MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 93864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_006834	CGATC	2	10	54336	54345	20 %	20 %	20 %	40 %	122878980
1003	NC_006834	ATC	2	6	54409	54414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	122878980
1004	NC_006834	CAC	2	6	54445	54450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	122878980
1005	NC_006834	CGA	2	6	54465	54470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878980
1006	NC_006834	GACG	2	8	54490	54497	25 %	0 %	50 %	25 %	122878980
1007	NC_006834	TGCGC	2	10	54600	54609	0 %	20 %	40 %	40 %	122878980
1008	NC_006834	GGGCT	2	10	54706	54715	0 %	20 %	60 %	20 %	122878980
1009	NC_006834	TGG	2	6	54794	54799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	122878980
1010	NC_006834	GCA	2	6	54830	54835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878980
1011	NC_006834	GGCCTG	2	12	54850	54861	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	122878980
1012	NC_006834	GC	3	6	54880	54885	0 %	0 %	50 %	50 %	122878980
1013	NC_006834	GTG	3	9	54916	54924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	122878980
1014	NC_006834	TGC	2	6	54968	54973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878980
1015	NC_006834	GCG	2	6	54998	55003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878980
1016	NC_006834	CG	3	6	55013	55018	0 %	0 %	50 %	50 %	122878980
1017	NC_006834	GCC	2	6	55039	55044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	122878980
1018	NC_006834	TGG	3	9	55067	55075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	122878980
1019	NC_006834	GCTCAA	2	12	55182	55193	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	122878980
1020	NC_006834	GGT	2	6	55333	55338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	122878980
1021	NC_006834	CGC	2	6	55341	55346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	122878980
1022	NC_006834	CAG	2	6	55383	55388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878980
1023	NC_006834	GC	3	6	55419	55424	0 %	0 %	50 %	50 %	122878980
1024	NC_006834	GCA	2	6	55443	55448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878980
1025	NC_006834	TGG	2	6	55451	55456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	122878980
1026	NC_006834	ACG	2	6	55484	55489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878980
1027	NC_006834	GGC	2	6	55598	55603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579683
1028	NC_006834	CCA	2	6	55639	55644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579683
1029	NC_006834	CACC	2	8	55682	55689	25 %	0 %	0 %	75 %	58579683
1030	NC_006834	GCC	2	6	55698	55703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579683
1031	NC_006834	GCC	2	6	55707	55712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579683
1032	NC_006834	CCA	2	6	55732	55737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579683
1033	NC_006834	GCT	2	6	55740	55745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579683
1034	NC_006834	CGG	2	6	55829	55834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579683
1035	NC_006834	GTTG	2	8	55862	55869	0 %	50 %	50 %	0 %	58579683
1036	NC_006834	CTG	2	6	55884	55889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579683
1037	NC_006834	CGCT	2	8	55921	55928	0 %	25 %	25 %	50 %	58579683
1038	NC_006834	CGC	2	6	55946	55951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579683
1039	NC_006834	GCA	2	6	55978	55983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579683
1040	NC_006834	GGCCT	2	10	56193	56202	0 %	20 %	40 %	40 %	58579684
1041	NC_006834	GT	3	6	56207	56212	0 %	50 %	50 %	0 %	58579684
1042	NC_006834	CGT	2	6	56216	56221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579684
1043	NC_006834	GCT	2	6	56240	56245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579684
1044	NC_006834	ATC	2	6	56259	56264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579684
1045	NC_006834	TGC	2	6	56269	56274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579684
1046	NC_006834	TTC	2	6	56307	56312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579684
1047	NC_006834	CTG	2	6	56328	56333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579684
1048	NC_006834	TTC	2	6	56361	56366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579684
1049	NC_006834	TCA	2	6	56407	56412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579684
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1051	NC_006834	ACG	2	6	56454	56459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579684
1052	NC_006834	GCAC	2	8	56472	56479	25 %	0 %	25 %	50 %	58579684
1053	NC_006834	TGG	2	6	56526	56531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579685
1054	NC_006834	CG	3	6	56537	56542	0 %	0 %	50 %	50 %	58579685
1055	NC_006834	CGC	2	6	56598	56603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579685
1056	NC_006834	GCA	2	6	56673	56678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579685
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1058	NC_006834	GAT	2	6	56716	56721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579685
1059	NC_006834	GC	4	8	56752	56759	0 %	0 %	50 %	50 %	58579685
1060	NC_006834	GCA	2	6	56786	56791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579685
1061	NC_006834	GGT	2	6	56830	56835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579685
1062	NC_006834	GAA	2	6	57111	57116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579686
1063	NC_006834	GTG	2	6	57219	57224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579686
1064	NC_006834	GCGT	2	8	57261	57268	0 %	25 %	50 %	25 %	58579686
1065	NC_006834	CTG	2	6	57349	57354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579686
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1071	NC_006834	CTGG	2	8	57793	57800	0 %	25 %	50 %	25 %	58579687
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1075	NC_006834	CATC	2	8	57859	57866	25 %	25 %	0 %	50 %	58579687
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1097	NC_006834	GC	3	6	59016	59021	0 %	0 %	50 %	50 %	122878981
1098	NC_006834	CTG	2	6	59038	59043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878981
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1102	NC_006834	CGCAG	2	10	59189	59198	20 %	0 %	40 %	40 %	122878981
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1110	NC_006834	AGC	2	6	59702	59707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878981
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1248	NC_006834	GCA	2	6	69020	69025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121632014
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