MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 3179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006834	ACCAC	2	10	1267	1276	40 %	0 %	0 %	60 %	58579624
2	NC_006834	TGGAA	2	10	4217	4226	40 %	20 %	40 %	0 %	58579626
3	NC_006834	CAAGC	2	10	4837	4846	40 %	0 %	20 %	40 %	58579626
4	NC_006834	AGCGA	2	10	4895	4904	40 %	0 %	40 %	20 %	58579626
5	NC_006834	GGCGC	2	10	5812	5821	0 %	0 %	60 %	40 %	58579627
6	NC_006834	CCGCG	2	10	6109	6118	0 %	0 %	40 %	60 %	58579627
7	NC_006834	CAAGC	2	10	9528	9537	40 %	0 %	20 %	40 %	58579629
8	NC_006834	CACTG	2	10	11294	11303	20 %	20 %	20 %	40 %	58579631
9	NC_006834	CGCGC	2	10	12931	12940	0 %	0 %	40 %	60 %	58579633
10	NC_006834	ACGGT	2	10	14977	14986	20 %	20 %	40 %	20 %	58579636
11	NC_006834	CAGCG	2	10	15977	15986	20 %	0 %	40 %	40 %	58579637
12	NC_006834	CAGCG	2	10	20668	20677	20 %	0 %	40 %	40 %	122878977
13	NC_006834	GCACC	2	10	20853	20862	20 %	0 %	20 %	60 %	122878977
14	NC_006834	CAGCG	2	10	22878	22887	20 %	0 %	40 %	40 %	58579642
15	NC_006834	CCAGA	2	10	26028	26037	40 %	0 %	20 %	40 %	58579646
16	NC_006834	GGCAC	2	10	27323	27332	20 %	0 %	40 %	40 %	58579649
17	NC_006834	GGCGG	2	10	27333	27342	0 %	0 %	80 %	20 %	58579649
18	NC_006834	TGGCC	2	10	27702	27711	0 %	20 %	40 %	40 %	122878978
19	NC_006834	ACCGC	2	10	28289	28298	20 %	0 %	20 %	60 %	122878978
20	NC_006834	GGGAG	2	10	30685	30694	20 %	0 %	80 %	0 %	58579652
21	NC_006834	GTGCA	2	10	31807	31816	20 %	20 %	40 %	20 %	58579653
22	NC_006834	GCATC	2	10	32425	32434	20 %	20 %	20 %	40 %	58579654
23	NC_006834	TGCAA	2	10	36722	36731	40 %	20 %	20 %	20 %	122878979
24	NC_006834	CCGCA	2	10	37186	37195	20 %	0 %	20 %	60 %	58579658
25	NC_006834	GCTGC	2	10	40941	40950	0 %	20 %	40 %	40 %	58579662
26	NC_006834	TGCGC	2	10	41246	41255	0 %	20 %	40 %	40 %	58579662
27	NC_006834	GCCCG	2	10	42135	42144	0 %	0 %	40 %	60 %	58579663
28	NC_006834	GGTCG	2	10	42339	42348	0 %	20 %	60 %	20 %	58579664
29	NC_006834	GTGCT	2	10	42726	42735	0 %	40 %	40 %	20 %	58579665
30	NC_006834	AGCGC	2	10	43356	43365	20 %	0 %	40 %	40 %	58579665
31	NC_006834	AGGCA	2	10	43646	43655	40 %	0 %	40 %	20 %	58579666
32	NC_006834	TTCAT	2	10	48563	48572	20 %	60 %	0 %	20 %	58579673
33	NC_006834	CCCGC	2	10	49887	49896	0 %	0 %	20 %	80 %	58579677
34	NC_006834	GTCAG	2	10	51077	51086	20 %	20 %	40 %	20 %	58579679
35	NC_006834	CCGCC	2	10	51720	51729	0 %	0 %	20 %	80 %	58579679
36	NC_006834	CTGCG	2	10	51863	51872	0 %	20 %	40 %	40 %	58579679
37	NC_006834	CCGTC	2	10	52337	52346	0 %	20 %	20 %	60 %	58579680
38	NC_006834	CGATC	2	10	54336	54345	20 %	20 %	20 %	40 %	122878980
39	NC_006834	TGCGC	2	10	54600	54609	0 %	20 %	40 %	40 %	122878980
40	NC_006834	GGGCT	2	10	54706	54715	0 %	20 %	60 %	20 %	122878980
41	NC_006834	GGCCT	2	10	56193	56202	0 %	20 %	40 %	40 %	58579684
42	NC_006834	TGCGC	2	10	58002	58011	0 %	20 %	40 %	40 %	58579687
43	NC_006834	CGCAG	2	10	59189	59198	20 %	0 %	40 %	40 %	122878981
44	NC_006834	TCCAG	2	10	61370	61379	20 %	20 %	20 %	40 %	58579689
45	NC_006834	TGCAC	2	10	67006	67015	20 %	20 %	20 %	40 %	58579694
46	NC_006834	CGTGT	2	10	69678	69687	0 %	40 %	40 %	20 %	121632015
47	NC_006834	GCACT	2	10	71571	71580	20 %	20 %	20 %	40 %	58579697
48	NC_006834	CAGCG	2	10	75203	75212	20 %	0 %	40 %	40 %	58579703
49	NC_006834	GAAGC	2	10	77088	77097	40 %	0 %	40 %	20 %	58579706
50	NC_006834	CTGCG	2	10	77183	77192	0 %	20 %	40 %	40 %	58579706
51	NC_006834	GAGCA	2	10	78425	78434	40 %	0 %	40 %	20 %	58579707
52	NC_006834	GCAGC	2	10	81602	81611	20 %	0 %	40 %	40 %	58579710
53	NC_006834	CGCAC	2	10	81899	81908	20 %	0 %	20 %	60 %	58579711
54	NC_006834	GCGGA	2	10	82288	82297	20 %	0 %	60 %	20 %	58579711
55	NC_006834	TTGGC	2	10	82593	82602	0 %	40 %	40 %	20 %	58579712
56	NC_006834	AGCGC	2	10	83329	83338	20 %	0 %	40 %	40 %	58579713
57	NC_006834	GCGCG	2	10	83598	83607	0 %	0 %	60 %	40 %	58579713
58	NC_006834	ACGCG	2	10	85543	85552	20 %	0 %	40 %	40 %	58579715
59	NC_006834	AATCC	2	10	87474	87483	40 %	20 %	0 %	40 %	58579717
60	NC_006834	CGAAC	2	10	89432	89441	40 %	0 %	20 %	40 %	58579718
61	NC_006834	CAGCG	2	10	91944	91953	20 %	0 %	40 %	40 %	58579720
62	NC_006834	CAGAT	2	10	94674	94683	40 %	20 %	20 %	20 %	58579726
63	NC_006834	CCGGT	2	10	95933	95942	0 %	20 %	40 %	40 %	58579727
64	NC_006834	AGCCA	2	10	99764	99773	40 %	0 %	20 %	40 %	58579731
65	NC_006834	GCGAC	2	10	102811	102820	20 %	0 %	40 %	40 %	58579733
66	NC_006834	GGACT	2	10	103174	103183	20 %	20 %	40 %	20 %	58579733
67	NC_006834	CGGCG	2	10	103395	103404	0 %	0 %	60 %	40 %	58579734
68	NC_006834	CGCTG	2	10	103737	103746	0 %	20 %	40 %	40 %	58579734
69	NC_006834	GCTGC	2	10	104464	104473	0 %	20 %	40 %	40 %	58579734
70	NC_006834	GGGCT	2	10	105969	105978	0 %	20 %	60 %	20 %	122878983
71	NC_006834	CCGGC	2	10	106249	106258	0 %	0 %	40 %	60 %	122878983
72	NC_006834	CCCGA	2	10	110653	110662	20 %	0 %	20 %	60 %	58579737
73	NC_006834	ACGCA	2	10	110705	110714	40 %	0 %	20 %	40 %	58579737
74	NC_006834	TGGCG	2	10	110784	110793	0 %	20 %	60 %	20 %	58579737
75	NC_006834	CGGCG	2	10	111878	111887	0 %	0 %	60 %	40 %	122878985
76	NC_006834	GCGTC	2	10	112922	112931	0 %	20 %	40 %	40 %	122878985
77	NC_006834	CGACC	2	10	113119	113128	20 %	0 %	20 %	60 %	58579739
78	NC_006834	TGGAA	2	10	117097	117106	40 %	20 %	40 %	0 %	58579740
79	NC_006834	CGACC	2	10	117380	117389	20 %	0 %	20 %	60 %	58579740
80	NC_006834	GGCAT	2	10	119914	119923	20 %	20 %	40 %	20 %	58579742
81	NC_006834	GTTGC	2	10	121066	121075	0 %	40 %	40 %	20 %	58579743
82	NC_006834	GCAAC	2	10	128484	128493	40 %	0 %	20 %	40 %	58579751
83	NC_006834	CGCGG	2	10	132356	132365	0 %	0 %	60 %	40 %	58579753
84	NC_006834	TGCGC	2	10	132519	132528	0 %	20 %	40 %	40 %	58579753
85	NC_006834	GGCGT	2	10	135591	135600	0 %	20 %	60 %	20 %	58579756
86	NC_006834	GCGCA	2	10	135794	135803	20 %	0 %	40 %	40 %	58579756
87	NC_006834	GGCGT	2	10	139062	139071	0 %	20 %	60 %	20 %	58579758
88	NC_006834	TGCAC	2	10	143076	143085	20 %	20 %	20 %	40 %	58579768
89	NC_006834	TGCAC	2	10	147714	147723	20 %	20 %	20 %	40 %	58579771
90	NC_006834	GCTGC	2	10	150929	150938	0 %	20 %	40 %	40 %	58579775
91	NC_006834	TGCGC	2	10	151234	151243	0 %	20 %	40 %	40 %	58579775
92	NC_006834	CGATC	2	10	154132	154141	20 %	20 %	20 %	40 %	58579777
93	NC_006834	TGCGC	2	10	154318	154327	0 %	20 %	40 %	40 %	58579777
94	NC_006834	ATCGC	2	10	156179	156188	20 %	20 %	20 %	40 %	58579780
95	NC_006834	GCAGC	2	10	156601	156610	20 %	0 %	40 %	40 %	58579780
96	NC_006834	CAGCG	2	10	158869	158878	20 %	0 %	40 %	40 %	58579782
97	NC_006834	CCTGC	2	10	159379	159388	0 %	20 %	20 %	60 %	58579782
98	NC_006834	GCTTG	2	10	161613	161622	0 %	40 %	40 %	20 %	58579785
99	NC_006834	ACGCC	2	10	162854	162863	20 %	0 %	20 %	60 %	122878987
100	NC_006834	CGGCG	2	10	163337	163346	0 %	0 %	60 %	40 %	122878987
101	NC_006834	GCGCG	2	10	169179	169188	0 %	0 %	60 %	40 %	58579791
102	NC_006834	TGGTC	2	10	169434	169443	0 %	40 %	40 %	20 %	58579791
103	NC_006834	CTTGC	2	10	170239	170248	0 %	40 %	20 %	40 %	58579791
104	NC_006834	CGGCG	2	10	170382	170391	0 %	0 %	60 %	40 %	58579791
105	NC_006834	CGTGC	2	10	176513	176522	0 %	20 %	40 %	40 %	58579796
106	NC_006834	GTTGT	2	10	178066	178075	0 %	60 %	40 %	0 %	58579797
107	NC_006834	GCGTC	2	10	179510	179519	0 %	20 %	40 %	40 %	58579798
108	NC_006834	CAACG	2	10	179899	179908	40 %	0 %	20 %	40 %	58579798
109	NC_006834	GGTGT	2	10	180858	180867	0 %	40 %	60 %	0 %	122878988
110	NC_006834	GCAGC	2	10	181214	181223	20 %	0 %	40 %	40 %	122878988
111	NC_006834	CGGCC	2	10	181607	181616	0 %	0 %	40 %	60 %	122878988
112	NC_006834	CGGTG	2	10	182414	182423	0 %	20 %	60 %	20 %	122878988
113	NC_006834	CGGTG	2	10	182489	182498	0 %	20 %	60 %	20 %	122878988
114	NC_006834	CGCTG	2	10	185482	185491	0 %	20 %	40 %	40 %	122878989
115	NC_006834	CCGGC	2	10	185700	185709	0 %	0 %	40 %	60 %	122878989
116	NC_006834	ACCAG	2	10	186564	186573	40 %	0 %	20 %	40 %	122878989
117	NC_006834	GCAAT	2	10	189848	189857	40 %	20 %	20 %	20 %	58579807
118	NC_006834	GTGCA	2	10	192168	192177	20 %	20 %	40 %	20 %	122878990
119	NC_006834	GCACG	2	10	193071	193080	20 %	0 %	40 %	40 %	122878990
120	NC_006834	GGTGG	2	10	195597	195606	0 %	20 %	80 %	0 %	58579813
121	NC_006834	GCGCG	2	10	198983	198992	0 %	0 %	60 %	40 %	122878991
122	NC_006834	TCGGT	2	10	199508	199517	0 %	40 %	40 %	20 %	122878991
123	NC_006834	CGTGC	2	10	212090	212099	0 %	20 %	40 %	40 %	58579831
124	NC_006834	GGGCA	2	10	215672	215681	20 %	0 %	60 %	20 %	58579835
125	NC_006834	GACGC	2	10	217676	217685	20 %	0 %	40 %	40 %	58579838
126	NC_006834	GCCGC	2	10	219321	219330	0 %	0 %	40 %	60 %	58579838
127	NC_006834	GGCGC	2	10	221919	221928	0 %	0 %	60 %	40 %	58579841
128	NC_006834	GAACT	2	10	224226	224235	40 %	20 %	20 %	20 %	122878996
129	NC_006834	ATCGC	2	10	225391	225400	20 %	20 %	20 %	40 %	122878996
130	NC_006834	CGTGC	2	10	226493	226502	0 %	20 %	40 %	40 %	122878997
131	NC_006834	TGCAC	2	10	227396	227405	20 %	20 %	20 %	40 %	122878997
132	NC_006834	CGCGC	2	10	228427	228436	0 %	0 %	40 %	60 %	58579845
133	NC_006834	GCCCG	2	10	228594	228603	0 %	0 %	40 %	60 %	58579845
134	NC_006834	ACGCC	2	10	228627	228636	20 %	0 %	20 %	60 %	58579845
135	NC_006834	GCCTG	2	10	228916	228925	0 %	20 %	40 %	40 %	58579845
136	NC_006834	AGCGC	2	10	229992	230001	20 %	0 %	40 %	40 %	58579845
137	NC_006834	CAGCG	2	10	231069	231078	20 %	0 %	40 %	40 %	58579846
138	NC_006834	CGTGG	2	10	231896	231905	0 %	20 %	60 %	20 %	58579846
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143	NC_006834	TGCGA	2	10	236660	236669	20 %	20 %	40 %	20 %	58579848
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150	NC_006834	GCCGA	2	10	247955	247964	20 %	0 %	40 %	40 %	58579858
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167	NC_006834	GCAGT	2	10	265774	265783	20 %	20 %	40 %	20 %	58579872
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393	NC_006834	CGGCA	2	10	619771	619780	20 %	0 %	40 %	40 %	58580217
394	NC_006834	GCGCG	2	10	620238	620247	0 %	0 %	60 %	40 %	58580217
395	NC_006834	GGGGA	2	10	620408	620417	20 %	0 %	80 %	0 %	58580217
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