MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Xylella fastidiosa M23 plasmid pXFAS01

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010579	TG	3	6	97	102	0 %	50 %	50 %	0 %	182682735
2	NC_010579	CT	3	6	1570	1575	0 %	50 %	0 %	50 %	182682736
3	NC_010579	CA	3	6	2402	2407	50 %	0 %	0 %	50 %	182682736
4	NC_010579	TC	3	6	3448	3453	0 %	50 %	0 %	50 %	182682737
5	NC_010579	TG	3	6	3849	3854	0 %	50 %	50 %	0 %	182682738
6	NC_010579	AG	3	6	5660	5665	50 %	0 %	50 %	0 %	182682740
7	NC_010579	AG	3	6	8747	8752	50 %	0 %	50 %	0 %	182682743
8	NC_010579	CA	3	6	8975	8980	50 %	0 %	0 %	50 %	182682744
9	NC_010579	TC	4	8	9193	9200	0 %	50 %	0 %	50 %	182682744
10	NC_010579	GC	3	6	10225	10230	0 %	0 %	50 %	50 %	182682745
11	NC_010579	CG	3	6	11184	11189	0 %	0 %	50 %	50 %	182682747
12	NC_010579	GC	3	6	11610	11615	0 %	0 %	50 %	50 %	182682747
13	NC_010579	TA	3	6	12288	12293	50 %	50 %	0 %	0 %	182682748
14	NC_010579	CA	3	6	12343	12348	50 %	0 %	0 %	50 %	182682748
15	NC_010579	AT	3	6	12916	12921	50 %	50 %	0 %	0 %	182682749
16	NC_010579	TA	3	6	13440	13445	50 %	50 %	0 %	0 %	182682750
17	NC_010579	TA	3	6	15133	15138	50 %	50 %	0 %	0 %	182682752
18	NC_010579	GT	3	6	16133	16138	0 %	50 %	50 %	0 %	182682752
19	NC_010579	TC	3	6	16315	16320	0 %	50 %	0 %	50 %	182682752
20	NC_010579	TC	3	6	16881	16886	0 %	50 %	0 %	50 %	182682752
21	NC_010579	CT	3	6	17118	17123	0 %	50 %	0 %	50 %	182682752
22	NC_010579	CG	3	6	17820	17825	0 %	0 %	50 %	50 %	182682752
23	NC_010579	AC	3	6	17963	17968	50 %	0 %	0 %	50 %	182682752
24	NC_010579	AT	3	6	18355	18360	50 %	50 %	0 %	0 %	182682752
25	NC_010579	CT	3	6	18708	18713	0 %	50 %	0 %	50 %	182682752
26	NC_010579	AC	3	6	19213	19218	50 %	0 %	0 %	50 %	182682753
27	NC_010579	AG	3	6	20520	20525	50 %	0 %	50 %	0 %	182682754
28	NC_010579	GT	3	6	22029	22034	0 %	50 %	50 %	0 %	182682756
29	NC_010579	TG	3	6	23782	23787	0 %	50 %	50 %	0 %	182682756
30	NC_010579	CT	3	6	24144	24149	0 %	50 %	0 %	50 %	182682757
31	NC_010579	CA	3	6	24270	24275	50 %	0 %	0 %	50 %	182682757
32	NC_010579	TC	3	6	25360	25365	0 %	50 %	0 %	50 %	182682757
33	NC_010579	CT	3	6	25758	25763	0 %	50 %	0 %	50 %	182682757
34	NC_010579	CA	3	6	26298	26303	50 %	0 %	0 %	50 %	182682757
35	NC_010579	CA	3	6	26447	26452	50 %	0 %	0 %	50 %	182682758
36	NC_010579	TG	3	6	27859	27864	0 %	50 %	50 %	0 %	182682760
37	NC_010579	AG	3	6	28894	28899	50 %	0 %	50 %	0 %	182682762
38	NC_010579	GT	3	6	31377	31382	0 %	50 %	50 %	0 %	182682765
39	NC_010579	GC	3	6	32605	32610	0 %	0 %	50 %	50 %	182682767
40	NC_010579	GT	3	6	32842	32847	0 %	50 %	50 %	0 %	182682767
41	NC_010579	GT	3	6	32938	32943	0 %	50 %	50 %	0 %	182682767
42	NC_010579	AC	3	6	33573	33578	50 %	0 %	0 %	50 %	182682768
43	NC_010579	CT	3	6	35144	35149	0 %	50 %	0 %	50 %	182682769
44	NC_010579	TA	3	6	36007	36012	50 %	50 %	0 %	0 %	182682771
45	NC_010579	TG	3	6	36203	36208	0 %	50 %	50 %	0 %	182682771
46	NC_010579	CG	3	6	38055	38060	0 %	0 %	50 %	50 %	182682774

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.