MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 chromosome

Total Repeats: 100046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_007705	CCT	2	6	272305	272310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	84621905
5503	NC_007705	GCG	2	6	272344	272349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621905
5504	NC_007705	GGT	2	6	272378	272383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621905
5505	NC_007705	CGT	2	6	272425	272430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621905
5506	NC_007705	GGGCA	2	10	272516	272525	20 %	0 %	60 %	20 %	84621905
5507	NC_007705	GTT	2	6	272776	272781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84621906
5508	NC_007705	GGA	2	6	272797	272802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	84621906
5509	NC_007705	GCG	2	6	272860	272865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621906
5510	NC_007705	TGC	3	9	272952	272960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621906
5511	NC_007705	ACG	2	6	273108	273113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621906
5512	NC_007705	TGG	3	9	273114	273122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621906
5513	NC_007705	GCTG	2	8	273162	273169	0 %	25 %	50 %	25 %	84621906
5514	NC_007705	ACGC	2	8	273299	273306	25 %	0 %	25 %	50 %	84621906
5515	NC_007705	CG	3	6	273325	273330	0 %	0 %	50 %	50 %	84621906
5516	NC_007705	CGCC	2	8	273478	273485	0 %	0 %	25 %	75 %	84621906
5517	NC_007705	GAC	2	6	273530	273535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621906
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5519	NC_007705	TCG	2	6	273604	273609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621906
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5522	NC_007705	TGC	2	6	274336	274341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621907
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5533	NC_007705	CGG	2	6	274819	274824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621908
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5549	NC_007705	GCGCA	2	10	275823	275832	20 %	0 %	40 %	40 %	84621909
5550	NC_007705	GC	3	6	275836	275841	0 %	0 %	50 %	50 %	84621909
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5591	NC_007705	CG	3	6	278656	278661	0 %	0 %	50 %	50 %	84621911
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5606	NC_007705	GCA	2	6	279553	279558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621911
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5624	NC_007705	GCACCA	2	12	281053	281064	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	84621912
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5629	NC_007705	CAA	2	6	281300	281305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84621912
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5633	NC_007705	CTG	2	6	281951	281956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621913
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5657	NC_007705	GGT	2	6	283070	283075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621915
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5659	NC_007705	GCCG	2	8	283121	283128	0 %	0 %	50 %	50 %	84621915
5660	NC_007705	TAC	2	6	283133	283138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84621915
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5740	NC_007705	GCGCC	2	10	287769	287778	0 %	0 %	40 %	60 %	84621919
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5745	NC_007705	CGC	2	6	287983	287988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621919
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5996	NC_007705	CCG	2	6	306998	307003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621934
5997	NC_007705	TGA	2	6	307022	307027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84621934
5998	NC_007705	ATC	2	6	307193	307198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84621935
5999	NC_007705	GCC	2	6	307219	307224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621935
6000	NC_007705	GGGTC	2	10	307251	307260	0 %	20 %	60 %	20 %	84621935

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