MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 103333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_010717	GCC	3	9	560900	560908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574801
11003	NC_010717	GCC	2	6	561002	561007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574801
11004	NC_010717	GCC	2	6	561104	561109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574801
11005	NC_010717	GCC	2	6	561206	561211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574801
11006	NC_010717	CCA	2	6	561229	561234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574801
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11009	NC_010717	GCC	2	6	561407	561412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574801
11010	NC_010717	TGGC	2	8	561417	561424	0 %	25 %	50 %	25 %	188574801
11011	NC_010717	GCC	2	6	561509	561514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574801
11012	NC_010717	TGGC	2	8	561519	561526	0 %	25 %	50 %	25 %	188574801
11013	NC_010717	GCC	2	6	561611	561616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574801
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11017	NC_010717	CCA	2	6	561835	561840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574801
11018	NC_010717	GCC	2	6	561914	561919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574801
11019	NC_010717	GCC	3	9	562016	562024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574801
11020	NC_010717	GCC	2	6	562118	562123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574801
11021	NC_010717	CCA	2	6	562141	562146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574801
11022	NC_010717	G	6	6	562168	562173	0 %	0 %	100 %	0 %	188574801
11023	NC_010717	CATG	2	8	562194	562201	25 %	25 %	25 %	25 %	188574801
11024	NC_010717	CGC	2	6	562222	562227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574801
11025	NC_010717	CGG	2	6	562271	562276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574802
11026	NC_010717	GT	3	6	562361	562366	0 %	50 %	50 %	0 %	188574802
11027	NC_010717	CGC	2	6	563197	563202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574803
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11029	NC_010717	GCC	2	6	563246	563251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574803
11030	NC_010717	TTC	2	6	563264	563269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574803
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11032	NC_010717	AGC	2	6	563302	563307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574804
11033	NC_010717	TGCGCT	2	12	563409	563420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574804
11034	NC_010717	GTCACC	2	12	563482	563493	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	188574804
11035	NC_010717	GC	3	6	563510	563515	0 %	0 %	50 %	50 %	188574804
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11038	NC_010717	ATCA	2	8	563620	563627	50 %	25 %	0 %	25 %	188574804
11039	NC_010717	CGC	2	6	563660	563665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574804
11040	NC_010717	CGA	2	6	563697	563702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574804
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11042	NC_010717	CGCT	2	8	563785	563792	0 %	25 %	25 %	50 %	188574804
11043	NC_010717	CG	3	6	563874	563879	0 %	0 %	50 %	50 %	188574804
11044	NC_010717	CGA	2	6	563886	563891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574804
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11047	NC_010717	GATC	2	8	564056	564063	25 %	25 %	25 %	25 %	188574804
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11050	NC_010717	ATGC	2	8	564189	564196	25 %	25 %	25 %	25 %	188574804
11051	NC_010717	TGG	2	6	564200	564205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574804
11052	NC_010717	TGA	3	9	564223	564231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188574804
11053	NC_010717	GAGCA	2	10	564333	564342	40 %	0 %	40 %	20 %	188574805
11054	NC_010717	GCA	2	6	564363	564368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574805
11055	NC_010717	GTCG	2	8	564374	564381	0 %	25 %	50 %	25 %	188574805
11056	NC_010717	CAG	3	9	564390	564398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574805
11057	NC_010717	CAG	3	9	564414	564422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574805
11058	NC_010717	TGC	3	9	564604	564612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574806
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11062	NC_010717	CAG	2	6	564983	564988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574807
11063	NC_010717	GCC	3	9	564989	564997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574807
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11069	NC_010717	CAT	2	6	565172	565177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574808
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11072	NC_010717	TCC	2	6	565297	565302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188574808
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11090	NC_010717	CG	3	6	565749	565754	0 %	0 %	50 %	50 %	188574809
11091	NC_010717	ACC	2	6	565864	565869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574809
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11101	NC_010717	CCTT	2	8	566809	566816	0 %	50 %	0 %	50 %	188574810
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11107	NC_010717	TCG	2	6	567121	567126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574810
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11119	NC_010717	GAC	3	9	567414	567422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574810
11120	NC_010717	GGC	2	6	567441	567446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574810
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11478	NC_010717	ATCA	2	8	589612	589619	50 %	25 %	0 %	25 %	188574825
11479	NC_010717	TGC	2	6	589637	589642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574825
11480	NC_010717	CGC	2	6	589649	589654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574825
11481	NC_010717	CTG	2	6	589696	589701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574825
11482	NC_010717	GGC	2	6	589715	589720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574825
11483	NC_010717	GCA	2	6	589734	589739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574825
11484	NC_010717	TC	3	6	589740	589745	0 %	50 %	0 %	50 %	188574825
11485	NC_010717	CCG	3	9	589775	589783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574825
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11488	NC_010717	GCG	2	6	590031	590036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574826
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11490	NC_010717	CGT	2	6	590139	590144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574826
11491	NC_010717	CGT	2	6	590163	590168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574826
11492	NC_010717	TCACAT	2	12	590260	590271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574826
11493	NC_010717	GTA	2	6	590275	590280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188574826
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11499	NC_010717	GCT	2	6	590414	590419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574826
11500	NC_010717	CCTTGC	2	12	590422	590433	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	188574826

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