MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 93864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_006834	AGC	2	6	552010	552015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580152
10003	NC_006834	GAT	2	6	552058	552063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58580152
10004	NC_006834	GGC	2	6	552081	552086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580152
10005	NC_006834	GGAT	2	8	552105	552112	25 %	25 %	50 %	0 %	58580152
10006	NC_006834	CGG	2	6	552113	552118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580152
10007	NC_006834	GC	3	6	552616	552621	0 %	0 %	50 %	50 %	58580153
10008	NC_006834	TGT	2	6	552625	552630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58580153
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10010	NC_006834	GC	4	8	552692	552699	0 %	0 %	50 %	50 %	58580153
10011	NC_006834	CGC	2	6	552703	552708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580153
10012	NC_006834	GCG	2	6	552798	552803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580153
10013	NC_006834	GC	3	6	552860	552865	0 %	0 %	50 %	50 %	58580153
10014	NC_006834	TTG	2	6	552927	552932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58580153
10015	NC_006834	GTA	2	6	553023	553028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58580153
10016	NC_006834	CAG	2	6	553104	553109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580153
10017	NC_006834	GC	5	10	553146	553155	0 %	0 %	50 %	50 %	58580153
10018	NC_006834	ACA	2	6	553163	553168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58580153
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10020	NC_006834	GCCAGC	2	12	553255	553266	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	58580153
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10022	NC_006834	GCA	2	6	553334	553339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580153
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10024	NC_006834	CAC	2	6	553455	553460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58580153
10025	NC_006834	GCT	2	6	553520	553525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580153
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10030	NC_006834	ATG	2	6	553855	553860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58580153
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10032	NC_006834	GGGAT	2	10	553873	553882	20 %	20 %	60 %	0 %	58580153
10033	NC_006834	GC	3	6	553904	553909	0 %	0 %	50 %	50 %	58580153
10034	NC_006834	CG	3	6	553919	553924	0 %	0 %	50 %	50 %	58580153
10035	NC_006834	CCA	2	6	553937	553942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58580153
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10040	NC_006834	CAG	2	6	554181	554186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580153
10041	NC_006834	TGA	2	6	554204	554209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58580153
10042	NC_006834	CAGC	2	8	554219	554226	25 %	0 %	25 %	50 %	58580153
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10092	NC_006834	CGGAC	2	10	558595	558604	20 %	0 %	40 %	40 %	58580158
10093	NC_006834	CAG	3	9	558663	558671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580158
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10102	NC_006834	AC	3	6	559046	559051	50 %	0 %	0 %	50 %	58580158
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10106	NC_006834	CCT	2	6	559984	559989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58580159
10107	NC_006834	TTG	2	6	560006	560011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58580159
10108	NC_006834	CG	5	10	560017	560026	0 %	0 %	50 %	50 %	58580159
10109	NC_006834	CCAG	2	8	560056	560063	25 %	0 %	25 %	50 %	58580159
10110	NC_006834	TCG	2	6	560070	560075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580159
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10112	NC_006834	GCA	2	6	560136	560141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580159
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10118	NC_006834	ATG	2	6	560397	560402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58580159
10119	NC_006834	TTCA	2	8	560435	560442	25 %	50 %	0 %	25 %	58580159
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10121	NC_006834	CGC	2	6	560522	560527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580159
10122	NC_006834	CT	4	8	560649	560656	0 %	50 %	0 %	50 %	58580159
10123	NC_006834	TCG	2	6	560667	560672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580159
10124	NC_006834	AAC	2	6	561000	561005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58580159
10125	NC_006834	ACG	3	9	561033	561041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580159
10126	NC_006834	GATT	2	8	561101	561108	25 %	50 %	25 %	0 %	58580159
10127	NC_006834	TGC	2	6	561118	561123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580159
10128	NC_006834	CGCTG	2	10	561312	561321	0 %	20 %	40 %	40 %	58580160
10129	NC_006834	CGT	2	6	561375	561380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580160
10130	NC_006834	GCC	2	6	561398	561403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580160
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10132	NC_006834	CGG	2	6	561441	561446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580160
10133	NC_006834	TGA	2	6	561507	561512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58580160
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10139	NC_006834	ATC	2	6	561734	561739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58580160
10140	NC_006834	ACC	2	6	561806	561811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58580160
10141	NC_006834	GAC	2	6	561844	561849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580160
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10143	NC_006834	GTCGCC	2	12	561895	561906	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	58580160
10144	NC_006834	CTGG	2	8	561922	561929	0 %	25 %	50 %	25 %	58580160
10145	NC_006834	CTT	2	6	561978	561983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58580160
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10147	NC_006834	CTTCGG	2	12	562065	562076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580160
10148	NC_006834	CGG	2	6	562107	562112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580160
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10150	NC_006834	TGC	2	6	562248	562253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580160
10151	NC_006834	GGCC	2	8	562296	562303	0 %	0 %	50 %	50 %	58580160
10152	NC_006834	TTGACC	2	12	562409	562420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58580160
10153	NC_006834	CCAGG	2	10	562510	562519	20 %	0 %	40 %	40 %	58580160
10154	NC_006834	GCC	2	6	562531	562536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580160
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10156	NC_006834	TCCA	2	8	563268	563275	25 %	25 %	0 %	50 %	58580161
10157	NC_006834	GCT	2	6	563331	563336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580161
10158	NC_006834	CGA	2	6	563337	563342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580161
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10161	NC_006834	A	6	6	563408	563413	100 %	0 %	0 %	0 %	58580161
10162	NC_006834	AGT	2	6	563484	563489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58580161
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10164	NC_006834	AAG	2	6	563552	563557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58580161
10165	NC_006834	CGTC	2	8	563652	563659	0 %	25 %	25 %	50 %	58580161
10166	NC_006834	CT	3	6	563702	563707	0 %	50 %	0 %	50 %	58580161
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10170	NC_006834	ATC	2	6	563978	563983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58580161
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10178	NC_006834	TCG	2	6	564529	564534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580162
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10182	NC_006834	GCC	2	6	564604	564609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580162
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10187	NC_006834	CAG	2	6	564816	564821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580162
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10193	NC_006834	CGA	2	6	565046	565051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580162
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10200	NC_006834	ATCGGC	2	12	565260	565271	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	58580162
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10213	NC_006834	CAG	2	6	565758	565763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580162
10214	NC_006834	CAG	2	6	565821	565826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580162
10215	NC_006834	GCC	2	6	565827	565832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580162
10216	NC_006834	CAT	2	6	565869	565874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58580162
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10218	NC_006834	CAG	2	6	565956	565961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580162
10219	NC_006834	GC	3	6	565971	565976	0 %	0 %	50 %	50 %	58580162
10220	NC_006834	GC	3	6	565982	565987	0 %	0 %	50 %	50 %	58580162
10221	NC_006834	GATC	2	8	565994	566001	25 %	25 %	25 %	25 %	58580162
10222	NC_006834	GCT	2	6	566175	566180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121632031
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10225	NC_006834	GGC	2	6	566209	566214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121632031
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10228	NC_006834	GCG	2	6	566282	566287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121632031
10229	NC_006834	GCT	2	6	566301	566306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121632031
10230	NC_006834	TGC	2	6	566315	566320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121632031
10231	NC_006834	GGT	3	9	566948	566956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58580165
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10233	NC_006834	TTC	2	6	567028	567033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58580165
10234	NC_006834	ACGC	2	8	567041	567048	25 %	0 %	25 %	50 %	58580165
10235	NC_006834	GCG	2	6	567074	567079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580165
10236	NC_006834	CCAC	2	8	567140	567147	25 %	0 %	0 %	75 %	58580165
10237	NC_006834	TGG	2	6	567167	567172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58580165
10238	NC_006834	GGT	2	6	567195	567200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58580165
10239	NC_006834	GCC	2	6	567202	567207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580165
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10241	NC_006834	GC	3	6	567382	567387	0 %	0 %	50 %	50 %	58580166
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10483	NC_006834	CGG	2	6	581756	581761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580184
10484	NC_006834	GC	3	6	581773	581778	0 %	0 %	50 %	50 %	58580184
10485	NC_006834	GGC	2	6	581802	581807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580184
10486	NC_006834	GC	3	6	581850	581855	0 %	0 %	50 %	50 %	58580184
10487	NC_006834	CGC	2	6	581870	581875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580184
10488	NC_006834	GCA	2	6	581912	581917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580184
10489	NC_006834	AGC	2	6	581950	581955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580184
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10491	NC_006834	CAG	2	6	581973	581978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580184
10492	NC_006834	GCG	2	6	581996	582001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580184
10493	NC_006834	GCCG	2	8	582018	582025	0 %	0 %	50 %	50 %	58580184
10494	NC_006834	GCA	2	6	582064	582069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580184
10495	NC_006834	CGG	2	6	582095	582100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580184
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10498	NC_006834	GCG	2	6	582143	582148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580184
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10500	NC_006834	CGG	2	6	582181	582186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580184

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