MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa M12 chromosome

Total Repeats: 39507

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010513	AGC	2	6	33237	33242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729275
502	NC_010513	TTG	2	6	33243	33248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729275
503	NC_010513	TGC	2	6	33270	33275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729275
504	NC_010513	GAA	2	6	33350	33355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729275
505	NC_010513	G	6	6	33422	33427	0 %	0 %	100 %	0 %	170729275
506	NC_010513	ATC	2	6	33488	33493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729275
507	NC_010513	CCG	2	6	33512	33517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729275
508	NC_010513	TGCG	2	8	33618	33625	0 %	25 %	50 %	25 %	170729275
509	NC_010513	CGA	2	6	33739	33744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729275
510	NC_010513	AGT	2	6	33764	33769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729275
511	NC_010513	TG	3	6	33779	33784	0 %	50 %	50 %	0 %	170729275
512	NC_010513	GC	3	6	33914	33919	0 %	0 %	50 %	50 %	170729276
513	NC_010513	CAT	2	6	33922	33927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729276
514	NC_010513	TTG	2	6	33989	33994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729276
515	NC_010513	GAC	2	6	34038	34043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729276
516	NC_010513	GTG	2	6	34047	34052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729276
517	NC_010513	TGC	2	6	34424	34429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729277
518	NC_010513	ATT	2	6	34732	34737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729278
519	NC_010513	T	6	6	34736	34741	0 %	100 %	0 %	0 %	170729278
520	NC_010513	GTA	3	9	34762	34770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729278
521	NC_010513	TGG	2	6	34793	34798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729278
522	NC_010513	TTA	2	6	34821	34826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729278
523	NC_010513	GAT	2	6	34838	34843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729278
524	NC_010513	ATG	3	9	34860	34868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729278
525	NC_010513	ACG	2	6	34908	34913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729278
526	NC_010513	CCT	2	6	34921	34926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170729278
527	NC_010513	CTG	2	6	34930	34935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729278
528	NC_010513	GTG	2	6	35008	35013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729278
529	NC_010513	AAT	2	6	35015	35020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170729278
530	NC_010513	TGC	2	6	35054	35059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729278
531	NC_010513	CAC	2	6	35066	35071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170729278
532	NC_010513	ATT	2	6	35456	35461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729279
533	NC_010513	GTA	2	6	35481	35486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729279
534	NC_010513	GTTT	2	8	35536	35543	0 %	75 %	25 %	0 %	170729279
535	NC_010513	CGTG	2	8	35549	35556	0 %	25 %	50 %	25 %	170729279
536	NC_010513	AAC	2	6	35640	35645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729279
537	NC_010513	GT	3	6	35649	35654	0 %	50 %	50 %	0 %	170729279
538	NC_010513	TGC	2	6	35655	35660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729279
539	NC_010513	GATC	2	8	35835	35842	25 %	25 %	25 %	25 %	170729280
540	NC_010513	TG	3	6	35884	35889	0 %	50 %	50 %	0 %	170729280
541	NC_010513	TTG	2	6	35890	35895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729280
542	NC_010513	AG	3	6	35911	35916	50 %	0 %	50 %	0 %	170729280
543	NC_010513	TTCT	2	8	36006	36013	0 %	75 %	0 %	25 %	170729280
544	NC_010513	TGA	2	6	36065	36070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729280
545	NC_010513	TGT	2	6	36073	36078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729280
546	NC_010513	TGA	2	6	36100	36105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729281
547	NC_010513	GC	3	6	36130	36135	0 %	0 %	50 %	50 %	170729281
548	NC_010513	CGA	2	6	36169	36174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729281
549	NC_010513	GGT	2	6	36245	36250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729281
550	NC_010513	TG	3	6	36286	36291	0 %	50 %	50 %	0 %	170729281
551	NC_010513	GCAG	2	8	36305	36312	25 %	0 %	50 %	25 %	170729281
552	NC_010513	TGTTTG	2	12	36352	36363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729281
553	NC_010513	GTT	2	6	36372	36377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729281
554	NC_010513	GGTG	2	8	36433	36440	0 %	25 %	75 %	0 %	170729281
555	NC_010513	CAGG	2	8	36448	36455	25 %	0 %	50 %	25 %	170729281
556	NC_010513	TGC	2	6	36533	36538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729281
557	NC_010513	TGG	2	6	36629	36634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729281
558	NC_010513	CCG	2	6	36657	36662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729281
559	NC_010513	ACA	2	6	36694	36699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729281
560	NC_010513	TGC	2	6	36706	36711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729281
561	NC_010513	GTT	2	6	36767	36772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729281
562	NC_010513	AGGTG	2	10	36821	36830	20 %	20 %	60 %	0 %	170729281
563	NC_010513	TTG	2	6	36861	36866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729281
564	NC_010513	ATT	2	6	36876	36881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729281
565	NC_010513	GGT	2	6	36899	36904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729281
566	NC_010513	GTT	2	6	36914	36919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729281
567	NC_010513	TTCT	2	8	36924	36931	0 %	75 %	0 %	25 %	170729281
568	NC_010513	TGGG	2	8	37024	37031	0 %	25 %	75 %	0 %	170729281
569	NC_010513	CAG	3	9	37032	37040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729281
570	NC_010513	TGG	2	6	37041	37046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729281
571	NC_010513	GTTG	2	8	37184	37191	0 %	50 %	50 %	0 %	170729281
572	NC_010513	G	9	9	37206	37214	0 %	0 %	100 %	0 %	170729281
573	NC_010513	AGG	2	6	37276	37281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729281
574	NC_010513	TTG	3	9	37302	37310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729281
575	NC_010513	GCT	2	6	37311	37316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729281
576	NC_010513	GCC	2	6	37319	37324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729281
577	NC_010513	TGC	2	6	37334	37339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729281
578	NC_010513	T	6	6	37647	37652	0 %	100 %	0 %	0 %	170729282
579	NC_010513	AGG	2	6	37930	37935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729282
580	NC_010513	GTGC	2	8	38007	38014	0 %	25 %	50 %	25 %	170729282
581	NC_010513	TGCGC	2	10	38117	38126	0 %	20 %	40 %	40 %	170729282
582	NC_010513	CGG	2	6	38184	38189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729282
583	NC_010513	TTC	2	6	38202	38207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170729282
584	NC_010513	G	6	6	38216	38221	0 %	0 %	100 %	0 %	170729282
585	NC_010513	TGA	2	6	38267	38272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729282
586	NC_010513	CGC	2	6	38275	38280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729282
587	NC_010513	AGTG	2	8	38422	38429	25 %	25 %	50 %	0 %	170729282
588	NC_010513	TGTC	2	8	39024	39031	0 %	50 %	25 %	25 %	170729283
589	NC_010513	GCC	2	6	39043	39048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729283
590	NC_010513	TGTTGC	2	12	39084	39095	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	170729283
591	NC_010513	CAA	2	6	39209	39214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729283
592	NC_010513	AGC	2	6	39261	39266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729283
593	NC_010513	ATT	2	6	39341	39346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729283
594	NC_010513	CAG	2	6	39352	39357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729283
595	NC_010513	ATC	2	6	39432	39437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729283
596	NC_010513	TTGA	2	8	39559	39566	25 %	50 %	25 %	0 %	170729283
597	NC_010513	GCT	2	6	39656	39661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729284
598	NC_010513	TC	3	6	39703	39708	0 %	50 %	0 %	50 %	170729284
599	NC_010513	GCTT	2	8	39716	39723	0 %	50 %	25 %	25 %	170729284
600	NC_010513	TGC	2	6	39737	39742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729284
601	NC_010513	CA	3	6	39748	39753	50 %	0 %	0 %	50 %	170729284
602	NC_010513	AGGTTG	2	12	39799	39810	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	170729284
603	NC_010513	CAGC	2	8	39914	39921	25 %	0 %	25 %	50 %	170729284
604	NC_010513	GTC	2	6	39966	39971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729284
605	NC_010513	GCA	2	6	39992	39997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729284
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607	NC_010513	AGC	2	6	40075	40080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729284
608	NC_010513	GCGG	2	8	40088	40095	0 %	0 %	75 %	25 %	170729284
609	NC_010513	G	6	6	40146	40151	0 %	0 %	100 %	0 %	170729284
610	NC_010513	GAG	2	6	40209	40214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729284
611	NC_010513	TGC	2	6	40282	40287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729284
612	NC_010513	T	8	8	40438	40445	0 %	100 %	0 %	0 %	170729284
613	NC_010513	GTG	2	6	40456	40461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729284
614	NC_010513	CGCGAC	2	12	40469	40480	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	170729284
615	NC_010513	ATT	2	6	40489	40494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729284
616	NC_010513	GTT	2	6	40607	40612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729284
617	NC_010513	CCG	2	6	40614	40619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729284
618	NC_010513	TGCGT	2	10	40643	40652	0 %	40 %	40 %	20 %	170729284
619	NC_010513	AGC	2	6	40732	40737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729284
620	NC_010513	TGC	2	6	40820	40825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729284
621	NC_010513	GTC	2	6	40837	40842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729284
622	NC_010513	TGC	2	6	40849	40854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729284
623	NC_010513	CCG	2	6	40870	40875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729284
624	NC_010513	T	6	6	40911	40916	0 %	100 %	0 %	0 %	170729284
625	NC_010513	CT	3	6	40917	40922	0 %	50 %	0 %	50 %	170729284
626	NC_010513	AGTG	2	8	40931	40938	25 %	25 %	50 %	0 %	170729284
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