MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. campestris str. 8004 chromosome

Total Repeats: 111163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007086	GCC	4	12	194010	194021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766500
4002	NC_007086	CTGG	2	8	194027	194034	0 %	25 %	50 %	25 %	66766500
4003	NC_007086	CCA	2	6	194044	194049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66766500
4004	NC_007086	CGG	2	6	194060	194065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766500
4005	NC_007086	GCT	2	6	194069	194074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766500
4006	NC_007086	AGC	2	6	194137	194142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766500
4007	NC_007086	GCAC	2	8	194148	194155	25 %	0 %	25 %	50 %	66766500
4008	NC_007086	GC	3	6	194226	194231	0 %	0 %	50 %	50 %	66766500
4009	NC_007086	AAC	2	6	194274	194279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66766500
4010	NC_007086	GCGCC	2	10	194339	194348	0 %	0 %	40 %	60 %	66766500
4011	NC_007086	GC	4	8	194428	194435	0 %	0 %	50 %	50 %	66766500
4012	NC_007086	ACA	2	6	194443	194448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66766500
4013	NC_007086	ACA	2	6	194617	194622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66766500
4014	NC_007086	TCCAG	2	10	194632	194641	20 %	20 %	20 %	40 %	66766500
4015	NC_007086	GCG	2	6	194655	194660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766500
4016	NC_007086	TGG	3	9	194755	194763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766500
4017	NC_007086	GCGT	2	8	194771	194778	0 %	25 %	50 %	25 %	66766500
4018	NC_007086	CG	3	6	194822	194827	0 %	0 %	50 %	50 %	66766500
4019	NC_007086	GCA	2	6	194828	194833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766500
4020	NC_007086	CGC	4	12	194885	194896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766500
4021	NC_007086	GCT	2	6	194900	194905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766500
4022	NC_007086	CCG	2	6	194945	194950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766500
4023	NC_007086	TGG	2	6	195086	195091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766501
4024	NC_007086	CTG	2	6	195163	195168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766501
4025	NC_007086	GCC	4	12	195193	195204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766501
4026	NC_007086	GCC	2	6	195255	195260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766501
4027	NC_007086	TGA	2	6	195296	195301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66766501
4028	NC_007086	TGG	2	6	195328	195333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766501
4029	NC_007086	GC	3	6	195377	195382	0 %	0 %	50 %	50 %	66766501
4030	NC_007086	GGC	2	6	195421	195426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766501
4031	NC_007086	GC	3	6	195425	195430	0 %	0 %	50 %	50 %	66766501
4032	NC_007086	TGG	2	6	195434	195439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766501
4033	NC_007086	TGC	2	6	195467	195472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766501
4034	NC_007086	GGA	2	6	195487	195492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66766501
4035	NC_007086	TGT	2	6	195514	195519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66766502
4036	NC_007086	TGC	3	9	195535	195543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766502
4037	NC_007086	GGT	2	6	195617	195622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766502
4038	NC_007086	GCA	2	6	195629	195634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766502
4039	NC_007086	CCG	2	6	195640	195645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766502
4040	NC_007086	CGT	2	6	195658	195663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766502
4041	NC_007086	GTT	2	6	195677	195682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66766502
4042	NC_007086	TGC	2	6	195703	195708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766502
4043	NC_007086	GTG	2	6	195709	195714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766502
4044	NC_007086	TGG	2	6	195751	195756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766502
4045	NC_007086	GTC	2	6	195794	195799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766502
4046	NC_007086	TTC	2	6	195804	195809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66766502
4047	NC_007086	GGC	2	6	195810	195815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766502
4048	NC_007086	CGG	2	6	195844	195849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766502
4049	NC_007086	GGC	2	6	195852	195857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766502
4050	NC_007086	GAT	2	6	195860	195865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66766502
4051	NC_007086	GAT	2	6	195872	195877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66766502
4052	NC_007086	CCG	2	6	195922	195927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766502
4053	NC_007086	TGG	2	6	195931	195936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766502
4054	NC_007086	GCC	2	6	195947	195952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766502
4055	NC_007086	CGGCCG	2	12	195976	195987	0 %	0 %	50 %	50 %	66766502
4056	NC_007086	CGGC	2	8	196018	196025	0 %	0 %	50 %	50 %	66766502
4057	NC_007086	TGA	2	6	196042	196047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66766502
4058	NC_007086	CCG	2	6	196048	196053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766502
4059	NC_007086	ATG	2	6	196056	196061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66766502
4060	NC_007086	GC	3	6	196080	196085	0 %	0 %	50 %	50 %	66766502
4061	NC_007086	GGGCCT	2	12	196157	196168	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	66766502
4062	NC_007086	GGT	2	6	196235	196240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766502
4063	NC_007086	TTC	2	6	196293	196298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66766502
4064	NC_007086	CG	3	6	196316	196321	0 %	0 %	50 %	50 %	66766502
4065	NC_007086	CAC	2	6	196322	196327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66766502
4066	NC_007086	TTGC	2	8	196374	196381	0 %	50 %	25 %	25 %	66766502
4067	NC_007086	CGG	4	12	196396	196407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766502
4068	NC_007086	TGA	2	6	196453	196458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66766502
4069	NC_007086	GTG	2	6	196461	196466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766502
4070	NC_007086	TGC	4	12	196468	196479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766502
4071	NC_007086	GGT	2	6	196538	196543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766502
4072	NC_007086	CGG	2	6	196595	196600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766502
4073	NC_007086	CGC	2	6	196615	196620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766502
4074	NC_007086	GTT	2	6	196634	196639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66766502
4075	NC_007086	CTGG	2	8	196700	196707	0 %	25 %	50 %	25 %	66766502
4076	NC_007086	TTC	2	6	196737	196742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66766502
4077	NC_007086	GC	3	6	196775	196780	0 %	0 %	50 %	50 %	66766502
4078	NC_007086	ACC	2	6	196895	196900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66766503
4079	NC_007086	C	6	6	196899	196904	0 %	0 %	0 %	100 %	66766503
4080	NC_007086	ACC	2	6	196922	196927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66766503
4081	NC_007086	GCT	3	9	196930	196938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766503
4082	NC_007086	CCG	3	9	196956	196964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766503
4083	NC_007086	ACT	2	6	197079	197084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66766503
4084	NC_007086	TTCG	2	8	197098	197105	0 %	50 %	25 %	25 %	66766503
4085	NC_007086	CG	3	6	197136	197141	0 %	0 %	50 %	50 %	66766503
4086	NC_007086	GCCAT	2	10	197166	197175	20 %	20 %	20 %	40 %	66766503
4087	NC_007086	CTA	2	6	197230	197235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66766503
4088	NC_007086	CGGCG	2	10	197247	197256	0 %	0 %	60 %	40 %	66766503
4089	NC_007086	GCA	2	6	197274	197279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766503
4090	NC_007086	GTG	2	6	197285	197290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766503
4091	NC_007086	CGA	2	6	197296	197301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766503
4092	NC_007086	GCG	3	9	197403	197411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766503
4093	NC_007086	CGA	2	6	197428	197433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766503
4094	NC_007086	GGT	2	6	197443	197448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766503
4095	NC_007086	ACG	2	6	197469	197474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766503
4096	NC_007086	TAC	2	6	197552	197557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66766503
4097	NC_007086	ACC	2	6	197561	197566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66766503
4098	NC_007086	CCG	2	6	197580	197585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766503
4099	NC_007086	CCG	2	6	197588	197593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766503
4100	NC_007086	CG	3	6	197614	197619	0 %	0 %	50 %	50 %	66766503
4101	NC_007086	CAA	2	6	197656	197661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66766503
4102	NC_007086	CGA	2	6	197686	197691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766503
4103	NC_007086	GTG	2	6	197695	197700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766503
4104	NC_007086	GCCAC	2	10	197709	197718	20 %	0 %	20 %	60 %	66766503
4105	NC_007086	TGG	2	6	197721	197726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766503
4106	NC_007086	TGG	2	6	197744	197749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766503
4107	NC_007086	GCG	2	6	197850	197855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766503
4108	NC_007086	GAA	2	6	197872	197877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66766503
4109	NC_007086	GAC	2	6	197918	197923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766503
4110	NC_007086	CGC	2	6	197929	197934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766503
4111	NC_007086	TTC	2	6	197957	197962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66766503
4112	NC_007086	GCC	2	6	197969	197974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766503
4113	NC_007086	TGC	2	6	198009	198014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766503
4114	NC_007086	AGGGCA	2	12	198021	198032	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	66766503
4115	NC_007086	CG	3	6	198039	198044	0 %	0 %	50 %	50 %	66766503
4116	NC_007086	CGC	2	6	198051	198056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766503
4117	NC_007086	CGGG	2	8	198114	198121	0 %	0 %	75 %	25 %	66766503
4118	NC_007086	GGGCG	2	10	198124	198133	0 %	0 %	80 %	20 %	66766503
4119	NC_007086	CTG	2	6	198134	198139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766503
4120	NC_007086	GCA	2	6	198171	198176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766503
4121	NC_007086	GAA	2	6	198209	198214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66766503
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4123	NC_007086	GCG	2	6	198246	198251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766503
4124	NC_007086	CAC	2	6	198313	198318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66766503
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4128	NC_007086	CG	3	6	198678	198683	0 %	0 %	50 %	50 %	66766504
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4246	NC_007086	GC	3	6	204994	204999	0 %	0 %	50 %	50 %	66766509
4247	NC_007086	CGGT	2	8	205044	205051	0 %	25 %	50 %	25 %	66766509
4248	NC_007086	CATCG	2	10	205058	205067	20 %	20 %	20 %	40 %	66766509
4249	NC_007086	TCT	2	6	205098	205103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66766509
4250	NC_007086	ATCG	2	8	205133	205140	25 %	25 %	25 %	25 %	66766509
4251	NC_007086	GC	3	6	205223	205228	0 %	0 %	50 %	50 %	66766509
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4255	NC_007086	GTGCG	2	10	205342	205351	0 %	20 %	60 %	20 %	66766509
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4259	NC_007086	GTC	2	6	205433	205438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766509
4260	NC_007086	GC	4	8	205453	205460	0 %	0 %	50 %	50 %	66766509
4261	NC_007086	CAG	2	6	205481	205486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766509
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4266	NC_007086	GC	3	6	205669	205674	0 %	0 %	50 %	50 %	66766509
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4270	NC_007086	GCC	2	6	206264	206269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766510
4271	NC_007086	GACGA	2	10	206300	206309	40 %	0 %	40 %	20 %	66766510
4272	NC_007086	GCG	2	6	206337	206342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766510
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4278	NC_007086	GCA	2	6	206610	206615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766510
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4283	NC_007086	CAG	2	6	206752	206757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766510
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4303	NC_007086	CTG	2	6	207334	207339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766511
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4306	NC_007086	TGC	2	6	207465	207470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766511
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4308	NC_007086	CGCTG	2	10	207803	207812	0 %	20 %	40 %	40 %	77761072
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4310	NC_007086	CG	3	6	207842	207847	0 %	0 %	50 %	50 %	77761072
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4312	NC_007086	ATGCCG	2	12	207871	207882	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77761072
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4327	NC_007086	TTC	2	6	208572	208577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77761072
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4359	NC_007086	GCCGA	2	10	210621	210630	20 %	0 %	40 %	40 %	66766513
4360	NC_007086	CAC	2	6	210653	210658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66766513
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4368	NC_007086	GC	3	6	210903	210908	0 %	0 %	50 %	50 %	66766513
4369	NC_007086	CACG	2	8	210928	210935	25 %	0 %	25 %	50 %	66766513
4370	NC_007086	GCC	2	6	211010	211015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766513
4371	NC_007086	CTGGT	2	10	211092	211101	0 %	40 %	40 %	20 %	66766513
4372	NC_007086	GC	3	6	211156	211161	0 %	0 %	50 %	50 %	66766513
4373	NC_007086	CCA	2	6	211162	211167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66766513
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4382	NC_007086	CGC	2	6	211954	211959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77761073
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4406	NC_007086	GC	3	6	212716	212721	0 %	0 %	50 %	50 %	77761073
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4477	NC_007086	CAC	2	6	215788	215793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66766518
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4480	NC_007086	GC	3	6	215889	215894	0 %	0 %	50 %	50 %	66766518
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4482	NC_007086	GCAGCG	2	12	215920	215931	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	66766518
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4489	NC_007086	GCT	2	6	216082	216087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766518
4490	NC_007086	GC	3	6	216089	216094	0 %	0 %	50 %	50 %	66766518
4491	NC_007086	GGT	2	6	216113	216118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766518
4492	NC_007086	CAGCGC	2	12	216119	216130	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	66766518
4493	NC_007086	GCT	3	9	216169	216177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766518
4494	NC_007086	GTG	2	6	216266	216271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766518
4495	NC_007086	ACG	2	6	216282	216287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766518
4496	NC_007086	GC	3	6	216328	216333	0 %	0 %	50 %	50 %	66766518
4497	NC_007086	GTG	2	6	216341	216346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766518
4498	NC_007086	CAG	2	6	216347	216352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766518
4499	NC_007086	GC	3	6	216359	216364	0 %	0 %	50 %	50 %	66766518
4500	NC_007086	GCT	2	6	216367	216372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766518

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