MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 chromosome

Total Repeats: 100046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007705	GCCATG	2	12	151403	151414	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	84621805
3002	NC_007705	GTC	2	6	151432	151437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621805
3003	NC_007705	CGT	2	6	151524	151529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621805
3004	NC_007705	GAAA	2	8	151539	151546	75 %	0 %	25 %	0 %	84621805
3005	NC_007705	TCG	2	6	151559	151564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621805
3006	NC_007705	CAC	2	6	151591	151596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621805
3007	NC_007705	GCGCG	2	10	151623	151632	0 %	0 %	60 %	40 %	84621805
3008	NC_007705	GTA	2	6	151714	151719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84621805
3009	NC_007705	GCA	2	6	151742	151747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621805
3010	NC_007705	CCGG	2	8	151758	151765	0 %	0 %	50 %	50 %	84621805
3011	NC_007705	CAG	2	6	151771	151776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621805
3012	NC_007705	TGGTC	2	10	151878	151887	0 %	40 %	40 %	20 %	84621805
3013	NC_007705	GAC	2	6	152099	152104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621805
3014	NC_007705	ACGC	2	8	152172	152179	25 %	0 %	25 %	50 %	84621805
3015	NC_007705	AGT	2	6	152196	152201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84621805
3016	NC_007705	GAT	2	6	152223	152228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84621805
3017	NC_007705	GCTT	2	8	152240	152247	0 %	50 %	25 %	25 %	84621805
3018	NC_007705	CAG	2	6	152254	152259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621805
3019	NC_007705	GAA	2	6	152278	152283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84621805
3020	NC_007705	CG	3	6	152298	152303	0 %	0 %	50 %	50 %	84621805
3021	NC_007705	TGC	2	6	152336	152341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621805
3022	NC_007705	GCGT	2	8	152358	152365	0 %	25 %	50 %	25 %	84621805
3023	NC_007705	GCG	2	6	152366	152371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621805
3024	NC_007705	CG	3	6	152473	152478	0 %	0 %	50 %	50 %	84621805
3025	NC_007705	CTG	2	6	152503	152508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621805
3026	NC_007705	CGC	2	6	152533	152538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621805
3027	NC_007705	CGTGCG	2	12	152540	152551	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	84621805
3028	NC_007705	CG	3	6	152559	152564	0 %	0 %	50 %	50 %	84621805
3029	NC_007705	CGG	2	6	152613	152618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621805
3030	NC_007705	CTTGC	2	10	152683	152692	0 %	40 %	20 %	40 %	84621805
3031	NC_007705	GCT	2	6	152736	152741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621805
3032	NC_007705	CCA	2	6	152763	152768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621805
3033	NC_007705	CGGCG	2	10	152826	152835	0 %	0 %	60 %	40 %	84621805
3034	NC_007705	GCT	2	6	152893	152898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621805
3035	NC_007705	GGA	2	6	152954	152959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	84621805
3036	NC_007705	GCA	2	6	153184	153189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621806
3037	NC_007705	GC	4	8	153326	153333	0 %	0 %	50 %	50 %	84621806
3038	NC_007705	GATC	2	8	153352	153359	25 %	25 %	25 %	25 %	84621806
3039	NC_007705	CGC	2	6	153371	153376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621806
3040	NC_007705	TGC	2	6	153447	153452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621806
3041	NC_007705	GCC	2	6	153489	153494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621806
3042	NC_007705	GC	3	6	153577	153582	0 %	0 %	50 %	50 %	84621806
3043	NC_007705	GCA	2	6	153615	153620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621806
3044	NC_007705	GATA	2	8	153636	153643	50 %	25 %	25 %	0 %	84621806
3045	NC_007705	GGC	2	6	153661	153666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621806
3046	NC_007705	GGC	2	6	153692	153697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621806
3047	NC_007705	TCCA	2	8	153714	153721	25 %	25 %	0 %	50 %	84621806
3048	NC_007705	GCT	2	6	153859	153864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621806
3049	NC_007705	CGCC	2	8	153874	153881	0 %	0 %	25 %	75 %	84621806
3050	NC_007705	CAG	2	6	153884	153889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621806
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3052	NC_007705	CAC	2	6	153995	154000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621806
3053	NC_007705	GC	3	6	154066	154071	0 %	0 %	50 %	50 %	84621806
3054	NC_007705	GGCCGC	2	12	154078	154089	0 %	0 %	50 %	50 %	84621806
3055	NC_007705	GCA	2	6	154111	154116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621806
3056	NC_007705	GAT	2	6	154139	154144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84621806
3057	NC_007705	GC	3	6	154176	154181	0 %	0 %	50 %	50 %	84621806
3058	NC_007705	CGG	2	6	154212	154217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621806
3059	NC_007705	CAG	3	9	154226	154234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621806
3060	NC_007705	G	6	6	154243	154248	0 %	0 %	100 %	0 %	84621806
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3062	NC_007705	ACG	2	6	154268	154273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621806
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3064	NC_007705	CCGCAT	2	12	154476	154487	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	84621807
3065	NC_007705	GGCCT	2	10	154506	154515	0 %	20 %	40 %	40 %	84621807
3066	NC_007705	GGCT	2	8	154521	154528	0 %	25 %	50 %	25 %	84621807
3067	NC_007705	CCA	2	6	154636	154641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621807
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3074	NC_007705	TGC	2	6	154921	154926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621807
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3083	NC_007705	ACA	2	6	155284	155289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84621807
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3089	NC_007705	TCG	2	6	155482	155487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621807
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3093	NC_007705	CG	3	6	155590	155595	0 %	0 %	50 %	50 %	84621807
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3101	NC_007705	GC	3	6	156083	156088	0 %	0 %	50 %	50 %	84621807
3102	NC_007705	GCG	2	6	156112	156117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621807
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3106	NC_007705	GGCC	2	8	156248	156255	0 %	0 %	50 %	50 %	84621807
3107	NC_007705	CGG	2	6	156341	156346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621807
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3109	NC_007705	GCCGC	2	10	156404	156413	0 %	0 %	40 %	60 %	84621807
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3123	NC_007705	CCTGG	2	10	156806	156815	0 %	20 %	40 %	40 %	84621807
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3493	NC_007705	GGT	2	6	174700	174705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621823
3494	NC_007705	GC	3	6	174730	174735	0 %	0 %	50 %	50 %	84621823
3495	NC_007705	GCACG	2	10	174841	174850	20 %	0 %	40 %	40 %	84621823
3496	NC_007705	ACC	2	6	174863	174868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621823
3497	NC_007705	GAA	2	6	174877	174882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84621823
3498	NC_007705	TCG	2	6	174923	174928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621823
3499	NC_007705	AGC	2	6	174956	174961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621823
3500	NC_007705	GGT	2	6	175006	175011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621823

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