MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 chromosome

Total Repeats: 113047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_007508	TGG	2	6	257543	257548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045774
5502	NC_007508	TTG	2	6	257566	257571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045774
5503	NC_007508	GAT	2	6	257580	257585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045774
5504	NC_007508	ATTT	2	8	257631	257638	25 %	75 %	0 %	0 %	78045774
5505	NC_007508	CGA	3	9	257648	257656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045774
5506	NC_007508	TCG	2	6	257669	257674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045774
5507	NC_007508	AGC	2	6	257692	257697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045774
5508	NC_007508	GAT	2	6	257853	257858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045774
5509	NC_007508	CGG	2	6	257991	257996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045775
5510	NC_007508	TCAC	2	8	258018	258025	25 %	25 %	0 %	50 %	78045775
5511	NC_007508	GCA	2	6	258049	258054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045775
5512	NC_007508	CGC	2	6	258121	258126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045775
5513	NC_007508	CGT	2	6	258232	258237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045775
5514	NC_007508	GAA	2	6	258287	258292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045775
5515	NC_007508	TAC	2	6	258335	258340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045775
5516	NC_007508	GTC	2	6	258386	258391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045775
5517	NC_007508	GGAT	2	8	258436	258443	25 %	25 %	50 %	0 %	78045775
5518	NC_007508	GC	3	6	258446	258451	0 %	0 %	50 %	50 %	78045775
5519	NC_007508	AGG	2	6	258456	258461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045775
5520	NC_007508	CT	3	6	258472	258477	0 %	50 %	0 %	50 %	78045775
5521	NC_007508	GAGT	2	8	258529	258536	25 %	25 %	50 %	0 %	78045775
5522	NC_007508	ACAGC	2	10	259001	259010	40 %	0 %	20 %	40 %	78045776
5523	NC_007508	AGT	2	6	259162	259167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045776
5524	NC_007508	GTGA	2	8	259189	259196	25 %	25 %	50 %	0 %	78045776
5525	NC_007508	TTC	2	6	259216	259221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045776
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5527	NC_007508	GCTT	2	8	259303	259310	0 %	50 %	25 %	25 %	78045776
5528	NC_007508	CGA	2	6	259330	259335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045776
5529	NC_007508	AGC	2	6	259356	259361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045776
5530	NC_007508	TGA	2	6	259444	259449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045776
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5532	NC_007508	GCA	2	6	259583	259588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045776
5533	NC_007508	TGG	2	6	259657	259662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045776
5534	NC_007508	CAGTC	2	10	259805	259814	20 %	20 %	20 %	40 %	78045776
5535	NC_007508	TGGC	2	8	259819	259826	0 %	25 %	50 %	25 %	78045776
5536	NC_007508	CGAAC	2	10	259910	259919	40 %	0 %	20 %	40 %	78045776
5537	NC_007508	AGA	2	6	259963	259968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045776
5538	NC_007508	GCA	2	6	260000	260005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045776
5539	NC_007508	GAGT	2	8	260006	260013	25 %	25 %	50 %	0 %	78045776
5540	NC_007508	AG	3	6	260033	260038	50 %	0 %	50 %	0 %	78045776
5541	NC_007508	CAT	2	6	260208	260213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045776
5542	NC_007508	CAT	2	6	260297	260302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045776
5543	NC_007508	C	6	6	260308	260313	0 %	0 %	0 %	100 %	78045776
5544	NC_007508	CAG	3	9	260318	260326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045776
5545	NC_007508	TCCT	2	8	260334	260341	0 %	50 %	0 %	50 %	78045776
5546	NC_007508	ATC	2	6	260343	260348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045776
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5549	NC_007508	CGT	2	6	260591	260596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045776
5550	NC_007508	ACC	2	6	260698	260703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045776
5551	NC_007508	CCGG	2	8	260738	260745	0 %	0 %	50 %	50 %	78045776
5552	NC_007508	GTC	2	6	260758	260763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045776
5553	NC_007508	GAT	2	6	260787	260792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045776
5554	NC_007508	CGG	2	6	260834	260839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045776
5555	NC_007508	GGA	2	6	260876	260881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045776
5556	NC_007508	TCCCA	2	10	260895	260904	20 %	20 %	0 %	60 %	78045776
5557	NC_007508	TCA	2	6	260938	260943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045776
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5561	NC_007508	CGA	2	6	261303	261308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045777
5562	NC_007508	TCC	2	6	261488	261493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78045777
5563	NC_007508	GGAA	2	8	261538	261545	50 %	0 %	50 %	0 %	78045777
5564	NC_007508	TCG	2	6	261555	261560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045777
5565	NC_007508	GTCTT	2	10	261582	261591	0 %	60 %	20 %	20 %	78045777
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5594	NC_007508	AGCG	2	8	263044	263051	25 %	0 %	50 %	25 %	78045780
5595	NC_007508	TC	3	6	263104	263109	0 %	50 %	0 %	50 %	78045780
5596	NC_007508	AATG	2	8	263115	263122	50 %	25 %	25 %	0 %	78045780
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5604	NC_007508	TGAC	2	8	263486	263493	25 %	25 %	25 %	25 %	78045780
5605	NC_007508	TTC	2	6	263506	263511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045780
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5608	NC_007508	CTG	2	6	263593	263598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045780
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5610	NC_007508	AATTG	2	10	263756	263765	40 %	40 %	20 %	0 %	78045780
5611	NC_007508	GATCCA	2	12	263815	263826	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78045780
5612	NC_007508	ACA	2	6	263861	263866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045780
5613	NC_007508	TGA	2	6	263877	263882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045780
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5616	NC_007508	CTGT	2	8	263908	263915	0 %	50 %	25 %	25 %	78045780
5617	NC_007508	ACA	2	6	263933	263938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045780
5618	NC_007508	CTTGAT	2	12	264081	264092	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	78045781
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5621	NC_007508	GAT	2	6	264309	264314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045781
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5623	NC_007508	TTC	2	6	264429	264434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045781
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5991	NC_007508	TTCG	2	8	282401	282408	0 %	50 %	25 %	25 %	78045797
5992	NC_007508	CGA	2	6	282515	282520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045797
5993	NC_007508	CG	3	6	282573	282578	0 %	0 %	50 %	50 %	78045797
5994	NC_007508	CGG	2	6	282764	282769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045798
5995	NC_007508	CGT	2	6	282787	282792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045798
5996	NC_007508	GTGC	2	8	282820	282827	0 %	25 %	50 %	25 %	78045798
5997	NC_007508	GCG	2	6	282914	282919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045798
5998	NC_007508	TGC	2	6	282928	282933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045798
5999	NC_007508	TGCG	2	8	283014	283021	0 %	25 %	50 %	25 %	78045798
6000	NC_007508	GCC	2	6	283052	283057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045798

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