MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 chromosome

Total Repeats: 100046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_007705	GACGC	2	10	199432	199441	20 %	0 %	40 %	40 %	84621846
4003	NC_007705	TGG	2	6	199476	199481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621846
4004	NC_007705	GGT	2	6	199603	199608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621846
4005	NC_007705	TGG	2	6	199611	199616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621846
4006	NC_007705	GCA	2	6	199656	199661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621846
4007	NC_007705	CAG	2	6	199666	199671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621846
4008	NC_007705	TGCC	2	8	199707	199714	0 %	25 %	25 %	50 %	84621846
4009	NC_007705	CCGC	2	8	199723	199730	0 %	0 %	25 %	75 %	84621846
4010	NC_007705	GTG	2	6	199760	199765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621846
4011	NC_007705	AGG	2	6	199809	199814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	84621846
4012	NC_007705	GGC	2	6	199844	199849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621846
4013	NC_007705	GGCC	2	8	199864	199871	0 %	0 %	50 %	50 %	84621846
4014	NC_007705	ACG	3	9	199872	199880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621846
4015	NC_007705	GCG	2	6	199895	199900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621846
4016	NC_007705	CGGC	2	8	199925	199932	0 %	0 %	50 %	50 %	84621846
4017	NC_007705	GC	3	6	200001	200006	0 %	0 %	50 %	50 %	84621846
4018	NC_007705	GCA	2	6	200025	200030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621846
4019	NC_007705	GAC	2	6	200087	200092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621846
4020	NC_007705	CG	4	8	200098	200105	0 %	0 %	50 %	50 %	84621846
4021	NC_007705	GC	4	8	200113	200120	0 %	0 %	50 %	50 %	84621846
4022	NC_007705	TGC	2	6	200253	200258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621846
4023	NC_007705	CG	3	6	200276	200281	0 %	0 %	50 %	50 %	84621846
4024	NC_007705	GCAG	2	8	200377	200384	25 %	0 %	50 %	25 %	84621846
4025	NC_007705	GC	3	6	200435	200440	0 %	0 %	50 %	50 %	84621846
4026	NC_007705	TAC	2	6	200480	200485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84621846
4027	NC_007705	AG	3	6	200494	200499	50 %	0 %	50 %	0 %	84621846
4028	NC_007705	GTG	2	6	200543	200548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621846
4029	NC_007705	GTG	2	6	200567	200572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621846
4030	NC_007705	CCG	2	6	200573	200578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621846
4031	NC_007705	CCA	2	6	200607	200612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621846
4032	NC_007705	GCT	2	6	200632	200637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621846
4033	NC_007705	GGCC	2	8	200713	200720	0 %	0 %	50 %	50 %	84621846
4034	NC_007705	ACG	2	6	200826	200831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621846
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4037	NC_007705	TCT	2	6	200904	200909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84621846
4038	NC_007705	GC	3	6	201026	201031	0 %	0 %	50 %	50 %	84621846
4039	NC_007705	GCAC	2	8	201053	201060	25 %	0 %	25 %	50 %	84621846
4040	NC_007705	GCCGC	2	10	201077	201086	0 %	0 %	40 %	60 %	84621846
4041	NC_007705	GCG	2	6	201165	201170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621846
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4046	NC_007705	GCT	2	6	201266	201271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621846
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4050	NC_007705	GC	3	6	201515	201520	0 %	0 %	50 %	50 %	84621847
4051	NC_007705	GCA	2	6	201573	201578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621847
4052	NC_007705	GTG	2	6	201589	201594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621847
4053	NC_007705	CAG	2	6	201619	201624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621847
4054	NC_007705	GTC	2	6	201643	201648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621847
4055	NC_007705	CCAT	2	8	201668	201675	25 %	25 %	0 %	50 %	84621847
4056	NC_007705	GCC	2	6	201702	201707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621847
4057	NC_007705	GTGCC	2	10	201710	201719	0 %	20 %	40 %	40 %	84621847
4058	NC_007705	TGTCG	2	10	202017	202026	0 %	40 %	40 %	20 %	84621848
4059	NC_007705	CGC	2	6	202095	202100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621848
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4072	NC_007705	GGC	2	6	202941	202946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621849
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4088	NC_007705	GTG	3	9	203775	203783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621850
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4095	NC_007705	TGCT	2	8	204501	204508	0 %	50 %	25 %	25 %	84621851
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4105	NC_007705	GCCG	2	8	204770	204777	0 %	0 %	50 %	50 %	84621851
4106	NC_007705	TCG	2	6	204804	204809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621851
4107	NC_007705	CAG	2	6	204812	204817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621851
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4109	NC_007705	GAT	2	6	204968	204973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84621851
4110	NC_007705	CAC	2	6	204974	204979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621851
4111	NC_007705	ATC	2	6	205020	205025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84621851
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4114	NC_007705	TCT	2	6	205117	205122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84621851
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4119	NC_007705	CGG	2	6	205581	205586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621852
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4121	NC_007705	CG	5	10	205612	205621	0 %	0 %	50 %	50 %	84621852
4122	NC_007705	GCT	2	6	205639	205644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621852
4123	NC_007705	GCAG	2	8	205687	205694	25 %	0 %	50 %	25 %	84621852
4124	NC_007705	CGG	2	6	205729	205734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621852
4125	NC_007705	CAAC	2	8	205762	205769	50 %	0 %	0 %	50 %	84621852
4126	NC_007705	GCCA	2	8	205793	205800	25 %	0 %	25 %	50 %	84621852
4127	NC_007705	GCA	2	6	205830	205835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621852
4128	NC_007705	CGGG	2	8	205872	205879	0 %	0 %	75 %	25 %	84621852
4129	NC_007705	TCATCG	2	12	205959	205970	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	84621852
4130	NC_007705	GAACT	2	10	205982	205991	40 %	20 %	20 %	20 %	84621852
4131	NC_007705	GAA	2	6	206000	206005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84621852
4132	NC_007705	GC	5	10	206006	206015	0 %	0 %	50 %	50 %	84621852
4133	NC_007705	TC	3	6	206110	206115	0 %	50 %	0 %	50 %	84621852
4134	NC_007705	CTG	2	6	206180	206185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621852
4135	NC_007705	ATGTGG	2	12	206295	206306	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	84621852
4136	NC_007705	GCG	2	6	206307	206312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621852
4137	NC_007705	GAA	2	6	206420	206425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84621852
4138	NC_007705	CGC	2	6	206439	206444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621852
4139	NC_007705	GC	3	6	206464	206469	0 %	0 %	50 %	50 %	84621852
4140	NC_007705	CAC	2	6	206480	206485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621852
4141	NC_007705	CGA	2	6	206554	206559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621852
4142	NC_007705	CGG	2	6	206562	206567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621852
4143	NC_007705	GCA	2	6	206638	206643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621852
4144	NC_007705	CGA	2	6	206710	206715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621852
4145	NC_007705	GCGT	2	8	206739	206746	0 %	25 %	50 %	25 %	84621852
4146	NC_007705	GC	3	6	206747	206752	0 %	0 %	50 %	50 %	84621852
4147	NC_007705	CGA	2	6	206761	206766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621852
4148	NC_007705	TGG	2	6	206808	206813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621852
4149	NC_007705	TG	3	6	206857	206862	0 %	50 %	50 %	0 %	84621852
4150	NC_007705	GCG	2	6	206920	206925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621852
4151	NC_007705	CAT	2	6	206929	206934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84621852
4152	NC_007705	CTT	2	6	207049	207054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84621852
4153	NC_007705	GATGGC	2	12	207134	207145	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	84621852
4154	NC_007705	ATCGC	2	10	207147	207156	20 %	20 %	20 %	40 %	84621852
4155	NC_007705	GCA	2	6	207157	207162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621852
4156	NC_007705	ACC	2	6	207176	207181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621852
4157	NC_007705	TGG	2	6	207189	207194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621852
4158	NC_007705	ACC	2	6	207207	207212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621852
4159	NC_007705	GC	4	8	207271	207278	0 %	0 %	50 %	50 %	84621852
4160	NC_007705	CGA	2	6	207331	207336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621852
4161	NC_007705	CTG	2	6	207931	207936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621853
4162	NC_007705	TGCC	2	8	207946	207953	0 %	25 %	25 %	50 %	84621853
4163	NC_007705	CGC	2	6	208057	208062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621853
4164	NC_007705	CCA	2	6	208072	208077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621853
4165	NC_007705	GCTG	2	8	208177	208184	0 %	25 %	50 %	25 %	84621853
4166	NC_007705	TTC	2	6	208203	208208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84621853
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4168	NC_007705	CGTGC	2	10	208235	208244	0 %	20 %	40 %	40 %	84621853
4169	NC_007705	ACGC	2	8	208348	208355	25 %	0 %	25 %	50 %	84621853
4170	NC_007705	ACC	2	6	208380	208385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621853
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4173	NC_007705	TGC	2	6	208453	208458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621853
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4178	NC_007705	GCAAGG	2	12	208762	208773	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	84621853
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4180	NC_007705	GC	3	6	208821	208826	0 %	0 %	50 %	50 %	84621853
4181	NC_007705	GC	4	8	208843	208850	0 %	0 %	50 %	50 %	84621853
4182	NC_007705	ACG	2	6	208870	208875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621853
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4184	NC_007705	GC	3	6	208905	208910	0 %	0 %	50 %	50 %	84621853
4185	NC_007705	GCT	2	6	208913	208918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621853
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4190	NC_007705	TGCAC	2	10	209138	209147	20 %	20 %	20 %	40 %	84621853
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4192	NC_007705	GGT	2	6	209222	209227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621853
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4204	NC_007705	CTG	2	6	210842	210847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621856
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4217	NC_007705	CTG	2	6	211205	211210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621856
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4230	NC_007705	CCTG	2	8	211591	211598	0 %	25 %	25 %	50 %	84621856
4231	NC_007705	CTG	2	6	211628	211633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621856
4232	NC_007705	CCA	2	6	211661	211666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621856
4233	NC_007705	C	6	6	211681	211686	0 %	0 %	0 %	100 %	84621856
4234	NC_007705	GCG	2	6	211729	211734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621856
4235	NC_007705	CG	3	6	211755	211760	0 %	0 %	50 %	50 %	84621856
4236	NC_007705	GGT	2	6	211807	211812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621856
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4238	NC_007705	CGA	2	6	211840	211845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621856
4239	NC_007705	GCG	2	6	211902	211907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621856
4240	NC_007705	CGA	4	12	211909	211920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621856
4241	NC_007705	CG	3	6	211932	211937	0 %	0 %	50 %	50 %	84621856
4242	NC_007705	CG	3	6	211989	211994	0 %	0 %	50 %	50 %	84621856
4243	NC_007705	CGAC	2	8	212035	212042	25 %	0 %	25 %	50 %	84621856
4244	NC_007705	GCC	2	6	212070	212075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621856
4245	NC_007705	GCG	2	6	212094	212099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621856
4246	NC_007705	CG	3	6	212098	212103	0 %	0 %	50 %	50 %	84621856
4247	NC_007705	CG	3	6	212142	212147	0 %	0 %	50 %	50 %	84621856
4248	NC_007705	CTG	2	6	212174	212179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621856
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4252	NC_007705	GC	3	6	212335	212340	0 %	0 %	50 %	50 %	84621856
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4352	NC_007705	TGG	2	6	216527	216532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621858
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4355	NC_007705	GC	3	6	216620	216625	0 %	0 %	50 %	50 %	84621858
4356	NC_007705	GCA	2	6	216634	216639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621858
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4358	NC_007705	CGA	2	6	216697	216702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621858
4359	NC_007705	CG	3	6	216798	216803	0 %	0 %	50 %	50 %	84621858
4360	NC_007705	GAC	2	6	216887	216892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621858
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4368	NC_007705	GC	3	6	217672	217677	0 %	0 %	50 %	50 %	84621859
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4370	NC_007705	ACCT	2	8	217832	217839	25 %	25 %	0 %	50 %	84621859
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4492	NC_007705	GGA	2	6	223168	223173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	84621861
4493	NC_007705	AGC	2	6	223202	223207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621861
4494	NC_007705	CGC	2	6	223209	223214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621861
4495	NC_007705	CGG	2	6	223287	223292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621861
4496	NC_007705	GCA	2	6	223302	223307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621861
4497	NC_007705	AGG	2	6	223317	223322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	84621861
4498	NC_007705	GCA	2	6	223366	223371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621861
4499	NC_007705	TGCGA	2	10	223406	223415	20 %	20 %	40 %	20 %	84621861
4500	NC_007705	GC	3	6	223475	223480	0 %	0 %	50 %	50 %	84621861

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