MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 10791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006834	GATG	2	8	44	51	25 %	25 %	50 %	0 %	58579624
2	NC_006834	CCCG	2	8	89	96	0 %	0 %	25 %	75 %	58579624
3	NC_006834	GTCG	2	8	839	846	0 %	25 %	50 %	25 %	58579624
4	NC_006834	CGAT	2	8	847	854	25 %	25 %	25 %	25 %	58579624
5	NC_006834	GCCG	2	8	1257	1264	0 %	0 %	50 %	50 %	58579624
6	NC_006834	TGCC	2	8	1286	1293	0 %	25 %	25 %	50 %	58579624
7	NC_006834	CCTG	2	8	1728	1735	0 %	25 %	25 %	50 %	58579625
8	NC_006834	GGAC	2	8	1764	1771	25 %	0 %	50 %	25 %	58579625
9	NC_006834	CCCG	2	8	1858	1865	0 %	0 %	25 %	75 %	58579625
10	NC_006834	CTGC	2	8	1978	1985	0 %	25 %	25 %	50 %	58579625
11	NC_006834	CCGT	2	8	1996	2003	0 %	25 %	25 %	50 %	58579625
12	NC_006834	TGCG	2	8	2438	2445	0 %	25 %	50 %	25 %	58579625
13	NC_006834	CGAA	2	8	2471	2478	50 %	0 %	25 %	25 %	58579625
14	NC_006834	GCCT	2	8	4858	4865	0 %	25 %	25 %	50 %	58579626
15	NC_006834	CCCG	2	8	5022	5029	0 %	0 %	25 %	75 %	58579626
16	NC_006834	CGAA	2	8	6348	6355	50 %	0 %	25 %	25 %	58579627
17	NC_006834	GCAG	2	8	7153	7160	25 %	0 %	50 %	25 %	58579627
18	NC_006834	GCCG	2	8	8331	8338	0 %	0 %	50 %	50 %	58579628
19	NC_006834	ACCC	2	8	9456	9463	25 %	0 %	0 %	75 %	58579629
20	NC_006834	GCAA	2	8	9859	9866	50 %	0 %	25 %	25 %	58579630
21	NC_006834	TGGG	2	8	9898	9905	0 %	25 %	75 %	0 %	58579630
22	NC_006834	GTCG	2	8	11717	11724	0 %	25 %	50 %	25 %	58579631
23	NC_006834	CGTT	2	8	12445	12452	0 %	50 %	25 %	25 %	58579632
24	NC_006834	GGTG	2	8	12542	12549	0 %	25 %	75 %	0 %	58579632
25	NC_006834	GAAG	2	8	12912	12919	50 %	0 %	50 %	0 %	58579633
26	NC_006834	GTGC	2	8	14562	14569	0 %	25 %	50 %	25 %	58579635
27	NC_006834	GATC	2	8	14756	14763	25 %	25 %	25 %	25 %	58579636
28	NC_006834	GGTG	2	8	15799	15806	0 %	25 %	75 %	0 %	58579637
29	NC_006834	CATC	2	8	15931	15938	25 %	25 %	0 %	50 %	58579637
30	NC_006834	GTTG	2	8	17209	17216	0 %	50 %	50 %	0 %	122878976
31	NC_006834	GTTG	2	8	17495	17502	0 %	50 %	50 %	0 %	122878976
32	NC_006834	GGCT	2	8	17839	17846	0 %	25 %	50 %	25 %	122878976
33	NC_006834	CGGC	2	8	18076	18083	0 %	0 %	50 %	50 %	122878976
34	NC_006834	CGTG	2	8	18726	18733	0 %	25 %	50 %	25 %	161899024
35	NC_006834	TGGC	2	8	19133	19140	0 %	25 %	50 %	25 %	161899024
36	NC_006834	GCCG	2	8	19174	19181	0 %	0 %	50 %	50 %	161899024
37	NC_006834	CGGC	2	8	19316	19323	0 %	0 %	50 %	50 %	161899024
38	NC_006834	CGGG	2	8	20729	20736	0 %	0 %	75 %	25 %	122878977
39	NC_006834	GATC	2	8	20739	20746	25 %	25 %	25 %	25 %	122878977
40	NC_006834	GCCG	2	8	20804	20811	0 %	0 %	50 %	50 %	122878977
41	NC_006834	GAGC	2	8	20973	20980	25 %	0 %	50 %	25 %	122878977
42	NC_006834	AGCA	2	8	21882	21889	50 %	0 %	25 %	25 %	122878977
43	NC_006834	CGTG	2	8	22664	22671	0 %	25 %	50 %	25 %	58579642
44	NC_006834	CCGG	2	8	22677	22684	0 %	0 %	50 %	50 %	58579642
45	NC_006834	TCGA	2	8	22813	22820	25 %	25 %	25 %	25 %	58579642
46	NC_006834	GTCT	2	8	22939	22946	0 %	50 %	25 %	25 %	58579642
47	NC_006834	CGCC	2	8	24327	24334	0 %	0 %	25 %	75 %	58579645
48	NC_006834	CGCC	2	8	24524	24531	0 %	0 %	25 %	75 %	58579645
49	NC_006834	CAGC	2	8	24685	24692	25 %	0 %	25 %	50 %	58579645
50	NC_006834	CGCC	2	8	24912	24919	0 %	0 %	25 %	75 %	58579645
51	NC_006834	CTGC	2	8	25080	25087	0 %	25 %	25 %	50 %	58579645
52	NC_006834	GCGT	2	8	25099	25106	0 %	25 %	50 %	25 %	58579645
53	NC_006834	CAGC	2	8	25716	25723	25 %	0 %	25 %	50 %	58579646
54	NC_006834	GCAC	2	8	27399	27406	25 %	0 %	25 %	50 %	58579649
55	NC_006834	GGGC	2	8	27930	27937	0 %	0 %	75 %	25 %	122878978
56	NC_006834	TCGA	2	8	28084	28091	25 %	25 %	25 %	25 %	122878978
57	NC_006834	GGGC	2	8	28134	28141	0 %	0 %	75 %	25 %	122878978
58	NC_006834	GCCG	2	8	28512	28519	0 %	0 %	50 %	50 %	122878978
59	NC_006834	GCCG	2	8	29551	29558	0 %	0 %	50 %	50 %	58579651
60	NC_006834	CGGC	2	8	30057	30064	0 %	0 %	50 %	50 %	58579651
61	NC_006834	GATG	2	8	30114	30121	25 %	25 %	50 %	0 %	58579651
62	NC_006834	TCAC	2	8	30645	30652	25 %	25 %	0 %	50 %	58579652
63	NC_006834	CTTG	2	8	30736	30743	0 %	50 %	25 %	25 %	58579652
64	NC_006834	GCCG	2	8	30802	30809	0 %	0 %	50 %	50 %	58579652
65	NC_006834	ACGC	2	8	31846	31853	25 %	0 %	25 %	50 %	58579653
66	NC_006834	GGTG	2	8	32394	32401	0 %	25 %	75 %	0 %	58579654
67	NC_006834	AGAA	2	8	32636	32643	75 %	0 %	25 %	0 %	58579654
68	NC_006834	CTTT	2	8	32946	32953	0 %	75 %	0 %	25 %	58579654
69	NC_006834	AGCA	2	8	33490	33497	50 %	0 %	25 %	25 %	58579654
70	NC_006834	TCAA	2	8	33653	33660	50 %	25 %	0 %	25 %	58579654
71	NC_006834	TTTG	2	8	34550	34557	0 %	75 %	25 %	0 %	58579655
72	NC_006834	ACGC	2	8	35157	35164	25 %	0 %	25 %	50 %	58579655
73	NC_006834	GTGC	2	8	35388	35395	0 %	25 %	50 %	25 %	58579655
74	NC_006834	GTGC	2	8	36904	36911	0 %	25 %	50 %	25 %	122878979
75	NC_006834	GGCG	2	8	36949	36956	0 %	0 %	75 %	25 %	122878979
76	NC_006834	CAGG	2	8	37534	37541	25 %	0 %	50 %	25 %	58579658
77	NC_006834	CCAG	2	8	38395	38402	25 %	0 %	25 %	50 %	58579659
78	NC_006834	CGAA	2	8	42188	42195	50 %	0 %	25 %	25 %	58579663
79	NC_006834	GCCG	2	8	42468	42475	0 %	0 %	50 %	50 %	58579664
80	NC_006834	TGCT	2	8	42763	42770	0 %	50 %	25 %	25 %	58579665
81	NC_006834	TCGG	2	8	43226	43233	0 %	25 %	50 %	25 %	58579665
82	NC_006834	TCCA	2	8	43872	43879	25 %	25 %	0 %	50 %	58579666
83	NC_006834	CATG	2	8	44124	44131	25 %	25 %	25 %	25 %	58579666
84	NC_006834	GCAG	2	8	44187	44194	25 %	0 %	50 %	25 %	58579667
85	NC_006834	GCGG	2	8	44202	44209	0 %	0 %	75 %	25 %	58579667
86	NC_006834	GATG	2	8	45615	45622	25 %	25 %	50 %	0 %	58579670
87	NC_006834	CCGA	2	8	45781	45788	25 %	0 %	25 %	50 %	58579670
88	NC_006834	CTGG	2	8	46206	46213	0 %	25 %	50 %	25 %	58579671
89	NC_006834	CCAT	2	8	46456	46463	25 %	25 %	0 %	50 %	58579671
90	NC_006834	GCTG	2	8	46917	46924	0 %	25 %	50 %	25 %	58579671
91	NC_006834	CGTC	2	8	47639	47646	0 %	25 %	25 %	50 %	58579672
92	NC_006834	GCGT	2	8	47712	47719	0 %	25 %	50 %	25 %	58579672
93	NC_006834	CACG	2	8	47881	47888	25 %	0 %	25 %	50 %	58579672
94	NC_006834	CGTC	2	8	48177	48184	0 %	25 %	25 %	50 %	58579672
95	NC_006834	ATCC	2	8	48372	48379	25 %	25 %	0 %	50 %	58579673
96	NC_006834	CGCA	2	8	48863	48870	25 %	0 %	25 %	50 %	58579674
97	NC_006834	GTGC	2	8	48903	48910	0 %	25 %	50 %	25 %	58579674
98	NC_006834	GCTG	2	8	51198	51205	0 %	25 %	50 %	25 %	58579679
99	NC_006834	CAGC	2	8	51795	51802	25 %	0 %	25 %	50 %	58579679
100	NC_006834	TGCG	2	8	52311	52318	0 %	25 %	50 %	25 %	58579680
101	NC_006834	TGGC	2	8	53183	53190	0 %	25 %	50 %	25 %	58579681
102	NC_006834	CGCA	2	8	53872	53879	25 %	0 %	25 %	50 %	58579681
103	NC_006834	GCCG	2	8	54216	54223	0 %	0 %	50 %	50 %	122878980
104	NC_006834	GACG	2	8	54490	54497	25 %	0 %	50 %	25 %	122878980
105	NC_006834	CACC	2	8	55682	55689	25 %	0 %	0 %	75 %	58579683
106	NC_006834	GTTG	2	8	55862	55869	0 %	50 %	50 %	0 %	58579683
107	NC_006834	CGCT	2	8	55921	55928	0 %	25 %	25 %	50 %	58579683
108	NC_006834	CCAG	2	8	56434	56441	25 %	0 %	25 %	50 %	58579684
109	NC_006834	GCAC	2	8	56472	56479	25 %	0 %	25 %	50 %	58579684
110	NC_006834	GCGT	2	8	57261	57268	0 %	25 %	50 %	25 %	58579686
111	NC_006834	CTGG	2	8	57793	57800	0 %	25 %	50 %	25 %	58579687
112	NC_006834	GCGA	2	8	57828	57835	25 %	0 %	50 %	25 %	58579687
113	NC_006834	CATC	2	8	57859	57866	25 %	25 %	0 %	50 %	58579687
114	NC_006834	CGCC	2	8	58306	58313	0 %	0 %	25 %	75 %	122878981
115	NC_006834	CCAT	2	8	58700	58707	25 %	25 %	0 %	50 %	122878981
116	NC_006834	GATG	2	8	58822	58829	25 %	25 %	50 %	0 %	122878981
117	NC_006834	GCCA	2	8	59099	59106	25 %	0 %	25 %	50 %	122878981
118	NC_006834	GCCG	2	8	59730	59737	0 %	0 %	50 %	50 %	122878981
119	NC_006834	CGAC	2	8	61361	61368	25 %	0 %	25 %	50 %	58579689
120	NC_006834	CGTG	2	8	61523	61530	0 %	25 %	50 %	25 %	58579689
121	NC_006834	TTCC	2	8	61923	61930	0 %	50 %	0 %	50 %	58579689
122	NC_006834	CTCA	2	8	62031	62038	25 %	25 %	0 %	50 %	58579689
123	NC_006834	GATT	2	8	62425	62432	25 %	50 %	25 %	0 %	58579689
124	NC_006834	TCGG	2	8	65424	65431	0 %	25 %	50 %	25 %	58579692
125	NC_006834	AGCC	2	8	65819	65826	25 %	0 %	25 %	50 %	58579692
126	NC_006834	CCGC	2	8	66331	66338	0 %	0 %	25 %	75 %	58579693
127	NC_006834	AAGG	2	8	66493	66500	50 %	0 %	50 %	0 %	58579693
128	NC_006834	TGCG	2	8	66968	66975	0 %	25 %	50 %	25 %	58579694
129	NC_006834	GCTG	2	8	68319	68326	0 %	25 %	50 %	25 %	58579696
130	NC_006834	GCCT	2	8	68553	68560	0 %	25 %	25 %	50 %	58579696
131	NC_006834	ACCG	2	8	68712	68719	25 %	0 %	25 %	50 %	58579696
132	NC_006834	TGGC	2	8	69566	69573	0 %	25 %	50 %	25 %	121632015
133	NC_006834	ACGC	2	8	70200	70207	25 %	0 %	25 %	50 %	58579697
134	NC_006834	CGGT	2	8	70347	70354	0 %	25 %	50 %	25 %	58579697
135	NC_006834	AACG	2	8	71330	71337	50 %	0 %	25 %	25 %	58579697
136	NC_006834	CGCC	2	8	72688	72695	0 %	0 %	25 %	75 %	58579699
137	NC_006834	CCAT	2	8	72882	72889	25 %	25 %	0 %	50 %	58579699
138	NC_006834	TCGC	2	8	73109	73116	0 %	25 %	25 %	50 %	58579700
139	NC_006834	GCTG	2	8	73398	73405	0 %	25 %	50 %	25 %	58579701
140	NC_006834	TGAG	2	8	74079	74086	25 %	25 %	50 %	0 %	58579701
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