MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. campestris str. B100 chromosome

Total Repeats: 112978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_010688	CAGGTA	2	12	185893	185904	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188989556
4003	NC_010688	CAC	3	9	185938	185946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989556
4004	NC_010688	CGC	2	6	185949	185954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989556
4005	NC_010688	CGT	2	6	185973	185978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989556
4006	NC_010688	GGT	2	6	186001	186006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989556
4007	NC_010688	GCC	3	9	186010	186018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989556
4008	NC_010688	CCA	2	6	186047	186052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989556
4009	NC_010688	TGG	2	6	186099	186104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989556
4010	NC_010688	GCG	2	6	186123	186128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989556
4011	NC_010688	CG	3	6	186309	186314	0 %	0 %	50 %	50 %	188989556
4012	NC_010688	CGGTGC	2	12	186316	186327	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	188989556
4013	NC_010688	GGC	3	9	186328	186336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989556
4014	NC_010688	GCG	2	6	186353	186358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989556
4015	NC_010688	CAG	2	6	186370	186375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989556
4016	NC_010688	GCC	2	6	186376	186381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989556
4017	NC_010688	AC	3	6	186382	186387	50 %	0 %	0 %	50 %	188989556
4018	NC_010688	CAG	2	6	186388	186393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989556
4019	NC_010688	GCG	3	9	186394	186402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989556
4020	NC_010688	GC	3	6	186419	186424	0 %	0 %	50 %	50 %	188989556
4021	NC_010688	GCG	2	6	186443	186448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989557
4022	NC_010688	CTG	2	6	186465	186470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989557
4023	NC_010688	GGT	2	6	186516	186521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989557
4024	NC_010688	GCC	2	6	186543	186548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989557
4025	NC_010688	GCTC	2	8	186566	186573	0 %	25 %	25 %	50 %	188989557
4026	NC_010688	GC	3	6	186583	186588	0 %	0 %	50 %	50 %	188989557
4027	NC_010688	AGC	2	6	186589	186594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989557
4028	NC_010688	CGT	2	6	186596	186601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989557
4029	NC_010688	AAC	2	6	186627	186632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188989557
4030	NC_010688	GTC	2	6	186636	186641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989557
4031	NC_010688	GCA	2	6	186650	186655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989557
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4033	NC_010688	GCG	2	6	186692	186697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989557
4034	NC_010688	CG	3	6	186702	186707	0 %	0 %	50 %	50 %	188989557
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4040	NC_010688	GC	4	8	186977	186984	0 %	0 %	50 %	50 %	188989557
4041	NC_010688	GCA	2	6	187046	187051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989557
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4043	NC_010688	CAA	2	6	187076	187081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188989557
4044	NC_010688	GCC	3	9	187131	187139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989557
4045	NC_010688	CAG	2	6	187149	187154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989557
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4048	NC_010688	GCT	2	6	187242	187247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989557
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4056	NC_010688	ACG	2	6	187635	187640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989558
4057	NC_010688	CGTCCA	2	12	187656	187667	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	188989558
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4102	NC_010688	CG	3	6	189337	189342	0 %	0 %	50 %	50 %	188989559
4103	NC_010688	GCA	2	6	189343	189348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989559
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4108	NC_010688	GCT	2	6	189590	189595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989560
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4121	NC_010688	GCG	2	6	190091	190096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989561
4122	NC_010688	GGT	2	6	190132	190137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989561
4123	NC_010688	GCA	2	6	190144	190149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989561
4124	NC_010688	CCG	2	6	190155	190160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989561
4125	NC_010688	CGT	2	6	190173	190178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989561
4126	NC_010688	GTT	2	6	190192	190197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188989561
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4133	NC_010688	GAT	2	6	190387	190392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188989561
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4145	NC_010688	GCT	2	6	190777	190782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989561
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4153	NC_010688	TGA	2	6	190968	190973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188989561
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4165	NC_010688	ACC	2	6	191437	191442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989562
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4200	NC_010688	CGC	2	6	192566	192571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989562
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4240	NC_010688	CGG	2	6	195082	195087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989564
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4242	NC_010688	TCA	2	6	195124	195129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989564
4243	NC_010688	CCGGCA	2	12	195139	195150	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	188989564
4244	NC_010688	GCA	2	6	195214	195219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989564
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4349	NC_010688	GC	3	6	199506	199511	0 %	0 %	50 %	50 %	188989568
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4354	NC_010688	CAG	2	6	199597	199602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989568
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4360	NC_010688	AAC	2	6	199813	199818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188989568
4361	NC_010688	AGC	2	6	199893	199898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989568
4362	NC_010688	CGTCGC	2	12	200127	200138	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	188989569
4363	NC_010688	CGC	2	6	200151	200156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989569
4364	NC_010688	GCCG	2	8	200194	200201	0 %	0 %	50 %	50 %	188989569
4365	NC_010688	GCG	2	6	200225	200230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989569
4366	NC_010688	TCT	2	6	200298	200303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188989569
4367	NC_010688	GCC	2	6	200369	200374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989569
4368	NC_010688	GACGA	2	10	200405	200414	40 %	0 %	40 %	20 %	188989569
4369	NC_010688	GCG	2	6	200442	200447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989569
4370	NC_010688	TCA	2	6	200577	200582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989569
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4372	NC_010688	CCA	2	6	200659	200664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989569
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4377	NC_010688	GTC	2	6	200800	200805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989569
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4379	NC_010688	CAG	2	6	200857	200862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989569
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4387	NC_010688	GCT	2	6	201187	201192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989570
4388	NC_010688	GCA	3	9	201207	201215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989570
4389	NC_010688	GCTG	2	8	201223	201230	0 %	25 %	50 %	25 %	188989570
4390	NC_010688	TC	3	6	201241	201246	0 %	50 %	0 %	50 %	188989570
4391	NC_010688	CTGC	3	12	201252	201263	0 %	25 %	25 %	50 %	188989570
4392	NC_010688	CGGC	2	8	201285	201292	0 %	0 %	50 %	50 %	188989570
4393	NC_010688	ATC	2	6	201293	201298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989570
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4395	NC_010688	GC	5	10	201323	201332	0 %	0 %	50 %	50 %	188989570
4396	NC_010688	TGGGCC	2	12	201333	201344	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	188989570
4397	NC_010688	CGC	2	6	201403	201408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989570
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4399	NC_010688	CTG	2	6	201439	201444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989570
4400	NC_010688	CTG	2	6	201470	201475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989570
4401	NC_010688	CAGGTG	2	12	201476	201487	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188989570
4402	NC_010688	TGCC	2	8	201885	201892	0 %	25 %	25 %	50 %	188989571
4403	NC_010688	CGCTG	2	10	201919	201928	0 %	20 %	40 %	40 %	188989571
4404	NC_010688	CGCC	2	8	201948	201955	0 %	0 %	25 %	75 %	188989571
4405	NC_010688	CG	3	6	201958	201963	0 %	0 %	50 %	50 %	188989571
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4411	NC_010688	CG	4	8	202216	202223	0 %	0 %	50 %	50 %	188989571
4412	NC_010688	GCG	2	6	202269	202274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989571
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4420	NC_010688	CGGT	2	8	202647	202654	0 %	25 %	50 %	25 %	188989571
4421	NC_010688	AAC	2	6	202782	202787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188989571
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4454	NC_010688	GA	3	6	204985	204990	50 %	0 %	50 %	0 %	188989573
4455	NC_010688	AGC	2	6	205000	205005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989573
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4467	NC_010688	CCA	2	6	206042	206047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989574
4468	NC_010688	GC	3	6	206067	206072	0 %	0 %	50 %	50 %	188989574
4469	NC_010688	CACCGG	2	12	206079	206090	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	188989574
4470	NC_010688	CCG	2	6	206101	206106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989574
4471	NC_010688	TGC	2	6	206156	206161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989574
4472	NC_010688	CG	3	6	206166	206171	0 %	0 %	50 %	50 %	188989574
4473	NC_010688	CACG	2	8	206192	206199	25 %	0 %	25 %	50 %	188989574
4474	NC_010688	GCC	2	6	206274	206279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989574
4475	NC_010688	CTGGT	2	10	206356	206365	0 %	40 %	40 %	20 %	188989574
4476	NC_010688	CACC	2	8	206423	206430	25 %	0 %	0 %	75 %	188989574
4477	NC_010688	ACC	3	9	206455	206463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989574
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4479	NC_010688	CAC	2	6	206586	206591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989574
4480	NC_010688	GCAAG	2	10	206654	206663	40 %	0 %	40 %	20 %	188989574
4481	NC_010688	CGC	2	6	207095	207100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989575
4482	NC_010688	GTT	2	6	207101	207106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188989575
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4484	NC_010688	GCA	2	6	207131	207136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989575
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