MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. campestris str. B100 chromosome

Total Repeats: 112978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_010688	CCA	2	6	139736	139741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989519
3003	NC_010688	GC	5	10	139744	139753	0 %	0 %	50 %	50 %	188989519
3004	NC_010688	CCGC	2	8	139781	139788	0 %	0 %	25 %	75 %	188989519
3005	NC_010688	CG	3	6	139789	139794	0 %	0 %	50 %	50 %	188989519
3006	NC_010688	CTG	2	6	139799	139804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989519
3007	NC_010688	GCC	2	6	139852	139857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989519
3008	NC_010688	TCG	2	6	139960	139965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989519
3009	NC_010688	GCG	2	6	139968	139973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989519
3010	NC_010688	GCA	2	6	139988	139993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989519
3011	NC_010688	TGC	2	6	139996	140001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989519
3012	NC_010688	AGC	2	6	140002	140007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989519
3013	NC_010688	GC	3	6	140025	140030	0 %	0 %	50 %	50 %	188989519
3014	NC_010688	GCA	2	6	140042	140047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989519
3015	NC_010688	GGC	2	6	140057	140062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989519
3016	NC_010688	TCT	2	6	140077	140082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188989519
3017	NC_010688	CGC	2	6	140103	140108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989519
3018	NC_010688	GAT	2	6	140118	140123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188989519
3019	NC_010688	GGC	2	6	140146	140151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989519
3020	NC_010688	CCA	2	6	140186	140191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989519
3021	NC_010688	GC	3	6	140258	140263	0 %	0 %	50 %	50 %	188989519
3022	NC_010688	TGC	2	6	140264	140269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989519
3023	NC_010688	GCA	2	6	140279	140284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989519
3024	NC_010688	GCA	2	6	140296	140301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989519
3025	NC_010688	CCA	2	6	140330	140335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989519
3026	NC_010688	CGGG	2	8	140392	140399	0 %	0 %	75 %	25 %	188989519
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3029	NC_010688	CG	3	6	140496	140501	0 %	0 %	50 %	50 %	188989519
3030	NC_010688	CGC	3	9	140552	140560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989519
3031	NC_010688	CGC	2	6	140565	140570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989519
3032	NC_010688	CGCCAC	2	12	140583	140594	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	188989519
3033	NC_010688	CCG	2	6	140614	140619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989519
3034	NC_010688	CAC	2	6	140637	140642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989519
3035	NC_010688	GC	3	6	140647	140652	0 %	0 %	50 %	50 %	188989519
3036	NC_010688	AGC	2	6	140689	140694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989519
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3038	NC_010688	GC	4	8	140720	140727	0 %	0 %	50 %	50 %	188989519
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3041	NC_010688	GCA	2	6	140885	140890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989519
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3043	NC_010688	GTC	2	6	140940	140945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989519
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3046	NC_010688	CAT	2	6	141084	141089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989519
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3048	NC_010688	GGCAC	2	10	141281	141290	20 %	0 %	40 %	40 %	188989519
3049	NC_010688	CGC	2	6	141348	141353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989519
3050	NC_010688	GCG	2	6	141354	141359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989519
3051	NC_010688	GC	3	6	141713	141718	0 %	0 %	50 %	50 %	188989520
3052	NC_010688	GCC	2	6	141735	141740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989520
3053	NC_010688	ATC	2	6	141770	141775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989520
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3055	NC_010688	GCC	2	6	141851	141856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989520
3056	NC_010688	GC	3	6	141863	141868	0 %	0 %	50 %	50 %	188989520
3057	NC_010688	ACG	2	6	141879	141884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989520
3058	NC_010688	GAA	2	6	141889	141894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188989520
3059	NC_010688	GGCCT	2	10	141926	141935	0 %	20 %	40 %	40 %	188989520
3060	NC_010688	CTTCGG	2	12	141952	141963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989520
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3069	NC_010688	CAT	2	6	142294	142299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989520
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3083	NC_010688	ACG	2	6	143165	143170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989521
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3085	NC_010688	CAT	2	6	143271	143276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989521
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3088	NC_010688	TGA	2	6	143354	143359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188989521
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3099	NC_010688	CGG	2	6	143842	143847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989522
3100	NC_010688	CGGCG	2	10	143878	143887	0 %	0 %	60 %	40 %	188989522
3101	NC_010688	CAG	2	6	143905	143910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989522
3102	NC_010688	CAC	2	6	144019	144024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989522
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3104	NC_010688	GTCG	2	8	144088	144095	0 %	25 %	50 %	25 %	188989522
3105	NC_010688	CCA	2	6	144132	144137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989522
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3108	NC_010688	CAC	2	6	144250	144255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989522
3109	NC_010688	CG	3	6	144256	144261	0 %	0 %	50 %	50 %	188989522
3110	NC_010688	GGA	2	6	144397	144402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188989522
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3112	NC_010688	CCG	2	6	144539	144544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989522
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3114	NC_010688	GGCTG	2	10	144656	144665	0 %	20 %	60 %	20 %	188989522
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3120	NC_010688	GTC	2	6	145028	145033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989523
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3122	NC_010688	TTC	2	6	145118	145123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188989523
3123	NC_010688	TGG	2	6	145179	145184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989523
3124	NC_010688	GTG	2	6	145197	145202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989523
3125	NC_010688	CAGCTG	2	12	145220	145231	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	188989523
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3129	NC_010688	CG	5	10	145451	145460	0 %	0 %	50 %	50 %	188989523
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3230	NC_010688	CGG	2	6	150375	150380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989525
3231	NC_010688	CAG	2	6	150474	150479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989525
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3233	NC_010688	GCA	2	6	150522	150527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989525
3234	NC_010688	ACA	2	6	150617	150622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188989525
3235	NC_010688	GGT	2	6	150655	150660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989525
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3237	NC_010688	CAA	2	6	150705	150710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188989525
3238	NC_010688	GC	3	6	150760	150765	0 %	0 %	50 %	50 %	188989525
3239	NC_010688	CACCTT	2	12	150858	150869	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	188989525
3240	NC_010688	GCCG	2	8	150954	150961	0 %	0 %	50 %	50 %	188989525
3241	NC_010688	GCGTGG	2	12	150962	150973	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	188989525
3242	NC_010688	CCA	2	6	151028	151033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989525
3243	NC_010688	GCG	2	6	151109	151114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989525
3244	NC_010688	CAA	3	9	151152	151160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188989525
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3246	NC_010688	CG	3	6	151228	151233	0 %	0 %	50 %	50 %	188989525
3247	NC_010688	CGC	2	6	151275	151280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989525
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3250	NC_010688	CTG	2	6	151384	151389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989525
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3351	NC_010688	CG	4	8	155371	155378	0 %	0 %	50 %	50 %	188989529
3352	NC_010688	ACC	2	6	155423	155428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989529
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3356	NC_010688	GGCCA	2	10	155582	155591	20 %	0 %	40 %	40 %	188989529
3357	NC_010688	CCACCG	2	12	155604	155615	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	188989529
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3361	NC_010688	GC	3	6	155793	155798	0 %	0 %	50 %	50 %	188989529
3362	NC_010688	GCCG	2	8	155870	155877	0 %	0 %	50 %	50 %	188989529
3363	NC_010688	GAGC	2	8	155887	155894	25 %	0 %	50 %	25 %	188989529
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3484	NC_010688	GCATG	2	10	162568	162577	20 %	20 %	40 %	20 %	188989533
3485	NC_010688	ACG	2	6	162711	162716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989533
3486	NC_010688	CGT	2	6	162922	162927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989533
3487	NC_010688	CAT	2	6	162958	162963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989533
3488	NC_010688	CGT	2	6	162980	162985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989533
3489	NC_010688	CA	3	6	163040	163045	50 %	0 %	0 %	50 %	188989533
3490	NC_010688	TCA	2	6	163086	163091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989533
3491	NC_010688	GACCT	2	10	163211	163220	20 %	20 %	20 %	40 %	188989533
3492	NC_010688	CCT	2	6	163237	163242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188989533
3493	NC_010688	GCT	2	6	163250	163255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989533
3494	NC_010688	GC	3	6	163357	163362	0 %	0 %	50 %	50 %	188989533
3495	NC_010688	GCT	2	6	163380	163385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989533
3496	NC_010688	CCG	2	6	163437	163442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989533
3497	NC_010688	CGAT	2	8	163465	163472	25 %	25 %	25 %	25 %	188989533
3498	NC_010688	CTC	2	6	163484	163489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188989533
3499	NC_010688	TAGG	2	8	163514	163521	25 %	25 %	50 %	0 %	188989533
3500	NC_010688	CAG	2	6	163595	163600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989533

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