MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 103333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010717	CGC	3	9	212003	212011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574479
4002	NC_010717	GAT	2	6	212013	212018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188574479
4003	NC_010717	CAC	2	6	212019	212024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574479
4004	NC_010717	ATC	2	6	212065	212070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574479
4005	NC_010717	AGA	2	6	212078	212083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574479
4006	NC_010717	GGT	2	6	212142	212147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574479
4007	NC_010717	TCT	2	6	212162	212167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574479
4008	NC_010717	GCGG	2	8	212294	212301	0 %	0 %	75 %	25 %	188574480
4009	NC_010717	CGG	2	6	212312	212317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574480
4010	NC_010717	CAG	2	6	212411	212416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574480
4011	NC_010717	TGC	2	6	212585	212590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574481
4012	NC_010717	GTG	2	6	212598	212603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574481
4013	NC_010717	CCG	2	6	212614	212619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574481
4014	NC_010717	CGG	2	6	212626	212631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574481
4015	NC_010717	GGT	2	6	212645	212650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574481
4016	NC_010717	CG	5	10	212657	212666	0 %	0 %	50 %	50 %	188574481
4017	NC_010717	GCT	2	6	212684	212689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574481
4018	NC_010717	GCAG	2	8	212732	212739	25 %	0 %	50 %	25 %	188574481
4019	NC_010717	CGG	2	6	212774	212779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574481
4020	NC_010717	CAAC	2	8	212807	212814	50 %	0 %	0 %	50 %	188574481
4021	NC_010717	GCCA	2	8	212838	212845	25 %	0 %	25 %	50 %	188574481
4022	NC_010717	GCA	2	6	212875	212880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574481
4023	NC_010717	CGGG	2	8	212917	212924	0 %	0 %	75 %	25 %	188574481
4024	NC_010717	TCATCG	2	12	213004	213015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	188574481
4025	NC_010717	GAACT	2	10	213027	213036	40 %	20 %	20 %	20 %	188574481
4026	NC_010717	GAA	2	6	213045	213050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574481
4027	NC_010717	GC	5	10	213051	213060	0 %	0 %	50 %	50 %	188574481
4028	NC_010717	TC	3	6	213155	213160	0 %	50 %	0 %	50 %	188574481
4029	NC_010717	CTG	2	6	213225	213230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574481
4030	NC_010717	ATGTGG	2	12	213340	213351	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	188574481
4031	NC_010717	GCG	2	6	213352	213357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574481
4032	NC_010717	GAA	2	6	213465	213470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574481
4033	NC_010717	CGC	2	6	213484	213489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574481
4034	NC_010717	GC	3	6	213509	213514	0 %	0 %	50 %	50 %	188574481
4035	NC_010717	CAC	2	6	213525	213530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574481
4036	NC_010717	CGA	2	6	213599	213604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574481
4037	NC_010717	CGG	2	6	213607	213612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574481
4038	NC_010717	GCA	2	6	213683	213688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574481
4039	NC_010717	CGA	2	6	213755	213760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574481
4040	NC_010717	GCGT	2	8	213784	213791	0 %	25 %	50 %	25 %	188574481
4041	NC_010717	GC	3	6	213792	213797	0 %	0 %	50 %	50 %	188574481
4042	NC_010717	CGA	2	6	213806	213811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574481
4043	NC_010717	TGG	2	6	213853	213858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574481
4044	NC_010717	TG	3	6	213902	213907	0 %	50 %	50 %	0 %	188574481
4045	NC_010717	GCG	2	6	213965	213970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574481
4046	NC_010717	CAT	2	6	213974	213979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574481
4047	NC_010717	CTT	2	6	214094	214099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574481
4048	NC_010717	GATGGC	2	12	214179	214190	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188574481
4049	NC_010717	ATCGC	2	10	214192	214201	20 %	20 %	20 %	40 %	188574481
4050	NC_010717	GCA	2	6	214202	214207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574481
4051	NC_010717	ACC	2	6	214221	214226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574481
4052	NC_010717	GC	4	8	214316	214323	0 %	0 %	50 %	50 %	188574481
4053	NC_010717	CGA	2	6	214376	214381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574481
4054	NC_010717	GC	3	6	214876	214881	0 %	0 %	50 %	50 %	188574482
4055	NC_010717	CGT	2	6	214891	214896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574482
4056	NC_010717	GCTT	2	8	214901	214908	0 %	50 %	25 %	25 %	188574482
4057	NC_010717	TCG	2	6	214928	214933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574482
4058	NC_010717	GCCA	2	8	214994	215001	25 %	0 %	25 %	50 %	188574482
4059	NC_010717	GTG	2	6	215020	215025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574482
4060	NC_010717	CTT	2	6	215056	215061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574482
4061	NC_010717	GC	3	6	215115	215120	0 %	0 %	50 %	50 %	188574482
4062	NC_010717	TTG	2	6	215150	215155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188574482
4063	NC_010717	CCGCGC	2	12	215234	215245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574482
4064	NC_010717	CGT	2	6	215247	215252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574482
4065	NC_010717	TCG	2	6	215270	215275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574482
4066	NC_010717	TCG	2	6	215333	215338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574482
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4069	NC_010717	GCG	2	6	215394	215399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574482
4070	NC_010717	GC	3	6	215410	215415	0 %	0 %	50 %	50 %	188574482
4071	NC_010717	GCT	2	6	215460	215465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574482
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4074	NC_010717	AGC	2	6	215576	215581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574482
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4077	NC_010717	TCG	2	6	215702	215707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574482
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4079	NC_010717	CG	3	6	215766	215771	0 %	0 %	50 %	50 %	188574482
4080	NC_010717	CAT	2	6	215797	215802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574482
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4086	NC_010717	GGT	2	6	216378	216383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574483
4087	NC_010717	CGTGC	2	10	216396	216405	0 %	20 %	40 %	40 %	188574483
4088	NC_010717	GC	3	6	216511	216516	0 %	0 %	50 %	50 %	188574483
4089	NC_010717	ACC	2	6	216541	216546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574483
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4091	NC_010717	AAG	2	6	216604	216609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574483
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4104	NC_010717	TGG	2	6	218119	218124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574484
4105	NC_010717	CTG	2	6	218165	218170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574484
4106	NC_010717	CCG	2	6	218176	218181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574484
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4108	NC_010717	CGCGC	2	10	218308	218317	0 %	0 %	40 %	60 %	188574484
4109	NC_010717	CGA	2	6	218335	218340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574484
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4111	NC_010717	CATC	2	8	218356	218363	25 %	25 %	0 %	50 %	188574484
4112	NC_010717	CGA	2	6	218407	218412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574484
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4116	NC_010717	ACGCC	2	10	218508	218517	20 %	0 %	20 %	60 %	188574484
4117	NC_010717	CTG	2	6	218528	218533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574484
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4120	NC_010717	GC	3	6	218653	218658	0 %	0 %	50 %	50 %	188574484
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4122	NC_010717	CTA	2	6	218698	218703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574484
4123	NC_010717	CG	3	6	218725	218730	0 %	0 %	50 %	50 %	188574484
4124	NC_010717	CGA	2	6	218790	218795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574484
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4154	NC_010717	GC	3	6	219658	219663	0 %	0 %	50 %	50 %	188574484
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4253	NC_010717	GCA	2	6	223931	223936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574486
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4486	NC_010717	CCGGTG	2	12	235785	235796	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	188574497
4487	NC_010717	GCC	2	6	235848	235853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574497
4488	NC_010717	GCG	2	6	235912	235917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574497
4489	NC_010717	TGG	2	6	235932	235937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574497
4490	NC_010717	CG	3	6	235945	235950	0 %	0 %	50 %	50 %	188574497
4491	NC_010717	CGG	2	6	236062	236067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574497
4492	NC_010717	GGTC	2	8	236091	236098	0 %	25 %	50 %	25 %	188574497
4493	NC_010717	CAG	3	9	236152	236160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574497
4494	NC_010717	GCG	2	6	236179	236184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574497
4495	NC_010717	CGGC	2	8	236199	236206	0 %	0 %	50 %	50 %	188574497
4496	NC_010717	CCAC	2	8	236214	236221	25 %	0 %	0 %	75 %	188574497
4497	NC_010717	TGCA	2	8	236222	236229	25 %	25 %	25 %	25 %	188574497
4498	NC_010717	GC	5	10	236274	236283	0 %	0 %	50 %	50 %	188574497
4499	NC_010717	CCA	2	6	236311	236316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574497
4500	NC_010717	CGG	2	6	236319	236324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574497

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