MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 103333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010717	GCC	2	6	159519	159524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574432
3002	NC_010717	AGC	2	6	159534	159539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574432
3003	NC_010717	GC	4	8	159538	159545	0 %	0 %	50 %	50 %	188574432
3004	NC_010717	TCG	2	6	159595	159600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574432
3005	NC_010717	CTG	2	6	159651	159656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574432
3006	NC_010717	GCCC	2	8	159665	159672	0 %	0 %	25 %	75 %	188574432
3007	NC_010717	GGCGC	2	10	159676	159685	0 %	0 %	60 %	40 %	188574432
3008	NC_010717	CG	3	6	159703	159708	0 %	0 %	50 %	50 %	188574432
3009	NC_010717	ACC	2	6	159751	159756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574432
3010	NC_010717	ACC	2	6	159850	159855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574432
3011	NC_010717	GCAC	2	8	159970	159977	25 %	0 %	25 %	50 %	188574432
3012	NC_010717	GCG	2	6	160119	160124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574432
3013	NC_010717	GC	3	6	160134	160139	0 %	0 %	50 %	50 %	188574432
3014	NC_010717	GTG	2	6	160143	160148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574432
3015	NC_010717	ACC	2	6	160152	160157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574432
3016	NC_010717	GC	3	6	160196	160201	0 %	0 %	50 %	50 %	188574432
3017	NC_010717	GCG	2	6	160225	160230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574432
3018	NC_010717	CGG	2	6	160247	160252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574432
3019	NC_010717	AGC	2	6	160281	160286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574432
3020	NC_010717	GC	3	6	160324	160329	0 %	0 %	50 %	50 %	188574432
3021	NC_010717	GGCC	2	8	160361	160368	0 %	0 %	50 %	50 %	188574432
3022	NC_010717	CGG	2	6	160454	160459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574432
3023	NC_010717	AGC	2	6	160473	160478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574432
3024	NC_010717	GCCGC	2	10	160517	160526	0 %	0 %	40 %	60 %	188574432
3025	NC_010717	GGC	2	6	160569	160574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574432
3026	NC_010717	CGA	2	6	160610	160615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574432
3027	NC_010717	CAG	2	6	160656	160661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574432
3028	NC_010717	ACCG	2	8	160686	160693	25 %	0 %	25 %	50 %	188574432
3029	NC_010717	GCG	2	6	160708	160713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574432
3030	NC_010717	GTCG	2	8	160769	160776	0 %	25 %	50 %	25 %	188574432
3031	NC_010717	CCTT	2	8	160789	160796	0 %	50 %	0 %	50 %	188574432
3032	NC_010717	GGT	2	6	160811	160816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574432
3033	NC_010717	CAC	2	6	160835	160840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574432
3034	NC_010717	TGC	2	6	160849	160854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574432
3035	NC_010717	GCA	2	6	160856	160861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574432
3036	NC_010717	GCA	2	6	160912	160917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574432
3037	NC_010717	CCTGG	2	10	160919	160928	0 %	20 %	40 %	40 %	188574432
3038	NC_010717	CAG	2	6	160977	160982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574432
3039	NC_010717	GGCC	2	8	161087	161094	0 %	0 %	50 %	50 %	188574432
3040	NC_010717	CGGC	2	8	161114	161121	0 %	0 %	50 %	50 %	188574432
3041	NC_010717	CACC	2	8	161155	161162	25 %	0 %	0 %	75 %	188574432
3042	NC_010717	GTC	2	6	161205	161210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574433
3043	NC_010717	AC	3	6	161219	161224	50 %	0 %	0 %	50 %	188574433
3044	NC_010717	TCG	2	6	161232	161237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574433
3045	NC_010717	GCC	2	6	161251	161256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574433
3046	NC_010717	GCT	2	6	161265	161270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574433
3047	NC_010717	CAG	2	6	161274	161279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574433
3048	NC_010717	CGC	2	6	161300	161305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574433
3049	NC_010717	CCG	2	6	161308	161313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574433
3050	NC_010717	CGG	2	6	161341	161346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574433
3051	NC_010717	CTT	2	6	161370	161375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574433
3052	NC_010717	CAA	2	6	161463	161468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188574433
3053	NC_010717	TGC	2	6	161477	161482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574433
3054	NC_010717	AGC	2	6	161488	161493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574433
3055	NC_010717	TTG	2	6	161506	161511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188574433
3056	NC_010717	CGC	3	9	161627	161635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574433
3057	NC_010717	CGG	2	6	161666	161671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574433
3058	NC_010717	AAC	2	6	161686	161691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188574433
3059	NC_010717	CTG	2	6	161695	161700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574433
3060	NC_010717	CGG	2	6	161714	161719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574433
3061	NC_010717	AC	3	6	161720	161725	50 %	0 %	0 %	50 %	188574433
3062	NC_010717	GCA	2	6	161848	161853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574433
3063	NC_010717	CGG	2	6	161873	161878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574433
3064	NC_010717	GGCT	2	8	161884	161891	0 %	25 %	50 %	25 %	188574433
3065	NC_010717	GCA	2	6	161902	161907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574433
3066	NC_010717	CGA	2	6	161949	161954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574433
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3068	NC_010717	CAGG	2	8	162392	162399	25 %	0 %	50 %	25 %	188574434
3069	NC_010717	ACCG	2	8	162407	162414	25 %	0 %	25 %	50 %	188574434
3070	NC_010717	GCA	2	6	162484	162489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574434
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3073	NC_010717	GGTC	2	8	162583	162590	0 %	25 %	50 %	25 %	188574434
3074	NC_010717	CAC	2	6	162658	162663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574434
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3076	NC_010717	CAC	2	6	162851	162856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574434
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3080	NC_010717	CGTGC	2	10	163069	163078	0 %	20 %	40 %	40 %	188574434
3081	NC_010717	GCA	2	6	163092	163097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574434
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3083	NC_010717	ATGC	2	8	163142	163149	25 %	25 %	25 %	25 %	188574434
3084	NC_010717	GCAG	2	8	163156	163163	25 %	0 %	50 %	25 %	188574434
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3086	NC_010717	CAC	2	6	163211	163216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574434
3087	NC_010717	GCG	2	6	163245	163250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574434
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3089	NC_010717	CGC	2	6	163319	163324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574434
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3094	NC_010717	GCC	2	6	163412	163417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574434
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3099	NC_010717	CTG	2	6	163589	163594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574434
3100	NC_010717	TGCT	2	8	163620	163627	0 %	50 %	25 %	25 %	188574434
3101	NC_010717	TGC	2	6	163644	163649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574434
3102	NC_010717	TGC	3	9	163662	163670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574434
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3104	NC_010717	CTG	2	6	163785	163790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574435
3105	NC_010717	TGA	2	6	164084	164089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188574436
3106	NC_010717	CGT	2	6	164184	164189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574436
3107	NC_010717	GAT	2	6	164591	164596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188574437
3108	NC_010717	CGCT	2	8	164611	164618	0 %	25 %	25 %	50 %	188574437
3109	NC_010717	GTTGT	2	10	164622	164631	0 %	60 %	40 %	0 %	188574437
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3112	NC_010717	CAGC	2	8	164777	164784	25 %	0 %	25 %	50 %	188574437
3113	NC_010717	GCCC	2	8	164807	164814	0 %	0 %	25 %	75 %	188574437
3114	NC_010717	GCG	2	6	164830	164835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574437
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3118	NC_010717	CGC	2	6	165255	165260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574438
3119	NC_010717	GC	3	6	165405	165410	0 %	0 %	50 %	50 %	188574438
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3121	NC_010717	GC	3	6	165439	165444	0 %	0 %	50 %	50 %	188574438
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3487	NC_010717	AGC	2	6	183648	183653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574460
3488	NC_010717	CGTG	2	8	183655	183662	0 %	25 %	50 %	25 %	188574460
3489	NC_010717	GCG	2	6	183909	183914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574461
3490	NC_010717	CAA	2	6	183940	183945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188574461
3491	NC_010717	CTG	2	6	183979	183984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574461
3492	NC_010717	CCA	2	6	184001	184006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574461
3493	NC_010717	GCC	2	6	184066	184071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574461
3494	NC_010717	TGC	2	6	184097	184102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574461
3495	NC_010717	CAC	2	6	184123	184128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574461
3496	NC_010717	CCA	2	6	184170	184175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574461
3497	NC_010717	TCG	2	6	184190	184195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574461
3498	NC_010717	CAC	2	6	184198	184203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574461
3499	NC_010717	GTC	3	9	184222	184230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574461
3500	NC_010717	CAA	2	6	184315	184320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188574461

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