MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 93864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_006834	GTG	2	6	164103	164108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579789
3003	NC_006834	TGC	2	6	164122	164127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579789
3004	NC_006834	TTC	2	6	164166	164171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579789
3005	NC_006834	CGA	2	6	164195	164200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579789
3006	NC_006834	TGC	2	6	164245	164250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579789
3007	NC_006834	CCA	2	6	164311	164316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579789
3008	NC_006834	GAA	2	6	164352	164357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579789
3009	NC_006834	GC	3	6	164383	164388	0 %	0 %	50 %	50 %	58579789
3010	NC_006834	TGT	2	6	164410	164415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579789
3011	NC_006834	GGT	2	6	164426	164431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579789
3012	NC_006834	TGCG	2	8	164449	164456	0 %	25 %	50 %	25 %	58579789
3013	NC_006834	GC	3	6	164484	164489	0 %	0 %	50 %	50 %	58579789
3014	NC_006834	TGG	2	6	164542	164547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579789
3015	NC_006834	GCC	2	6	164597	164602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579789
3016	NC_006834	CGG	2	6	164621	164626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579789
3017	NC_006834	GC	3	6	164657	164662	0 %	0 %	50 %	50 %	58579789
3018	NC_006834	GTG	2	6	164739	164744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579789
3019	NC_006834	GCC	2	6	164772	164777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579789
3020	NC_006834	GCC	2	6	164806	164811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579789
3021	NC_006834	TGG	2	6	164833	164838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579789
3022	NC_006834	GTG	2	6	164865	164870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579789
3023	NC_006834	CTT	2	6	164882	164887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579789
3024	NC_006834	GC	3	6	164910	164915	0 %	0 %	50 %	50 %	58579789
3025	NC_006834	CCA	2	6	165053	165058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579789
3026	NC_006834	GTG	3	9	165141	165149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579789
3027	NC_006834	AGC	2	6	165166	165171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579789
3028	NC_006834	ATC	2	6	165174	165179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579789
3029	NC_006834	ATT	2	6	165190	165195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58579789
3030	NC_006834	CGCA	2	8	165300	165307	25 %	0 %	25 %	50 %	58579789
3031	NC_006834	ACT	2	6	165313	165318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579789
3032	NC_006834	GGC	2	6	165369	165374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579789
3033	NC_006834	GGCC	2	8	165377	165384	0 %	0 %	50 %	50 %	58579789
3034	NC_006834	GTG	2	6	165385	165390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579789
3035	NC_006834	CAT	2	6	165396	165401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579789
3036	NC_006834	GCG	2	6	165419	165424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579789
3037	NC_006834	TAC	2	6	165450	165455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579789
3038	NC_006834	CAC	2	6	165509	165514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579789
3039	NC_006834	GTG	2	6	165521	165526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579789
3040	NC_006834	TGC	2	6	165596	165601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579789
3041	NC_006834	TGG	2	6	165616	165621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579789
3042	NC_006834	CG	4	8	165644	165651	0 %	0 %	50 %	50 %	58579789
3043	NC_006834	GTG	2	6	165686	165691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579789
3044	NC_006834	GCG	2	6	165727	165732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579789
3045	NC_006834	GAA	2	6	165735	165740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579789
3046	NC_006834	GAGC	2	8	165824	165831	25 %	0 %	50 %	25 %	58579789
3047	NC_006834	GCT	2	6	165854	165859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579789
3048	NC_006834	CG	3	6	165864	165869	0 %	0 %	50 %	50 %	58579789
3049	NC_006834	GCG	2	6	165881	165886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579789
3050	NC_006834	TTG	2	6	165993	165998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579789
3051	NC_006834	GAC	3	9	166038	166046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579789
3052	NC_006834	TGAGTG	2	12	166068	166079	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	58579789
3053	NC_006834	TTG	2	6	166094	166099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579790
3054	NC_006834	TGG	2	6	166147	166152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579790
3055	NC_006834	GCG	2	6	166169	166174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579790
3056	NC_006834	AAG	2	6	166187	166192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579790
3057	NC_006834	CAGC	2	8	166226	166233	25 %	0 %	25 %	50 %	58579790
3058	NC_006834	GGC	2	6	166297	166302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579790
3059	NC_006834	CGA	2	6	166398	166403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579790
3060	NC_006834	CGT	3	9	166431	166439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579790
3061	NC_006834	CG	3	6	166451	166456	0 %	0 %	50 %	50 %	58579790
3062	NC_006834	CGCCTG	2	12	166614	166625	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	58579790
3063	NC_006834	CTG	2	6	166661	166666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579790
3064	NC_006834	GC	3	6	166697	166702	0 %	0 %	50 %	50 %	58579790
3065	NC_006834	GCT	2	6	166793	166798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579790
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3068	NC_006834	CGC	2	6	166868	166873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579790
3069	NC_006834	GC	3	6	166904	166909	0 %	0 %	50 %	50 %	58579790
3070	NC_006834	GTGG	2	8	166927	166934	0 %	25 %	75 %	0 %	58579790
3071	NC_006834	GTC	2	6	166963	166968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579790
3072	NC_006834	CGATGT	3	18	166969	166986	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58579790
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3077	NC_006834	CA	3	6	167153	167158	50 %	0 %	0 %	50 %	58579790
3078	NC_006834	CG	3	6	167165	167170	0 %	0 %	50 %	50 %	58579790
3079	NC_006834	ACCG	2	8	167177	167184	25 %	0 %	25 %	50 %	58579790
3080	NC_006834	TGC	2	6	167235	167240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579790
3081	NC_006834	CGA	2	6	167287	167292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579790
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3087	NC_006834	TGA	2	6	167436	167441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579790
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3089	NC_006834	CGC	2	6	167496	167501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579790
3090	NC_006834	GCT	2	6	167529	167534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579790
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3094	NC_006834	CTG	2	6	167684	167689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579790
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3098	NC_006834	GC	4	8	167763	167770	0 %	0 %	50 %	50 %	58579790
3099	NC_006834	ATC	2	6	167796	167801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579790
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3103	NC_006834	CAA	2	6	168454	168459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579791
3104	NC_006834	GC	3	6	168473	168478	0 %	0 %	50 %	50 %	58579791
3105	NC_006834	TGC	2	6	168496	168501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579791
3106	NC_006834	GTT	2	6	168534	168539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579791
3107	NC_006834	CGG	2	6	168573	168578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579791
3108	NC_006834	AGCC	2	8	168585	168592	25 %	0 %	25 %	50 %	58579791
3109	NC_006834	CGG	2	6	168655	168660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579791
3110	NC_006834	GGTC	2	8	168738	168745	0 %	25 %	50 %	25 %	58579791
3111	NC_006834	GCCG	2	8	168775	168782	0 %	0 %	50 %	50 %	58579791
3112	NC_006834	GTA	2	6	168847	168852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579791
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3114	NC_006834	GGC	2	6	168913	168918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579791
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3117	NC_006834	CGT	2	6	169080	169085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579791
3118	NC_006834	GAAA	2	8	169095	169102	75 %	0 %	25 %	0 %	58579791
3119	NC_006834	TCG	2	6	169115	169120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579791
3120	NC_006834	CAC	2	6	169147	169152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579791
3121	NC_006834	GCGCG	2	10	169179	169188	0 %	0 %	60 %	40 %	58579791
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3123	NC_006834	GCA	2	6	169298	169303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579791
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3490	NC_006834	GCA	2	6	189545	189550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579807
3491	NC_006834	CG	3	6	189624	189629	0 %	0 %	50 %	50 %	58579807
3492	NC_006834	GAT	2	6	189702	189707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579807
3493	NC_006834	GTC	3	9	189727	189735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579807
3494	NC_006834	GCAAT	2	10	189848	189857	40 %	20 %	20 %	20 %	58579807
3495	NC_006834	CAT	2	6	189886	189891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579807
3496	NC_006834	ACG	2	6	189992	189997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579807
3497	NC_006834	TGT	2	6	190096	190101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579807
3498	NC_006834	CAC	2	6	190106	190111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579807
3499	NC_006834	TGGC	2	8	190131	190138	0 %	25 %	50 %	25 %	58579807
3500	NC_006834	GCA	3	9	190186	190194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579807

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