MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 chromosome

Total Repeats: 100046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_007705	TGC	2	6	246623	246628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621882
5003	NC_007705	CGG	2	6	246642	246647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621882
5004	NC_007705	CAA	2	6	246666	246671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84621882
5005	NC_007705	GC	3	6	246711	246716	0 %	0 %	50 %	50 %	84621882
5006	NC_007705	GCCGCT	2	12	246746	246757	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	84621883
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5010	NC_007705	TGC	2	6	247042	247047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621883
5011	NC_007705	GCC	2	6	247053	247058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621883
5012	NC_007705	CTG	2	6	247083	247088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621883
5013	NC_007705	GCC	2	6	247114	247119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621883
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5017	NC_007705	GCC	2	6	247191	247196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621883
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5020	NC_007705	CGA	2	6	247307	247312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621883
5021	NC_007705	TCG	3	9	247366	247374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621883
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5033	NC_007705	TGC	2	6	248113	248118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621884
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5054	NC_007705	GCCG	2	8	248909	248916	0 %	0 %	50 %	50 %	84621884
5055	NC_007705	CG	3	6	248932	248937	0 %	0 %	50 %	50 %	84621884
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5059	NC_007705	CGA	2	6	249094	249099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621884
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5108	NC_007705	TTGG	2	8	251724	251731	0 %	50 %	50 %	0 %	84621885
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5123	NC_007705	CGGTG	2	10	252473	252482	0 %	20 %	60 %	20 %	84621885
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5241	NC_007705	GC	4	8	258025	258032	0 %	0 %	50 %	50 %	84621888
5242	NC_007705	AG	3	6	258078	258083	50 %	0 %	50 %	0 %	84621888
5243	NC_007705	AAG	2	6	258118	258123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84621888
5244	NC_007705	TCGA	2	8	258145	258152	25 %	25 %	25 %	25 %	84621888
5245	NC_007705	GCC	2	6	258232	258237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621888
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5363	NC_007705	TGCGC	2	10	263994	264003	0 %	20 %	40 %	40 %	84621895
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5367	NC_007705	AGC	3	9	264158	264166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621895
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5370	NC_007705	CGT	2	6	264261	264266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621896
5371	NC_007705	ACCGC	2	10	264272	264281	20 %	0 %	20 %	60 %	84621896
5372	NC_007705	GAC	2	6	264316	264321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621896
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5374	NC_007705	CGGC	2	8	264555	264562	0 %	0 %	50 %	50 %	84621896
5375	NC_007705	CGA	2	6	264567	264572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621896
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5490	NC_007705	TCG	2	6	271477	271482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621904
5491	NC_007705	AGC	2	6	271510	271515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621904
5492	NC_007705	GGT	2	6	271560	271565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621904
5493	NC_007705	GCG	2	6	271577	271582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621904
5494	NC_007705	GCA	2	6	271702	271707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621904
5495	NC_007705	GC	3	6	272069	272074	0 %	0 %	50 %	50 %	84621905
5496	NC_007705	CGT	2	6	272088	272093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621905
5497	NC_007705	CGT	2	6	272104	272109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621905
5498	NC_007705	GGC	2	6	272117	272122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621905
5499	NC_007705	CTG	2	6	272138	272143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621905
5500	NC_007705	TGC	2	6	272200	272205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621905

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