MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa M12 chromosome

Total Repeats: 39507

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010513	TTCG	2	8	275162	275169	0 %	50 %	25 %	25 %	170729458
4002	NC_010513	GGT	2	6	275203	275208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729458
4003	NC_010513	CTGG	2	8	275249	275256	0 %	25 %	50 %	25 %	170729458
4004	NC_010513	TGG	2	6	275258	275263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729458
4005	NC_010513	ATG	2	6	275267	275272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729458
4006	NC_010513	AGC	2	6	275323	275328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729458
4007	NC_010513	AGAC	2	8	275361	275368	50 %	0 %	25 %	25 %	170729458
4008	NC_010513	GT	3	6	275381	275386	0 %	50 %	50 %	0 %	170729458
4009	NC_010513	CGT	2	6	275449	275454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729458
4010	NC_010513	GGCT	2	8	275538	275545	0 %	25 %	50 %	25 %	170729458
4011	NC_010513	CGGA	2	8	275608	275615	25 %	0 %	50 %	25 %	170729458
4012	NC_010513	TGGCTT	2	12	275640	275651	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	170729458
4013	NC_010513	GCA	2	6	275751	275756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729458
4014	NC_010513	TCG	2	6	275806	275811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729458
4015	NC_010513	TGG	2	6	275822	275827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729458
4016	NC_010513	CCTGG	2	10	275834	275843	0 %	20 %	40 %	40 %	170729458
4017	NC_010513	T	6	6	276460	276465	0 %	100 %	0 %	0 %	170729459
4018	NC_010513	CGA	2	6	276495	276500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729459
4019	NC_010513	CAC	2	6	276513	276518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170729459
4020	NC_010513	GCA	2	6	276555	276560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729459
4021	NC_010513	CAG	2	6	276568	276573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729459
4022	NC_010513	GTG	2	6	276636	276641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729459
4023	NC_010513	TGA	2	6	276714	276719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729459
4024	NC_010513	AGT	2	6	276743	276748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729459
4025	NC_010513	ACA	2	6	276760	276765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729459
4026	NC_010513	CGT	2	6	276797	276802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729459
4027	NC_010513	GCC	2	6	276818	276823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729459
4028	NC_010513	AGC	2	6	276837	276842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729459
4029	NC_010513	ATG	2	6	276848	276853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729459
4030	NC_010513	AGGT	2	8	276923	276930	25 %	25 %	50 %	0 %	170729459
4031	NC_010513	GAT	3	9	276934	276942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729459
4032	NC_010513	CCA	2	6	276982	276987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170729459
4033	NC_010513	GTG	2	6	277050	277055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729459
4034	NC_010513	A	7	7	277076	277082	100 %	0 %	0 %	0 %	170729459
4035	NC_010513	CCATA	2	10	277103	277112	40 %	20 %	0 %	40 %	170729459
4036	NC_010513	AAC	2	6	277147	277152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729459
4037	NC_010513	ATC	2	6	277253	277258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729459
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4039	NC_010513	CTG	2	6	277278	277283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729459
4040	NC_010513	A	7	7	277306	277312	100 %	0 %	0 %	0 %	170729459
4041	NC_010513	GCA	2	6	277358	277363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729459
4042	NC_010513	CAT	2	6	277372	277377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729459
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4045	NC_010513	GCA	2	6	277497	277502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729459
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4047	NC_010513	GA	3	6	277553	277558	50 %	0 %	50 %	0 %	170729459
4048	NC_010513	A	7	7	277570	277576	100 %	0 %	0 %	0 %	170729459
4049	NC_010513	GAT	2	6	277587	277592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729459
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4051	NC_010513	ATTG	2	8	277963	277970	25 %	50 %	25 %	0 %	170729460
4052	NC_010513	TGC	3	9	278062	278070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729460
4053	NC_010513	T	9	9	278507	278515	0 %	100 %	0 %	0 %	170729461
4054	NC_010513	GGA	2	6	278584	278589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729461
4055	NC_010513	TGA	2	6	278679	278684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729461
4056	NC_010513	GGGT	2	8	278742	278749	0 %	25 %	75 %	0 %	170729461
4057	NC_010513	GAA	2	6	278758	278763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729461
4058	NC_010513	GTA	2	6	278782	278787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729461
4059	NC_010513	GCT	2	6	278794	278799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729461
4060	NC_010513	TGGC	2	8	278824	278831	0 %	25 %	50 %	25 %	170729461
4061	NC_010513	TG	3	6	278895	278900	0 %	50 %	50 %	0 %	170729461
4062	NC_010513	CAG	2	6	278932	278937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729461
4063	NC_010513	TTTG	2	8	278942	278949	0 %	75 %	25 %	0 %	170729461
4064	NC_010513	TCC	2	6	278981	278986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170729461
4065	NC_010513	ATG	2	6	278993	278998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729461
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4070	NC_010513	GAC	2	6	279081	279086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729461
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4072	NC_010513	CAGG	2	8	279511	279518	25 %	0 %	50 %	25 %	170729463
4073	NC_010513	GTGC	2	8	279622	279629	0 %	25 %	50 %	25 %	170729463
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4082	NC_010513	TCG	2	6	280096	280101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729463
4083	NC_010513	GAT	2	6	280122	280127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729463
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4087	NC_010513	CAG	2	6	280163	280168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729463
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4090	NC_010513	CAG	2	6	280274	280279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729463
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4095	NC_010513	TGAT	2	8	280580	280587	25 %	50 %	25 %	0 %	170729463
4096	NC_010513	TGCG	2	8	280637	280644	0 %	25 %	50 %	25 %	170729463
4097	NC_010513	TGA	2	6	280679	280684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729463
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4104	NC_010513	CAAG	2	8	281047	281054	50 %	0 %	25 %	25 %	170729464
4105	NC_010513	GTA	2	6	281129	281134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729464
4106	NC_010513	CGCTG	2	10	281179	281188	0 %	20 %	40 %	40 %	170729464
4107	NC_010513	GTT	2	6	281194	281199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729464
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4110	NC_010513	TTG	2	6	281393	281398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729464
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4112	NC_010513	CGCTG	2	10	281814	281823	0 %	20 %	40 %	40 %	170729465
4113	NC_010513	GGT	3	9	281958	281966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729465
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4116	NC_010513	CTTGG	2	10	282126	282135	0 %	40 %	40 %	20 %	170729465
4117	NC_010513	TGG	2	6	282174	282179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729465
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4119	NC_010513	TGG	2	6	282248	282253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729465
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4121	NC_010513	GCA	2	6	282332	282337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729465
4122	NC_010513	AAT	2	6	282373	282378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170729465
4123	NC_010513	CCA	2	6	282435	282440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170729465
4124	NC_010513	TGGTCG	2	12	282459	282470	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	170729465
4125	NC_010513	TGC	2	6	282585	282590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729465
4126	NC_010513	GGTC	2	8	282630	282637	0 %	25 %	50 %	25 %	170729465
4127	NC_010513	GTC	2	6	282659	282664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729465
4128	NC_010513	GGC	2	6	282684	282689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729465
4129	NC_010513	GGC	2	6	282693	282698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729465
4130	NC_010513	GGTG	2	8	282708	282715	0 %	25 %	75 %	0 %	170729465
4131	NC_010513	CGG	2	6	282722	282727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729465
4132	NC_010513	GA	3	6	282787	282792	50 %	0 %	50 %	0 %	170729465
4133	NC_010513	ACG	2	6	282809	282814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729465
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4137	NC_010513	ATC	2	6	282989	282994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729465
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4140	NC_010513	GGT	2	6	283098	283103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729465
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4142	NC_010513	TGG	2	6	283137	283142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729465
4143	NC_010513	CAC	2	6	283154	283159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170729465
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4149	NC_010513	CCACG	2	10	283521	283530	20 %	0 %	20 %	60 %	170729466
4150	NC_010513	CCAG	2	8	283593	283600	25 %	0 %	25 %	50 %	170729466
4151	NC_010513	GTT	3	9	283605	283613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729466
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4153	NC_010513	GT	3	6	283707	283712	0 %	50 %	50 %	0 %	170729466
4154	NC_010513	GCA	2	6	283725	283730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729466
4155	NC_010513	TTGGG	2	10	283742	283751	0 %	40 %	60 %	0 %	170729466
4156	NC_010513	CTTC	2	8	283776	283783	0 %	50 %	0 %	50 %	170729466
4157	NC_010513	TGC	2	6	283829	283834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729466
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4159	NC_010513	GC	3	6	283903	283908	0 %	0 %	50 %	50 %	170729466
4160	NC_010513	CCA	2	6	283933	283938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170729466
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4163	NC_010513	TTAG	2	8	283985	283992	25 %	50 %	25 %	0 %	170729466
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4230	NC_010513	GCC	2	6	287141	287146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729469
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4232	NC_010513	AGTTG	2	10	287206	287215	20 %	40 %	40 %	0 %	170729469
4233	NC_010513	TGG	2	6	287260	287265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729469
4234	NC_010513	GAT	2	6	287294	287299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729469
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4237	NC_010513	GT	3	6	287380	287385	0 %	50 %	50 %	0 %	170729469
4238	NC_010513	CGCGTA	2	12	287395	287406	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170729469
4239	NC_010513	TGGTGT	2	12	287435	287446	0 %	50 %	50 %	0 %	170729469
4240	NC_010513	CCG	2	6	287458	287463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729469
4241	NC_010513	GCTT	2	8	287532	287539	0 %	50 %	25 %	25 %	170729469
4242	NC_010513	GTA	2	6	287671	287676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729469
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4485	NC_010513	TCC	2	6	304272	304277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170729482
4486	NC_010513	CTT	2	6	304292	304297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170729482
4487	NC_010513	GC	3	6	304345	304350	0 %	0 %	50 %	50 %	170729482
4488	NC_010513	TCA	2	6	304370	304375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729482
4489	NC_010513	AGC	2	6	304417	304422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729482
4490	NC_010513	GAT	2	6	304431	304436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729482
4491	NC_010513	GCT	2	6	304451	304456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729482
4492	NC_010513	GAG	2	6	304464	304469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729482
4493	NC_010513	GCTA	2	8	304473	304480	25 %	25 %	25 %	25 %	170729482
4494	NC_010513	T	6	6	304515	304520	0 %	100 %	0 %	0 %	170729482
4495	NC_010513	ACG	2	6	304584	304589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729482
4496	NC_010513	CGA	2	6	304614	304619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729482
4497	NC_010513	CAGATC	2	12	307592	307603	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170729483
4498	NC_010513	TCA	2	6	307624	307629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729483
4499	NC_010513	TTG	2	6	307831	307836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729484
4500	NC_010513	A	6	6	307878	307883	100 %	0 %	0 %	0 %	170729484

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