860	257867	0 %	25 %	25 %	50 %	346723163
5542	NC_016010	TGG	2	6	257960	257965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723163
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5545	NC_016010	TGC	2	6	258168	258173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723164
5546	NC_016010	CAT	2	6	258181	258186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723164
5547	NC_016010	CAT	2	6	258202	258207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723164
5548	NC_016010	GCT	2	6	258209	258214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723164
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5551	NC_016010	GCA	2	6	258537	258542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723165
5552	NC_016010	GTC	2	6	258547	258552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723165
5553	NC_016010	TGCC	2	8	258616	258623	0 %	25 %	25 %	50 %	346723165
5554	NC_016010	GCT	2	6	258777	258782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723165
5555	NC_016010	CGT	2	6	258864	258869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723165
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5557	NC_016010	CGC	2	6	258882	258887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723165
5558	NC_016010	CCA	2	6	258957	258962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723165
5559	NC_016010	AGGCCA	2	12	258978	258989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723165
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5561	NC_016010	CCGA	2	8	259037	259044	25 %	0 %	25 %	50 %	346723165
5562	NC_016010	CGG	2	6	259119	259124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723165
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5569	NC_016010	GC	3	6	259420	259425	0 %	0 %	50 %	50 %	346723165
5570	NC_016010	GTC	2	6	259429	259434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723165
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5574	NC_016010	GCAG	2	8	259902	259909	25 %	0 %	50 %	25 %	346723166
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5581	NC_016010	GC	3	6	260191	260196	0 %	0 %	50 %	50 %	346723166
5582	NC_016010	GCA	2	6	260202	260207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723166
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5585	NC_016010	GC	3	6	260295	260300	0 %	0 %	50 %	50 %	346723166
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5589	NC_016010	GAC	2	6	260413	260418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723166
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5603	NC_016010	CACC	2	8	261032	261039	25 %	0 %	0 %	75 %	346723167
5604	NC_016010	TCCG	2	8	261055	261062	0 %	25 %	25 %	50 %	346723167
5605	NC_016010	GTG	2	6	261069	261074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723167
5606	NC_016010	GCC	2	6	261096	261101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723167
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5609	NC_016010	CGA	2	6	261248	261253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723167
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5621	NC_016010	CGC	2	6	261831	261836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723167
5622	NC_016010	TGC	2	6	261838	261843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723167
5623	NC_016010	GCTG	2	8	261910	261917	0 %	25 %	50 %	25 %	346723167
5624	NC_016010	AGC	2	6	261919	261924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723167
5625	NC_016010	GCC	2	6	261934	261939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723167
5626	NC_016010	GTG	2	6	262008	262013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723167
5627	NC_016010	TGG	2	6	262039	262044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723167
5628	NC_016010	TGGT	2	8	262076	262083	0 %	50 %	50 %	0 %	346723167
5629	NC_016010	GCG	3	9	262117	262125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723167
5630	NC_016010	GCT	2	6	262139	262144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723167
5631	NC_016010	GCG	2	6	262157	262162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723167
5632	NC_016010	GCG	2	6	262218	262223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723168
5633	NC_016010	TGC	2	6	262226	262231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723168
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5635	NC_016010	CCG	2	6	262269	262274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723168
5636	NC_016010	CGC	2	6	262280	262285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723168
5637	NC_016010	GCC	2	6	262297	262302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723168
5638	NC_016010	GCG	2	6	262432	262437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723168
5639	NC_016010	TGC	2	6	262471	262476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723168
5640	NC_016010	GGCGAT	2	12	262506	262517	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	346723168
5641	NC_016010	GGT	2	6	262547	262552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723168
5642	NC_016010	GC	3	6	262643	262648	0 %	0 %	50 %	50 %	346723168
5643	NC_016010	CGT	2	6	263029	263034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723169
5644	NC_016010	CCG	2	6	263043	263048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723169
5645	NC_016010	GAC	2	6	263087	263092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723169
5646	NC_016010	AGC	2	6	263115	263120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723169
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5648	NC_016010	CTGC	2	8	263170	263177	0 %	25 %	25 %	50 %	346723169
5649	NC_016010	GGCG	2	8	263227	263234	0 %	0 %	75 %	25 %	346723169
5650	NC_016010	GGCC	2	8	263271	263278	0 %	0 %	50 %	50 %	346723169
5651	NC_016010	GAG	2	6	263279	263284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	346723169
5652	NC_016010	TCG	2	6	263292	263297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723169
5653	NC_016010	CGG	2	6	263311	263316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723169
5654	NC_016010	AAG	2	6	263333	263338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346723169
5655	NC_016010	TTCC	2	8	263385	263392	0 %	50 %	0 %	50 %	346723169
5656	NC_016010	CAC	2	6	263401	263406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723169
5657	NC_016010	CTG	2	6	263420	263425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723169
5658	NC_016010	GCC	2	6	263520	263525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723169
5659	NC_016010	TGC	2	6	263565	263570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723169
5660	NC_016010	GCATCA	2	12	263613	263624	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	346723169
5661	NC_016010	CGC	2	6	263628	263633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723169
5662	NC_016010	GTT	2	6	263662	263667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346723169
5663	NC_016010	CTT	2	6	263882	263887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723170
5664	NC_016010	TCT	2	6	263911	263916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723170
5665	NC_016010	GCA	2	6	263947	263952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723170
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5668	NC_016010	CG	3	6	264061	264066	0 %	0 %	50 %	50 %	346723170
5669	NC_016010	TGC	4	12	264219	264230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723170
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5672	NC_016010	GGC	2	6	264281	264286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723170
5673	NC_016010	CAG	2	6	264287	264292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723170
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5675	NC_016010	CAG	2	6	264350	264355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723170
5676	NC_016010	CAG	3	9	264362	264370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723170
5677	NC_016010	TCG	2	6	264565	264570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723171
5678	NC_016010	CGTG	2	8	264578	264585	0 %	25 %	50 %	25 %	346723171
5679	NC_016010	GCG	2	6	264589	264594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723171
5680	NC_016010	CGG	2	6	264596	264601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723171
5681	NC_016010	CAA	2	6	264611	264616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723171
5682	NC_016010	GCT	2	6	264689	264694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723171
5683	NC_016010	CCG	2	6	264707	264712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723171
5684	NC_016010	CGA	2	6	264776	264781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723171
5685	NC_016010	GC	3	6	264783	264788	0 %	0 %	50 %	50 %	346723171
5686	NC_016010	ATC	2	6	264804	264809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723171
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5688	NC_016010	CCA	2	6	264844	264849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723171
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5690	NC_016010	ACCCG	2	10	264952	264961	20 %	0 %	20 %	60 %	346723172
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5692	NC_016010	GCTG	2	8	265044	265051	0 %	25 %	50 %	25 %	346723172
5693	NC_016010	GGC	2	6	265092	265097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723172
5694	NC_016010	CGA	2	6	265102	265107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723172
5695	NC_016010	TGG	2	6	265226	265231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723172
5696	NC_016010	GCT	2	6	265243	265248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723172
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5698	NC_016010	GCC	2	6	265505	265510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723172
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5700	NC_016010	ACGC	2	8	265675	265682	25 %	0 %	25 %	50 %	346723173
5701	NC_016010	TGTC	2	8	265689	265696	0 %	50 %	25 %	25 %	346723173
5702	NC_016010	CTG	2	6	265704	265709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723173
5703	NC_016010	CCGGC	2	10	265717	265726	0 %	0 %	40 %	60 %	346723173
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5705	NC_016010	GCAGGC	2	12	265799	265810	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	346723173
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5707	NC_016010	GC	3	6	265835	265840	0 %	0 %	50 %	50 %	346723173
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5711	NC_016010	ACG	2	6	265954	265959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723173
5712	NC_016010	GAAC	2	8	265964	265971	50 %	0 %	25 %	25 %	346723173
5713	NC_016010	CAT	2	6	265982	265987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723173
5714	NC_016010	CGC	2	6	266058	266063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723173
5715	NC_016010	CG	4	8	266117	266124	0 %	0 %	50 %	50 %	346723173
5716	NC_016010	AGC	2	6	266179	266184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723173
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5719	NC_016010	GCGCTG	2	12	266274	266285	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	346723173
5720	NC_016010	CGG	2	6	266321	266326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723173
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5722	NC_016010	ATC	2	6	266367	266372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723173
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5724	NC_016010	GC	4	8	266464	266471	0 %	0 %	50 %	50 %	346723173
5725	NC_016010	GCA	2	6	266495	266500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723173
5726	NC_016010	GGC	2	6	266501	266506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723173
5727	NC_016010	CAG	2	6	266523	266528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723173
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5729	NC_016010	CGG	2	6	266549	266554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723173
5730	NC_016010	CGT	2	6	266798	266803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723174
5731	NC_016010	GCT	2	6	266832	266837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723174
5732	NC_016010	GTC	2	6	266852	266857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723174
5733	NC_016010	CCA	2	6	266869	266874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723174
5734	NC_016010	GCCCCG	2	12	266892	266903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723174
5735	NC_016010	TGC	2	6	266912	266917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723174
5736	NC_016010	GCC	2	6	266960	266965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723174
5737	NC_016010	GAA	2	6	267006	267011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346723174
5738	NC_016010	ACA	2	6	267076	267081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723174
5739	NC_016010	GTG	2	6	267100	267105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723174
5740	NC_016010	CG	3	6	267118	267123	0 %	0 %	50 %	50 %	346723174
5741	NC_016010	TCT	2	6	267133	267138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723174
5742	NC_016010	ACGC	2	8	267166	267173	25 %	0 %	25 %	50 %	346723174
5743	NC_016010	GC	3	6	267349	267354	0 %	0 %	50 %	50 %	346723174
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5865	NC_016010	CAGAT	2	10	272450	272459	40 %	20 %	20 %	20 %	346723178
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5981	NC_016010	CTGC	2	8	276911	276918	0 %	25 %	25 %	50 %	346723181
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5988	NC_016010	GCA	2	6	277437	277442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723182
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5990	NC_016010	CGG	2	6	277556	277561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723182
5991	NC_016010	CAA	2	6	277575	277580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346723182
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