MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 103333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010717	GCA	2	6	25518	25523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574292
502	NC_010717	GATGCG	2	12	25591	25602	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188574292
503	NC_010717	TGCCCA	2	12	25656	25667	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	188574292
504	NC_010717	CAG	2	6	25687	25692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574292
505	NC_010717	CAGC	2	8	25717	25724	25 %	0 %	25 %	50 %	188574292
506	NC_010717	CTTC	2	8	26232	26239	0 %	50 %	0 %	50 %	188574293
507	NC_010717	TTAT	2	8	26366	26373	25 %	75 %	0 %	0 %	188574293
508	NC_010717	TGC	2	6	26385	26390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574293
509	NC_010717	GGC	2	6	26415	26420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574293
510	NC_010717	TGA	2	6	26435	26440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188574293
511	NC_010717	CTG	2	6	26479	26484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574293
512	NC_010717	GC	3	6	26494	26499	0 %	0 %	50 %	50 %	188574293
513	NC_010717	GGC	2	6	26508	26513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574293
514	NC_010717	CAA	2	6	26554	26559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188574293
515	NC_010717	GCCCG	2	10	26581	26590	0 %	0 %	40 %	60 %	188574293
516	NC_010717	CGA	2	6	26592	26597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574293
517	NC_010717	CCA	2	6	26622	26627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574293
518	NC_010717	CG	3	6	26631	26636	0 %	0 %	50 %	50 %	188574293
519	NC_010717	CGC	2	6	26672	26677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574293
520	NC_010717	CAG	2	6	26713	26718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574293
521	NC_010717	GC	3	6	26793	26798	0 %	0 %	50 %	50 %	188574293
522	NC_010717	GCCC	2	8	26805	26812	0 %	0 %	25 %	75 %	188574293
523	NC_010717	ACC	2	6	27089	27094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574294
524	NC_010717	CAT	2	6	27130	27135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574294
525	NC_010717	CGT	2	6	27162	27167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574294
526	NC_010717	CCA	2	6	27192	27197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574294
527	NC_010717	ATC	2	6	27549	27554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574295
528	NC_010717	CAC	3	9	27581	27589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574295
529	NC_010717	CGC	2	6	27629	27634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574295
530	NC_010717	GC	3	6	27642	27647	0 %	0 %	50 %	50 %	188574295
531	NC_010717	TGGCC	2	10	27704	27713	0 %	20 %	40 %	40 %	188574295
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533	NC_010717	TTC	2	6	27762	27767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574295
534	NC_010717	CCG	2	6	27799	27804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574295
535	NC_010717	GCC	2	6	27843	27848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574295
536	NC_010717	CGC	2	6	27890	27895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574295
537	NC_010717	GC	5	10	27894	27903	0 %	0 %	50 %	50 %	188574295
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539	NC_010717	TGG	2	6	27949	27954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574295
540	NC_010717	GCG	2	6	27994	27999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574295
541	NC_010717	ACCGCC	2	12	28041	28052	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	188574295
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543	NC_010717	CAT	2	6	28073	28078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574295
544	NC_010717	TCGA	2	8	28086	28093	25 %	25 %	25 %	25 %	188574295
545	NC_010717	GC	3	6	28102	28107	0 %	0 %	50 %	50 %	188574295
546	NC_010717	G	7	7	28136	28142	0 %	0 %	100 %	0 %	188574295
547	NC_010717	GC	4	8	28198	28205	0 %	0 %	50 %	50 %	188574295
548	NC_010717	ACCGC	2	10	28291	28300	20 %	0 %	20 %	60 %	188574295
549	NC_010717	CG	3	6	28313	28318	0 %	0 %	50 %	50 %	188574295
550	NC_010717	GGC	2	6	28335	28340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574295
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552	NC_010717	GCCG	2	8	28514	28521	0 %	0 %	50 %	50 %	188574295
553	NC_010717	CGCCTG	2	12	28548	28559	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	188574295
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555	NC_010717	CGA	2	6	28577	28582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574295
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557	NC_010717	ACG	2	6	28711	28716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574295
558	NC_010717	TGC	2	6	28808	28813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574296
559	NC_010717	CAG	2	6	28826	28831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574296
560	NC_010717	CTG	2	6	29035	29040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574297
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565	NC_010717	CA	3	6	29414	29419	50 %	0 %	0 %	50 %	188574298
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622	NC_010717	GC	3	6	35561	35566	0 %	0 %	50 %	50 %	188574302
623	NC_010717	GGCG	2	8	35570	35577	0 %	0 %	75 %	25 %	188574302
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