MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 64409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006834	GCA	2	6	400	405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579624
2	NC_006834	GCC	2	6	420	425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579624
3	NC_006834	TGT	2	6	475	480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579624
4	NC_006834	GCA	2	6	484	489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579624
5	NC_006834	CGG	2	6	520	525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579624
6	NC_006834	TTC	2	6	585	590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579624
7	NC_006834	GAT	2	6	596	601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579624
8	NC_006834	CAG	2	6	648	653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579624
9	NC_006834	CGA	2	6	671	676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579624
10	NC_006834	TTC	2	6	684	689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579624
11	NC_006834	TTC	2	6	717	722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579624
12	NC_006834	GCC	2	6	748	753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579624
13	NC_006834	ATC	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579624
14	NC_006834	CCG	2	6	855	860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579624
15	NC_006834	CGA	2	6	923	928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579624
16	NC_006834	AAG	2	6	948	953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579624
17	NC_006834	TGG	2	6	997	1002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579624
18	NC_006834	ACT	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579624
19	NC_006834	TGC	2	6	1279	1284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579624
20	NC_006834	GGA	2	6	1827	1832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58579625
21	NC_006834	ACC	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579625
22	NC_006834	GTG	3	9	2029	2037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579625
23	NC_006834	CAG	2	6	2089	2094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579625
24	NC_006834	CTA	2	6	2103	2108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579625
25	NC_006834	CTG	2	6	2119	2124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579625
26	NC_006834	TGC	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579625
27	NC_006834	GGC	2	6	2209	2214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579625
28	NC_006834	ATC	2	6	2227	2232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579625
29	NC_006834	GCT	2	6	2256	2261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579625
30	NC_006834	AAG	3	9	2546	2554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579625
31	NC_006834	CGA	2	6	2586	2591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579625
32	NC_006834	CAG	2	6	2706	2711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579625
33	NC_006834	TCG	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579626
34	NC_006834	CAA	2	6	4186	4191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579626
35	NC_006834	GGC	2	6	4231	4236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579626
36	NC_006834	TGC	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579626
37	NC_006834	GTG	2	6	4354	4359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579626
38	NC_006834	GCG	2	6	4391	4396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579626
39	NC_006834	GTG	2	6	4397	4402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579626
40	NC_006834	CCG	2	6	4407	4412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579626
41	NC_006834	AGA	2	6	4878	4883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579626
42	NC_006834	GAC	2	6	4924	4929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579626
43	NC_006834	CAC	2	6	4951	4956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579626
44	NC_006834	TGT	2	6	5201	5206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579627
45	NC_006834	CGA	2	6	5230	5235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
46	NC_006834	TGC	2	6	5289	5294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579627
47	NC_006834	GGT	2	6	5380	5385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579627
48	NC_006834	CGA	2	6	5398	5403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
49	NC_006834	CGA	2	6	5422	5427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
50	NC_006834	GAA	2	6	5507	5512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579627
51	NC_006834	TGC	2	6	5544	5549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579627
52	NC_006834	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579627
53	NC_006834	CGA	2	6	5566	5571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
54	NC_006834	CGG	2	6	5590	5595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579627
55	NC_006834	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579627
56	NC_006834	CAG	2	6	5678	5683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
57	NC_006834	AGC	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
58	NC_006834	CAC	2	6	5746	5751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579627
59	NC_006834	CGA	2	6	5869	5874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
60	NC_006834	CGA	2	6	5893	5898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
61	NC_006834	GGC	2	6	5912	5917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579627
62	NC_006834	CGC	2	6	5955	5960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
63	NC_006834	TGG	2	6	6006	6011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579627
64	NC_006834	CAA	2	6	6064	6069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579627
65	NC_006834	GGC	2	6	6086	6091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579627
66	NC_006834	GAC	2	6	6191	6196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
67	NC_006834	CGG	2	6	6294	6299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579627
68	NC_006834	TCG	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579627
69	NC_006834	CGC	2	6	6431	6436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
70	NC_006834	TGC	2	6	6582	6587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579627
71	NC_006834	CGA	2	6	6694	6699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
72	NC_006834	ACC	2	6	6723	6728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579627
73	NC_006834	CAT	2	6	6730	6735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579627
74	NC_006834	TGA	2	6	6738	6743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579627
75	NC_006834	CTT	2	6	6790	6795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579627
76	NC_006834	GCC	2	6	6847	6852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
77	NC_006834	GCG	2	6	6944	6949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579627
78	NC_006834	CGA	2	6	6964	6969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
79	NC_006834	GCC	2	6	6970	6975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
80	NC_006834	ACT	2	6	7000	7005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579627
81	NC_006834	GCC	2	6	7090	7095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
82	NC_006834	TGG	2	6	7239	7244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579627
83	NC_006834	CCG	2	6	7249	7254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
84	NC_006834	GAA	2	6	7265	7270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579627
85	NC_006834	TGC	2	6	7281	7286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579627
86	NC_006834	GCG	2	6	7305	7310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579627
87	NC_006834	CAA	2	6	7384	7389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579627
88	NC_006834	GCT	2	6	7429	7434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579627
89	NC_006834	AAG	2	6	7445	7450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579627
90	NC_006834	GCC	2	6	7452	7457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
91	NC_006834	AGC	2	6	7497	7502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
92	NC_006834	ACC	2	6	7511	7516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579627
93	NC_006834	GCC	2	6	7568	7573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
94	NC_006834	CGC	2	6	7616	7621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
95	NC_006834	GCC	2	6	7787	7792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579628
96	NC_006834	GCT	2	6	7793	7798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579628
97	NC_006834	CGC	2	6	7835	7840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579628
98	NC_006834	GGC	2	6	7913	7918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579628
99	NC_006834	GCC	2	6	7959	7964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579628
100	NC_006834	TGT	2	6	8032	8037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579628
101	NC_006834	ACT	2	6	8038	8043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579628
102	NC_006834	CGT	2	6	8046	8051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579628
103	NC_006834	CTG	2	6	8059	8064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579628
104	NC_006834	CGC	2	6	8129	8134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579628
105	NC_006834	GAA	2	6	8220	8225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579628
106	NC_006834	GTG	2	6	8265	8270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579628
107	NC_006834	GAG	2	6	8286	8291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58579628
108	NC_006834	CTG	2	6	8292	8297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579628
109	NC_006834	CCG	2	6	8300	8305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579628
110	NC_006834	GCC	2	6	8418	8423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579628
111	NC_006834	GCA	2	6	8449	8454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579628
112	NC_006834	GCG	2	6	8460	8465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579628
113	NC_006834	TGC	2	6	8510	8515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579628
114	NC_006834	GGC	2	6	8543	8548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579628
115	NC_006834	CCA	2	6	8812	8817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579629
116	NC_006834	GCC	2	6	8833	8838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579629
117	NC_006834	GGT	2	6	8843	8848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579629
118	NC_006834	CGT	2	6	8960	8965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579629
119	NC_006834	TGG	2	6	8974	8979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579629
120	NC_006834	GCC	2	6	8987	8992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579629
121	NC_006834	TCG	2	6	9028	9033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579629
122	NC_006834	CGG	2	6	9062	9067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579629
123	NC_006834	CGC	2	6	9122	9127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579629
124	NC_006834	CAC	2	6	9165	9170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579629
125	NC_006834	GAA	2	6	9171	9176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579629
126	NC_006834	CAT	2	6	9215	9220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579629
127	NC_006834	GCC	2	6	9237	9242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579629
128	NC_006834	CTG	2	6	9306	9311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579629
129	NC_006834	ATG	2	6	9414	9419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579629
130	NC_006834	TGT	2	6	9871	9876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579630
131	NC_006834	GTC	2	6	9909	9914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579630
132	NC_006834	TTC	2	6	9941	9946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579630
133	NC_006834	GAG	2	6	9984	9989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58579630
134	NC_006834	CGA	2	6	10018	10023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579630
135	NC_006834	AGC	2	6	10044	10049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579630
136	NC_006834	CAA	2	6	10076	10081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579630
137	NC_006834	GCC	2	6	10185	10190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579630
138	NC_006834	GAC	2	6	10200	10205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579630
139	NC_006834	AAG	2	6	10218	10223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579630
140	NC_006834	GCA	2	6	10229	10234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579630
141	NC_006834	ACA	2	6	10258	10263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579630
142	NC_006834	CAG	2	6	10317	10322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579630
143	NC_006834	GCT	2	6	10496	10501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579630
144	NC_006834	CGC	3	9	10544	10552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579630
145	NC_006834	CGC	2	6	10562	10567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579630
146	NC_006834	GCC	3	9	10641	10649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579630
147	NC_006834	TGC	2	6	10667	10672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579630
148	NC_006834	GAA	2	6	10686	10691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579630
149	NC_006834	TCA	2	6	10759	10764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579630
150	NC_006834	TAC	2	6	10833	10838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579630
151	NC_006834	CAG	2	6	10971	10976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579630
152	NC_006834	GAA	2	6	11004	11009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579630
153	NC_006834	AAG	2	6	11013	11018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579630
154	NC_006834	ATC	2	6	11019	11024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579630
155	NC_006834	AAC	2	6	11197	11202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579631
156	NC_006834	ATG	2	6	11304	11309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579631
157	NC_006834	CAC	2	6	11357	11362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579631
158	NC_006834	TGG	2	6	11374	11379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579631
159	NC_006834	CCT	2	6	11388	11393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58579631
160	NC_006834	CGC	7	21	11398	11418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579631
161	NC_006834	GCC	4	12	11432	11443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579631
162	NC_006834	CGC	2	6	11458	11463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579631
163	NC_006834	CCG	4	12	11481	11492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579631
164	NC_006834	GGT	2	6	11501	11506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579631
165	NC_006834	CGC	2	6	11542	11547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579631
166	NC_006834	CCG	2	6	11622	11627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579631
167	NC_006834	CCG	2	6	11634	11639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579631
168	NC_006834	TGC	2	6	11756	11761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579631
169	NC_006834	GCA	2	6	11769	11774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579631
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171	NC_006834	CGC	3	9	11966	11974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579632
172	NC_006834	CCT	2	6	12109	12114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58579632
173	NC_006834	TCA	2	6	12127	12132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579632
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