MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 93864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_006834	GCC	2	6	314675	314680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579923
5503	NC_006834	TTC	2	6	314741	314746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579923
5504	NC_006834	GCC	2	6	314790	314795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579923
5505	NC_006834	TGC	2	6	314831	314836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579923
5506	NC_006834	GGT	2	6	314930	314935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579923
5507	NC_006834	GTA	2	6	314960	314965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579923
5508	NC_006834	ATC	2	6	314972	314977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579923
5509	NC_006834	AGCGCG	2	12	314986	314997	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58579923
5510	NC_006834	CG	4	8	314994	315001	0 %	0 %	50 %	50 %	58579923
5511	NC_006834	CTT	2	6	315343	315348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579924
5512	NC_006834	CCA	2	6	315524	315529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579924
5513	NC_006834	A	8	8	315564	315571	100 %	0 %	0 %	0 %	58579924
5514	NC_006834	CTG	2	6	316158	316163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579926
5515	NC_006834	TGCC	2	8	316173	316180	0 %	25 %	25 %	50 %	58579926
5516	NC_006834	ACC	2	6	316301	316306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579926
5517	NC_006834	TTC	2	6	316430	316435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579926
5518	NC_006834	GGT	2	6	316444	316449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579926
5519	NC_006834	CGTGC	2	10	316462	316471	0 %	20 %	40 %	40 %	58579926
5520	NC_006834	ACC	2	6	316607	316612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579926
5521	NC_006834	GC	3	6	316664	316669	0 %	0 %	50 %	50 %	58579926
5522	NC_006834	AAG	2	6	316670	316675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579926
5523	NC_006834	CTG	2	6	316683	316688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579926
5524	NC_006834	CATGCG	2	12	316764	316775	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	58579926
5525	NC_006834	TGC	2	6	316801	316806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579926
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5527	NC_006834	GTT	2	6	316921	316926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579926
5528	NC_006834	ACAA	2	8	316944	316951	75 %	0 %	0 %	25 %	58579926
5529	NC_006834	GCAC	2	8	316966	316973	25 %	0 %	25 %	50 %	58579926
5530	NC_006834	GCAAGG	2	12	316993	317004	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	58579926
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5532	NC_006834	GC	3	6	317051	317056	0 %	0 %	50 %	50 %	58579926
5533	NC_006834	GC	4	8	317073	317080	0 %	0 %	50 %	50 %	58579926
5534	NC_006834	ACG	2	6	317100	317105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579926
5535	NC_006834	GC	3	6	317135	317140	0 %	0 %	50 %	50 %	58579926
5536	NC_006834	GCT	2	6	317143	317148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579926
5537	NC_006834	ATGTGA	2	12	317154	317165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579926
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5539	NC_006834	ACG	2	6	317281	317286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579926
5540	NC_006834	TGCAC	2	10	317368	317377	20 %	20 %	20 %	40 %	58579926
5541	NC_006834	GGC	2	6	317412	317417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579926
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5543	NC_006834	GC	3	6	317462	317467	0 %	0 %	50 %	50 %	58579926
5544	NC_006834	CAT	2	6	317485	317490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579926
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5546	NC_006834	GTT	2	6	317895	317900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579928
5547	NC_006834	T	7	7	317902	317908	0 %	100 %	0 %	0 %	58579928
5548	NC_006834	GCG	2	6	317946	317951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579928
5549	NC_006834	GC	4	8	318026	318033	0 %	0 %	50 %	50 %	58579928
5550	NC_006834	CCA	2	6	318038	318043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579928
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5552	NC_006834	GCCA	2	8	318114	318121	25 %	0 %	25 %	50 %	58579928
5553	NC_006834	CCG	2	6	318225	318230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579928
5554	NC_006834	TCA	2	6	318287	318292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579928
5555	NC_006834	GCA	2	6	318335	318340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579928
5556	NC_006834	GAA	2	6	318378	318383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579928
5557	NC_006834	CGGGC	2	10	318400	318409	0 %	0 %	60 %	40 %	58579928
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5559	NC_006834	CGCCA	2	10	318447	318456	20 %	0 %	20 %	60 %	58579928
5560	NC_006834	GC	3	6	318542	318547	0 %	0 %	50 %	50 %	58579928
5561	NC_006834	GGT	2	6	318567	318572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579928
5562	NC_006834	GC	3	6	318614	318619	0 %	0 %	50 %	50 %	58579928
5563	NC_006834	CGC	2	6	318642	318647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579928
5564	NC_006834	CTG	2	6	318651	318656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579928
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5571	NC_006834	GCC	2	6	318780	318785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579928
5572	NC_006834	CGG	2	6	318789	318794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579928
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5574	NC_006834	CAGG	2	8	318834	318841	25 %	0 %	50 %	25 %	58579928
5575	NC_006834	GC	3	6	318923	318928	0 %	0 %	50 %	50 %	58579929
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5593	NC_006834	CAG	2	6	319781	319786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579930
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5602	NC_006834	CGG	2	6	320082	320087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579931
5603	NC_006834	ATCGA	2	10	320126	320135	40 %	20 %	20 %	20 %	58579931
5604	NC_006834	CGC	2	6	320181	320186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579931
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5606	NC_006834	CTGG	2	8	320251	320258	0 %	25 %	50 %	25 %	58579931
5607	NC_006834	TGGT	2	8	320276	320283	0 %	50 %	50 %	0 %	58579931
5608	NC_006834	CCAGCA	2	12	320295	320306	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	58579931
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5613	NC_006834	GGT	2	6	320457	320462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579932
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5625	NC_006834	GCA	2	6	321071	321076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579932
5626	NC_006834	CGA	2	6	321122	321127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579932
5627	NC_006834	GCA	2	6	321138	321143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579933
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5629	NC_006834	CTG	2	6	321206	321211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579933
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5633	NC_006834	GAT	2	6	321332	321337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579933
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5868	NC_006834	GGCC	2	8	337953	337960	0 %	0 %	50 %	50 %	58579955
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5996	NC_006834	TGCC	2	8	343103	343110	0 %	25 %	25 %	50 %	58579958
5997	NC_006834	TGCG	2	8	343249	343256	0 %	25 %	50 %	25 %	58579958
5998	NC_006834	TGC	2	6	343290	343295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579958
5999	NC_006834	CGC	2	6	343301	343306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579958
6000	NC_006834	A	6	6	343353	343358	100 %	0 %	0 %	0 %	58579958

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