MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 71168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010717	GCA	2	6	400	405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574271
2	NC_010717	GCC	2	6	420	425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574271
3	NC_010717	TGT	2	6	475	480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188574271
4	NC_010717	GCA	2	6	484	489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574271
5	NC_010717	CGG	2	6	520	525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574271
6	NC_010717	TTC	2	6	585	590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574271
7	NC_010717	GAT	2	6	596	601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188574271
8	NC_010717	CAG	2	6	648	653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574271
9	NC_010717	CGA	2	6	671	676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574271
10	NC_010717	TTC	2	6	684	689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574271
11	NC_010717	TTC	2	6	717	722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574271
12	NC_010717	GCC	2	6	748	753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574271
13	NC_010717	ATC	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574271
14	NC_010717	CCG	2	6	855	860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574271
15	NC_010717	CGA	2	6	923	928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574271
16	NC_010717	AAG	2	6	948	953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574271
17	NC_010717	TGG	2	6	997	1002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574271
18	NC_010717	ACT	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574271
19	NC_010717	TGC	2	6	1279	1284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574271
20	NC_010717	GGA	2	6	1827	1832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188574272
21	NC_010717	ACC	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574272
22	NC_010717	GTG	3	9	2029	2037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574272
23	NC_010717	CAG	2	6	2089	2094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574272
24	NC_010717	CTA	2	6	2103	2108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574272
25	NC_010717	CTG	2	6	2119	2124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574272
26	NC_010717	TGC	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574272
27	NC_010717	GGC	2	6	2209	2214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574272
28	NC_010717	ATC	2	6	2227	2232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574272
29	NC_010717	GCT	2	6	2256	2261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574272
30	NC_010717	AAG	3	9	2546	2554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574272
31	NC_010717	CGA	2	6	2586	2591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574272
32	NC_010717	CAG	2	6	2706	2711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574272
33	NC_010717	TCG	2	6	4036	4041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574273
34	NC_010717	CAA	2	6	4187	4192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188574273
35	NC_010717	GGC	2	6	4232	4237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574273
36	NC_010717	TGC	2	6	4240	4245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574273
37	NC_010717	GTG	2	6	4355	4360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574273
38	NC_010717	GCG	2	6	4392	4397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574273
39	NC_010717	GTG	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574273
40	NC_010717	CCG	2	6	4408	4413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574273
41	NC_010717	AGA	2	6	4879	4884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574273
42	NC_010717	GAC	2	6	4925	4930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574273
43	NC_010717	CAC	2	6	4952	4957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574273
44	NC_010717	CGA	2	6	5231	5236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574274
45	NC_010717	TGC	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574274
46	NC_010717	GGT	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574274
47	NC_010717	CGA	2	6	5399	5404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574274
48	NC_010717	CGA	2	6	5423	5428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574274
49	NC_010717	GAA	2	6	5508	5513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574274
50	NC_010717	TGC	2	6	5545	5550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574274
51	NC_010717	CGG	2	6	5555	5560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574274
52	NC_010717	CGA	2	6	5567	5572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574274
53	NC_010717	CGG	2	6	5591	5596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574274
54	NC_010717	GGT	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574274
55	NC_010717	CAG	2	6	5679	5684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574274
56	NC_010717	AGC	2	6	5719	5724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574274
57	NC_010717	CAC	2	6	5747	5752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574274
58	NC_010717	CGA	2	6	5870	5875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574274
59	NC_010717	CGA	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574274
60	NC_010717	GGC	2	6	5913	5918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574274
61	NC_010717	CGC	2	6	5956	5961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574274
62	NC_010717	TGG	2	6	6007	6012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574274
63	NC_010717	CAA	2	6	6065	6070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188574274
64	NC_010717	GGC	2	6	6087	6092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574274
65	NC_010717	GAC	2	6	6192	6197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574274
66	NC_010717	CGG	2	6	6295	6300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574274
67	NC_010717	TCG	2	6	6379	6384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574274
68	NC_010717	CGC	2	6	6432	6437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574274
69	NC_010717	TGC	2	6	6583	6588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574274
70	NC_010717	CGA	2	6	6695	6700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574274
71	NC_010717	ACC	2	6	6724	6729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574274
72	NC_010717	CAT	2	6	6731	6736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574274
73	NC_010717	TGA	2	6	6739	6744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188574274
74	NC_010717	CTT	2	6	6791	6796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574274
75	NC_010717	GCC	2	6	6848	6853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574274
76	NC_010717	GCG	2	6	6945	6950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574274
77	NC_010717	CGA	2	6	6965	6970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574274
78	NC_010717	GCC	2	6	6971	6976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574274
79	NC_010717	ACT	2	6	7001	7006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574274
80	NC_010717	GCT	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574274
81	NC_010717	GCC	2	6	7091	7096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574274
82	NC_010717	TGG	2	6	7240	7245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574274
83	NC_010717	CCG	2	6	7250	7255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574274
84	NC_010717	GAA	2	6	7266	7271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574274
85	NC_010717	TGC	2	6	7282	7287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574274
86	NC_010717	GCG	2	6	7306	7311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574274
87	NC_010717	CAA	2	6	7385	7390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188574274
88	NC_010717	GCT	2	6	7430	7435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574274
89	NC_010717	AAG	2	6	7446	7451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574274
90	NC_010717	GCC	2	6	7453	7458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574274
91	NC_010717	AGC	2	6	7498	7503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574274
92	NC_010717	ACC	2	6	7512	7517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574274
93	NC_010717	GCC	2	6	7569	7574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574274
94	NC_010717	CGC	2	6	7617	7622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574274
95	NC_010717	GCC	2	6	7788	7793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574275
96	NC_010717	GCT	2	6	7794	7799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574275
97	NC_010717	CGC	2	6	7836	7841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574275
98	NC_010717	GGC	2	6	7914	7919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574275
99	NC_010717	GCC	2	6	7960	7965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574275
100	NC_010717	TGT	2	6	8033	8038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188574275
101	NC_010717	ACT	2	6	8039	8044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574275
102	NC_010717	CGT	2	6	8047	8052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574275
103	NC_010717	CTG	2	6	8060	8065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574275
104	NC_010717	CGC	2	6	8130	8135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574275
105	NC_010717	GAA	2	6	8221	8226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574275
106	NC_010717	GTG	2	6	8266	8271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574275
107	NC_010717	GAG	2	6	8287	8292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188574275
108	NC_010717	CTG	2	6	8293	8298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574275
109	NC_010717	CCG	2	6	8301	8306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574275
110	NC_010717	CTG	2	6	8417	8422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574275
111	NC_010717	GCA	2	6	8450	8455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574275
112	NC_010717	GCG	2	6	8461	8466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574275
113	NC_010717	TGC	2	6	8511	8516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574275
114	NC_010717	GGC	2	6	8544	8549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574275
115	NC_010717	CCA	2	6	8813	8818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574276
116	NC_010717	GCC	2	6	8834	8839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574276
117	NC_010717	GGT	2	6	8844	8849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574276
118	NC_010717	CGT	2	6	8961	8966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574276
119	NC_010717	TGG	2	6	8975	8980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574276
120	NC_010717	GCC	2	6	8988	8993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574276
121	NC_010717	TCG	2	6	9029	9034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574276
122	NC_010717	CGG	2	6	9063	9068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574276
123	NC_010717	CGC	2	6	9123	9128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574276
124	NC_010717	CAC	2	6	9166	9171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574276
125	NC_010717	GAA	2	6	9172	9177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574276
126	NC_010717	CAT	2	6	9216	9221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574276
127	NC_010717	GCC	2	6	9238	9243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574276
128	NC_010717	CTG	2	6	9307	9312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574276
129	NC_010717	ATG	2	6	9415	9420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188574276
130	NC_010717	TGT	2	6	9872	9877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188574277
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500	NC_010717	CAT	2	6	38734	38739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574307

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