MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 93864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_006834	CAC	2	6	272333	272338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579877
5003	NC_006834	CCG	2	6	272355	272360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579877
5004	NC_006834	GCC	2	6	272393	272398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579877
5005	NC_006834	GCAC	2	8	272434	272441	25 %	0 %	25 %	50 %	58579877
5006	NC_006834	CTG	2	6	272493	272498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579877
5007	NC_006834	GCC	2	6	272514	272519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579877
5008	NC_006834	GCC	2	6	272616	272621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579877
5009	NC_006834	GGT	2	6	272636	272641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579877
5010	NC_006834	GTG	2	6	272745	272750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579877
5011	NC_006834	CTG	3	9	272784	272792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579877
5012	NC_006834	GCC	2	6	272822	272827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579877
5013	NC_006834	GGT	2	6	272861	272866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579877
5014	NC_006834	GCT	2	6	272873	272878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579877
5015	NC_006834	GCG	2	6	272887	272892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579877
5016	NC_006834	TTC	2	6	272895	272900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579877
5017	NC_006834	CCG	2	6	272903	272908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579877
5018	NC_006834	TGG	2	6	272965	272970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579877
5019	NC_006834	CGG	2	6	272972	272977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579877
5020	NC_006834	TCG	2	6	272995	273000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579877
5021	NC_006834	GGCG	2	8	273003	273010	0 %	0 %	75 %	25 %	58579877
5022	NC_006834	TGC	2	6	273028	273033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579877
5023	NC_006834	GGC	2	6	273042	273047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579877
5024	NC_006834	GC	3	6	273065	273070	0 %	0 %	50 %	50 %	58579877
5025	NC_006834	CGA	2	6	273155	273160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579877
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5028	NC_006834	GGT	2	6	273245	273250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579877
5029	NC_006834	ACG	2	6	273280	273285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579877
5030	NC_006834	GCAC	2	8	273296	273303	25 %	0 %	25 %	50 %	58579877
5031	NC_006834	CTGG	2	8	273347	273354	0 %	25 %	50 %	25 %	58579877
5032	NC_006834	GCC	2	6	273405	273410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579877
5033	NC_006834	TTGC	2	8	273429	273436	0 %	50 %	25 %	25 %	58579877
5034	NC_006834	TTG	2	6	273444	273449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579877
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5036	NC_006834	CGTCAC	2	12	273542	273553	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	58579877
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5038	NC_006834	ATC	2	6	273573	273578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579877
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5040	NC_006834	CG	3	6	273607	273612	0 %	0 %	50 %	50 %	58579877
5041	NC_006834	TCAGCG	2	12	273637	273648	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	58579877
5042	NC_006834	TGC	2	6	273661	273666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579877
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5044	NC_006834	TGC	2	6	273688	273693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579877
5045	NC_006834	TCG	2	6	273708	273713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579877
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5051	NC_006834	CGA	3	9	273899	273907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579877
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5053	NC_006834	TGCG	2	8	273958	273965	0 %	25 %	50 %	25 %	58579877
5054	NC_006834	GCA	2	6	273980	273985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579877
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5059	NC_006834	TGC	2	6	274318	274323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579877
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5061	NC_006834	GTA	2	6	274331	274336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579877
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5063	NC_006834	TCG	2	6	276247	276252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579881
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5065	NC_006834	CGA	2	6	276326	276331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579881
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5092	NC_006834	AAC	2	6	279178	279183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579888
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5099	NC_006834	CATG	2	8	280100	280107	25 %	25 %	25 %	25 %	58579889
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5103	NC_006834	CG	3	6	280387	280392	0 %	0 %	50 %	50 %	58579889
5104	NC_006834	GCG	2	6	280395	280400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579889
5105	NC_006834	CAG	2	6	280407	280412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579889
5106	NC_006834	GCG	2	6	280445	280450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579889
5107	NC_006834	GCG	3	9	280508	280516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579889
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5122	NC_006834	TTG	2	6	281340	281345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579890
5123	NC_006834	A	6	6	281358	281363	100 %	0 %	0 %	0 %	58579890
5124	NC_006834	GCA	2	6	281374	281379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579890
5125	NC_006834	CTGC	2	8	281413	281420	0 %	25 %	25 %	50 %	58579890
5126	NC_006834	GCCCAT	2	12	281462	281473	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	58579890
5127	NC_006834	TCG	2	6	281496	281501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579890
5128	NC_006834	CAG	2	6	281516	281521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579890
5129	NC_006834	TCG	2	6	281562	281567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579890
5130	NC_006834	GCT	2	6	281587	281592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579890
5131	NC_006834	CCA	2	6	281593	281598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579890
5132	NC_006834	CGG	2	6	281599	281604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579890
5133	NC_006834	TGCGG	2	10	281650	281659	0 %	20 %	60 %	20 %	58579890
5134	NC_006834	GAT	2	6	281687	281692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579891
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5136	NC_006834	ATC	2	6	281803	281808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579891
5137	NC_006834	TGC	2	6	281848	281853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579891
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5139	NC_006834	CAT	2	6	281951	281956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579891
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5141	NC_006834	GC	5	10	281982	281991	0 %	0 %	50 %	50 %	58579891
5142	NC_006834	AGC	2	6	282031	282036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579891
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5146	NC_006834	GC	3	6	282363	282368	0 %	0 %	50 %	50 %	121632023
5147	NC_006834	TCT	2	6	284214	284219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579895
5148	NC_006834	TCA	2	6	284272	284277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579895
5149	NC_006834	GTT	2	6	284288	284293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579895
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5151	NC_006834	TGC	2	6	284371	284376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579896
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5154	NC_006834	GC	3	6	284448	284453	0 %	0 %	50 %	50 %	58579896
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5160	NC_006834	TCG	2	6	284728	284733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579896
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5187	NC_006834	TCG	2	6	286855	286860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122879003
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5226	NC_006834	AC	3	6	289603	289608	50 %	0 %	0 %	50 %	58579903
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5237	NC_006834	CA	3	6	290670	290675	50 %	0 %	0 %	50 %	122879004
5238	NC_006834	GCA	2	6	290682	290687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122879004
5239	NC_006834	CAA	2	6	290740	290745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	122879004
5240	NC_006834	AAT	2	6	290903	290908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	122879004
5241	NC_006834	GGCTG	2	10	290970	290979	0 %	20 %	60 %	20 %	122879004
5242	NC_006834	TGG	2	6	290984	290989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	122879004
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5244	NC_006834	TGG	2	6	291002	291007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	122879004
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5368	NC_006834	TCGT	2	8	298534	298541	0 %	50 %	25 %	25 %	122879006
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5400	NC_006834	GCAG	2	8	301601	301608	25 %	0 %	50 %	25 %	58579914
5401	NC_006834	CGA	2	6	301650	301655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579914
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5479	NC_006834	TACT	2	8	313192	313199	25 %	50 %	0 %	25 %	58579922
5480	NC_006834	GCGG	2	8	313213	313220	0 %	0 %	75 %	25 %	58579922
5481	NC_006834	TGC	2	6	313229	313234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579922
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5484	NC_006834	CGG	2	6	313659	313664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579922
5485	NC_006834	TAC	2	6	313665	313670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579922
5486	NC_006834	GAT	2	6	313785	313790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579922
5487	NC_006834	GGTGT	2	10	313806	313815	0 %	40 %	60 %	0 %	58579922
5488	NC_006834	TTGC	2	8	314193	314200	0 %	50 %	25 %	25 %	58579923
5489	NC_006834	GCAGC	2	10	314231	314240	20 %	0 %	40 %	40 %	58579923
5490	NC_006834	GCA	2	6	314260	314265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579923
5491	NC_006834	CGG	2	6	314283	314288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579923
5492	NC_006834	GCC	2	6	314301	314306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579923
5493	NC_006834	TGGCC	2	10	314332	314341	0 %	20 %	40 %	40 %	58579923
5494	NC_006834	CAC	2	6	314387	314392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579923
5495	NC_006834	CAAC	2	8	314396	314403	50 %	0 %	0 %	50 %	58579923
5496	NC_006834	GCA	2	6	314424	314429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579923
5497	NC_006834	GTG	2	6	314451	314456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579923
5498	NC_006834	CCT	2	6	314470	314475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58579923
5499	NC_006834	GC	3	6	314534	314539	0 %	0 %	50 %	50 %	58579923
5500	NC_006834	TCC	2	6	314547	314552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58579923

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