MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 103333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_010717	CAC	3	9	259754	259762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574518
5003	NC_010717	TGG	2	6	259851	259856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574518
5004	NC_010717	GCA	2	6	259915	259920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574518
5005	NC_010717	GCT	2	6	259946	259951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574518
5006	NC_010717	GC	3	6	259958	259963	0 %	0 %	50 %	50 %	188574518
5007	NC_010717	GTG	2	6	259967	259972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574518
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5009	NC_010717	CTAC	2	8	260559	260566	25 %	25 %	0 %	50 %	188574519
5010	NC_010717	GCT	3	9	260600	260608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574519
5011	NC_010717	GC	3	6	260611	260616	0 %	0 %	50 %	50 %	188574519
5012	NC_010717	GCCG	2	8	260678	260685	0 %	0 %	50 %	50 %	188574519
5013	NC_010717	GCG	2	6	260714	260719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574519
5014	NC_010717	TGG	2	6	260728	260733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574519
5015	NC_010717	GC	3	6	260739	260744	0 %	0 %	50 %	50 %	188574519
5016	NC_010717	GCG	2	6	260781	260786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574519
5017	NC_010717	CTGA	2	8	260814	260821	25 %	25 %	25 %	25 %	188574519
5018	NC_010717	GC	3	6	260845	260850	0 %	0 %	50 %	50 %	188574519
5019	NC_010717	CGC	2	6	260883	260888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574519
5020	NC_010717	GCA	2	6	260891	260896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574519
5021	NC_010717	CCCG	2	8	260999	261006	0 %	0 %	25 %	75 %	188574519
5022	NC_010717	AGC	2	6	261007	261012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574519
5023	NC_010717	GC	4	8	261011	261018	0 %	0 %	50 %	50 %	188574519
5024	NC_010717	CGC	2	6	261064	261069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574519
5025	NC_010717	CGC	3	9	261113	261121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574519
5026	NC_010717	GC	4	8	261120	261127	0 %	0 %	50 %	50 %	188574519
5027	NC_010717	AG	3	6	261173	261178	50 %	0 %	50 %	0 %	188574519
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5029	NC_010717	TCGA	2	8	261240	261247	25 %	25 %	25 %	25 %	188574519
5030	NC_010717	GCC	2	6	261327	261332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574519
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5033	NC_010717	GCCC	3	12	261561	261572	0 %	0 %	25 %	75 %	188574520
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5043	NC_010717	GCA	3	9	261939	261947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574520
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5052	NC_010717	GCAC	2	8	262278	262285	25 %	0 %	25 %	50 %	188574520
5053	NC_010717	CTG	2	6	262337	262342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574520
5054	NC_010717	GCC	2	6	262358	262363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574520
5055	NC_010717	GCC	2	6	262460	262465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574520
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5057	NC_010717	GTG	2	6	262589	262594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574520
5058	NC_010717	CTG	3	9	262628	262636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574520
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5060	NC_010717	GGT	2	6	262705	262710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574520
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5065	NC_010717	TGG	2	6	262809	262814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574520
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5122	NC_010717	TTCG	2	8	265082	265089	0 %	50 %	25 %	25 %	188574522
5123	NC_010717	GCG	2	6	265123	265128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574522
5124	NC_010717	GCA	2	6	265168	265173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574522
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5126	NC_010717	GGC	2	6	265298	265303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574522
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5128	NC_010717	TCG	2	6	266092	266097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574523
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5130	NC_010717	CGA	2	6	266171	266176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574523
5131	NC_010717	CGG	2	6	266180	266185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574523
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5133	NC_010717	CTG	2	6	266372	266377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574524
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5142	NC_010717	GAA	2	6	266737	266742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574525
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5146	NC_010717	CGG	2	6	266866	266871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574525
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5150	NC_010717	TGCGC	2	10	267090	267099	0 %	20 %	40 %	40 %	188574526
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5154	NC_010717	AGC	3	9	267254	267262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574526
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5163	NC_010717	CGA	2	6	267663	267668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574526
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5230	NC_010717	GCA	2	6	273496	273501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574530
5231	NC_010717	GCCGA	2	10	273517	273526	20 %	0 %	40 %	40 %	188574530
5232	NC_010717	GATCGA	2	12	273597	273608	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188574530
5233	NC_010717	CAG	2	6	273624	273629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574530
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5235	NC_010717	GC	3	6	273699	273704	0 %	0 %	50 %	50 %	188574530
5236	NC_010717	CACCGG	2	12	273711	273722	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	188574530
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5240	NC_010717	TGC	2	6	273788	273793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574530
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5485	NC_010717	ACG	2	6	284342	284347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574539
5486	NC_010717	CGGC	2	8	284348	284355	0 %	0 %	50 %	50 %	188574539
5487	NC_010717	CCG	2	6	284360	284365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574539
5488	NC_010717	CTG	2	6	284380	284385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574539
5489	NC_010717	GC	3	6	284452	284457	0 %	0 %	50 %	50 %	188574539
5490	NC_010717	CAGC	2	8	284487	284494	25 %	0 %	25 %	50 %	188574539
5491	NC_010717	GGTG	2	8	284511	284518	0 %	25 %	75 %	0 %	188574539
5492	NC_010717	GC	3	6	284584	284589	0 %	0 %	50 %	50 %	188574539
5493	NC_010717	GCC	2	6	284602	284607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574539
5494	NC_010717	GCCTGC	2	12	284660	284671	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	188574539
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5499	NC_010717	CAGGC	2	10	284884	284893	20 %	0 %	40 %	40 %	188574540
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